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[期刊] 水产学报  [作者] 李宏俊  梁瑜  邢坤  苏浩  高祥刚  隋立军  赫崇波  
利用EST数据库开发SNP是筛选SNP标记的重要途径。本研究利用EST数据库开发紫贻贝的SNP标记,利用QualitySNP软件对紫贻贝已有的19 709条EST序列中含有4条以上同源序列的重叠群进行分析,在含有4条以上同源序列的963个重叠群中,筛选得到候选SNP位点4 833个,SNP的平均频率为129.1 bp,其中C/T和A/G突变较多,分别占总数的28.8%和27.4%。根据候选SNP位点设计30组引物,通过等位基因特异性PCR结合溶解曲线分析,在30个野生个体中进行基因分型验证,6组引物(20%)没有扩增产物,10组引物(33%)没有多态性,14组(47%)引物具有二等位基因多态性...
[期刊] 上海海洋大学学报  [作者] 董兆鹏  岳晓雪  田中旭  侯思凡  姜立盛  
基于YOLO的贻贝(Mytilus edulis)识别与检测技术,是实现贻贝分级、分苗等作业环节机械化和智能化的关键。然而,贻贝因外部特征不够清晰明确,给识别准确率的提高带来了挑战。本文提出一种基于改进YOLOv5算法的贻贝目标检测模型(CST-YOLO)。该算法融合CoordAttention注意力机制,以增强特征表达能力;采用SIoU作为边界框回归损失函数,以减少边界框回归损失,提高模型的检测速度;将Head替换为改进的解耦头TSCODE Head来提高检测准确率。并在自制的贻贝数据集上进行算法测试,实验结果显示:相比YOLOv5算法,CST-YOLO算法准确率P提高了0.428%,mAP_0.5:0.95达到92.221%,提高了1.583%。实验表明CST-YOLO算法在保证检测速度的前提下,有效提高了贻贝目标的检测精度。本研究有助于机器视觉技术在贻贝养殖业自动化与智能化生产加工中的应用。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 李瀚  唐唯  郝大海  王培  李灿辉  
分析细胞质遗传背景是马铃薯育种亲本选配和早世代选择工作的重点。以4个携带不同细胞质遗传背景的马铃薯栽培品种为实验材料,利用已开发的cpDNA/mtDNA多态性标记,建立了在一个pcR反应体系中能同时鉴别不同细胞质遗传背景的多重pcR扩增体系。结果表明:多重pcR和单一pcR扩增体系对马铃薯cpDNA上4个位点(NDh c/tRN V、Rps16/tRN Q、1/11A、10)和mtDNA上位点BAND 1的扩增及经BAm h I酶切后的片段一致。用该体系鉴别大规模群体的细胞质遗传背景,可大大降低实验成本,节约时间、人力和物力,在马铃薯种质资源鉴定和分子标记辅助选育中具有重要的应用价值。
[期刊] 渔业科学进展  [作者] 吴莹莹  孟宪红  孔杰  王清印  栾生  罗坤  
利用高分辨率溶解曲线(High resolution melt,HRM),结合非标记探针技术,对中国对虾转录组EST测序序列中的118个候选SNP位点进行了位点多态性检测,获得了39个具有二等位基因多态性的SNP位点,占总候选位点的比例为33.1%。对这些SNP位点在一个48尾中国对虾群体中的多态性进行了分析,结果表明,观测杂合度Ho和期望杂合度He的分布范围分别为0.000~0.947和0.049~0.506,有效等位基因数分布范围为1.051~1.999,平均为1.574;多态信息含量分析显示39个位点的PIC值范围为0.0476~0.375,平均为0.272。另外,基因功能注释表明,39...
