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[期刊] 华北农学报
[作者]
王利英 乔军 石瑶 王振英 李素文
为应用分子标记建立一套快速准确的杂交种鉴定方法,利用已有的236对SSR分子标记对3个茄子品种进行多态性标记筛选,并进行待测品种的分子标记纯度鉴定以及田间纯度鉴定,获得特定品种的指纹信息。结果显示,筛选出用于茄子纯度鉴定的多态性引物15对,利用该系列引物进行纯度鉴定,品种1-2010、3-2010和9-2010纯度结果分别为98%,96%和100%,在此基础上获得了对应品种的指纹信息。应用SSR进行茄子品种纯度鉴定与田间检测结果一致,证明分子标记检测茄子杂交种纯度可行且高效,具有一定的理论和应用价值。
关键词：
茄子 纯度鉴定 多态性引物 SSR
[期刊] 华北农学报
[作者]
盖树鹏
建立快速、准确鉴定玉米种子纯度技术是控制种子质量的有效措施。本研究针对SSR鉴定结果低于种植鉴定结果的问题,分析了可能的原因,提出了解决办法。利用筛选的特异标记测定了标记在原种、大田用自交系、套袋配制杂交种中的检出率,测定了2个杂交种(莱农14和莱农15)共16份样品的纯度。特异标记检出率随着自交系繁殖代数增加呈现逐渐降低的趋势;杂交种出苗率越低,SSR鉴定结果与田间鉴定结果的差值越大,是导致SSR检测纯度偏低的两个主要原因。将SSR结果与田间种植结果相比较,建立了SSR鉴定与田间种植鉴定的回归方程,可准确鉴定杂交种的纯度。
关键词：
玉米 纯度 SSR 田间鉴定
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
胡辉林 党润盈 王军
建立了种子酯酶同工酶聚丙烯酰胺凝胶电泳法鉴定向日葵杂交种及自交系的技术 ,并对 3对自交系及 8个向日葵品种进行了鉴定。结果表明 :(1 )自交系与其杂交种酶谱有明显区别 ,杂交种酶型具双亲互补性 ;(2 ) 8个向日葵品种可从酶谱区分 ;(3)该法快速、成本低 ,具一定适应范围 ,鉴定向日葵品种纯度效果良好
关键词：
向日葵 酯酶同工酶 PAGE 品种鉴定
[期刊] 林业科学研究
[作者]
湛欣 鲁好君 赵帅 陈晓阳 邓小梅
［目的］本研究旨在建立红椿ＳＳＲ－ＰＣＲ最佳反应体系，并筛选适于红椿ＳＳＲ分析的高多态性引物。［方法］通过Ｌ１６（４５）正交试验设计，确立红椿ＳＳＲ－ＰＣＲ最佳反应体系；利用优化后的体系对来自楝科植物的１３５对ＳＳＲ引物，在６个不同的红椿居群中进行扩增，筛出能有效扩增的引物并进一步筛选出适于红椿的高多态性引物。［结果］（１）１０μＬ基于荧光ｄ ＵＴＰ的ＳＳＲ－ＰＣＲ体系中包含：１０×ｂＵｆｆｅＲ １．０μＬ，Ｔａｑ酶（５ Ｕ·μＬ－１）０．１μＬ，Ｍｇ ＣＬ２（２５ＭＭｏＬ·Ｌ－１）０．８μＬ，ｄ ＮＴＰ（２００ ＭＭｏＬ·Ｌ－１）０．０２５μＬ，荧光ｄ ＵＴＰ（１ ＮＭｏＬ·μＬ－１）０．０．．．
关键词：
SSR 红椿 体系优化 引物筛选
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨宏 刘小俊 梁根云 李跃建
为了快速而准确地鉴定杂交黄瓜种子的纯度和真伪，用１６４对全基因组覆盖的ＳＳＲ引物对黄瓜品种‘川绿２号’及其亲本进行多态性筛选。结果表明，２８对引物在亲本间具多态性，这些引物在１～７号染色体均有分布，其中２、６号染色体上分布有较多多态性位点。２８对多态性引物中共显性引物２２对，缺失多态性引物６对。共显性引物中有１０对引物在杂交后代表现为清晰、稳定的父母本互补的带型，特异性强，可分辨程度高，可以用来区别其中混杂的母本、父本及其他种子，为‘川绿２号’及其亲本指纹图谱的核心引物。利用这１０对引物对１批‘川绿２号’种子进行检测，分子标记鉴定纯度为９６．０％，真、假杂种编号与田间鉴定结果一致。这２８对引物．．．
关键词：
黄瓜 川绿2号 SSR指纹图谱 纯度鉴定
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
刘霞 郭玉华 王松文 李传友 刘芳 张欣 施利利
选用分布于水稻12条染色体上的249对SSR引物,对9个不同类型水稻品种进行DNA扩增,筛选到具有3条以上特异扩增条带的SSR引物39对,其中能揭示籼粳多态性的引物有6对。用筛选到的引物在9个不同水稻品种间的扩增结果,初步分析了SSR标记的多态性及用于水稻指纹分析、籼粳分化分析和聚类分析的潜力。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
强强 畅引东 孙瑛健 贾仡伟 张作刚
