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[期刊] 中国水产科学
[作者]
强光峰 杨国梁 陈雪峰 孔杰 夏正龙 高强 罗坤 栾生
精确地估计加性和显性遗传效应,可以提高选择准确度和加速遗传进展。本研究构建了343个罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)G7G9育种群体全同胞家系(半同胞家系244个),测定了29523尾个体的收获体重。基于单性状动物模型,利用平均信息约束最大似然法(average information restricted maximum likelihood method,AIREML)估计了G7、G8、G9和G8+G9 4个数据集收获体重的方差组分。分析时采用了两种模型:(1)加性遗传效
[期刊] 水产学报
[作者]
周晓敏 戴习林
罗氏沼虾因其自身的生长优势，已成为我国重要的养殖虾类，为保证其养殖的持续健康发展，对其进行遗传多样性分析。利用罗氏沼虾性腺组织转录组测序结果，参考NCBI数据库，选取60个SNP位点，以马来西亚野生群体（MW）为样本采用直接测序技术进行位点多态性检测，得到25个（41.7%）具有二等位基因位点。并对罗氏沼虾上海（SH）、浙江（ZJ）、马来西亚养殖群体（MF）、生长快品系选育群体（BG）及MW群体5个群体的150尾个体进行遗传多样性分析，其观测杂合度H_(o)和期望杂合度H_(e)的分布范围分别为0.18～0.30和0.28～0.37，平均多态性信息含量值依次为0.29、0.24、0.21、0.26、0.33，表现为中低等多态水平；群体间的遗传相似性系数和遗传距离变化范围分别为0.659～0.968、0.032～0.417，MF群体和BG群体遗传相似系数最小、遗传距离最大，SH群体和ZJ群体遗传相似系数最大、遗传距离最小；遗传分化指数和基因流的范围分别为0.045～0.363和0.440～5.293，MF群体和MW群体之间出现最高值，SH群体和ZJ群体出现最低值，SH群体和ZJ群体基因流最高，MF群体和MW群体最低；AMOVA分子方差分析显示，遗传变异主要来源于群体内，群体间的变异为26.33%。5个群体近交系数为0.151～0.342，3个养殖群体的平均近交系数均高于野生群体，对25个位点在5个群体中的基因型统计分析，有9个位点处BG群体的基因型与其他3个养殖群体基因型分离方向相反，有14个位点处3个养殖群体较MW群体，杂合个体频数普遍降低。研究结果为进一步开展罗氏沼虾遗传育种研究及保护政策的制定提供了参考。
关键词：
罗氏沼虾 SNP 直接测序法 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张海琪 何中央 徐晓林 李明云 杜建明
采用形态学方法、同工酶电泳技术和DNA分析方法对罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii DeMan)缅甸野生群体(BNP种群)和浙江省养殖群体(ZCP种群)的遗传多样性进行比较分析。结果表明,两种群在外形、体色、生长等方面存在一定的差异;对罗氏沼虾11种酶的25个基因位点进行分析,得出BNP种群和ZCP种群的同工酶分析所得出的多态位点比例及平均杂合度分别为12％和:16％,0.0431和0.0501。根据同工酶的基因频率计算得两种群的遗传相似系数为0.9963,遗传距离为0.0037;22个经筛选的10bp随机引物共检测到139个RAPD位点,BNP种群的多态位点比例和遗...
