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[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 高琛  韩萍萍  王彬彬  张倩  范丽娟  王欢  蒲广  刘航  张总平  牛培培  周娟  黄瑞华  李平华  
[目的]本试验旨在鉴别影响苏淮猪肉滴水损失的关键基因及位点,为苏淮猪肉品质选育提供重要分子标记。[方法]屠宰301头苏淮猪(胴体重为58.67±7.47 kg),测定肌肉滴水损失,并分析含有SAP结构域的肌肉增强因子2激活基因(MAMSTR)rs337473375(C>T)位点、抵抗素基因(RETN)rs327132149(G>A)位点、兰尼定受体基因(RYR1)g.1843C>T位点、磷酸化酶激酶γ1基因(PHKG1)g.8283C>A位点,一磷酸腺苷激活蛋白激酶γ3亚基基因(PRKAG3)p.Arg200Gln位点和p.Ile199Val位点等6个已报道的影响滴水损失的候选基因功能位点在301头苏淮猪群体中的遗传多态性,使用SAS 9.2软件的混合线性模型分析上述基因多态性与苏淮猪肌肉滴水损失的关联性。[结果]苏淮猪群体肌肉滴水损失为(1.83±0.07)%,变异系数为67.88%。其中,母猪肌肉滴水损失极显著地低于阉公猪。5个候选基因的6个功能位点在苏淮猪群体中均存在多态性。其中,MAMSTR基因rs337473375(C>T)位点C、T等位基因的基因频率分别是0.661和0.339,该位点与猪肉滴水损失极显著关联;RETN基因rs327132149(G>A)位点G、A等位基因频率分别为0.032和0.968,该位点与苏淮猪肉滴水损失无关联;RYR1基因g.1843C>T位点C、T等位基因的基因频率分别是0.967和0.033,该位点与猪肉滴水损失显著关联,CC型为有利基因型;PHKG1基因g.8283位点在苏淮猪群体中未发现遗传多态性,但我们在该位点前一个碱基处发现新的突变rs697732005(A>G)位点,其G、A等位基因频率分别为0.264和0.736,此位点与苏淮猪猪肉滴水损失显著关联,GG型为有利基因型;PRKAG3基因p.Arg200Gln位点在苏淮猪群体中未检测到多态性,但该基因p.Ile199Val位点有多态性,G、A等位基因频率分别为0.834和0.166,且此位点与滴水损失有显著关联的趋势。[结论]综上所述,MAMSTR基因rs337473375位点、RYR1基因g.1843C>T位点和PHKG1基因的rs697732005位点是影响苏淮猪肉滴水损失的候选基因位点,可作为降低苏淮猪肉滴水损失的潜在分子标记。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 徐春瑛1  刘智1  傅颖滢1  李艳1  许晓波2  王厚江3  陈杰1*  
以猪Integrinalpha9(ITGA-9)基因为候选基因,通过相关分析发掘该基因与三元杂种猪滴水损失性状关联的分子遗传标记。采用PCR-SSCP和RT-PCR方法对98头洋三元杂交猪ITGA-9基因第3内含子进行多态性检测,分析其与滴水损失性状和ITGA-9基因表达水平的关系。在ITGA-9基因第3内含子1791碱基处发现c.7698+1791 C>T突变,C和T等位基因频率分别为0.469和0.531。统计分析表明,CC型个体的滴水损失显著低于TT型个体(P<0.05),且CC型个体mRNA表达水平显著低于TT型个体(P<0.05)。ITGA-9基因mRNA表达水平与相应的滴水损失性状...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 徐春瑛  刘智  傅颖滢  李艳  许晓波  王厚江  陈杰  
以猪整联蛋白α9(Integrin alpha 9,ITGA-9)基因为候选基因,通过相关分析发掘该基因与三元杂种猪滴水损失性状关联的分子遗传标记。采用PCR-SSCP和RT-PCR方法对98头洋三元杂种猪ITGA-9基因第3内含子进行多态性检测,分析其与滴水损失性状和ITGA-9基因表达水平的关系。结果表明:在ITGA-9基因第3内含子1791碱基处发现c.158+1731C>T突变,C和T等位基因频率分别为0.469和0.531。统计分析表明,CC型个体的滴水损失显著低于TT型个体(P<0.05),且CC型个体mRNA表达水平显著低于TT型个体。ITGA-9基因mRNA表达水平与相应的滴水...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 周利华  郭源梅  段艳宇  张志燕  杨凯旋  麻骏武  
【目的】通过全基因组扫描,鉴别影响猪肉滴水损失数量性状位点(QTL)。【方法】采用EZ-滴水损失测定法和袋测定法,测定了白色杜洛克×二花脸资源群体884头F2代个体的背最长肌和半膜肌在采样后24和48 h的滴水损失。利用SAS软件分析了6个滴水损失性状间的相关性,以及滴水损失与其它肉质性状的相关性。检测了3个世代个体在19条染色体上194个微卫星的基因型。据此,应用QTL Express在线进行了影响滴水损失QTL的定位分析。【结果】滴水损失在两种肌肉间或两种测定方法间有较高的相关性(r=0.50—0.58,P<0.01)。滴水...
