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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张朋振 薛琳琳 杨小进 范收武 李旺
【目的】从自然环境中筛选、鉴定高效降解羽毛细菌,并通过转录组学筛选该菌株中差异表达基因(DEGs),以探明其降解羽毛的分子机制。【方法】利用梅花桩采样法采集长期堆放羽毛的土壤,利用羽毛发酵培养基筛选分离可高效降解羽毛的细菌,对其进行形态学描述和分子生物学鉴定。以筛选菌株为研究对象,将其分别接种于羽毛发酵培养基(试验组)和LB培养基(对照组)中,培养36 h后收集2个处理组菌体进行转录组测序,之后对试验组与对照组中DEGs进行筛选,利用GO功能注释和KEGG富集分析对DEGs进行注释,探索DEGs在羽毛降解菌降解过程中起关键作用的功能和通路。【结果】筛选得到1株高效降解羽毛的菌株XS6,培养24 h后其能将羽毛发酵培养基(羽毛10.0 g/L)中羽枝降解97%,角蛋白酶活性为201.2 U/mL;且培养36 h后,在培养基中检测到了亚硝酸盐。经形态学和分子生物学鉴定,菌株XS6为白色芽孢杆菌。转录组测序结果表明,在2个处理组之间共筛选出655个DEGs,其中表达上调基因148个,表达下调基因507个。GO功能注释结果显示,DEGs注释到3大类32个功能组中,其中与代谢过程、细胞过程、细胞、细胞部分、催化活性有关的基因注释较多。KEGG富集分析结果显示,DEGs主要在能量和物质代谢途径、信号传导途径、生物合成途径富集。【结论】成功获得了1株高效降解羽毛的白色芽孢杆菌XS6,其在降解羽毛过程中参与了菌株间的协同作用、能量代谢以及生物大分子物质的合成。
关键词：
羽毛降解 降解菌 转录组学 降解机制
[期刊] 西南农业学报
[作者]
季金殿 岳寿松 黄亦钧 游银伟 尤生波 葛海涛 牛钟相
从长期堆积羽毛废弃物的土壤中分离到1株高效降解羽毛角蛋白的菌株JJD-1,该菌株能在以羽毛为唯一碳氮源的培养基上生长。克隆了该菌的16S rDAN序列(GenBank接受号:FJ765512),并以其同源性为基础构建了相关属种的系统发育树。结果表明,16S rDAN序列全长1489 bp,BLAST显示该菌株与微杆菌属同源;JJD-1菌株在进化关系上也与微杆菌属(Microbacterium)聚成一族。特别是与Microbacteriumsp.YK18的同源性最高,其序列相似性达99%。结合形态学、生理生化特征,将其鉴定为微杆菌属,命名为Microbacteriumsp.JJD-1。该研究结果...
关键词：
羽毛角蛋白降解菌 鉴定 系统发育分析
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
柯野 谢天涵 梅颖诗 张敏 黄湘 屈奇奇
从羽毛废弃物的排水沟污泥中采集污泥样品,通过富集培养、分离、纯化、发酵筛选,获得一株降解羽毛效果最佳的RM菌株.对该菌株进行形态特征、16S rDNA序列以及生理生化试验初步鉴定RM菌株为Deinococcus actinosclerus.该菌株在4%羽毛含量条件下,培养7 d后对羽毛的降解率高达60%,且羽毛水解产物含有多种氨基酸,如丝氨酸、天冬氨酸.RM菌株产生的胞外蛋白酶以丝氨酸蛋白酶为主,也含有天冬氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶.粗酶液最适反应温度为45℃,最适pH为10.0;金属离子Cu~(2+)、Mg~(2+)能够提高蛋白酶活性,而Ca~(2+)、Ni~(2+)、Zn~(2+)及蛋白酶抑制剂苯甲基磺酰氟、乙二胺四乙酸、亮抑蛋白酶肽对酶活性有抑制作用.通过以上结果可知,RM菌株对羽毛的高效降解具有较高的潜在应用价值.