【目的】探究玉米大斑病菌（Exserohilum turcicum）基因组简单重复序列（SSR）位点信息特征，并筛选和验证多态性引物，为后续玉米大斑病菌遗传多样分析及遗传图谱的构建奠定基础。【方法】利用MISA软件对已有玉米大斑病菌基因组序列进行SSR位点检索；采用Primer 3.0设计SSR引物，通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对SSR引物多态性进行筛选和验证。【结果】玉米大斑病菌30条染色体基因组中共搜索到12 046个SSR位点，SSR位点平均密度为276.9个·Mb-1。其中：三核苷酸重复型SSR最多，占总SSR数量的31.38%；五核苷酸重复型SSR最少，占总SSR数量的2.10%。全基因组中共检测到203种碱基重复类型，其中，C/G重复类型最多，SSR位点数量为2 299个，占比19.09%，AC/GT次之（1 669个，占比13.86%）。SSR位点的重复次数主要集中在5～16次，占总SSR数量的91.38%；重复次数为10次的SSR位点数量最多，占总SSR数量的18.40%；SSR序列长度范围为10～300 bp，其中，10～20 bp占比最多，占总SSR数量的72.12%。通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，从78对引物中筛选出25对扩增性好且多态性高的SSR引物。【结论】玉米大斑病菌基因组含有丰富的SSR位点，具有开发多态性SSR引物的潜力；筛选的25对扩增性好且多态性高的SSR引物可用于后续玉米大斑病菌的鉴定、遗传多样性分析及遗传图谱构建等研究。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
高海娜 张恩慧 李殿荣 王灏 马英夏 许忠民
【目的】分析甘蓝杂交种纯度的SSR分子标记鉴定结果与田间形态学鉴定结果的一致性,寻找一种快速、准确鉴定甘蓝杂交种纯度的方法。【方法】选用SSR分子标记,筛选杂交种具有父母本互补带型的引物,用其鉴定"秦甘50"杂交种的纯度,并与田间常规鉴定结果的一致性进行比较。【结果】300对SSR分子标记引物中,有1对引物SQ1019对"秦甘50"杂交种表现为父母本互补带型;利用引物SQ1019标记鉴定"秦甘50"大田杂交种的纯度为96.3%;"秦甘50"大田杂交种经田间鉴定纯度为96.0%,2种鉴定结果的一致性高达99.7%。【结论】SQ1019是SSR分子标记"秦甘50"杂交种的特异引物,SSR分子标记是...
关键词：
甘蓝 SSR分子标记 种子纯度
[期刊] 华北农学报
[作者]
张超杰 徐维华 刘万好 唐美玲
以黑珍珠和砂蜜豆为材料,对AFLP分析过程中模板DNA的制备、酶切与连接、酶切连接产物的预扩增与选择性扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳等过程中易出现的问题及其解决方法作了对比研究,建立了一套适合于甜樱桃的AFLP分子标记体系。共筛选了64对引物,其中30对扩增效果理想,能够得到清晰、稳定的条带,平均每对引物扩增条带为60条。该体系的建立为研究甜樱桃遗传多样性和标记农艺性状的技术平台构建奠定了基础。
关键词：
甜樱桃 AFLP
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
王世杰 王雪婷 杜向前 陈洪刚 张会恰 杨敏生
【目的】利用经过长期筛选的11对SSR引物对50份杨树新品种(系)进行扩增,探究11对引物的品种鉴定能力和核心引物的筛选依据,为杨树新品种的鉴定、育种工作和核心引物的筛选工作奠定基础。【方法】使用毛细管电泳技术对扩增结果进行检测,计算等位重复序列数、Shannon信息指数和引物多态性信息指数等。按0/1矩阵记录扩增条带的有无,并通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。计算单个引物和11对引物组合的遗传相似系数,分析遗传相似系数之间的相关性,剔除相关性较低的引物,再对剩余的引物组合进行聚类分析。【结果】11对引物共扩增出122个DNA片段,平均每对引物扩增的等位重复序列数为11.091个;不同引物PIC值的变化范围是0.530～0.908,平均值为0.803。11对引物的聚类结果显示,当支距为0.40时,参试样品可以分为2个大类;当支距为0.37时,可分为4个亚类,聚类结果与品种(系)的谱系来源基本吻合。在11对现有引物的基础上,通过分析单个引物和11对引物的遗传相似系数之间的相关性,优化得到9对核心引物。相关性分析和聚类分析表明,优化后的9对引物具有高效鉴定能力和亲缘关系聚类效果。【结论】本研究证实SSR分子标记可以有效鉴定杨树新品种,并较好反映品种之间的亲缘关系;同时,利用遗传相似系数的相关性可优化现有的引物,为杨树的育种及核心引物的筛选工作提供了参考。
关键词：
杨树新品种 SSR标记 核心引物
[期刊] 华北农学报
[作者]
张国裕 张帆 姜立纲 翟伟卜 李海真
为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析,进行了南瓜EST-SSR标记的开发。从NCBI数据库下载1 457条南瓜属作物EST序列,去除冗余序列后进行SSR位点搜索,共得到215条含有SSR位点的EST序列。这些SSR位点包含111种重复基元,其中二核苷酸(62个,占28.84%)和三核苷酸(86个,占40.0%)重复类型占主导地位;重复基元中出现最多的是CT(21个,占9.77%),其次为TC(13个,占6.05%)和AAG(12个,占5.58%)。将215个SSR位点设计成EST-SSR引物后,随机合成了其中的43对引物。利用4份遗传背景差异较大的南瓜自交系对合成的43对引物进行...
