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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
赵新春 贾智英 李盛文 李池陶 石连玉
【目的】研究易捕鲤的群体遗传结构，为其优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用奠定基础。【方法】提取９６尾易捕鲤个体的鳍条基因组ＤＮＡ，以其为模板，利用３０对微卫星标记进行ＰＣＲ扩增，根据基因型，利用生物信息学软件对各种遗传参数进行分析。【结果】在９６尾易捕鲤个体中，共检测到１５４个等位基因，每个位点的等位基因数３～９个，平均有效等位基因数为４．０６０ ７；期望杂合度为０．５９６ ９～０．８７１ ０，平均为０．７４０ ０；多态信息含量为０．６２８ ０～０．８５５ ０，平均为０．７０２ ２，说明此品种具有较丰富的遗传多样性；哈迪－温伯格平衡检验结果表明，群体处于不平衡状态；群体平均固定系数为－０．．．
关键词：
易捕鲤 微卫星 遗传结构 保种
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾智英 李飞 李池陶 石连玉
松浦鲤作为鲤鱼的一个培育品种,在我国北方地区的鱼类养殖实践中占有重要地位,为了促进该品种优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用,本研究应用29对多态性较高的微卫星标记对松浦鲤保种群体进行了遗传结构研究。结果显示:在194尾松浦鲤个体中,共检测到166个等位基因,平均有效等位基因数为5.724 1,平均多态信息含量为0.584 9,平均期望杂合度为0.572 2;哈迪-温伯格平衡检验结果群体处于不平衡状态;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为69.8。该研究表明人工选择压力对松浦鲤保种群体造成了较大影响,虽然其仍具有较丰富的遗传多样性,但由于经历了瓶颈效...
关键词：
松浦鲤 保种 微卫星 遗传结构
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张军 赵团结 盖钧镒
【目的】研究中国大豆育成品种总群体的遗传结构分化及其地理生态亚群和育成时期亚群的遗传多样性、特异性及其相互关系,为中国大豆育种主干亲本遴选提供遗传背景依据。【方法】从1923-2005年育成的1300个品种中抽选378份中国大豆育成品种组成代表性样本,选用大豆核基因组64个SSR标记,采用Structure Version2.2软件,进行群体遗传结构分析、亚群体分化分析和遗传多样性与遗传特异性分析。【结果】中国大豆育成品种群体由7类血缘组成,遗传上明显分化为不同的地理生态亚群和育成时期亚群,各有其不同的血缘构成特点;各地理生态亚群具有其特有、特缺和互补等位变异,体现了其遗传来源的相对生态特异性...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李盛文 贾智英 柏盈盈 李池陶 石连玉
应用35对多态性较高的微卫星标记对鲤新品种——松浦红镜鲤(Cyprinus carpio var.songpu red mirror carp)的保种群体进行了遗传结构研究。结果显示,在91尾松浦红镜鲤个体中,共检测到140个等位基因,每个位点等位基因数3~6个,平均有效等位基因数为3.042 6;期望杂合度范围为0.375 0~0.827 4,均值为0.649 3;多态信息含量范围为0.396~0.912,均值为0.586 9;哈迪-温伯格平衡检验结果表明群体处于不平衡状态;平均固定系数为-0.026,说明该群体存在杂合子过剩现象;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计...