关键词：
罗氏沼虾 遗传多样性 同工酶 RAPD
[期刊] 淡水渔业
[作者]
朱皓东 宫金华 马克异 陈焕根 李家乐 冯建彬
本研究测定了罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)缅甸野生、泰国和越南养殖群体共109尾个体的全长、体长和体重等10个形态性状，综合运用相关分析法、通径分析法和回归分析法分析野生和养殖群体主要形态性状对体重的影响。结果显示：3个群体体重的变异系数均较大，显示出较大的选育潜力，其中缅甸野生群体选育潜力最大。除第2腹节长外，群体间其他形态性状的变异系数均是缅甸野生群体最大，越南养殖群体最小，形态性状存在显著的群体差异。缅甸野生群体的头胸甲宽、第2腹节长和第2腹节宽对体重的通径系数达到极显著水平。泰国养殖群体的全长、头胸甲宽和第2腹节长对体重的通径系数达到显著或极显著水平。越南养殖群体的头胸甲长和第2腹节宽对体重的通径系数达到极显著水平。此外，缅甸野生和泰国养殖群体的第2腹节长对体重都呈负相关作用。各群体所筛选出的形态性状对体重回归方程的回归关系均达到极显著水平，缅甸野生、泰国和越南养殖群体所筛选出的形态性状对体重的决定系数R~2分别为0.982、0.941和0.933。结果表明，在实际生产中，可基于群体形态性状对体重的多元回归方程，对体重通径关系达到显著或极显著水平的形态性状可作为定向选育指标。
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
杨学明 郭亚芬 蒋钦杨 陈福艳 梁万文 蒋和生
运用PCR方法,扩增罗氏沼虾缅甸原种F1代、广西选育群体和江苏养殖群体的线粒体DNA上的细胞色素氧化酶(Cytochrome oxidase subunit I,COI)基因,在此基础上选用10种限制性内切酶对扩增产物进行限制性片段长度多态(RFLP)分析。三个群体共发现2个多态位点,11种酶切图谱,3种基因型。三群体的多态座位比例、平均杂合度和基因型多样性指数分别为:缅甸原种F122.2%、0.0556、0.0472,广西选育群体22.2%、0.0400、0.0398,江苏养殖群体11.1%、0.0106和0.0083,群体间遗传差异未见显著。根据群体间遗传距离构建UPGMA聚类关系图,显示...
[期刊] 水产学报
[作者]
朱其建 戴习林 邹卫丽 蒋飞 苏建 过正乾 王海洋 丁福江
为深入了解罗氏沼虾抗病选育群体的抗病力和遗传信息,通过人工注射溶藻弧菌感染16个罗氏沼虾选育群体,并利用微卫星分子标记对选育群体进行遗传结构分析。结果显示,16个选育群体抗溶藻弧菌感染能力存在明显差别,并从中鉴定出抗病力强的群体3个(SCR11-6、SCR11-11和SCR11-16),其在感染溶藻弧菌感染后的成活率达80%;抗病力比较强的群体7个;抗病力一般的群体4个,成活率为65%~70%;抗病力差的群体2个,成活率为35%~50%。8对微卫星引物共检测到53个等位基因,每对引物的等位基因数为5~9个,平均为6.625个,多态信息含量(PIC)为0.629 4~0.829 4,平均为0.7...
[期刊] 水产学报
[作者]
李明云 张海琪 朱俊杰 邬勇 黄福勇 何中央 徐晓林 杜建明
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,对浙江省罗氏沼虾养殖群体和新引进的缅甸自然群体的遗传差异进行了比较分析,以期从分子水平了解罗氏沼虾的种群遗传多样性背景及与引种的关系。采用经筛选的22个10bp的随机引物对罗氏沼虾两群体各20尾进行群体RAPD分析。22个引物共检测到139个位点。养殖群体的多态位点比例为30.22％,群体平均杂合度为0.2646,Shannon多样性指数为0.0780,群体内各个体之间的遗传共享度为0.9353,遗传距离为0.0647;自然群体的多态位点比例为33.82％,群体的平均杂合度和Shannon多样性指数分别为0.2888和0.0940,群体内各个体之间的遗传...