[期刊] 水产学报  [作者] 周中盛   贺楚晗   林倩   梁箫   杨金龙  
为了探究生物活性肽对海洋细菌生物被膜形成和贻贝稚贝附着的影响,实验首先通过紫贻贝肽直接刺激厚壳贻贝稚贝,观察其对稚贝附着的诱导能力;随后选用具有不同诱导能力的海洋细菌海假交替单胞菌和南海雷辛格氏菌,在形成生物被膜过程中分别添加不同浓度的紫贻贝肽,分析其对生物被膜形成及膜成分的影响,并进一步研究生物被膜的变化对厚壳贻贝稚贝附着的影响。结果显示,紫贻贝肽可显著诱导稚贝附着,1.0 g/L的紫贻贝肽诱导效果最高,且显著提高生物被膜细菌密度和被膜胞外蛋白含量;10.0 g/L的紫贻贝肽诱导效果最低,且显著降低生物被膜细菌密度和被膜胞外蛋白含量。研究表明,不同浓度的紫贻贝肽对细菌生物被膜产生不同的影响,从而使生物被膜诱导稚贝附着能力受到影响。综上,紫贻贝肽可以直接诱导厚壳贻贝稚贝附着,也能通过影响海洋细菌生物被膜的形成能力和被膜胞外蛋白含量间接影响厚壳贻贝稚贝附着。本研究可为探究生物活性肽的生理功能及其在贻贝稚贝附着阶段的调控提供新的思路。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)  [作者] 林长光  刘亚轩  吴悌霖  林金玉  郭长明  朱志明  
采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA>GA>GG,长白猪3种基因型分布为:GA>AA>GG.大白和长白猪的A等位基因频率分别为0.710、0.541,G等位基因频率分别为0.290、0.459.AA基因型个体比GA和GG基因型个体生长速度快,等位基因A对猪的生长具有正效应,同时背膘厚变薄.3种基因型个体在达100 kg活体背膘厚及其估计育种值(EBV)的大小为:GG>GA>AA.因此,在种猪选...
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 邱海芳  汪超  张庆德  刘榜  
采用PCR-RFLP方法对通城、大白和长白3个纯种及长大通和大长通2个三元杂种共5个群体MyoD1基因第1内含子的多态性进行了研究,并对多态位点与生长、胴体和肉质性状进行了关联分析。结果发现第1内含子第257位存在1个A/C颠换,引起DdeⅠ酶切位点的改变。PCR产物经DdeⅠ酶切后,检测到2个等位基因,3种基因型,其中通城猪中C等位基因的分布占主要优势,大白、长白猪中2种等位基因的分布频率相近。关联分析结果表明,不同的基因型与肉色评分和失水率相关(P<0.05或P<0.01);CC基因型个体的肉色评分显著高于AA和AC基因型个体;而CC基因型个体的失水率极显著低于AA基因型个体。研究结果进一...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 白小青  郁枫  王金勇  程丰  
 根据人、猪、牛的酪氨酸酶(Tyrosinase,TYR)基因部分序列(GenBank:AF237808,AF237809,AF181962,AY046527),利用Oligo6.0软件设计5对引物,对荣昌猪的TYR基因进行了PCR扩增,并用单链构象多态分析(SSCP)方法进行了多态性检测。结果发现,外显子1呈多态,其余3个外显子均呈单态。克隆测序首次得到猪的酪氨酸酶基因外显子2,3,4的部分序列(序列已被GenBank收录,登录号分别为AY236997,AY279998,AY242973),而且发现外显子1的多态是由于起始密码子上游第46位的G突变成A造成的。
[期刊] 中国水产科学  [作者] 孙效文  梁利群  
用 50 0对斑马鱼SSLP标记引物对黑龙江野鲤 (CyprinuscarpiohaematopterusTemmincketSchlegel)和柏氏鲤 (CyprinuspellegrinipellegriniTchang)进行种间遗传差异分析 ,共发现 110个斑马鱼标记在鲤鱼种间表现出差异 ,故可作为黑龙江野鲤和柏氏鲤间的分子标记 ,也可作为建立遗传连锁图谱的遗传标记。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 苟本富  
采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测,比较了2种方法的多态性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,共获得108个AFLP标记,片段大小在100~2000 bp,得到33个多态位点,多态性位点百分率为30.56%;双酶切采用25对双酶切AFLP引物,在50~600 bp扩增出清晰条带658条,得到182个多态位点,占总扩增带的27.6%。对多态性片段进行统计,计算出不同品种间的相似系数和遗传距离。结果表明:硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远,且其它四种蔷薇的遗传距离均较近,这与蔷薇品种来源和培育史...