关键词：
松浦红镜鲤 微卫星 群体遗传结构 保种
[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘娟 袁林聪 李伟斌 白寿有 李进荣 蔡实旺 尹馨玉 孔令富 武祥伟
杞麓鲤(Cyprinus carpio chilia)是云南特有水产种质资源，为研究杞麓鲤保种群体的遗传结构，本研究开发了15个多态性高的杞麓鲤微卫星(SSR)分子标记，并对保种群体进行了SSR分析。结果显示：杞麓鲤保种群体40个个体的平均等位基因数为7.8个，有效等位基因数为3.2～8.9,期望杂合度为0.696 4～0.900 0,多态信息含量为0.647 6～0.877 0,保种群体遗传多样性水平较高。基于突变模型与等位基因分布均检测到了保种群体的瓶颈效应，近交系数F_(is)为0.249 7,保种群体存在近交现象，并且10个SSR位点偏离Hardy-Weinberg平衡。结果表明杞麓鲤保种群体的遗传多样性较高，但经历了瓶颈效应，不利于继续保种。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
费贵华 盖钧镒 马育华
在南京夏播条件下，研究华南四省区大豆地方品种群体主要农艺和品质性状的遗传特点、选择潜力和性状相关、华南群体具有植株高、粒小、蛋白质含量高、油分含量低、产量低等特点。百粒重、产量遗传变异丰富，选择潜力大；品质性状遗传变异小，选择潜力有限。全生育期是遗传变异中的最主要成分性状，且以全生育期进行的动态聚类分析分成的三类，有按春、夏、秋（冬）品种自然分类的趋势．产量与蛋白质含量负相关，与油分含量无显著相关；蛋白质含量与油分含量无显著相关。
[期刊] 华北农学报
[作者]
张超 佟广香 匡友谊 尹家胜
利用29对多态性较好的微卫星引物对哲罗鱼保种群体332个个体(由4个子代群体组成)进行遗传多样性的分析。结果表明:29对引物扩增的等位基因数为2~13,平均有效等位基因数为3.961 3,平均观测杂合度Ho和平均期望杂合度He分别为0.642和0.675 1,平均多态信息含量PIC为0.633。4个子代群体的遗传多样性趋势为B7(F1♀×野生♂3×3)略高于B10(F1♀×F1♂3×3),B10(F1♀×F1♂3×3)略高于B6(野生♀×野生♂3×3),B9(F1♀×F1♂1×1)最低。4个群体间的遗传距离趋势为:除F1♀×F1♂1×1群体外,野生♀×野生♂3×3群体与F1♀×F1♂3×3群体...
关键词：
哲罗鱼 遗传多样性 微卫星 保种
[期刊] 西南农业学报
[作者]
董飚 孙国波 段修军 秦豪荣 徐琪 乔娜 陈国宏
本文运用10对荧光标记微卫星引物分析了皖西白鹅和豁眼鹅的遗传多样性,采用全自动扫描技术提高试验结果的可信度,经比较品种间等位基因频率、优势等位基因、特有等位基因、群体遗传参数等指标,了解2个品种之间存在的差异,为品种保护和开发利用提供参考资料。结果显示,在10个微卫星座位上,皖西白鹅检测到69个等位基因,豁眼鹅检测到52个等位基因。品种间有些座位优势等位基因是相同的,有些座位优势等位基因是不同的,少数等位基因是品种特有的。皖西白鹅的杂合度为0.6220,多态信息含量为0.5629;豁眼鹅的杂合度为0.5285,多态信息含量为0.4810,表明2个鹅品种都有丰富的遗传多样性。皖西白鹅和豁眼鹅之间...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
鲁云风 王茜 黄文波 史利华 吴克亮
【目的】基于微卫星标记特点,采用计算机模拟技术,探讨畜禽保种群遗传多样性的变化过程。【方法】选择30个均匀分布于基因组、具有4—10个等位基因的标记位点,位点间无相互作用;模拟产生的畜禽保种群公母比例为1﹕5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定,世代间无重叠,群体有效大小分别为Ne=10、20、50、100和200,保种繁殖50个世代,1 000次重复。采用多态性位点数(num-p)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ae)、观测基因杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、稀有等位基因数(RA)、缺乏丰富位点数(NRP)作为遗传多样性度量指标。【结果】保种群体的遗传多样性总体...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
鲁翠云 杜雪松 郑先虎 李超 程磊 孙志鹏 孙效文 陈忠
