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[期刊] 林业科学研究
[作者]
吴元旺 谢佳铭 丛培娟 曹传旺 孙丽丽
[目的]旨在通过虚拟筛选技术筛选Methuselah-like(Ldmthl1)蛋白潜在的小分子抑制剂，并通过分子动力学模拟、MM-PBSA及生物测定，探究潜在化合物对Ldmthl1蛋白的抑制能力，为针对舞毒蛾Ldmthl1研发新型靶向杀虫剂奠定理论基础。[方法]以舞毒蛾为研究对象，构建Ldmthl1同源模型，虚拟筛选Ldmthl1受体小分子抑制剂，并采用分子动力学和MM-PBSA计算结合自由能分析6种潜在小分子抑制剂与Ldmthl1受体的结合强度；通过生物测定分析6种潜在小分子抑制剂的毒力，同时将6种潜在小分子抑制剂与溴氰菊酯进行联合使用，探究6种潜在化合物的增效作用。[结果]Ldmthl1含7个跨膜结构，符合G蛋白偶联受体结构特点，评估后符合蛋白模型评估标准；分子对接获得20个候选化合物，根据结合方式及结合能确定6种小分子化合物为潜在的抑制剂；分子动力学模拟显示，6种潜在小分子抑制剂通过氢键和疏水作用力与Ldmthl1受体稳定结合；MM-PBSA计算结合自由能发现6种潜在小分子抑制剂与Ldmthl1受体结合紧密；致死浓度LC30溴氰菊酯与6种抑制剂按照1:1、1:2和2:1的比例联合使用饲喂舞毒蛾3龄幼虫，6种抑制剂与溴氰菊酯具有协同增效作用，且当混合比例为1:2时，增效作用最显著，但溴氰菊酯浓度过高时，导致抑制剂无增效作用。[结论]虚拟筛选得到6种可与Ldmthl1受体稳定结合且具有杀虫活性潜在小分子抑制剂，与溴氰菊酯联用后呈现增效作用，本研究可为研发Ldmthl1靶向新型杀虫剂奠定理论基础。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
串丽敏 安志装 杜连凤 赵同科 李顺江
【目的】揭示尿素中添加脲酶/硝化抑制剂后,土壤中硝态氮、铵态氮的迁移转化以及淋溶损失规律。【方法】温室土柱淋溶培养试验,研究尿素中单独添加脲酶抑制剂N-丁基硫代磷酰三胺(NBPT)和硝化抑制剂双氰胺(DCD),以及两者配合施用对氮素在土体中淋溶损失的影响。【结果】在施尿素氮600 kg.hm-2条件下,尿素中添加NBPT、DCD以及DCD与NBPT配合施用,均可在24 d之前显著降低淋溶液硝态氮浓度,并在30 d后达到峰值,DCD、DCD与NBPT配合施用的峰值延缓了7 d。整个试验周期中,DCD处理对氮素淋溶表现为较好的抑制效果,NBPT以及DCD与NBPT配合施用,在培养试验后期抑制效果较...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
刘学贵 何文飞 高品一 李丹琦 刘长风
由水稻黄单胞菌(Xoo)引起的水稻白叶枯病通常会给水稻带来严重危害；由于抗生素类药物的广泛使用，Xoo出现了耐药性。细菌通过体内的胱硫醚-γ-裂解酶(CSE)产生内源性硫化氢（H_(2)S）是其增强耐药性的重要方式。为降低Xoo的耐药性，基于分子对接技术，以Xoo体内的CSE为靶标，从68个吲哚类生物碱中虚拟筛选CSE抑制剂。结果显示，化合物1-hydroxyrutaecarpine、indicant和strictosamide对靶蛋白的亲和力分别为-36.40、-35.15和-34.30 kJ·mol~(-1)，均低于参考化合物NL3(-33.89 kJ·mol~(-1))。上述化合物的部分结构均能嵌入蛋白活性空腔并与周围氨基酸产生较为稳定的相互作用。由此推测化合物1-hydroxyrutaecarpine、indican及strictosamide可能会对Xoo体内的CSE产生一定的抑制作用。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
谢天宝 印春生 杨红
海洋生物的多样性、活性物质结构的新颖性以及海洋环境的独特性使得海洋生物成为天然抗肿瘤活性物质的重要来源之一。以分子电性距离矢量(MEDV-13)为结构描述子,应用基于预测的变量筛选(VMSP)方法,对44种海洋Fascaplysin类CDK4抑制剂的活性作用数据进行模拟分析,获得一个6变量的定量结构—活性关系(QSAR)模型,而且对样本内部使用LOO(Leave-One-Out)验证方法、外部通过测试集对模型进行了验证。模型相关系数r=0.923 9,LOO交互检验相关系数q=0.878 9,显示模型具有良好的估计能力和对外部样本的预测能力。随后,计算了模型最优子集各变量对生物活性的碎片贡献率...