关键词：
南瓜 EST-SSR 标记开发 杂种纯度
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
孟倩 董军刚 胡永敏 兰刚 董振生
【目的】建立有效的鉴定"甘杂1号"种子纯度的SSR分子标记方法,为提高"甘杂1号"大田制种纯度提供分子辅助工具。【方法】以"甘杂1号"杂交种及其母本3131A和父本3116C种子为供试材料,利用SSR分子标记技术鉴定"甘杂1号"种子纯度,从200对引物中筛选出特异性强、稳定性高的SSR引物,并将SSR引物鉴定的"甘杂1号"种子纯度与田间种植鉴定结果进行比较。【结果】在200对SSR引物中,筛选出了2对在杂交种和父母本之间存在显著差异的引物(CB10569和Na12E03),且条带清晰可辨,即杂交种含有父母本的特异互补带型。将这2个引物在120株"甘杂1号"杂交种群体中进行重复验证,发现CB10...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
蒋莉莉 张高原 张建农
【目的】研究有效的西瓜杂交组合种子纯度的ＳＳＲ标记鉴定方法，为室内鉴定的实际应用提供理论依据。【方法】以西瓜杂交组合Ｔ－１及其亲本自交系Ｐ－１、Ｍ－１３为材料，在子叶展平期采用ＣＴＡＢ法提取ＤＮＡ，利用优化的西瓜ＳＳＲ标记方法进行杂交种子的纯度鉴定，并与田间表型鉴定进行比较。【结果】从３６对ＳＳＲ引物中筛选出３对（ＭＣＰＩ－５、ＭＣＰＩ－１６、ＭＣＰＩ－１７）稳定性强、可重复性好、在杂交种及其母本之间具有多态性的引物。将这３对引物中的ＭＣＰＩ－５和ＭＣＰＩ－１６用于２６７株Ｔ－１杂交种群体纯度鉴定，显示种子纯度为９７．７５％，与田间种植鉴定结果一致。【结论】３对ＳＳＲ引物ＭＣＰＩ－５、ＭＣＰＩ．．．
关键词：
西瓜 杂交种 种子纯度 SSR标记
[期刊] 华北农学报
[作者]
侯名语 杨鑫雷 郭慧敏 穆国俊 刘立峰
通过筛选栽培花生间具有多态性的SSR,分析总结多态性SSR的特征,旨在选择性利用SSR标记,推动栽培种花生遗传图谱构建、相关农艺性状的QTL定位和分子标记辅助育种进程。以秦皇岛光秧、石腰豆、印度窄叶、抗019、四粒红和黑花生6个不同植物学类型的中国栽培种花生为材料,选用不同设计类型的1 523个SSR标记筛选品种间多态性SSR,并对其扩增片段长度、重复基序、重复次数等进行分析。结果表明,1 523个标记中,筛选获得43对多态性SSR标记,产生123个多态性标记位点,多态性标记数占2.8%。43对多态性SSR标记中,以ARS××的多态性最高,在6个品种中多态率达6.8%。统计各种质间具多态性的S...
关键词：
花生 SSR 多态性 特征
[期刊] 西南农业学报
[作者]
姚宗泽 李阳 郭宗娟 李军萍 聂贵芳 赵自仙 李云波
【目的】验证SNP分子标记中HRM技术鉴定结果的可靠性,为杂交玉米种子纯度鉴定方法的选择提供参考。【方法】以杂交种家佳荣2号及其父母本、近似杂交组合JR02为材料,采用田间小区种植鉴定和SNP分子标记中的HRM技术两种方法对杂交玉米家佳荣2号的同一批种子样品进行纯度鉴定。【结果】田间小区种植纯度鉴定结果为97.8%,SNP分子标记纯度鉴定结果为97.1%。【结论】SNP分子标记中的HRM技术鉴定结果可靠,可作为杂交玉米种子的纯度鉴定方法之一。
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