为了评估金边鲤(Cyprinus carpio var.Jinbian)群体的遗传组成,制定合理的繁殖配组策略,本研究用24个QTL标记分析了金边鲤亲本群体的遗传结构及雌、雄个体间遗传距离。结果显示:在192尾样本中共检测到184个等位基因,群体平均等位基因数(N_o)、有效等位基因数(N_e)、观测杂合度(H_o)、期望杂合度(H_e)和多态信息含量(PIC)分别为7.667、3.941、0.590、0.707和0.670,表明群体处于高度多态水平(PIC≥0.5),具备进一步选育优良品种的遗传潜力。经Bonferroni校正的Hardy-Weinberg平衡检验显示,金边鲤群体有10个位点显著或极显著偏离平衡,多数位点表现为杂合子缺失。在此基础上统计了金边鲤雌、雄个体间的遗传距离在0.1231～1.8563之间,遗传距离呈正态分布,且中间值位于0.7～0.9,占38.36%,结合聚类图将192个个体划分为3个繁殖组,组间呈现出显著的遗传分化,交叉配组能够有效避免近亲繁殖。研究结果为金边鲤选育、繁殖配组及持续利用提供参考。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
辛娜娜 张蕊 徐肇友 肖纪军 王帮顺 周志春
木荷为我国亚热带地区主要的珍贵优质阔叶用材树种和生态防护树种。利用筛选的14对多态性强的SSR引物,对木荷1代育种群体中来自15个产地133个亲本进行遗传多样性分析,为其优异种质资源保存、杂交亲本选配及新种质创制提供科学依据。结果表明:14对引物共扩增86个位点,每对引物检测到的等位基因数(Na)变异范围为2 11个,平均等位基因数(Na)为6.14个,平均有效等位基因数(Ne)为3.23个,平均观察杂合度(Ho)为0.572 0,平均Shannon信息指数(I)和平均Nei’s基因多样性指数(Nei)分别为1.224 7和0.599 0,说明木荷1代育种群体具有丰富的遗传多样性,其中,福建建...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
董在杰 曲疆奇 苏胜彦 梁政远 明俊超 袁新华 谢庄
运用TRAP标记技术,选取10个多态性较好的引物组合对荷包红鲤、黄河鲤、建鲤、兴国红鲤和黑龙江野鲤等5个鲤群体进行遗传多样性分析,其中固定引物是根据目标候选基因GHR基因的序列设计。结果表明,共扩增出168个位点,其中多态性位点134个,平均多态位点比例为80.41%,平均多态性信息含量为0.29。分子变异方差分析(AMOVA)结果显示群体内的方差贡献率达96.97%,表明各个鲤群体内存在较大的遗传变异。种群再分效应固定指数(FST=0.030 26,P<0.05)表明不同鲤群体间有显著的遗传分化。基于目标候选基因的TRAP标记对5个鲤群体进行聚类分析,结果表明建鲤和兴国红鲤首先聚成一类,然后...
关键词：
鲤 TRAP标记 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
单云晶 鲁翠云 李超 张明昭 顾颖 孙效文
本研究通过对5个鲤养殖品种即高寒鲤(Cyprinus carpio Frigid carp)、松浦鲤(Cyprinus carpio Songpu carp)、蓝鳞鲤(Cyprinus carpio blue var)、松浦镜鲤(Cyprinus carpio Songpu mirror carp)和红镜鲤(Cyprinus carpio Red mirror carp)的线粒体COI基因部分序列的测定,比较并分析了其遗传多样性和系统进化关系。在5个鲤品种共100个样本的线粒体COI序列中检测到8种单倍型,其中5个单倍型(H1、H2、H4、H5、H6)涵盖样本较多,占总样本数的94.06%。蓝...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
江锡兵 章平生 张东北 吴仁超 吴剑 吴聪连 赖俊声 龚榜初
[目的]解析控制栗属农艺性状的自然等位变异并获得与其相关联的SSR位点，为分子标记辅助选择和高效育种奠定基础。[方法]以涵盖9个杂交组合的235份栗杂交子代混合群体为材料，采用SSR标记对其进行群体遗传结构和连锁不平衡（LD）分析，并将32个高多态性SSR标记与25个农艺性状进行关联分析。[结果]统计概率P
[期刊] 中国水产科学
[作者]
鲁翠云 张晓丽 顾颖 李超 董在杰 冯建新 程磊 孙效文
用微卫星标记分析了鲤鱼（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ Ｌ．）的２个品种福瑞鲤和豫选黄河鲤选育群体的遗传结构，并揭示了雌雄个体间遗传距离的分布规律。结果表明，２３个微卫星标记在福瑞鲤（Ｆｒ，ｎ＝１９２）和豫选黄河鲤（ｙＸ，ｎ＝９６）中各检测到１６０个和１３１个等位基因。福瑞鲤的平均有效等位基因数（ｎ＿ｅ）、观测杂合度（Ｈ＿ｏ）、期望杂合度（Ｈ＿ｅ）和多态信息含量（ｐｉＣ）分别为４．５５９、０．６９５、０．７４１和０．７０２，群体处于高度多态水平（ｐｉＣ≥０．５）；豫选黄河鲤的４项遗传多样性参数分别为３．６２０、０．６６５、０．６４２和０．６００。虽然豫选黄河鲤同样处于高度多态水平（ｐｉＣ≥０．．．．
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