[期刊] 上海海洋大学学报  [作者] 孙建华  鲍宝龙  
对体色相关通路基因的9个错义突变位点进行了测序调查,在体色黑化、体色白化和体色正常的半滑舌鳎小样本群体中,发现其中3个突变位点与体色白化存在显著性相关,进一步通过扩大样本验证,显示B型内皮素受体第160位的C/T位点(ertB-160-C/T)与体色白化呈极显著性相关(P0.05),而在无眼侧皮肤中的表达明显高于有眼侧皮肤(P<0.01)。在白化半滑舌鳎中tyr在有眼侧色素部分和非色素部分的表达水平均显著高于无眼侧(P<0.01)。此外,白化半滑舌鳎中无眼侧alox5的表达水平均显著高于有眼侧(P<0.05),有眼侧白化区alox5的表达水平明显高于有眼侧白色皮肤(P<0.01),首次鉴定出与半滑舌鳎养殖群体体色白化相关的突变位点,为今后半滑舌鳎的体色选育提供了分子基础。
[期刊] 上海海洋大学学报  [作者] 孙建华  鲍宝龙  
对体色相关通路基因的9个错义突变位点进行测序调查,在体色黑化、体色白化和体色正常的半滑舌鳎小样本群体中发现3个突变位点与体色白化存在显著性相关,进一步通过扩大样本验证,显示B型内皮素受体第160位的C/T位点(ertB-160-C/T)与体色白化呈极显著性相关,酪氨酸酶第473的G/A位点(tyr-473-G/A)和花生四烯酸5-脂氧合酶的第1 178位的C/T位点(alox5-1178-C/T)与体色白化呈显著性相关。这3个突变位点分别位于蛋白Periplasmic_Binding_Protein_type1、Tyosinase C-terminal和Lipoxygenase结构域。qRT-PCR检测表明:ertB在白化半滑舌鳎中有眼侧正常和白化皮肤表达没有显著差异,而在无眼侧皮肤的表达显著高于有眼侧皮肤;在白化半滑舌鳎中tyr在有眼侧正常和白化皮肤的表达水平均显著高于无眼侧;白化半滑舌鳎中无眼侧alox5的表达水平均显著高于有眼侧,有眼侧白化区alox5的表达水平明显高于有眼侧正常皮肤。这些与半滑舌鳎养殖群体体色白化相关的突变位点可为今后半滑舌鳎的体色选育提供分子基础。
[期刊] 中国内部审计  [作者] 王雪  
曾经有人问过这样一个问题:"一滴水怎样才能保持不干涸?"有人答道:"把它放到大海里面去!"是啊,滴水汇海,单薄、渺小的一滴滴水珠聚于一处,便汇成了气势磅礴、浩渺无边的大海。如果我是一滴水,内部审计便是那大海。2016年的春天,满怀对未来的憧憬,我荣幸地加入了内部审计这个大家庭,成为一名审计人。从此,"诚信、客观、保密、胜任"是我的职责信仰,"医士、卫士、谋士"是我的角色追求。
[期刊] 中国内部审计  [作者] 王雪  
曾经有人问过这样一个问题:"一滴水怎样才能保持不干涸?"有人答道:"把它放到大海里面去!"是啊,滴水汇海,单薄、渺小的一滴滴水珠聚于一处,便汇成了气势磅礴、浩渺无边的大海。如果我是一滴水,内部审计便是那大海。2016年的春天,满怀对未来的憧憬,我荣幸地加入了内部审计这个大家庭,成为一名审计人。从此,"诚信、客观、保密、胜任"是我的职责信仰,"医士、卫士、谋士"是我的角色追求。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 左北瑶  钱宏光  刘佳森  李蕴华  乌云毕力克  艾肯江  应诗家  王子玉  努尔尼沙  王旭  郭志勤  王锋  
以影响不同绵羊品种产羔数的BMPR-IB、BMP15和GDF9基因作为候选基因,采用连接酶检测反应(LDR)法,检测10个突变位点在德国肉用美利奴羊上的多态性及其对产羔数的影响。结果表明:在德国肉用美利奴羊中未发现BMPR-IB基因的FecB突变和BMP15基因的FecXI、FecXB、FecXL、FecXH、FecXG、FecXR突变及GDF9基因的FecGH(G8)、FecTT突变,但在GDF9上检测到G1突变,该突变处于Hardy-Weinberg平衡状态,达到中度多态水平,但其多态性与产羔数无显著性相关。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 刘璐  苏玉虹  王军  赵会仁  袁志发  
【目的】通过构建整合图谱及Meta分析,利用数学模型整合优化猪肉系水力相关数量性状位点(QTL),并比较已知候选基因与"真实"QTL(MQTL)的位置,分析其相关性,为猪肉系数力的分子标记辅助选择奠定基础。【方法】收集2000年至今发表的猪肉系水力相关QTL信息,以美国肉畜研究中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪遗传连锁图谱为参考图谱,利用BioMercater 2.1软件将已报道的猪肉系水力相关QTL映射到参考图谱,构建新的整合图谱,分析其中存在的QTL簇;对各QTL簇进行Meta分析,将原始QTL整合为"真实"QTL(MQTL);将已知的候选基因促红细胞生成素受体基因(EPOR)、锚...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 刘璐  刘海余  苏玉虹  王军  赵会仁  袁志发  
