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[期刊] 西南农业学报
[作者]
王娜 徐嘉翼 叶鑫 隋世江 张鑫 牛世伟
【目的】有效控制土壤氮素损失是维持稻田生产力和降低氮肥施用引发环境污染的重要管理措施。【方法】本文以聚天门冬氨酸钙盐(PASP-Ca)与常规尿素复配为供试材料,利用成对大田施肥试验(尿素-T1和PASP-Ca尿素-T2),研究PASP-Ca尿素对稻田土壤细菌群落及土壤N素硝化作用的影响。【结果】施肥后第3天,NH~+_4-N是影响细菌群落组成的关键环境因子。Nitrosomonadales(亚硝化单胞菌)、Nitrospiraceae(硝化螺旋菌)为T2处理的优势菌,且T2处理的Nitrospiraceae丰度显著高于T1处理,土壤NH~+_4-N浓度较T1处理降低了19.47%。施肥后第5、10天,NO~-_3-N是影响细菌群落组成的关键环境因子。Nitrosomonadales和Nitrospiraceae为T1处理的优势菌,且T2处理的Nitrosomonadales丰度显著低于T1处理,土壤NO~-_3-N浓度较T1处理降低了3.80%～9.58%。【结论】本试验初步表明,PASP-Ca尿素通过调控参与N素硝化的土壤细菌丰度,改变了土壤细菌群落多样性,影响N素的硝化过程,对降低氮素流失风险和提高氮肥利用率具有潜在作用。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
宋宇 王鹏 韦月平
【目的】本文探讨了不同稻田栽培模式下土壤细菌群落组成和多样性的变化。【方法】利用高通量测序技术对河蟹共作稻田(SDHXZ)、非洲雁共作稻田(SDFYZ)和单作稻田(SDKBZ)3种栽培模式表层土壤细菌进行高通量测序及分析。【结果】测序共获得240 070个有效序列,3157个OTU,48个门,115个纲,224个目,391个科,721个属和1343个种。Venn图显示3个处理组共有的细菌OTU数是1525个,SDFYZ特有OUT数最多为357个,SDHXZ的ace指数和shannon指数均高于SDFYZ和SDKBZ,说明SDHXZ土壤细菌多样性和丰富度高于其他2个处理。稻田土壤细菌多样性与pH和氨态氮相关性较大,丰富度则与硝态氮呈正相关。3个处理的优势菌门和优势菌属基本相同。PCoA分析图显示3个处理的土壤细菌群落结构差异较大。【结论】SDHXZ表层土壤细菌群落多样性和丰度最高,具有更好的土壤细菌生态基础。该研究可为合理选择水稻栽培模式提供一定理论支持。
[期刊] 水产学报
[作者]
罗衡 赵良杰 李丰 郭海松 沈竑 刘其根
农业—水产复合生产体系(integrated agri-aquaculture system,IAAS)因其具有良好的生态环境效应及能生产满足市场对食品安全需求的绿色稻米而成为了农业可持续发展的主要方向之一。了解这种农水复合系统中土壤细菌群落结构特征对于种养工艺的改进和生态调控的实现具有重要意义。实验采用高通量测序技术比较稻鳖共作(R-T)和稻田单作(R-M)2种模式下稻田表层和根系土壤微生物的群落结构,旨在为稻鳖种养生态学积累资料和为稻鳖综合种养的生产技术优化提供理论依据。高通量测序结果显示,两种模式下稻田表层及根系土壤中主要细菌门类为变形菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、硝化螺旋菌门和绿弯菌门。与R-M相比,R-T表层土壤中绿弯菌门、硝化螺旋菌门和酸杆菌门的相对丰度增加,变形菌门和拟杆菌门的相对丰度减少;而其根系土壤硝化螺旋菌门、拟杆菌门和变形菌门的相对丰度增加,绿弯菌门和酸杆菌门的相对丰度减少。主要优势菌属为酸杆菌属、亚硝化单胞菌属、硝化螺旋菌属、地杆菌属、芽单胞菌属、黄单胞菌属6类。其中亚硝化单胞菌属、硝化螺旋菌属、芽单胞菌属和酸杆菌属在两种模式的表层土壤中的相对丰度存在显著差异;硝化螺旋菌属和地杆菌属在根系土壤中的相对丰度存在显著差异。引入养殖鳖(R-T)后,稻田根系和表层土壤的细菌Chao指数及Shannon指数均增加。PCA以及聚类分析结果显示,养殖鳖引入后,稻田表层土壤的细菌群落结构产生明显变化,同时也在一定程度上对水稻根系的菌群产生了影响。研究初步揭示了稻鳖共作复合生态系统优于稻田单作系统的微生物生态基础。
[期刊] 林业科学
[作者]