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张晋龙 马怡茗 舒伟学 李晓霞 柯欣 颜华 贾良辉
【目的】建立羽毛降解杆状链霉菌（Streptomyces bacillaris）S-28的遗传转化系统，并对其进行优化，为该菌株的遗传改造奠定基础。【方法】以大肠杆菌-链霉菌穿梭整合型质粒pSET152为出发质粒，大肠杆菌(Escherichia coli)S17-1/pSET152为供体，羽毛降解杆状链霉菌S-28孢子为受体进行接合转移试验,并对影响接合效率的培养基种类、MgCl2浓度、热激温度、预萌发时间、供受体比例和接合转移时间等要素进行优化。【结果】 确定筛选羽毛降解杆状链霉菌S-28菌株接合转化
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
蔡曼 杨蕾蕾 周宇光
为获得可用于石油、农药污染生物修复的高效烃降解菌，以高黏度的超稠油为唯一碳源，从大庆油井采出液中分离和筛选烃降解菌，并通过残油族组分及全烃组分的分析，拟阐明这些菌株的烃降解特性。结果表明：菌株Ｈ１１和Ｗ１４对黏度为普通稠油３０倍的超稠油有良好的乳化分散能力，经１６ＳｒｒＮＡ基因序列比对分析，初步鉴定这２菌株均为铜绿假单胞菌ＰＳｅｕｄｏｍｏＮＡＳ ＡｅｒｕｇｉＮｏＳＡ，接种这２菌株后，培养液中稠油的饱和烃相对含量均降低２０％以上，其中接种菌株Ｈ１１后，沥青质的相对含量也降低５％；同时，Ｈ１１和Ｗ１４对长链烃类的降解范围较广，分别最高可作用至Ｃ２６和Ｃ２８碳链长度的化合物，并对烃组分有代谢利用选择．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王彦辉 杜良伟 李红红 封国君 罗韬
以功夫菊酯为目标，从生产拟除虫菊酯农药厂污水处理口的淤泥里筛选高效降解真菌，并对降解菌进行鉴定和降解特性研究。经形态学和１８Ｓ ｒＤＮＡ测序鉴定，该高效降解真菌为青霉菌（ＰｅＮｉｃｉｌｌｉｕｍ ＳＰ．）。采用色谱法对降解特性进行研究，结果表明：在ＰＨ＝７．０，温度３０℃，底物浓度５０ ｍｇ／ｌ时降解效果最好，７ Ｄ时对功夫菊酯降解率达到８３．９０％；该菌株还可降解溴氰菊酯、高效氯氰菊睹。
关键词：
功夫菊酯 生物降解 青霉菌 降解特性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
景岳龙 朱凤晓 王军玲 呼世斌 秦宝福 张磊
【目的】筛选高效降解联苯菊酯菌株,为环境中联苯菊酯的生物修复提供菌种资源。【方法】采用室内培养法,从湖南某农药厂下水道污泥中,以联苯菊酯作为唯一碳源进行摇瓶培养筛选,以降解率作为评价指标确定高效菌株,根据生理生化特性和16SrDNA对菌株进行鉴定,并对降解的最佳温度、pH、接种量和联苯菊酯质量浓度进行了筛选。【结果】获得1株革兰氏阴性好氧杆状菌,经鉴定为戴尔福特菌(Delftiatsuruhatensis),命名为HLB-1。在pH7.0、30℃、接种量100mL/L、120r/min的条件下培养5d,菌株HLB-1对200mg/L联苯菊酯的降解率可达74.5%。获得的高效降解联苯菊酯菌株,其...
关键词：
联苯菊酯 生物降解 生物修复 戴尔福特菌
[期刊] 西南农业学报
[作者]
朱友峰 岳寿松 宋爱荣 游银伟 尤升波 王翠萍
利用硫酸铵分级沉淀和交联葡聚糖G-100凝胶柱纯化了高效降解羽毛的嗜麦芽窄食单胞菌YHYJ-1所产角蛋白酶,纯化的角蛋白酶,经SDS-PAGE蛋白电泳分析,分子量为48.3 kda。结果表明,该酶最适反应温度和最适pH值分别为50℃和9.0,30～40℃具有较好的温度稳定性,60℃酶活下降很快;在pH 7.0～9.5的范围内具有较好的稳定性。金属离子Ni2+、Zn2+对角蛋白酶具有明显抑制作用,Cu2+、Fe2+、Fe3+能完全抑制酶活;1%巯基乙醇对酶具有明显激活作用。EDTA和PMSF对该角蛋白酶几乎完全抑制,可判定该酶是丝氨酸金属蛋白酶,是一种新的蛋白酶。
关键词：
角蛋白酶 嗜麦芽窄食单胞菌 性质 纯化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
薛琳琳 张朋振 杨小进 范收武 李旺
【目的】筛选高效实用的玉米赤霉烯酮(ZEN)降解菌株,并初步探究其降解机制及降解效果。【方法】以ZEN为唯一碳源,从发霉饲料和土壤样品中筛选菌株,通过形态学观察、16S r DNA测序分析对菌株进行鉴定;以培养时间为变量对菌株生长速率和ZEN降解率进行相关分析;通过测定菌株不同活性成分及失活处理后的ZEN降解率对降解活性物质进行初步分析定位;对比探究硫酸铵沉淀法(硫酸铵饱和度分别为30%,40%,50%,60%,70%和80%)和单宁-聚乙二醇法(单宁质量浓度分别为2,5,10,15和20 mg/m L;聚乙二醇质量浓度分别为6,8,10,12和14 mg/m L)对粗降解酶的提取效果;通过SDS-PAGE凝胶电泳测定目标活性蛋白的分子质量,最后以菌株和粗酶液调节霉变玉米粉的水分质量分数,测定ZEN的降解效果。【结果】筛选得到试验菌株XJ-140,经鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens),该菌在培养24 h时可降解93.75%的ZEN(2μg/m L)。菌株XJ-140以胞外酶降解ZEN为主,同时辅以细胞壁吸附。硫酸铵沉淀法(硫酸铵饱和度60%)和单宁-聚乙二醇法(最优单宁质量浓度为10mg/m L,最优聚乙二醇质量浓度为10 mg/m L)提取粗降解酶的ZEN降解率分别为37.14%和51.49%,单宁-聚乙二醇法提取效果更优。初步推断目标活性蛋白的分子质量在61 ku或28 ku。此外,菌株XJ-140的发酵液和粗酶液均能够降解霉变玉米粉中的ZEN。【结论】筛选的菌株XJ-140通过胞外酶降解ZEN,实际应用中对ZEN污染的玉米粉有一定清除效果。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
