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[期刊] 中国水产科学
[作者]
潘亚雄 陶晋升 张宇 周俊 潘佳琳 唐昭阳 樊轶为 胡名广 李慧菊 黄鑫 褚武英 张建社
镉(Cd)是一种具有高度细胞毒性的重金属,其生物半衰期长,不易降解,水体中即使很低浓度镉也能对鱼类造成较大损伤。过氧化物酶体增殖物激活受体共激活因子1(peroxisomeproliferatoractivatedreceptor-γco-activator-1,pgc1)是一种转录共激活因子,其通过激活PPARγ等转录因子活性而参与一系列基因表达调控,在生物能量代谢、线粒体生物合成、抗氧化等生理过程中起着重要的调控作用。为了阐明鳜(Siniperca chuatsi) pgc1基因序列特征、组织表达及重金属镉胁迫对其昼夜节律性表达的影响,本研究对鳜pgc1α、pgc1β基因启动子顺式调控元件、序列特征、组织表达以及水体镉暴露下鳜脑组织中pgc1α和pgc1β基因表达的昼夜节律进行了分析。结果表明,鳜pgc1α和pgc1β启动子中存在NF-E2、IRF1等能量代谢相关转录因子结合位点, pgc1β启动子上存在节律转录因子KLF9结合位点。鳜pgc1α、pgc1β基因都包含完整的LXXLL基序和RRM结构域,与斑马鱼(Danio rerio) pgc1α和pgc1β基因同源性分别为51.6%和59.7%,与人类基因同源性分别为41.5%和28.4%,序列保守性较低。鳜pgc1α和pgc1β基因表达具有明显的组织特异性,均在脑、肾脏、心脏中特异性表达。自然条件下,鳜脑组织中pgc1α和pgc1β表达具有显著的昼夜节律性,均为昼高夜低的表达趋势,其基因表达峰值相位分别为ZT 7.07 h和ZT 8.25 h。重金属镉胁迫导致鳜脑组织pgc1α和pgc1β基因表达昼夜差异减小,振幅下降,基因表达峰值相位分别提前至ZT3.71h和ZT 5.65 h,表明水体镉暴露对鳜脑组织pgc1α、pgc1β基因昼夜节律性表达具有显著的扰乱作用。
关键词：
鳜 pgc1 组织表达 镉暴露 昼夜节律
[期刊] 水产学报
[作者]
吉红 刘品 李杰 淡荣 杨公社
获得了草鱼过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助活化因子1α(PGC-1α)部分cDNA序列(GenBank注册号为HM015283),并进行了序列同源性分析;采用实时定量反转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)方法,检测了PGC-1α基因在草鱼不同组织的表达状况;研究了投喂高不饱和脂肪酸(HUFAs)对草鱼肝胰脏PGC-1α基因时序表达的影响。结果显示,所获得的草鱼PGC-1α基因部分cDNA序列长度为612bp,与人、牛、小鼠、斑马鱼和金鱼等动物的同源性为75%～97%;该基因在草鱼肝胰脏、肾脏、肌肉、心脏、鳃等10个组织中均有表达,其中在肾脏和心脏中表达丰度最高,在精巢和脾脏中表达丰度最低;草鱼...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
章霞 张莹莹 李蒙 郑尧 王在照
【目的】克隆大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)G蛋白偶联受体30(G protein-coupled receptor30)基因GPR30,研究其在成鱼各组织中的表达状况;用EE2(17α-ethynylestradiol)处理大鳞副泥鳅雌性幼鱼后,检测GPR30、ERαmRNA在幼鱼肝脏和卵巢中的表达状况,探究EE2对雌激素膜受体GPR30和经典雌激素核受体ERα基因表达的影响,推测GPR30可能存在的生理功能。【方法】采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和快速扩增cDNA末端(RACE)技术,克隆大鳞副泥鳅GPR30,对其核苷酸序列及所编码的氨基酸序列信息和进...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李泓江 刘婉 刘大志 钟艺文 谭进 刘小燕