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
宋高鹏 刘铭健 王进绅 倪春林 刘叔文
新冠病毒刺突蛋白的S2介导了病毒与宿主细胞的膜融合过程，其氨基酸酸序列在Omicron等变异株中均高度保守，可作为开发新型抗新冠病毒药物的重要靶点。基于此前沿热点课题，该文设计了一类以桦木酸磺酰胺皂苷衍生物为结构骨架的新型小分子Omicron融合抑制剂的综合性实验。以马铃薯三糖桦木酸皂苷1为苗头化合物，利用生物电子等排体原理及基于结构的药物设计方法（SBDD）设计并合成了三个马铃薯三糖桦木酸磺酰胺衍生物T-1、T-2、T-3，利用NMR及HRESIMs对其进行结构表征，并基于S/HIV模型测试了其在细胞水平对Omicron等多种新冠病毒变异株的抑制活性。在此基础上，综合利用表面等离子共振SPR、免疫共沉淀（Co-PI）、细胞-细胞融合实验、分子对接等实验得出该类皂苷分子能够嵌入S1/S2亚基交界处空腔、稳定S蛋白融合前的构象从而抑制病毒入胞，进而表现出广谱抗新冠病毒活性的结论。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
刘鹏 孙丽丽 张琪慧 曹传旺
昆虫小分子热激蛋白(smHsp)是分子质量在1243 k Da、具有分子伴侣活性的应激蛋白,可以在环境胁迫下帮助蛋白质折叠和转运。本文为明确舞毒蛾的smHsp基因特性及对杀虫剂甲萘威胁迫的响应,从舞毒蛾无参照全转录本文库中鉴定获得6个小分子热激蛋白家族基因,全长基因开放阅读框为444567 bp,编码147188个氨基酸,理论等电点为5.586.17。根据分子质量大小分别命名为Ld Hsp17.0、Ld Hsp18.7、Ld Hsp19.1、Ld Hsp20.3、Ld Hsp21.3和Ld Hsp21.4
关键词：
舞毒蛾 smHsp 甲萘威 表达分析
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
孙慧 吴祖建 林奇英 谢联辉
论述了小分子病毒抑制物的结构及对病毒的抑制机理 ,讨论了植物病毒抑制剂研究中存在的问题及研究前景
关键词：
小分子植物病毒抑制物质 结构 抑制机理
[期刊] 世界农业
[作者]
孙艳楠 张清 朱灵珊
文章论述了德国新型硝化抑制剂3,4-二甲基吡唑磷酸盐利用土壤胶体吸附铵离子,控制铵态氮向硝态氮转化的作用机理,减少硝态氮的淋失和氧化氮的排放,提高氮肥利用率。阐明了DMPP的使用效果受气候条件、土壤性状、作物品种、种植季节和氮肥品种的影响。
关键词：
DMPP 作用机理 使用效果
[期刊] 林业科学
[作者]
钱路 安榆林 徐梅 杨晓军 朱宏斌
舞毒蛾是一种食性很广、危害很大的世界性林木害虫,根据其地理分布和生活特性,现在被分为亚洲型和欧洲型2种。对来自俄罗斯远东地区、蒙古、日本、美国和中国5个地理种群,共26份舞毒蛾样品进行AFLP分子标记研究。成功建立并优化舞毒蛾AFLP分析体系,从16对引物组合中筛选出3对扩增条带多、多态检出率高的荧光标记引物组合,利用CEQ-8000遗传分析仪进行毛细管电泳及数据分析,共检测到507个多态性位点。通过PAUP软件对AFLP数据进行UPGM和NJ树的聚类分析以及遗传距离分析,结果表明:5个地理种群舞毒蛾明显分成欧洲型(美国种群)和亚洲型,其中亚洲型又可分成俄罗斯、日本、中国及蒙古3个类群。美国种...
