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[期刊] 华北农学报
[作者]
王华 魏玉兵 童建伟 张明军 王建福 王欣荣 成述儒
为从分子水平研究甘肃境内典型养殖模式下甘肃高山细毛羊、小尾寒羊、藏羊、蒙古羊和滩羊５个绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３基因多态性与屠宰性能和肉品质的相关性，探讨以ＰＲＫＡＧ３为候选基因，提高绵羊屠宰性能和肉品质的可能性。采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术对５个绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３基因外显子４，５和内含子４多态性进行检测，并就ＰＲＫＡＧ３基因多态性与９月龄屠宰性能和肉品质进行相关性分析。结果表明，在ＰＲＫＡＧ３基因２ ６８９ ｂＰ处发生了Ａ＞Ｇ的突变，位于第４内含子第２３ ｂＰ处，表现出３种基因型，ＡＡ、Ａｂ和ｂｂ。纯合度（Ｈｏ）分别为０．６７，０．６９，０．７６，０．６９，０．５９，杂合度（Ｈｅ）分别为０．３３．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
樊月圆 富国文 昝林森 李卫真 王绍卿
以6个牛品种(秦川牛、南阳牛、郏县红牛、鲁西牛、安格斯和夏南牛)共计717个个体为研究对象,采用PCR-SSCP方法与DNA测序相结合的方法,对PPARδ基因全部编码区及部分内含子区域的SNPs位点进行检测,并分析了SNPs位点与秦川牛的部分胴体、肉质性状的相关性。结果表明,在检测样本中,未检测到编码区的突变,仅在PPARδ基因第2内含子上发现了1个61 C→T的突变。χ2检验显示,在该位点,南阳牛和夏南牛处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),其余4个群体均处于Hardy-Wein-berg不平衡状态(P<0.05);除夏南牛群体处于中度多态,其余5个群体均属于低度多态;相...
[期刊] 华北农学报
[作者]
石丰运 朱广琴 廖云琼 王兵
胰岛素样生长因子结合蛋白(Insulin-like Growth Factor Binding Proteins,IGFBPs)与动物的生长发育有密切的联系。为了探讨IGFBP-3基因作为绵羊屠宰性状候选基因的可能性,本研究采用单链构象多态性(Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism,PCR-SSCP)结合测序方法检测592只甘肃高山细毛羊IGFBP-3基因的变异特征,并分析核苷酸变异与屠宰性状的相关性。结果表明,绵羊IGFBP-3第4外显子区检测到1个单核苷酸变异位点(g.87 A>C),A和B 2个等位基因(等位基因频率:56.76%和43.24%),表现为AA、AB和BB 3种基因型(基因型频率:29.73%,54.05%和16.22%),并且所研究的群体在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。相关性结果表明,甘肃高山细毛羊IGFBP-3基因g.87 A>C处的变异对宰前活质量、热胴体质量有极显著影响(P<0.01);对眼肌面积、GR值、嫩度有显著影响(P<0.05)。本研究表明,等位基因B的绵羊群体具有更高的屠宰率,它可以作为甘肃高山细毛羊屠宰性状选育的分子标记用于生产实践中。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宋付标 昝林森 王洪程 王洪宝 田万强 王虹 钟昕
【目的】对秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行SNPs检测,并研究其与秦川牛肉质性状的相关性。【方法】采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法,对324头2~3岁秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行多态性分析,用最小二乘法拟合线性模型对Chemerin基因不同基因型与秦川牛肉质性状(宰前活质量、胴体质量、背膘厚、大理石花纹评分、系水力、眼肌面积和嫩度)进行关联分析。【结果】秦川牛Chemerin基因第2外显子868 bp处发生了A→G突变,第6外显子2 948 bp处发生了C→G突变;用PCR-SSCP方法检测得到AA、AG、GG、EE和EF 5种基因型,其基因型频...
