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[期刊] 林业科学
[作者]
高志民 刘青 牟少华 李雪平 胡陶
锌指蛋白在原核生物与真核生物基因转录调控中发挥着重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从绿竹叶片中分离到1个锌指蛋白基因,命名为BoBZF(GenBank登记号:EU606025)。BoBZF cDNA全长1076bp,编码256个氨基酸。蛋白结构分析表明,其编码的蛋白具有2个B-Box结构域,属于B-Box型锌指蛋白。组织特异性表达显示BoBZF在叶片、叶鞘、幼茎和根中均有表达,其中在叶片的表达丰度较高。将BoBZF置于CaMV35S启动子控制下,构建到载体pBI121的多克隆位点,并转化拟南芥。RT-PCR分析表明,BoBZF已在拟南芥中表达。转基因植株耐旱性明显提高,意味着BoBZF...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
牟少亮 曹蕾 官德义 方开星 何水林
利用cDNA-AFLP分析籼稻明恢86应答稻纵卷叶螟取食基因差异表达,发现1个与植物同源结构域(PHD)锌指蛋白高度同源的TDF,分离获得该TDF对应的粳稻全长cDNA.该全长cDNA与籼稻、玉米、蓖麻、葡萄、拟南芥和大豆等作物PHD锌指蛋白推定氨基酸序列的同源性分别为98.43%、86.01%、54.58%、57.02%、57.51%和55.88%.荧光定量PCR研究表明,日本晴(粳稻)叶片中该基因的表达也受稻纵卷叶螟取食的诱导,推测该基因与籼稻和粳稻应答稻纵卷叶螟取食密切相关.
关键词：
稻纵卷叶螟 PHD锌指蛋白 表达分析
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
林江波 王伟英 李海明 吴水金 邹晖 李跃森 戴艺民
【目的】克隆中国水仙植物ＡＴ富集序列锌结合蛋白基因（ＮＴＰＬＡＴＺ１），为研究该基因的生物学功能奠定基础。【方法】利用ＲＡＣＥ技术克隆了ＮＴＰＬＡＴＺ１ＣＤＮＡ全长，利用生物信息学方法分析其核苷酸及氨基酸序列，将ＮＴＰＬＡＴＺ１与原核表达载体ＰＧＥＸ－４Ｔ－３连接，转化ＢＬ２１并进行诱导表达，通过半定量ＰＣＲ分析用多效唑处理后该基因在中国水仙不同生长时期叶片中的表达情况。【结果】ＮＴＰＬＡＴＺ１的ＣＤＮＡ全长１ ０２４ＢＰ，包含１个６４２ＢＰ的完整阅读框架，编码２１３个氨基酸；编码蛋白具有ＰＬＡＴＺ ｓｕＰＥＲｆＡｍｉＬｙ蛋白保守区，与大豆（ＧＬｙＣｉＮＥ ｍＡＸ，Ａｉｉ１９３１４．１）ＰＬＡ．．．
关键词：
中国水仙 PLATZ 基因表达 锌指蛋白
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李小娟 孙昭华 柯忻 路文静 郭程瑾 谷俊涛 肖凯
【目的】在克隆小麦锌指蛋白基因TaZAT6的基础上,深入研究该基因的分子特征和在不同磷水平下的表达特性。【方法】通过对富集石新828不同低磷胁迫时间点特异表达基因的cDNA差减文库克隆测序,获得1锌指蛋白型转录因子基因EST。利用RT-PCR技术,在低磷处理24h的石新828和冀7369根系中克隆了该锌指蛋白基因TaZAT6,并采用该技术进一步研究该基因应答介质中Pi的特征。【结果】TaZAT6开放阅读框为717bp,编码238个氨基酸残基,编码的蛋白质中含有1个保守的核定位区、2个C2H2锌指蛋白域和1个DLN保守盒。系统进化分析表明,TaZAT6可能与另外2个小麦锌指蛋白基因ZAT22和Z...