关键词：
舞毒蛾 AFLP 分子标记 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张霄 胡晓丹 仲建锋 武爱华 徐重新 刘媛 张存政 谢雅晶 刘贤金
【目的】利用原核表达小菜蛾（Ｐｌｕｔｅｌｌａ ｘｙｌｌｏｓｔｅｌｌａ）中肠膜结合碱性磷酸酯酶（ｍｅｍｂｒａｎｅ－ｂｏｕｎｄ ａｌｋａｌｉｎｅ ＰｈｏｓＰｈａｔａｓｅ，ｍａｌＰ）并经ｌｉｇａｎｄ ｂｌｏｔ验证其具有与Ｃｒｙ１ａＣ毒素结合的能力；通过同源建模和分子对接研究Ｃｒｙ１ａＣ－ｍａｌＰ的结合模式，预测毒素和受体结合区域及关键氨基酸位点（热点残基），为了解毒素－受体互作机制及分子改造增强Ｃｒｙ毒素活性的研究打下基础。【方法】针对小菜蛾ｍａｌＰ全长设计引物，并以小菜蛾Ｃ ｄｎａ为模板扩增ｍａｌＰ基因，双酶切后用ｔ４连接酶连接至Ｐｅｔ－２６ｂ原核表达载体，将构建的Ｐｅｔ－２６ｂ－ｍａｌＰ载体转化．．．
[期刊] 林业科学
[作者]
赵燕 杨龙 曹露凡 周成刚 罗万春
以舞毒蛾为材料,分离提取酚氧化酶,研究4-己基间苯二酚(4HR)和曲酸对舞毒蛾酚氧化酶活力的影响。结果表明:4HR对该虫的单酚酶和二酚酶活性均表现很强的抑制作用,其IC50分别为0.00041和0.00035mmol.L-1。其中,4HR对单酚酶活力表达的迟滞时间有明显的延长效应,浓度为0.0002mmol.L-1时可使单酚酶活力表达迟滞时间从181s延长到253s;而当浓度为0.0005mmol.L-1时,其迟滞时间则延长至372s。以邻苯二酚为底物时,4HR对二酚酶的抑制作用表现为典型的竞争型抑制类型,抑制常数KI为0.00015mmol.L-1。曲酸对舞毒蛾的单酚酶和二酚酶活性均表现较强...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李晓晗 陈婧 周斌
[目的]线粒体作为重要的能量代谢细胞器，不仅可以调控宿主先天免疫通路影响病毒复制，而且其生物学功能的改变与病毒生命周期密不可分。本文旨在确定抑制日本乙型脑炎病毒（JEV）的线粒体靶向化合物。[方法]通过体外CCK-8、间接免疫荧光、蛋白免疫印迹及RT-qPCR等实验，对382种线粒体靶向化合物抗JEV的效果进行评价，筛选到的敏感药物在小鼠体内进行抗病毒效果验证。[结果] 体外实验证明，丙酮酸钠（Sodium 2-oxopropanoate）、布喹那（Brequinar）及松果菊苷（Echinacoside）三种线粒体靶向化合物对JEV复制有明显的抑制作用；动物实验结果表明，三种药物不仅有效抑制了JEV在小鼠体内的增殖，同时对小鼠的死亡率和体重变化也产生了明显影响，给药组小鼠体重增加明显高于对照组，且死亡率更低，其中以布喹那给药组最为明显。[结论]本研究成功筛选出3种抗JEV的线粒体靶向化合物，为探究线粒体在病毒复制中发挥的作用提供了借鉴，也为抗JEV的临床药物研发提供了新的思路。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
傅丽 苏壮 石元亮 王玲莉 李梦娟 赛丹
通过田间埋袋试验,探讨脲酶抑制剂N-丁基硫代磷酰三胺(NBPT)与不同硝化抑制剂双氰胺(DCD)、3-甲基吡啶-1-1羧酰胺(CMP)和4氨基-1,2,4-三唑盐酸盐(ATC)组合对土壤尿素氮转化的影响。结果表明:添加不同硝化抑制剂DCD、CMP、ATC时,均能不同程度减缓尿素水解,并且可推迟尿素水解5d,增加土壤有效N含量,其中添加硝化抑制剂CMP,对土壤NH4+-N和NO3--含量变化、硝化抑制率和土壤总有效N水平的影响最大。
关键词：
尿素 氮素利用率 脲酶抑制剂 硝化抑制剂
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
孙霜青 贺润娜 王志坤 李春玲 胡松青 王秀民
为拓展分子模拟实验课程内容，设计了该实验教学项目。实验包括泡排体系基础学习、计算模型构建及任务提交、计算结果分析等内容。文章介绍了泡沫体系模型的设计和模拟方法，分别利用CO_2响应型表面活性剂分子十二烷基叔胺（C12A）以及耐盐改性后的分子构建泡排剂体系，对其稳定机理与响应消泡机理进行了分析，并通过不同无机盐研究了高矿化度条件下泡沫体系的各种性能。
关键词：
CO_2智能响应 分子模拟 泡排体系
[期刊] 中国科学技术大学学报
[作者]
何鸿宾 江维
NLRP3是一种重要的胞内模式识别受体,可以与ASC及pro-caspase-1形成炎症小体,促进IL-1β和IL-18等炎性介质的成熟和分泌,从而促进炎症反应.NLRP3炎症小体活化失调与多种人类重大疾病密切相关,如痛风、动脉粥样硬化、神经退行性疾病和2型糖尿病等.因此NLRP3炎症小体是上述疾病的潜在干预靶点,许多NLRP3炎症小体抑制剂对相关疾病表现出良好的预防或者治疗效果.本文对NLRP3炎症小体抑制剂最近的研究进展进行简要综述.
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