[期刊] 华北农学报
[作者]
梁鹏 张稳 冯登侦 强浩 荣轩 孟科
旨在分析滩羊与杜泊羊和小尾寒羊肉品质变化和肌肉内基因的表达情况，初步揭示它们肉质性状差异的分子机理，为其他绵羊品种选育与改良提供理论依据。通过对8月龄杜泊羊、滩羊和小尾寒羊的肉品质分析比较，并采用Illumina HiSeq~(TM) 4000平台对背最长肌组织进行转录组测序和分析，挖掘它们肉质性状差异的相关调控基因。结果显示：共筛选出820个差异表达基因，其中杜泊羊与滩羊之间99个，杜泊羊与小尾寒羊之间436个，滩羊与小尾寒羊之间552个。对差异基因进行GO功能富集分析结果显示，各比较组分别显著富集在224,517,657个GO条目中；KEGG通路富集分析表明，DEGs富集在cAMP、MAPK、AMPK、嘌呤代谢、甘油磷脂代谢、氨基酸和脂肪酸代谢以及糖酵解/异生等信号通路，进一步筛选出FOS、PLA2G4E、LPIN1、AMPD1、AMPD3、NT5C1A、GPI、PFKM和PKM等与肉品质调控和风味物质代谢有关的候选基因。对随机挑选的几个差异基因进行实时荧光定量PCR验证，结果显示，与转录组测序结果表达趋势一致，说明测序结果可靠，研究获得的这些差异基因可作为宁夏优质肉羊新品种(系)培育的基础资料。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛SIRT3基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下468头18~24月龄健康秦川母牛，采用DNA直接测序技术进行SIRT3基因全区域遗传变异检测。运用SPSS16.0软件中最小二乘法拟合线性模型，对SIRT3基因不同基因型与秦川牛体尺(体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽)和肉质性状(背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量)进行关联分析。【结果】经DNA测序发现，秦川牛SIRT3基因在第4内含子上存在2个突变位点，分别为C22522T突变和C22680G突变，均存在3种基因型。χ2检验...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛ＳＩＲＴ３基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下４６８头１８～２４月龄健康秦川母牛，采用ＤＮＡ直接测序技术进行ＳＩＲＴ３基因全区域遗传变异检测。运用ＳＰＳＳ１６．０软件中最小二乘法拟合线性模型，对ＳＩＲＴ３基因不同基因型与秦川牛体尺（体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽）和肉质性状（背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量）进行关联分析。【结果】经ＤＮＡ测序发现，秦川牛ＳＩＲＴ３基因在第４内含子上存在２个突变位点，分别为Ｃ２２５２２Ｔ突变和Ｃ２２６８０Ｇ突变，均存在３种基因型。χ２检验．．．
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
刘亚轩 肖石军 郭长明 陈福珍 林金玉 陈晓燕 沈金清 杨锋 林长光
选择对仔猪腹泻有显著影响的产肠毒素大肠杆菌(ETEC)F4ac的受体基因MUC13为研究对象,采用PCR-SNaPshot判型与常规育种技术相结合的方法,对544头大白猪核心育种群进行基因判定及基因型与生长、肉质性状相关性的研究.结果表明,大白猪MUC13基因型分布大小为:腹泻易感杂合基因型GA>腹泻抗性纯合基因型GG>腹泻易感纯合基因型AA,腹泻抗性有利基因G的等位基因频率为0.669,腹泻易感不利基因A的等位基因频率为0.331.3种基因型个体达100kg日龄及其估计育种值(EBV)、达100 kg背膘厚及其EBV的大小为:AA>GA>GG;眼肌面积、肌内脂肪含量和估计瘦肉率的大小为:GG...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
杨又兵 钱凯凤 刘永建 任旭鸽 周臣 游祥宾
通过测定约180日龄的8个群体(梅山、大白、长白、大白×梅山F1代、梅山×大白F1代、长白×大白F1代、大白×长白F1代以及大白×梅山F2代)459头猪胴体性状、肉质性状以及肌细胞生成素基因(MYOG)多态性，分析MYOG在猪群体中的遗传效应。结果表明：MYOG在猪群体中呈现3种基因型，即AA、AB、BB；群体瘦肉率的提高与BB基因型显著相关，相较于AA与AB基因型，其提高幅度分别为3.57%和3.28%；在大白×梅山F2代群体中，MYOG的基因型与背最长肌pH值、股二头肌pH值呈显著相关；在大白×梅山F1代群体中，MYOG基因型与股二头肌大理石纹MM2呈显著相关。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
杨又兵 钱凯凤 刘永建 任旭鸽 周臣 游祥宾
通过测定约180日龄的8个群体(梅山、大白、长白、大白×梅山F1代、梅山×大白F1代、长白×大白F1代、大白×长白F1代以及大白×梅山F2代)459头猪胴体性状、肉质性状以及肌细胞生成素基因(MYOG)多态性，分析MYOG在猪群体中的遗传效应。结果表明：MYOG在猪群体中呈现3种基因型，即AA、AB、BB；群体瘦肉率的提高与BB基因型显著相关，相较于AA与AB基因型，其提高幅度分别为3.57%和3.28%；在大白×梅山F2代群体中，MYOG的基因型与背最长肌pH值、股二头肌pH值呈显著相关；在大白×梅山F1代群体中，MYOG基因型与股二头肌大理石纹MM2呈显著相关。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王慧华 赵福平 张莉 魏彩虹 杜立新
【目的】中国畜禽遗传资源种类丰富,畜禽品种数量约占全球已知种类的1/6,是世界畜禽遗传资源最为丰富的国家之一。《中国畜禽遗传资源志》是在农业部的领导和组织下,经过8年的调查和编写而成,较好的总结了中国畜禽地方品种、培育品种和引入品种地域分布和性能特点。文章对《中国畜禽遗传资源志-羊志》中地方绵羊品种的重要生产性能相关性状作进一步分析,期望从中筛选出适合于肉用品种培育的素材。【方法】整理汇总《羊志》中地方绵羊品种的主要产地,以及体尺、胴体及繁殖方面共13个肉用相关性状信息。依据《羊志》将地方品种分为蒙古系、哈萨克系和藏系并对3大谱系进行多重比较,利用R语言中主成分分析和系统聚类分析方法对信息较全...