[期刊] 华北农学报
[作者]
任美艳 王志林 郭慧琴 薛敏 殷玉梅 王茅雁
为了研究强抗逆植物沙冬青寒旱诱导表达基因AmZFP1(Zinc finger protein 1)的生理功能,通过转录谱分析,从中鉴定出一个受寒旱诱导的ZFP全长cDNA序列并命名为AmZFP1。利用半定量RT-PCR方法对AmZFP1进行了表达分析,结果表明,在室内正常培养的沙冬青幼苗中该基因有较高表达量,在低温或干燥处理248 h其表达量明显上调,尤其以干燥处理上调速度更快且上调幅度略高;在野外自然生长植株的嫩叶、花蕾和幼嫩果荚中AmZFP1均有较明显的表达,而在嫩枝和根中检测不到其转录本;在野外植株
关键词：
沙冬青 锌指蛋白 表达分析 基因克隆
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
张彬 禾璐 候蕊 路阳 马芳芳 王兴春 杨致荣 韩渊怀 李红英
以‘晋谷45’和‘晋谷42’2个品种作为试验材料,采用聚乙二醇(PEG-6000)模拟干旱胁迫处理谷子幼苗,检测不同处理时间下丙二醛(MDA)的含量,评价其抗旱性。此外,在2个品种中克隆获得SiZFP182基因的cDNA全长,分析比较它们之间的序列差异;通过定量RT-PCR的方法分析SiZFP182基因在受到干旱胁迫的谷子幼苗中的表达特性。结果表明,‘晋谷45’的抗旱性强于‘晋谷42’,2个品种中SiZFP182基因的序列存在5处单碱基差异,使得编码的氨基酸序列不同。此外,PEG胁迫处理后24h内,SiZFP182基因在2个品种中的表达水平均表现出先升高后降低的趋势,处理后6~12h,该基因在...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
赵玎玲 王梦璇 孙天杰 苏伟华 赵志华 肖付明 赵青松 闫龙 张洁 王冬梅
【目的】由大豆花叶病毒（soybean mosaic virus,SMV）引起的大豆花叶病是世界性大豆病害之一，利用病毒诱导的基因沉默（virus induced gene silencing,VIGS）技术研究GmSZFP在大豆与SMV互作过程中发挥的功能，为深入探讨其分子机制奠定基础。【方法】以大豆品种冀豆7号与SMV毒株SC-8、N3组成的亲和、不亲和组合为试验材料，运用生物信息学预测GmSZFP的分子结构特征；以酵母转录激活试验检测其转录因子活性；借助实时定量PCR(RT-qPCR)验证GmSZFP在大豆与SMV互作中转录水平的表达特征；结合VIGS技术探究GmSZFP在大豆与SMV互作过程中的功能。【结果】通过PCR克隆GmSZFP的CDS区，序列全长为1 071 bp；氨基酸序列分析和酵母转录激活试验发现GmSZFP为C2H2型锌指蛋白转录因子，且具有转录激活活性；RT-qPCR结果显示，GmSZFP受SMV的强烈诱导，在亲和组合与不亲和组合中的表达模式不同，在不亲和组合中，GmSZFP呈先上升后下降的表达趋势，其表达水平明显高于亲和组合，若在接种病毒前给叶片预注射咪唑，GmSZFP的表达水平降低，并与亲和组合相近，说明GmSZFP在转录水平响应SMV的侵染并受胞内H2O2信号调控；利用VIGS技术沉默GmSZFP后，发现接种部位胼胝质的积累水平较对照大大降低，RT-qPCR检测胼胝质合酶基因GmGSL7c和GmGSL12b的表达量较对照降低，胼胝质水解酶基因BG的表达量较对照增加；在基因沉默植株叶片上点接种SMV后72 h，病毒向外扩散至2 mm，在96 h时病毒扩散至3 mm，而对照组叶片在接种点外始终未能检测到SMV外壳蛋白CP的表达；摩擦接种SMV后10 d，在基因沉默植株的上位叶表现出花叶、失绿和卷曲等感病症状，并检测到CP的表达，说明沉默GmSZFP后，SMV在胞间扩散和长距离运输的能力均增强。【结论】大豆GmSZFP是典型的C2H2型单锌指蛋白，GmSZFP在大豆抵抗SMV侵染过程中发挥正调控作用。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
黄骥 张红生 曹雅君 王东 王建飞 杨金水
[期刊] 中国农业科学
[作者]
武会娟 罗军 张丽娟 杨宝进 韩雪峰 王海滨
【目的】克隆西农萨能山羊泌乳中期和后期乳腺组织差异表达基因Ubi-d4并进行生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能以及乳腺退化的分子机制提供信息。【方法】以西农萨能羊乳腺组织为材料,利用抑制性消减杂交技术筛选泌乳中期和后期乳腺组织差异表达基因,用RT-PCR克隆Ubi-d4基因,用实时定量PCR分析Ubi-d4基因的表达水平变化,用生物信息学方法对Ubi-d4基因进行结构和功能域预测。【结果】山羊乳腺Ubi-d4基因开放读码框全长1176bp,编码391个氨基酸,GenBank登陆号为EF105410;与牛(XM_881516)、人(NM_006268.3)、鼠(NM_011262)、兔(X...