【目的】通过构建整合图谱和Meta分析,利用数学模型整合与优化猪肉色相关QTL,分析已知候选基因与"真实"QTL(MQTL)的关联性,为肉色性状的分子标记辅助选择奠定基础。【方法】收集猪肉色相关QTL,包括明度系数(L值,MCOLORL)、红度值(a值,MCOLORa)和黄色度(b值,MCOLORb)等指标,利用BioMercator2.1软件,将原始QTL映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪遗传连锁图谱中,构建整合图谱,分析得到QTL簇;对各QTL簇进行Meta分析,定位MQTL;进一步将已知候选基因映射到整合图谱,比较候选基因与各MQTL在染色体上的位置关系,分析其...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 许雪芬  高杰  蒋忠荣  刘曦  赵永华  彭海云  泽丹多吉  郑玉才  
本研究分析了昌台牦牛(Bos grunniens)乳酸脱氢酶-1(LDH1)的遗传多态性。实验提取了80头昌台牦牛基因组DNA,采用PCR-RFLP和新建立的等位基因特异PCR技术,分别对LDH1的H亚基编码基因ldhb的2个突变点进行检测。结果表明,昌台牦牛中检测到2种ldhb G896A基因型(AA、AG),未检测到GG型,其中形成LDH1快带的G等位基因频率为0.1125,且均为杂合型(AG);首次从基因水平上分析牦牛ldhb A689C基因型,观察到AA和AC共2种基因型,其中仅1头牦牛携带LDH1慢带相关的C等位基因,且为AC杂合型。试验结果表明,昌台牦牛ldhb存在与其他牦牛品种类...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 李红霞  陆悦健  王建新  周明国  
克隆了小麦赤霉病菌 (Fusariumgraminearum)、油菜菌核病菌 (Sclerotiniasclerotiorum )、辣椒炭疽病菌 (Col letotrichumgloeosporiodies)和番茄灰霉病菌 (Botrytiscinerea) 4种病原菌的 9个菌株的 β 微管蛋白基因 ,进而与典型模式菌粗糙麦孢霉 (Neurosporacrassa)进行序列比较。结果表明 ,4种病原真菌 β 微管蛋白序列与粗糙麦孢霉具高度同源性 ;油菜菌核病菌、辣椒炭疽病菌和番茄灰霉病菌的 β 微管蛋白 198位氨基酸由Glu突变为Ala ,是导致上述病原菌产生对多菌灵 (MBC)抗药性的...
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 张晴  余海翔  张忠明  
为了阐明豆科植物共生反应与免疫反应的协调机制,揭示参与植物细胞侵染、定殖及固氮过程中根瘤菌基因的功能,以苜蓿中华根瘤菌Sm2011为材料,构建了约8 000株Tn5-sacB转座子插入的突变体库。利用巢式PCR检测技术,从中鉴定和筛选出nodC、nifH、smc01188和smc04024等4个特定目标基因的插入突变体及其插入位点。通过结瘤试验考察突变体共生及固氮表型,结果显示:植株接种smc01188突变体28d后,与对照植株相比,该基因突变导致根瘤固氮酶活下降,与慢生型大豆根瘤菌该基因突变体的表型类似;smc04024基因突变不影响植株生长,根瘤发育基本正常;接种nifH突变体后,植株呈缺氮表型,生长发育受阻,根瘤为白色;接种nodC突变体后植株不结瘤,说明Tn5-SacB的插入导致nifH、nodC基因功能丧失。利用PCR检测、鉴定和分离目标基因突变体是一种行之有效的方法。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 赵秀  朱小龙  何亚文  梁永恒  
[目的]探讨酿酒酵母中磷脂合成相关基因突变对细胞自噬和液泡形态的影响。[方法]通过尼罗红染色观察酵母中磷脂合成相关基因突变后脂滴的形态;用绿色荧光蛋白(GFP)标记细胞自噬蛋白Atg8后,采用荧光显微镜和免疫印迹试验检测突变体细胞自噬的发生情况,并使用荧光染料FM4-64检测液泡形态;此外,检测相关突变体对吩嗪-1-羧酸(申嗪霉素)的敏感性。[结果]在营养有限条件下,酿酒酵母中磷脂合成相关基因突变体中脂滴的大小或数量受到不同程度的影响,但细胞自噬在常规检测条件下正常;其中磷脂酸胞苷转移酶编码基因CDS1突变导致液泡形态异常(碎片化),而其他磷脂合成相关基因突变不影响液泡形态;回补CDS1后,c...
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