刘方春 邢尚军 马海林 丁延芹 陈波 杜秉海
从6年生冬枣根际土壤中筛选出1株根际促生细菌(PGPR),以发酵鸡粪(DC)为吸附载体制成PGPR生物肥(PF),利用传统的氯仿熏蒸法和现代的T-RFLP技术,从冬枣根际土壤中可培养微生物的数量、细菌群落多样性和微生物量碳的动态变化3个方面,分析PF、普通生物肥料(NF)和DC对冬枣根际土壤微生物特征的影响。结果表明:同NF处理相比,PF处理中的细菌数量和微生物总量显著增加,真菌数量显著减少,但放线菌数量差异不显著。PF处理根际土壤具有较高的丰富度指数、多样性指数和均匀度指数。基于T-RFLP的主成分分析结果表明:PF处理的细菌群落结构成为1个独立的群,NF,DC和CK处理构成1个相对独立的群...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张曼 侯天钰 张应榕 王娟红 陈波浪
【目的】为了解不同磷肥施用量对棉田土壤理化性质及其细菌群落结构的影响，以连续6年不同磷添加的田间定位试验为背景，探讨土壤细菌群落与其理化性质的关系。【方法】试验共设5个处理：0kg/hm~(2)(P0)、75kg/hm~(2)(P1)、150kg/hm~(2)(P2)、300kg/hm~(2)(P3)和450kg/hm~(2)(P4)。测定花铃期棉田土壤含水率、温度、容重、pH、电导率以及有机质等理化指标，运用高通量测序技术分析不同施磷水平0～20cm土层细菌多样性及其结构组成。【结果】施磷可以降低pH和电导率含量，而对土壤容重和含水量均无较大影响；不同施磷水平对土壤有机质含量和温度均产生显著影响，且在P2时达到最高。细菌群落结构中，2个优势菌门为变形菌门和放线菌门，3个优势菌纲为γ-变形菌纲、α-变形菌纲和β-变形菌纲，2个优势菌目为假单胞菌目和根瘤菌目，2个优势菌科为假单胞菌科和慢生根瘤菌科，4个优势菌属为中华根瘤菌属、慢生根瘤菌属、链霉菌属和糖多孢菌属。P2处理的OTU数和Chao1 指数分别为 4702 和 6217.79，均属最高。说明磷添加可以增加土壤细菌群落的丰富度和多样性。具有溶磷作用的 3个门（放线菌门、变形菌门和浮霉菌门）和 2个属（慢生根瘤菌属和链霉菌属）相对丰度随磷肥施入而显著升高。RDA分析结果表明，土壤pH、电导率、有机质和容重与放线菌门呈显著正相关，与变形菌门呈负相关。【结论】与不施用磷肥相比，施用磷肥可显著提高土壤温度、有机质和细菌优势菌群（浮霉菌门、β-变形菌纲、慢生根瘤菌属和链霉菌属）相对丰度，降低土壤pH和电导率。其中，P2处理的土壤温度、有机质和α多样性明显提高，电导率显著下降，能够有效改善土壤生态环境，进而提高土壤肥力。
关键词：
磷肥 棉田土壤 理化性质 细菌群落结构
[期刊] 中国农业科学
[作者]
曹辉 李燕歌 周春然 宁留芳 杨洪强
【目的】根区土壤微生物是影响根系环境的重要因素，炭化苹果枝是废弃果树枝条低氧高温热解产物，研究施用炭化苹果枝对苹果根区土壤细菌和真菌的群落结构及其多样性的影响，为炭化苹果枝的合理应用以及改善果园土壤生物学性状提供理论依据。【方法】在春季，将长势一致的２年生‘富士’苹果幼树（砧木为平邑甜茶）移栽到含有不同质量比（０—４％）炭化苹果枝的盆栽土壤中，于移栽１２０ ｄ后采集土样，提取基因组ｄＮＡ，通过ＰＣＲ扩增建立文库，利用Ｍｉｓｅｑ平台ｉｌｌｕＭｉＮＡ第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学分析土壤细菌１６ｓ Ｒ ＲＮＡ基因Ｖ３＋Ｖ４区域和真菌ｉＴｓ１区域的丰富度和多样性指数以及群落结构。【结果】从．．．
[期刊] 农业现代化研究
[作者]
万宇宸 李树凤 索全义 温增欣 李梦琪
土霉素作为养殖业中常用的一种促生长抗生素，极易在畜禽粪便中残留,直接还田可能对土壤微生物繁殖和作物生长带来潜在威胁。然而，现有研究多集中在高浓度梯度下，未能完全适用于实际生产情况，有必要研究土霉素在实际残留量下对细菌群落多样性的影响，为有机肥的安全施用提供理论依据。本研究设置土霉素添加量0.2 mg/kg，利用高通量测序技术分析细菌群落组成、结构变化和显著富集物种类型。结果表明，随时间推移土霉素显著改变了细菌群落结构，使厚壁菌门、放线菌门的相对丰度增加，增加幅度为1.1%～5.0%；同时，使变形菌门、绿湾菌门和拟杆菌门的相对丰度降低，降低幅度在2.0%以下。与对照组（CK）相比，添加土霉素处理（OCK）中高温放线菌科细菌显著富集。本研究证明了0.2 mg/kg土霉素能改变土壤细菌群落物种相对丰度，导致群落结构差异，并且显著富集了高温放线菌。这为探寻对抗生素污染具有指示作用的微生物提供新思路，并为有机肥的安全施用提供科学依据。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