[期刊] 林业科学
[作者]
张伟溪 刘浡洋 丁昌俊 张冰玉 黄秦军 褚延广 苏晓华
C2H2型锌指蛋白转录因子在激活胁迫相关基因、增强植物抗逆性方面具有重要的作用。以来自极端抗逆木本植物霸王C2H2型锌指蛋白转录因子基因(ZxZF)为外源基因,利用农杆菌介导法对欧美杨‘渤丰1号’进行遗传转化。经卡那霉素筛选获得80株抗性植株,通过PCR检测获得17株呈阳性植株,Southern印记杂交检测证实外源基因以单拷贝方式整合到5个转基因株系体内,RT-PCR及qRT-PCR分子检测表明,外源基因在4个转基因株系中成功表达。PEG模拟干旱胁迫试验结果初步表明,转基因株系叶片相对含水量和脯氨酸含量均显著高于非转基因植株10%以上,转基因株系抗旱性得到一定程度提高。研究表明ZxZF转录因子...
关键词：
欧美杨 锌指蛋白基因 遗传转化 抗旱性
[期刊] 林业科学
[作者]
娄永峰 杨丽 彭镇华 赵韩生 高志民
【目的】B-box锌指蛋白(BZF)在植物生长发育和应对逆境过程中发挥着重要的调控作用。强光胁迫对竹子的生长发育有着重要的影响,通过分析毛竹BZF基因编码蛋白的分子特征及组织表达模式,研究过量表达Pe BZF4转基因植株的荧光动力学参数变化,以期为揭示竹子BZF基因对强光的应答与调节机制提供参考。【方法】采用同源基因比对的方法直接从Bamboo GDB中获得毛竹BZF基因同源序列,利用专用软件和在线公共平台分析基因及其编码蛋白序列,查找各种作用元件,预测蛋白功能结构域,分析蛋白的亲水性/疏水性。采用实时定量PCR技术分析基因在不同组织中的表达情况以及强光(1 200μmol·m-2s-1)和黑...
关键词：
毛竹 锌指蛋白基因 光胁迫 基因表达
[期刊] 林业科学
[作者]
娄永峰 杨丽 彭镇华 赵韩生 高志民
【目的】Ｂ－Ｂｏｘ锌指蛋白（ＢＺＦ）在植物生长发育和应对逆境过程中发挥着重要的调控作用。强光胁迫对竹子的生长发育有着重要的影响，通过分析毛竹ＢＺＦ基因编码蛋白的分子特征及组织表达模式，研究过量表达Ｐｅ ＢＺＦ４转基因植株的荧光动力学参数变化，以期为揭示竹子ＢＺＦ基因对强光的应答与调节机制提供参考。【方法】采用同源基因比对的方法直接从ＢａｍＢｏｏ ＧＤＢ中获得毛竹ＢＺＦ基因同源序列，利用专用软件和在线公共平台分析基因及其编码蛋白序列，查找各种作用元件，预测蛋白功能结构域，分析蛋白的亲水性／疏水性。采用实时定量ＰＣＲ技术分析基因在不同组织中的表达情况以及强光（１ ２００μｍｏｌ·ｍ－２ｓ－１）和黑．．．
关键词：
毛竹 锌指蛋白基因 光胁迫 基因表达
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
史军娜 刘美芹 师静 王艳萍 智冠华 陈玉珍 卢存福
根据沙冬青低温干旱诱导cDNA文库表达序列标签中锌指蛋白基因序列设计特异引物,采用PCR技术扩增锌指蛋白基因AmZFPG的cDNA全长。序列分析表明,cDNA全长669bp,推测编码223个氨基酸残基、分子量约25kD的蛋白质。氨基酸保守性分析及同类锌指结构比对表明AmZFPG属于GATA结合蛋白家族,且具有高度的保守性。系统发生分析表明,其与紫花苜蓿富含脯氨酸的细胞壁蛋白进化亲缘关系最近。半定量RT-PCR分析显示,AmZFPG基因是受低温和干旱诱导表达上调的基因,初步得出AmZFPG基因与沙冬青低温和干旱胁迫响应相关。
关键词：
沙冬青 锌指蛋白 序列分析 表达分析
[期刊] 林业科学
[作者]
高志民 刘成 刘颖丽 彭镇华
The light harvesting chlorophyll a/b-binding protein is one of key proteins in the transformation from light energy to chemical energy. An open reading frame coding precursor protein of cab gene was cloned from the first strand of bamboo cDNA through RT-PCR methods,and named as cab-PhE1 (cab gene 1 ...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
林琳 李健 李慧玉 穆怀志 姜静
从以刚毛柽柳为材料构建的NaCl胁迫的根cDNA文库中测序得到1条LTP基因序列,其全长为635 bp、编码116个氨基酸,命名为ThLTP基因。采用实时荧光定量RT-PCR的方法,分别对0.2 mol.L-1NaCl、150μmol.L-1CdCl2、20%(W/V)PEG6000、100μmol.L-1ABA及4℃下ThLTP基因在柽柳中的表达模式进行了分析,结果表明:ThLTP基因除了在4℃条件下根组织中为下调表达外,在其它处理中均表现为上调表达。将ThLTP基因克隆到大肠杆菌(Escherichia coli)的原核表达载体pET32a中,对重组菌Escherichia coli BL...
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