采用荧光定量PCR技术,检测翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)快肌和慢肌中与糖代谢相关的16个基因的表达情况,并比较其表达差异性,分析翘嘴鳜肌肉糖代谢调控特点。结果显示:在快肌和慢肌中,与葡萄糖摄取和磷酸化相关的基因存在显著性差异表达的各有4个;与糖原代谢相关的基因有显著性差异表达的有2个;PI3K、MAPK5、MAPK63个基因在快肌中的相对表达量极显著高于在慢肌中的,表明与这3个基因相关的葡萄糖的摄取和利用快肌强于慢肌;而MEF2α、PGC–1α、PGC–1β、PDK1、MAPK4、GYS1、GSK3β7个基因在慢肌中的相对表达量显著高于快肌,表明与这7个基因相关的葡萄糖的摄取和利用慢肌强于快肌。
关键词：
翘嘴鳜 快肌 慢肌 糖代谢 基因表达
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张真 梁旭方 徐晶 何珊 李姣
以肉食性鱼类翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)为研究对象,对其肽YY(peptide YY,PYY)基因进行鉴定和分析,并通过中枢注射人工合成的鳜PYY多肽,研究PYY对翘嘴鳜摄食量的影响。氨基酸序列多重比对结果发现,sc-PYY与各个物种的氨基酸序列高度保守,鱼类中与狼鲈(Dicentrarchus labrax)、红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)一致性较高;实时荧光定量PCR检测sc-PYY mRNA表达的组织分布,结果显示,sc-PYY mRNA在脑中表达量最高,在肠道、肌肉、眼睛中亦有较高的表达;翘嘴鳜中枢注射PYY后,摄食量在4 h相比于对照组(PBS)显著性下降。这表明PYY可能在减少鳜的食物摄入量中发挥着重要的作用。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
朱鑫 叶苏杭 李源 甘泉 刘帅朋 潘亚雄 包凌晟 陈圆华 褚武英
miRNAs作为一类具有重要调控作用的非编码单链小分子RNA,对生物节律的调控发挥着重要的作用。为探究鳜(Siniperca chuatsi) miR-21的时空表达特征以及短期饥饿对其昼夜节律表达的影响,本研究利用实时荧光定量PCR分析了鳜胚胎不同发育阶段、幼鱼不同组织以及饥饿5 d后鳜白肌中miR-21的表达特征。结果显示,在胚胎发育的早期可以检测到较高水平的miR-21,随着胚胎的发育其表达逐渐降低,至原肠胚早期仅能检测到少量miR-21; miR-21在原肠胚后的表达有所提高,但除尾芽期和心搏期外其余各阶段表达量无显著性差异; miR-21在所检测的组织中均有表达,其中在心、肠和红肌中具有较高水平的表达;正常投喂时,鳜白肌中miR-21的表达具有昼夜节律性,为昼低夜高的节律性振荡;饥饿5d后,miR-21的表达虽仍具有昼夜节律性,但其中值、振荡幅度、峰值相位等都受到了明显影响;靶基因预测分析显示Arntl2 mRNA的3′UTR序列有miR-21结合的靶位点,且荧光定量PCR的结果显示Arntl2的表达趋势在饥饿5 d后与miR-21的表达趋势相反。结果表明, miR-21呈母源性表达,在神经胚后表达开始上升说明miR-21可能参与调控神经胚后的器官形成; miR-21在不同组织中的表达无明显组织特异性,但在心、肠和红肌组织中可能有重要功能;饥饿胁迫能够影响miR-21在鳜白肌的节律性表达,并且miR-21可能通过调控昼夜节律基因Arntl2参与鳜的节律性调控从而影响鳜肌肉的生长和逆境胁迫下的生理功能。
[期刊] 水产学报
[作者]
卢荣华 杨峰 孙君君 谢帝芝 秦超彬 杨丽萍 郑文佳 聂国兴
为探讨过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子-1β基因在草鱼能量代谢中的作用,本研究克隆了草鱼PGC-1β基因的核心序列,并对其进行了生物信息学分析;利用Real-time PCR技术检测了PG C-1β在不同组织中的表达状况;同时研究了饥饿、饥饿再投喂及高糖(糖含量45%)高脂(脂含量8%)饲料对草鱼肝脏PGC-1β表达的影响。结果显示,所获得的草鱼PGC-1β基因部分c DNA片段长为885 bp(Gen Bank登录号:KM580493.1),共编码293个氨基酸,与斑马鱼的同源性为81%;该基因在脑中的表达量最高,肠和肝脏次之;与正常投喂组相比,饥饿(7 d)导致PGC-1β在肝脏中的...