林耀奔 叶艳妹 刘书畅 杨建辉
为了研究不同农地整治措施对土壤细菌的影响,通过高通量测序技术,对不同农地整治措施下土壤细菌多样性与种群结构进行对比分析。结果表明:(1)从细菌多样性来看,实施农地整治的样点土壤细菌多样性显著提高;(2)从细菌种群结构来看,实施田块归并、平整土地、筑造沟渠以及土壤培肥等措施有效提高了甲基暖菌属(Methylocaldum)、亚硝化单胞菌(Nitrosomonas)、脱硫线菌属(Desulfonema)等有益菌属的丰度;(3)通过与土壤环境因子的相关性分析,酸碱度、铜和铅含量是影响农地整治区土壤细菌多样性与结构的重要因素。该研究证实了农地整治对提高土壤细菌多样性和改善土壤质量的重要作用,也为农地整治工作的开展提供了科学依据。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘魁 杨亚丽 杨继周 王正旭 田阳阳 杨博凯 严杰 吴昊 赵文军
【目的】研究化肥减量配施有机肥对田烟根际土壤细菌群落多样性的影响,为烟区土壤改良及可持续发展提供科学依据。【方法】在等氮条件下设置100%化肥氮、20%有机肥氮+80%化肥氮、40%有机肥氮+60%化肥氮、60%有机肥氮+40%化肥氮4个处理,运用常规分析和高通量测序技术研究不同处理土壤酶活性及细菌群落多样性的变化。【结果】化肥减量配施40%～60%有机肥有利于提高田烟根际土壤脲酶及蔗糖酶活性。而化肥减量配施20%～40%有机肥有利于提高根际土壤细菌群落α多样性指数。在门水平上,变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、酸杆菌门及芽单胞菌门为主要优势细菌门,且变形菌门相对丰度随有机肥用量的增多呈增加趋势。在属水平上,罗思河小杆菌属、Dyella属、unidentified Gammaproteobacteria属及卡斯特兰尼氏菌属相对丰度随有机肥用量的增多呈增加趋势;鞘氨醇单胞菌属及鞘脂菌属相对丰度以化肥减量配施40%有机肥处理最高;各处理Salinimicrobium属和Pontibacter属相对丰度均低于对照。细菌群落相似性分析结果表明:化肥减量配施40%有机肥对田烟根际土壤细菌群落组成变化的影响更为明显。【结论】化肥减量配施有机肥有利于提高田烟根际土壤酶活性及细菌群落多样性,改善细菌群落结构组成,其中以化肥减量配施40%有机肥表现更优。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
熊川 李小林 李强 郑林用
为了解野生羊肚菌的生境,研究其菌塘土壤细菌群落的结构与多样性,运用PCR–DGGE技术,对采集于凉山州冕宁县野生羊肚菌发生地的8个羊肚菌菌塘土样和2个非菌塘土样进行分析。结果表明:羊肚菌菌塘土壤与非菌塘土壤细菌群落的结构差异和多样性差异较大;菌塘土壤的多样性指数(H)和丰度(S)比非菌塘土壤的高;菌塘土壤中Thermosporotrichaceae、Myxococcaceae和Rhodospirillaceae等3科细菌在羊肚菌菌塘土壤中占据优势地位;羊肚菌菌塘土壤细菌多样性程度总体优于非菌塘土壤。
关键词：
羊肚菌 土壤 细菌 群落结构
[期刊] 中国农业科学
[作者]
卜洪震 王丽宏 尤金成 肖小平 杨光立 胡跃高 曾昭海
【目的】土壤微生物在地球化学循环及维持土壤肥力和作物产量方面发挥了重要作用,为了研究长期不同施肥制度对土壤肥力状况的影响,明确施肥制度与土壤微生物的关系。【方法】采用土壤熏蒸和磷脂脂肪酸分析方法,研究了湖南宁乡不施肥处理、施用化肥、常规施肥、秸秆还田、30%有机肥+化肥和60%有机肥+化肥6个长期肥料定位试验的土壤微生物量碳及磷脂脂肪酸。【结果】与不施肥对照相比,施用化肥、秸秆还田及有机肥与化肥配合施用可以显著的提高土壤微生物量碳及总磷脂脂肪酸的量。长期施用化肥后,群落中含有iC15:0的微生物明显增多,长期施用有机肥和秸秆还田后,群落中含iC15:0微生物明显减少,而含aC15:0微生物则显...