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
卢万鸿
尾叶桉是我国最重要的桉树改良树种之一,长期以来积累了丰富的尾叶桉优良种质资源。目前,我国的尾叶桉改良处于第三代改良阶段。尾叶桉第二代育种群体的构成材料是第一代育种群体中经高强度人工选择的自由授粉子代,第三代育种群体的构成材料同样经历高强度的人工选择,主要为尾叶桉前两个世代的自由授粉子代。因此,尾叶桉高世代育种群体的遗传多样性和遗传结构较之前的世代群体发生了很大的变化,但世代间的遗传物质又存在很大的继承关系。所以,在计划推进尾叶桉进入下一个世代的改良、选择构成下一代群体的遗传材料之前,了解现有世代育种群体的
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
罗坤 孔杰 栾生 杨翠华 杨国梁 王军毅 张宇飞
对106个罗氏沼虾家系(包括32个半同胞家系)5月龄的5个生长性状进行测量。采用动物模型,把性别、雌虾出池时是否抱卵作为固定效应,并以日龄为协变量,借助DFREML方法估计头胸甲长、腹长、最后腹节长、体长和体重等性状的方差组分,进行遗传参数的估算。结果表明,5个生长性状的变异系数中体重的变异系数最大,为36.80;罗氏沼虾5月龄头胸甲长、腹长、最后腹节长、体长和体重的遗传力分别为0.06、0.07、0.02、0.07和0.07,生长性状的遗传力属低遗传力;5个生长性状的表型相关系数在0.398～0.910之间,遗传相关系数在0.35～1.0之间,其中头胸甲长与体长的遗传相关程度最高,遗传相关系...
关键词：
罗氏沼虾 生长性状 遗传参数
[期刊] 华北农学报
[作者]
张林 甘金华 张涛 何力 周剑光
为保护、评估及合理利用罗氏沼虾种质资源，为今后指导育种及养殖提供理论依据，以采自广西及江苏数丰良种场的罗氏沼虾为材料，采用PHA和秋水仙素肌肉注射、精巢或卵巢细胞直接制片法，对罗氏沼虾染色体核型进行了研究。采用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳技术，分析了罗氏沼虾肌肉或鳃组织乳酸脱氢酶(LDH)、苹果酸脱氢酶(MDH)、酯酶(EST)、醇脱氢酶(ADH)4种同工酶的组织表达模式，并初步分析了其生化遗传学特性及遗传结构。结果表明：罗氏沼虾为二倍体，2N=118=56M+24SM+10ST+28T,臂数(NF)为198。未发现带有随体或次缢痕的染色体及性染色体。4种酶共记录出22个等位基因15个基因位点，位点平均有效等位基因数(Ne)为1.47;4种酶有7个基因频率为0.1500～0.8500的多态位点；多态位点比例P为46.7%;平均期望杂合度(He)值为0.191 7,平均观测杂合度(Ho)值为0.261 1,Hardy-Weinberg遗传偏离指数(D)值为0.379 7,表明其杂合子过剩及缺失现象并存，但杂合子过剩现象更突出，说明该群体遗传变异范围较宽，变异程度较大，群体遗传多样性高，可为今后的人工育种提供良好的亲本。
关键词：
罗氏沼虾 染色体 核型 同工酶 遗传结构
[期刊] 水产学报
[作者]
戴习林 刘洁 李晶晶 江宗冰 明磊 蒋飞
利用60对微卫星分子标记分别对罗氏沼虾3个养殖群体进行遗传多样性分析,通过比较样本量及标记量对遗传多样性指标的影响,探讨最适宜的样本量及标记量。结果显示,样本量和标记量的大小均对遗传多样性指数有较大的影响,其中样本量与平均等位基因数和平均有效等位基因数呈高度正相关,与杂合度和Nei氏遗传多样性指数分别呈中度、高度相关,样本量为1030时,遗传参数变化差异显著,样本量大于30,变化差异不显著;标记量与遗传参数也存在不同程度的相关性,标记量为525时,各遗传多样性指数变化有明显差异,标记量大于25时,各遗传参
关键词：
罗氏沼虾 遗传多样性 微卫星 样本量
[期刊] 林业科学研究
[作者]
辛娜娜 张蕊 徐肇友 肖纪军 王帮顺 周志春
木荷为我国亚热带地区主要的珍贵优质阔叶用材树种和生态防护树种。利用筛选的14对多态性强的SSR引物,对木荷1代育种群体中来自15个产地133个亲本进行遗传多样性分析,为其优异种质资源保存、杂交亲本选配及新种质创制提供科学依据。结果表明:14对引物共扩增86个位点,每对引物检测到的等位基因数(Na)变异范围为2 11个,平均等位基因数(Na)为6.14个,平均有效等位基因数(Ne)为3.23个,平均观察杂合度(Ho)为0.572 0,平均Shannon信息指数(I)和平均Nei’s基因多样性指数(Nei)分别为1.224 7和0.599 0,说明木荷1代育种群体具有丰富的遗传多样性,其中,福建建...