[期刊] 水产学报
[作者]
宋美泽 黎明 李健 袁莉霞 王日昕 石戈
为研究急性氨氮胁迫对大弹涂鱼炎性反应相关基因表达的影响,实验挑选初始体质量为(15.14±0.05) g的健康大弹涂鱼幼鱼180尾,进行96 h的急性氨氮胁迫实验。结果显示,大弹涂鱼96 h氨氮半致死浓度为8.99 mg/L总氨氮(0.11 mg/L非离子氨,T-AN);氨氮胁迫后TNF基因的mRNA表达量分别于12和96 h时显著上调,96 h时表达量达到0 h时的2倍;IL-1基因的mRNA表达量12 h时显著上调,为0 h时表达量的6倍;氨氮胁迫后IL-6基因的mRNA表达量分别于12和96 h时显著上调,表达量达到0 h时的1.5倍;氨氮胁迫后IL-8基因的mRNA表达量在24 h时出现显著下调。研究表明,大弹涂鱼96 h氨氮半致死浓度为8.99 mg/L总氨氮;半致死浓度的氨氮胁迫48 h后,TNF、IL-1、IL-6和IL-8基因的mRNA表达量持续升高,推测过度炎性应激可能是导致鱼类氨中毒死亡的原因之一。
关键词：
大弹涂鱼 氨氮 基因 促炎性因子
[期刊] 水产学报
[作者]
俞菊华 戈贤平 唐永凯 刘波
使用实时定量RT-PCR测定了摄食无糖(脂肪9.13%,蛋白63.38%)、高糖(糖23.93%,脂肪9.94%,蛋白40.53%)、低脂(中糖)(脂肪9.92%,糖14.45%,蛋白50.14%)、高脂(脂肪19.93%,糖14.98%,蛋白40.88%)饲料的翘嘴红鲌在摄食后0、3、6、12、24hPEPCK的表达水平。结果显示,饲料中糖含量一致的情况下,高脂组和低脂组翘嘴红鲌PEPCK的表达差异不显著;脂肪水平一致时,高糖(23.93%)和中糖(14.45%)饲料组翘嘴红鲌PEPCK的表达,除了在0、3h时高糖组显著高外,6、12、24h没显著差异,但12、24h高糖组PEPCK相对较低...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
罗小华 刘臻 肖克宇 张建社 梅秋兰 房志家 鲁双庆
根据GenBank上大眼鳜生长激素cDNA序列(收录号:AY155227)设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术从翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)脑垂体中克隆了生长激素基因(scGH)编码区序列并对其真核表达载体的构建进行了研究。结果显示:扩增片段全长615 bp,共编码204个氨基酸。该序列与GenBank上大眼鳜生长激素cDNA序列同源性为99.84%。将scGHcDNA序列定向插入pYES2/CT真核表达载体中,经过筛选、酶切和测序,证明重组子中确实插入了翘嘴鳜GH片段。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
陈璐 杨臻 徐锦华 乔璐 宋金龙 孙慧武 穆迎春
除虫脲(diflubenzuron， DFB)是一种常用的杀虫剂，其代谢物残留会威胁水生动物及人体健康。为探究水产动物响应DFB胁迫的分子机制，本研究以鲤(Cyprinus carpio)为对象，选定0.1 mg/L和1.0 mg/L的药浴浓度对鲤进行15 d暴露实验。采用RNA-Seq技术对肝脏开展转录组测序，以P_(adj)
关键词：
鲤 除虫脲 肝脏 转录组学 毒理
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李创举 宋明月 岳华梅 阮瑞 叶欢 杨晓鸽
