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[期刊] 中国水产科学
[作者]
刘必谦 周湘池 王亚军 俞小燕
利用两种市售的DNA提取试剂盒对几种紫菜进行基因组DNA提取。该方法需要的组织量少 ,需时短 ,获得的基因组DNA纯度高 ,可被AFLP内切酶 ,特别是EcoRⅠ完全酶切 ,完全满足AFLP研究的需要。不同的DNA提取方法及提取出的基因组DNA的质量对酶切效果及以后的实验结果有影响。
[期刊] 水产学报
[作者]
茅云翔 崔菁菁 孔凡娜
高分子量基因组文库是开展条斑紫菜基因组学研究的必备工具。构建了由23 040个Fosmid克隆组成的条斑紫菜孢子体无偏倚基因组文库。检测分析表明:文库克隆重组率为100%;插入DNA片段长度为28~40kb,平均长度为35kb,文库覆盖率约为条斑紫菜基因组的2.78倍;从超级池中筛查条斑紫菜18S rRNA、atpA、h2A、rbcL基因,至少能得到一个阳性克隆,印证了计算所推测的文库覆盖率;随机选取6个Fosmid克隆经100代传代后插入DNA片段未发生丢失或长度变化,表明克隆传代的稳定性。该文库的构建为开展条斑紫菜基因组特性分析和基因克隆奠定了基础。
[期刊] 华北农学报
[作者]
王涛 王超楠 张红 温娟娟 张斌
快速高效的DNA提取是作物大规模分子育种的关键一步。旨为构建一种快速提取大白菜基因组DNA的方法,以大白菜叶片为试验材料,比较了CTAB法、二步CTAB法以及4种碱裂解法提取DNA的质量,分析了不同方法提取的DNA为模板的PCR扩增效果,还对不同方法提取的基因组DNA的保存时间和保存条件进行了比较,选择最优的方法在抗根肿病基因分子标记辅助选择中进行了应用。结果表明,CTAB法和3种碱裂解法提取的基因组DNA作为模板的PCR扩增产物,都可以通过8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测到清晰的条带。其中碱裂解法Ⅲ,
关键词:
大白菜 基因组DNA 快速提取
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
庄华梅 荆玉谱 张林杰 汪宽福 李晓辉 陈建丽 吴刚
研究了不同温度下不同时间处理对小菜蛾caspase-9蛋白酶活性和基因组DNA的影响.结果表明,40、42、45、47℃4个温度处理均能在短时间内使caspase-9蛋白酶活性显著增强;此外,33.5和40℃处理72 h可导致小菜蛾基因组DNA显著降解,电泳时呈现细胞凋亡的特征条带.高温能够诱导小菜蛾细胞凋亡.
关键词:
小菜蛾 细胞凋亡 caspase-9酶
[期刊] 华北农学报
[作者]
徐粤宇 周玉雷 赵茂林 王志平 王克武 张艳
Mb级DNA的制备和酶切是构建YAC,PAC,BAC,BIBAC和TAC文库与大尺度物理图谱的基础。以浓度0.4%(m/m)NaCl人工模拟盐池中生长的多枝赖草再生叶为材料提取细胞核,经钢丝细胞筛过滤,多次回收滤渣和离心上清中的细胞核,相差显微镜调浓度达108个/mL后,经LMP包埋,蛋白酶K降解核蛋白,脉冲电泳纯化回收后,在LMP胶块中2 Mb以上DNA的浓度约为250 ng/μL。在胶中经Hind III部分酶切再用脉冲电泳回收不同大小范围的DNA,电洗脱浓缩除盐后浓度约为25 ng/μL。用此方法得到的核DNA不但无细胞器DNA等的污染,而且浓度高,可直接用于各种人工染色体文库的构建。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
黄建安 黄意欢 罗军武 王坤波 周李华
为了从富含多酚和多糖等多种次生代谢物质的茶树叶片中分离出高质量的基因组 DNA,对 4种植物 DNA提取方法进行改良后 ,以茶树春梢为材料 ,对提取效果进行了比较 ,并首次采用 CTAB区室法提取茶树基因组DNA.结果表明 ,用该 4种方法提取的 DNA,其 OD2 6 0 / OD2 80 都在 1.8以上 ,相对分子质量均大于 2 1kb,能完全被Eco R 酶切消化 ,也能获得清晰的 PCR扩增图谱 .因此 ,只要操作合理 ,4种方法均能提取出高质量的 DNA.