[期刊] 中国水产科学  [作者] 全迎春  梁利群  孙效文  姚昆  雷清泉  
用6 072对斑马鱼(Danio rerio)微卫星引物对黑龙江鲤(Cyprinus carpio haematopterusTemminck et Schlegel)、荷包红鲤(Cyprinus carpiovar.wuyuanensis)和柏氏鲤(Cyprinus pellegriniTchang)进行种间遗传差异分析,共发现563个斑马鱼微卫星标记在鲤鱼种间表现出多态性。从中随机抽选25个标记,对斑马鱼和3种鲤鱼的遗传多样性进行分析,使用Phylip3.63软件按照Nei氏标准遗传距离计算种间遗传距离,再用MEGA3.0软件绘制NJ系统发生树,并进行1 000次bootstrap检验系统...
[期刊] 上海海洋大学学报  [作者] 林军  邓明星  章守宇  闫庆  
为获知贻贝浮筏养殖海域表层(3 m)水温的季节变化规律及其对紫贻贝生长的影响,实测多年枸杞岛贻贝养殖场表层水温,并在一个养殖周期内分7航次采集紫贻贝样获取体质量、壳长等数据。结果显示,观测期内最高、最低表层水温分别为29.2℃和4.6℃。夏季表层水温日变幅可超过4℃,而春季与秋季低于2℃。紫贻贝体质量与月龄的多项式回归方程为:W=0.000 6m4+0.006 4m3-0.132 6m2+0.859 9m+0.6568(R2=0.999 1)。紫贻贝壳长与月龄的多项式回归方程为:L=0.000 8m4+0.057 7m3-1.099 7m2+7.536 6m+20.044(R2=0.998 9...
[期刊] 水产学报  [作者] 常抗美  刘慧慧  李家乐  沈玉帮  
2005-2007年对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)和厚壳贻贝(Mytilus coruscus)种间进行了杂交生产性试验,通过亲贝强化培育、确认雌雄亲贝、改革育苗水体交换方法、投喂混合单细胞藻类、流水培养附着稚贝等技术,获得F1代。结果表明,正交F1代幼虫的成活率明显高于反交F1代和厚壳贻贝,在幼虫培育前期与紫贻贝的成活率相当,但随着幼虫的发育有高于紫贻贝的趋势。正交F1代幼虫的壳长和壳高在培育阶段的前期生长与紫贻贝相当,低于厚壳贻贝,高于反交F1代;但后期的生长明显增快,并高于反交F1代和其他两种贻贝。各试验组贻贝海区养殖的成活率在90%以上,正交F1代最高,...
[期刊] 水产学报  [作者] 宋传文  闫喜武  桑士田  霍忠明  刘青  
为估计紫贻贝生长性状的遗传力,采用平衡巢式设计方法和人工采卵授精技术,按照1雄配3雌的原则,构建了紫贻贝13个父系半同胞家系和39个母系全同胞家系,分别测定了每个家系2、3、5、6月龄生长性状壳高、壳长。运用全同胞组内相关法估计紫贻贝2、3、5、6月龄生长性状的壳高、壳长遗传力。结果表明,雌性遗传方差组分均显著大于雄性遗传方差组分(P<0.05),雌性遗传方差组分存在显著的母性效应(P<0.05),因此父系半同胞组内相关法计算的狭义遗传力是紫贻贝狭义遗传力的无偏估计值。所测各月龄父系半同胞组分估计的壳高遗传力分别为0.29、0.85、0.84和0.87,壳长遗传力分别为0.27、0.87、0....
[期刊] 水产学报  [作者] 陈碧鹃  陈民山  吴彰宽  
氰戊菊酯、胺菊酯对紫贻贝生长的影响THEEFFECTSOFFENVALERATEANDTETRAMETHRINONTHEGROWTHOFMYTILUSEDULIS陈碧鹃陈民山吴彰宽(中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛266071)CHENBiJ...
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