关键词：
绵羊 地方品种 肉羊 多元分析
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
高明刚 刘镒 王瑞华 韩敏 李媛媛
[目的]挖掘与萝卜肉质根糖含量相关性状密切关联的SSR位点,为萝卜品质改良提供参考。[方法]以134份萝卜品种构成的自然群体为材料,在成熟期对萝卜肉质根中的果糖、葡萄糖、蔗糖、可溶性总糖含量和甜度值进行连续3年(2015—2017年)的表型鉴定,利用SPSS 20.0软件对上述5个糖含量性状进行相关性分析,选用156对SSR引物进行群体扫描,利用PowerMarker V3.25软件分析134份萝卜品种的遗传多样性,应用Structure2.3.4软件分析包含134份萝卜品种自然群体的遗传结构,利用Tassel 3.0软件对SSR标记与糖含量相关性状进行关联分析。[结果]134份萝卜品种的糖含量相关性状在群体中变异较广,甜度值的广义遗传力最高(60.10%),其次是葡萄糖(53.79%)、可溶性总糖(48.51%)和果糖(40.73%),蔗糖的广义遗传力最低(30.67%)。用156对SSR引物从134份萝卜品种中共检测到349个多态性位点,多态性信息量(PIC)为0.106～0.864,多样性指数为0.112～0.877。群体结构分析表明,134份萝卜品种可分为2个亚群,其中亚群1包含46个萝卜品种,对应表1中1～46号品种;亚群2包含88个萝卜品种,对应表1中47～134号品种;且亚群分类与地理来源无明显对应关系。在P≤0.01阈值条件下,检测到与5个糖含量相关性状关联的位点61个,其中与葡萄糖含量关联的位点16个,与甜度值关联的位点13个,与蔗糖含量关联的位点13个,与可溶性总糖含量关联的位点10个,与果糖含量关联的位点9个,单个位点的表型变异解释率为5.19%～16.29%。[结论]获得61个与萝卜肉质根糖含量相关性状显著关联的SSR位点,其中有14个标记位点具有“一因多效”现象,能同时被2个或2个以上性状检测到。
关键词：
萝卜 糖含量 关联分析 遗传力 SSR
[期刊] 华北农学报
[作者]
韩晴 曹珂 朱更瑞 方伟超 陈昌文 王新卫 刘扩展 游双红 王力荣
以大久保、08-9-106和08-9-107为试材,分析了果实成熟后期中果皮果肉硬度变化、粘离核性状的形成以及中果皮和近核处果肉的乙烯释放和相关基因表达的变化。结果表明,在果实中果皮中,大久保在成熟期果肉硬度下降快,乙烯释放明显,同期PpPG、PpACS1、PpYUC11相对表达量呈先升后降趋势;而08-9-106果肉硬度下降较快,但没有明显的乙烯释放和乙烯合成相关基因(PpACS1和PpYUC11)的表达;08-9-107在成熟后期硬度下降不明显,没有检测到明显的乙烯释放和乙烯合成相关基因的表达。在近核处果肉中,大久保的果实表现为离核性状,同期检测到明显的乙烯释放和相关合成基因(主要为PpACS1)的表达;而08-9-106的果实也表现为离核,但乙烯释放和基因表达与中果皮类似,均无明显检出;08-9-107表现为粘核,虽然乙烯释放量和PpACS1表达较低,但PpACO1和PpYUC11却有一定程度的表达。综上,大久保属于响应乙烯的离核溶质类型,08-9-106属于不响应乙烯的离核溶质类型,08-9-107属于响应乙烯的粘核硬质类型。桃果肉硬度的变化及粘离核性状的形成与PpPG基因的表达相关,PpACS1而非PpACO1是3份桃种质中调控乙烯含量的关键基因。
关键词：
桃 质地 粘离核 基因表达 乙烯
[期刊] 华北农学报
[作者]
张静静 宋玉芹 李桢 朱艳菲 张廷荣
利用Illumina HD SNP技术对484头中国西门塔尔牛SCD1基因的遗传变异及其与部分肉质性状的相关性进行了分析。结果表明,该群体中存在7个SCD1基因的SNP位点。SCD1基因第4内含子存在A8605G、A9229G与A10050C 3个SNP位点;第5内含子存在1个SNP位点A12304G;3’UTR区存在A13655G、C14790T与A15565G 3个位点。A8605G位点的B等位基因为优势等位基因,频率为0.748,其他位点等位基因频率在0.4～0.6之间。χ2检验结果显示,SCD1基因的所有SNPs均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。SCD1基因的7个SNPs位点...
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