实验克隆了兴国红鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ ｖａｒ ｓｉｎｇｕｏｎｅｎｓｉｓ）雄激素受体（ａｎｄｒｏｇｅｎ ｒｅＣｅｐｔｏｒ，ａｒ）基因的全长Ｃ ｄｎａ序列和卵黄蛋白原（ｖｉｔｅｌｌｏｇｅｎｉｎ，ｖｔｇ）基因的部分Ｃ ｄｎａ序列，并对雌性个体组织及甲基睾丸酮（Ｍｅｔｈｙｌｔｅｓｔｏｓｔｅｒｏｎｅ，Ｍｔ）暴露下幼鱼肝胰腺（以下简称：肝）中ａｒ和ｖｔｇ的表达进行检测。兴国红鲤ａｒ基因Ｃ ｄｎａ全长３ ２２９ ｂｐ，包括１０４ ｂｐ的５＇非编码区（ｕｎｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｒｅｇｉｏｎ，ｕｔｒ）、编码８４６个氨基酸的２ ５４１ ｂｐ开放阅读框（ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａＭｅ，ｏｒｆ）．．．
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李育媚 廖永冠 鲍宝龙
2-甲基异茨醇（2-methylisoborneol， 2-MIB）是由多种放线菌土壤生物、蓝细菌等产生的一种挥发性有机物，在水体中广泛存在。为探究2-MIB对鱼类会产生哪些影响，本研究将斑马鱼饲养在2-MIB浓度为42 ng/L的水中24 h后，进行鳃组织的转录组测序分析，发现2-MIB处理组中有163个基因显著上调，565个基因显著下调。KEGG通路富集显示氧化磷酸化相关的生化过程上调，而免疫相关信号通路发生下调，RT-qPCR进一步显示，2-MIB显著上调氧化磷酸化相关基因ndufb7、mt-cyb、mt-nd4、mt-nd6、mt-co2和mt-atp6的表达，而Toll-like receptor signaling pathway相关免疫基因rela、cd40、ikbkb、mapk8b、mapk3、ripk1l显著下调。2-MIB暴露后，鳃和肝脏组织中超氧化物歧化酶SOD活性升高。本研究表明2-MIB会提高斑马鱼氧化磷酸化水平，同时降低Toll样受体信号通路相关基因的表达。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
孙丰坤 周姗 李蕾蕾 詹亚光 曾凡锁
［目的］探究白桦生物钟基因运行机制及在生长发育、胁迫应答中的作用。［方法］运用生物信息学方法对白桦ＢｐＬＨＹ、ＢｐＴＯＣ１、ＢｐＧＩ节律基因进行分析，预测其编码蛋白的结构功能。利用ＲＴ－ｐＣＲ方法检测白桦ＢｐＬＨＹ、ＢｐＴＯＣ１、ＢｐＧＩ基因昼夜表达模式，在非生物胁迫重金属Ｃｄ、低温（４℃）、与盐（Ｎａ ＣＬ）及信号诱导Ｓａ（水杨酸）、ＳＮｐ（硝普钠）下的表达情况。［结果］白桦ＢｐＬＨＹ、ＢｐＴＯＣ１、ＢｐＧＩ节律基因编码的均为疏水性非分泌型，具有跨膜能力的ｍＩｘｅｄ蛋白。白桦ＢｐＴＯＣ１、ＢｐＬＨＹ基因表达量均呈现白天低夜晚高的昼夜变化模式，而ＢｐＧＩ表达量则表现出白天高夜晚低的模式。在重金．．．
关键词：
白桦 节律基因 生物信息学 非生物胁迫
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
上官宵兆 刘美玲 毛颖睿 王晓强 王雅昱 汪桂玲 李家乐
本实验通过RACE技术、实时荧光定量（qRT-PCR）技术，原位杂交和17β-雌二醇注射来探究17β-HSD11基因在三角帆蚌性腺发育和性激素合成中的表达特性和作用。结果显示17β-HSD11基因的cDNA全长为1134 bp， 其中5' UTR 40 bp，开放阅读框（ORF）923 bp，3' UTR 171 bp，编码307个氨基酸。17β-HSD11基因在肝胰腺、性腺中表达量较高，且卵巢极显著高于精巢（P < 0.01）。原位杂交结果显示雌性三角帆蚌卵母细胞、滤泡膜和卵膜上均存在杂交信号。注射不同浓度17β-雌二醇之后发现17β-HSD11基因在雌雄性腺中的相对表达量均被抑制，其中低浓度注射后，17β-HSD11基因的表达量在卵巢中下降33.38%，在精巢中下降37.74%。而高浓度注射后，17β-HSD11基因的表达量在卵巢中下降57.78%，在精巢中下降61.31%。由此推测17β-HSD11可能与三角帆蚌性腺发育和雌激素合成相关。
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