关键词：
红壤 施肥 微生物量碳 磷脂脂肪酸
[期刊] 中国农业科学
[作者]
靳振江 邰继承 潘根兴 李恋卿 宋祥云 谢添 刘晓雨 王丹
【目的】通过湖北荆江地区湿地与稻田土壤有机质、微生物多样性及土壤酶活性比较分析,研究在人为培育下水稻土有机碳与微生物特性之间的关系。【方法】在湖北荆江地区采集代表性河流湿地和稻田耕层(0—20 cm)土壤样本,用硫酸-重铬酸钾消煮法和氯仿熏蒸-硫酸钾提取法测定土壤有机碳和微生物生物量碳,用稀释平板菌落计数法和PCR-DGGE研究微生物区系数量和群落结构多样性,并配合比色法测定土壤酶活性。【结果】湿地在长期种植水稻后,土壤有机碳含量提高了55.42%,全氮和碱解氮也大幅度升高。而且,微生物生物量碳提高了180%。尽管细菌、真菌、放线菌和自生固氮菌的丰度与细菌和真菌多样性均未发生分异,但是稻田土壤...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宋亚娜 吴明基 林艳
【目的】基于水稻田间定位试验,利用nirS功能基因研究不同氮肥水平对稻田土壤反硝化细菌群落多样性的影响。【方法】运用PCR-DGGE(聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳)结合DNA克隆测序和荧光定量PCR(Real-time PCR)技术对反硝化细菌nirS基因进行检测,分析田间定位试验第4年不同氮肥水平下稻田nirS型反硝化细菌群落结构和丰度的变化。【结果】依据DGGE图谱计算的群落多样性指数显示,与不施肥对照处理(CK)比较,施用氮肥处理(N1:75 kg N.hm-2,N2:150 kg N.hm-2和N3:225 kg N.hm-2)可促进稻田土壤nirS型反硝化细菌群落多样性指数提高,尤...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
高禾苗 任爱天 张绍聪 袁龙义
【目的】土壤细菌对土壤生态系统功能和健康维持起着重要作用。在了解核桃林土壤细菌群落随林龄的变化规律的基础上，结合土壤因子进一步探究土壤微生物群落与土壤理化性质及土壤酶活性之间的关系。阐明土壤微生物群落变化的驱动因素，为该地区核桃林的高效可持续经营管理提供科学依据。【方法】以不同种植年限（平均年龄8年、50年和100年以上）西藏核桃林为研究对象，基于高通量测序技术，研究不同树龄下土壤微生物组成及多样性的变化，并结合土壤理化因子进一步探究种植年限对土壤微生物群落的影响。【结果】（1）核桃种植年限没有显著影响细菌丰富度，但是古核桃林（100年以上）显著降低了细菌香农指数、优势度指数和均匀度指数。（2）变形菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、芽单胞菌门、黏球菌门、放线菌门、拟杆菌门和绿弯菌门是土壤细菌优势菌门。不同树龄下部分微生物类群的相对丰度差异显著，随着种植年限的增长，土壤放线菌门的相对丰度增加，绿弯菌门的相对丰度降低，此外拟杆菌门的相对丰度呈现先增加后降低的趋势。（3）非度量多维尺度分析结果显示，不同种植年限核桃林土壤细菌群落组成之间存在显著差异。同时，冗余分析表明，土壤硝态氮含量对细菌群落组成影响显著。（4）相关性分析也显示土壤酶和土壤理化性质与微生物多样性以及优势菌门之间存在显著相关关系。【结论】核桃定植年限通过改变土壤理化性质和酶活性，改变了土壤微生物群落的多样性和群落结构，其中古核桃林细菌群落多样性显著降低，加剧了土壤微生态失衡。研究结果为明确不同龄林核桃林土壤微生物群落特征研究提供重要补充。在实际生产中除更新核桃树外，可合理使用无机和有机肥或者微生物菌肥，从而维护核桃林土壤生态系统的稳定。
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