孔雯 先锋 李长影 王家昕 李晓华
以烟碱为唯一碳源,从湖北省襄樊烟草种植地中分离得到1株烟碱降解菌,命名为DBA5。经常规的形态观察、生理生化分析和16S rDNA序列同源性分析,初步鉴定该菌株为烟碱节杆菌属(Arthrobacter nicotianae)。当烟碱质量浓度为4.0 g/L时,培养48 h烟碱降解率为93.32%,生长旺盛。当烟碱质量浓度为5.0g/L时,培养48 h烟碱降解率为65.10%。当烟碱质量浓度高于6.0 g/L时,DBA5菌株生长和烟碱降解均呈下降趋势,烟碱降解率低于7.56%。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
熊焰 刘力源 罗睿 朱欢
从养殖水体中筛选出1株对亚硝酸盐具有高效降解能力、增殖速度快、稳定和安全的优良菌株,经细菌学常规检测和16SrRNA序列分析确定为巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium),并命名为SZ-3。对SZ-3菌株降解条件的单因素实验发现,其最佳降解条件是:pH7.0,温度33℃,降解所需的最低葡萄糖含量为0.01mg/L,在24h内对亚硝酸盐的降解率达69.58%。在亚硝酸盐质量浓度为5mg/L的100L污染水体养殖实验中,添加1000mL含量为1×108CFU/mL的SZ-3培养菌液离心后的纯菌体,在28℃的水温条件下经96h,SZ-3菌株对亚硝酸盐的降解率可达91.78%。表明该菌株...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
陈颖曦 柏连阳 曾爱平 周小毛 宋杰辉 王彦辉 刘二明
从湖南瑞泽农药厂污水池中筛选到1株吡嘧磺隆降解菌DF12,经形态学、生理生化及16S rDNA鉴定为恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida),该菌在100 mL三角瓶中摇瓶体积70 mL、接种量2.0%(OD600=0.80)、pH7.0条件下对吡嘧磺隆降解率可达74.78%。
关键词：
吡嘧磺隆 假单胞菌属 降解特性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
解林奇 刘君 高淼 徐晶 周义清 孙建光
【目的】筛选具有降解多菌灵功能的菌系和菌株,了解菌系构成和菌株的系统发育地位,确定实验室条件下菌系和菌株对土壤中多菌灵的降解效果。【方法】采用无机盐培养基富集、筛选降解多菌灵菌系及菌株,比色法测定菌系及菌株降解多菌灵能力,变性梯度凝胶电泳(DGGE)结合切胶回收测序分析菌系构成,16S rDNA序列分析结合细菌常规鉴定方法对菌株进行初步鉴定。【结果】筛选到9个菌系,纯培养条件下10 d对初始浓度600mg.L-1多菌灵降解率23.14%—70.64%;从5个降解菌系中筛选到5株降解菌,编号为111-3、161-4、165-2、166-2、167-4,纯培养条件下15 d对初始浓度600 mg....
关键词：
多菌灵 降解 细菌 筛选
[期刊] 西南农业学报
[作者]
余瑛 郭志龙 卫泽峰 罗微 黄伟九 陈波水
从重庆地区受润滑油污染的酸性土壤中筛选润滑油降解菌,采用形态学和16 srDNA分析鉴定其分类地位,研究它们以润滑油作为唯一碳源的生长能力,并对其烷烃羟化酶基因(alkB)进行了PCR分析。从污染的土壤样品中分离出11株细菌。用酶法检测和干重法检测发现9株细菌均能分解利用润滑油,16 srDNA分析表明这些菌分属Pseudom onas,Cupriavidus,Bacillus,Acine-tobacter,Stenotrophom onas。对这些菌株的PCR分析发现其alkB基因扩增片段大小介于160和400 bp之间。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
胡秀虹 黄剑
为筛选阿维菌素降解菌以提供农药污染物修复的依据,利用富集培养法从长期施用阿维菌素农药的土壤中分离得到1株阿维菌素降解菌,标记为AW1-12。采用高效液相色谱法对该菌株的阿维菌素降解能力进行测定。结果表明:当接种量为2.5%时,该菌株在含100 mg/L的阿维菌素无机盐基础培养液中,30℃,150 r/min,pH=7的条件下摇床培养9 d后,对阿维菌素的降解率达80%,而第6天为菌株的最佳培养时间。根据形态、生理生化和16S rRNA序列分析,初步鉴定菌株AW1-12为Ochrobactrumhaematophilum AW1-12。
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