[期刊] 水产学报
[作者]
崔文涛 邹宇凡 白志毅 王志炎 李典中
为了解安徽地区克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性，实验以芜湖（WH）、宣城（XC）、合肥（HF）3个安徽地区克氏原螯虾人工养殖群体为研究对象，分别以铜陵（TL）、马鞍山（MAS）2个安徽野生群体和监利（JL）、建湖（JH）、滆湖（GH）、兴化（XH）4个人工养殖群体作为对照，选用10对克氏原螯虾微卫星引物对其进行微卫星遗传多样性和遗传结构研究。结果显示，安徽地区人工养殖克氏原螯虾群体的平均遗传多样性均高于2个野生群体和江苏、湖北4个地区的人工养殖群体，其中XC群体的遗传多样性最高。9个群体全部10个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。AMOVA分析表明遗传变异是由群体内部决定的；大多数组的F_(st)表现出中度分化（0.05 < F_(st )< 0.15）。基因流表明不同群体之间存在着广泛的基因交换，尤其是GH和JH群体之间。基于群体间Nei's遗传距离及UPGMA聚类树结果显示，WU群体、GH群体、MAS群体和JH群体聚为一组，XC群体和HF群体同属于一组，而JL群体、TL群体、XH群体分别自成一组。STRUCTUR结果显示，XC群体和HF群体的大多数个体被分配到相同的遗传群中，说明上述群体起源相同。研究表明安徽地区克氏原螯虾人工养殖群体具有较高的遗传多样性，结果为安徽地区克氏原螯虾种质资源的保护和改良，提供了参考资料。
关键词：
克氏原螯虾 遗传多样性 遗传结构 微卫星
[期刊] 中国水产科学
[作者]
仲伟鹏 罗坤 孟宪红 陈宝龙 隋娟 孔杰 曹宝祥 邢群 栾生
为研究竞争性环境下中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)体重性状的间接遗传效应,设计多家系多分组方案,对来源于中国对虾G11代育种群体的103个测试家系限制配合饲料投喂量(正常投喂量50%),利用经典动物模型和包含间接遗传效应的扩展动物模型估算收获体重的遗传参数。基于2种模型估计出的经典遗传力分别为0.581±0.071和0.616±0.074。似然比率检验表明,体重的间接遗传效应显著,对总遗传方差的贡献度高达75.03%。由于存在一个较大的负直接遗传效应与间接遗传效应协方差(-2.1982),导致总遗传方差与表型方差的比值仅为0.524±0.212,小于经典的遗传力估计值。基于协方差获得的直接遗传效应与间接遗传效应的遗传相关系数为-0.495±0.184,暗示测试个体间存在较强的竞争交互。本研究表明,在饲料投喂量受限制的竞争性环境下,对虾个体间较强的竞争交互行为,对中国对虾收获体重间接产生了可遗传的效应,减少了可利用的总遗传变异。今后在设计中国对虾育种方案时,应避免在资源受限的强竞争环境下开展性状测试和遗传评估。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
管云雁 刘文广 何毛贤
采用9个多态性微卫星位点分析马氏珠母贝(Pinctada fucata)壳高选育品系(JCS)4个世代的遗传多样性与遗传结构的变化。结果表明,随着选育的进行,4个世代每个位点的平均有效等位基因数(Ne)从2.096下降至1.435,平均等位基因丰度(Rs)从3.556下降至2.556,平均观测杂合度从0.492渐次下降至0.269,遗传多样性呈明显的下降趋势。随着选育世代的增加,从等位基因频率的变化来看,部分呈上升趋势,部分呈下降趋势,部分基本保持稳定,其中,一些低频基因甚至会趋于消失。在所有等位基因中,大部分的频率呈随机变化趋势,并在不同的世代间上下波动;HHM20-158 bp的频率呈有规...
关键词：
马氏珠母贝 选育 遗传变异 微卫星
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