关键词:
脱氧核糖核酸 茶树 提取方法
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘遵春 包东娥 廖明安
通过添加Vc对传统的CTAB法进行改进,结果表明:在磨样时,1 g鲜样中添加0.10 g的Vc提取的DNA质量最高;最佳提取材料是嫩芽,其次是新梢和成熟叶片。
关键词:
金花梨 基因组DNA 提取
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
谢一青 李志真 黄儒珠 肖祥希 王志洁
为从富含次生代谢物的光皮桦Betula luminifera嫩叶中获得高质量DNA,设计了5种先提核再提DNA的CTAB法Ⅰ,CTAB法Ⅱ,CTAB法Ⅲ,CTAB法Ⅳ及改进的SDS法,并以常规CTAB法为对照。用不同的方法就光皮桦基因组DNA进行了提取,采用琼脂糖凝胶电泳检测、A260/A280值测定、限制性内切酶处理和PCR扩增等方法对所提的DNA进行了比较分析。结果表明:实验设计的5种改进方法提取的DNA质量要比常规法的好,但提取的效果差异较大。其中改进的CTAB法Ⅰ是提取光皮桦基因组DNA的最佳方法;PCR扩增结果表明,不同的DNA提取方法会影响PCR带型的变化。图3表1参13
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
吴少华 张大生 潘东明 赖钟雄
提取了木奈基因组 DNA,并以其为模板对影响 RAPD扩增的重要参数进行优化试验 ,以期建立木奈 RAPD反应的优化体系 .结果表明 ,PCR扩增体系最佳条件是 :2 0 μL体积中 ,2 0 0 μmol·L- 1 d NTP、2 .5 mmol· L- 1 Mg Cl2 、0 .2 μmol· L- 1随机引物、2 5 .0 ng·μL- 1 DNA模板、1 -2 U Tag酶
关键词:
木奈 基因组DNA RAPD
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘殿林 杨瑞环 哈玉洁
采用SDS法、尿素法、改良SDS法、氯化苄法和CTAB法对黄瓜的基因组DNA进行提取。结果表明,改良SDS法提取的黄瓜叶片DNA具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光谱特点,其A260/A280在1 7~1 9之间,DNA的产量为450μg/g。用该法提取的黄瓜DNA适合进行RAPD分析。
关键词:
黄瓜 DNA提取方法 RAPD分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
和志娇 谭宏伟 徐中志 和加卫 程在全 和根强 董霞
在总结多种蜜蜂DNA提取方法的基础上,以酒精浸泡保存的东方蜜蜂为试材,发展了一种提取蜜蜂DNA的方法。用此方法提取蜜蜂DNA的OD260/280值显示产物纯度较高,能够被限制性内切酶完全酶切,取材少,时间短。用ISSR分子标记技术对其PCR扩增,可得到清晰的条带。用这种蜜蜂基因组DNA提取的改良方法所获的DNA数量和质量都很高,可用于各种分子生物学实验。
关键词:
蜜蜂 基因组DNA 提取方法
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
梁玉琴 李芳东 傅建敏 乌云塔娜 吴硕
针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试剂盒较改良CTAB法提取的DNA质量高、杂质少,DNA得率略低,但其操作步骤简单,耗时短,毒害小,因其费用较改良CTAB法高,各实验室可根据自身条件选择适宜方法提取柿属植物DNA。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
康强 周鑫 罗燕 田青 程建国 赵位
【目的】探索从林麝粪便中提取基因组DNA并进行物种鉴定的可行性,为林麝野外调查工作以及分子粪便学在林麝保护中的应用提供科学依据。【方法】采集林麝粪便,采用改良的CTAB抽提基因组DNA;按常规PCR法对mTDNA D-looP区和CyT B基因进行扩增测序后,用DNAmAN 6.0软件进行系统发育分析;在不同温度存放不同时间,研究林麝粪便基因组DNA的提取与mTDNA D-looP区和CyT B基因PCR扩增的时效性。【结果】以提取的基因组DNA为模板进行PCR扩增均能特异性地扩增出mTDNA D-looP区和CyT B基因。系统发育分析结果表明:所扩增产物为林麝的mTDNA D-looP区和...
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
张杰 张晓鹏 李鹏高 赵志强
分别将研磨、水煮两种预处理方法和改良CTAB法、试剂盒法两种提取方法进行组合,比较提取小鼠粪便细菌基因组DNA的效果。结果发现,研磨预处理过的样品提取到的细菌基因组DNA的浓度和纯度均高于水煮预处理过的样品,研磨结合改良CTAB法提取到的DNA完整性好于其他方法,研磨结合改良CTAB法是一种提取粪便细菌基因组DNA较为实用可靠的方法。
关键词:
粪便 细菌基因组DNA 提取方法
[期刊] 林业科学研究
[作者]
李发根 杨华 尹光天 许煌灿 甘四明
Genomic DNA was successfully extracted from leaf tissues of two rattan species,Calamus simplificifolius and Daemonorops margaritae,using a modified CTAB method.This method could remove phenolic compounds,polysaccharides and proteins,and the quality and quantity of DNA extracted were reliably charact...
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