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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛SIRT3基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下468头18~24月龄健康秦川母牛，采用DNA直接测序技术进行SIRT3基因全区域遗传变异检测。运用SPSS16.0软件中最小二乘法拟合线性模型，对SIRT3基因不同基因型与秦川牛体尺(体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽)和肉质性状(背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量)进行关联分析。【结果】经DNA测序发现，秦川牛SIRT3基因在第4内含子上存在2个突变位点，分别为C22522T突变和C22680G突变，均存在3种基因型。χ2检验...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛ＳＩＲＴ３基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下４６８头１８～２４月龄健康秦川母牛，采用ＤＮＡ直接测序技术进行ＳＩＲＴ３基因全区域遗传变异检测。运用ＳＰＳＳ１６．０软件中最小二乘法拟合线性模型，对ＳＩＲＴ３基因不同基因型与秦川牛体尺（体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽）和肉质性状（背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量）进行关联分析。【结果】经ＤＮＡ测序发现，秦川牛ＳＩＲＴ３基因在第４内含子上存在２个突变位点，分别为Ｃ２２５２２Ｔ突变和Ｃ２２６８０Ｇ突变，均存在３种基因型。χ２检验．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宋付标 昝林森 王洪程 王洪宝 田万强 王虹 钟昕
【目的】对秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行SNPs检测,并研究其与秦川牛肉质性状的相关性。【方法】采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法,对324头2~3岁秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行多态性分析,用最小二乘法拟合线性模型对Chemerin基因不同基因型与秦川牛肉质性状(宰前活质量、胴体质量、背膘厚、大理石花纹评分、系水力、眼肌面积和嫩度)进行关联分析。【结果】秦川牛Chemerin基因第2外显子868 bp处发生了A→G突变,第6外显子2 948 bp处发生了C→G突变;用PCR-SSCP方法检测得到AA、AG、GG、EE和EF 5种基因型,其基因型频...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
刘嫣然 吴森 王晓宇 昝林森
【目的】研究秦川肉牛FGF2基因的多态性及其与肉牛生长和肉质性状的关联性。【方法】选取1824月龄的健康秦川肉牛384头,测定其生长和肉质性状指标,采集血样,采用DNA技术检测FGF2基因全部外显子中的单核苷酸突变位点,对突变位点进行基因型分型,研究其单核苷酸基因多态性(SNP),并以一般线性模型(GLM)分析该SNP位点与秦川肉牛生长和肉质性状的关联性。【结果】在第1、2外显子上未发现突变位点,在第3外显子上存在4个SNP突变位点:SV1(g.A54740>T),SV2(g.A54758>C),SV3(
关键词：
秦川肉牛 FGF2基因 多态性 关联分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘梅 朱怡轩 王孝义 陈强 董新星 严达伟 李明丽
【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料，对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测，选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的差异分析。【结果】在宣和猪PID1基因外显子3区域共检测出4个SNP位点，分别为253643 bp处的T→C(T253643C)、253675 bp处的G→C(G253675C)、253734 bp处的A→G(A253734G)和253827 bp处的G→A(G253827A)。4个SNP位点均检测出3种基因型，分别以等位基因T、G、G、A及基因型TT、GC、AG、AA的频率最高。4个SNP位点共有9种单倍型和24种单倍型组合，其中单倍型CGGA和单倍型组合CGGA/TCAA的频率最高。各位点杂合度在0.4490～0.4997，都属于中度多态且都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P >0.05)，遗传多样性比较丰富。G253675C位点与大理石纹评分存在显著关联，其中GC基因型可显著提高大理石纹评分(P
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
余横伟 桂林生 胡言 昝林森
【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择1824月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,提取血液DNA,PCR扩增FABP3及FABP4基因,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析SNP位点基因型和单倍型组合对肉牛肉用性状(背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量)的影响。【结果】测序发现,在FABP3基因第3个内含子上检测出1
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
田万强 梅楚刚 付常振 辛亚平 张松 王国庆 昝林森
【目的】研究秦川牛、南阳牛、鲁西牛和安格斯牛共６３０头个体的单磷酸腺苷激活的蛋白激酶α２亚基（ＡＭＰＫα２）基因ＰＲＫＡＡ２的多态性，并分析其多态性与２００头秦川牛生长及肉质性状的关联性。【方法】利用ＰＣＲＳＳＣＰ、ＤＮＡ测序、飞行质谱（ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ）等技术，分析检测４个品种牛ＰＲＫＡＡ２基因６个外显子的单核酸多态性（ＳＮＰＳ）；采用生物信息学方法结合统计分析软件，分析秦川牛各多态位点的遗传变异特性与体尺及肉质性状的关联性。【结果】ＰＲＫＡＡ２基因第２、４、６、７、８、９外显子中，只检测到第４外显子２７Ｇ＞Ｃ和６０Ｔ＞Ｃ ２个突变位点；关联分析表明，２７Ｇ＞Ｃ位点与秦川牛背膘厚和眼肌面积．．．
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
邱海芳 汪超 张庆德 刘榜
采用PCR-RFLP方法对通城、大白和长白3个纯种及长大通和大长通2个三元杂种共5个群体MyoD1基因第1内含子的多态性进行了研究,并对多态位点与生长、胴体和肉质性状进行了关联分析。结果发现第1内含子第257位存在1个A/C颠换,引起DdeⅠ酶切位点的改变。PCR产物经DdeⅠ酶切后,检测到2个等位基因,3种基因型,其中通城猪中C等位基因的分布占主要优势,大白、长白猪中2种等位基因的分布频率相近。关联分析结果表明,不同的基因型与肉色评分和失水率相关(P<0.05或P<0.01);CC基因型个体的肉色评分显著高于AA和AC基因型个体;而CC基因型个体的失水率极显著低于AA基因型个体。研究结果进一...
关键词：
猪 MyoD1基因 多态性 肉质性状
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
周建强 祁增源 韩银仓 刘秀 孙永刚
[目的]研究牦牛SMAD4基因SNPs与生长性状的关系,探寻与牦牛生长性状相关的分子标记。[方法]采用DNA测序和单倍型分型技术,对青海牦牛SMAD4基因进行SNPs检测及其基因分型、连锁不平衡和单倍型分析,并对多态位点的基因型及组合单倍型与牦牛生长性状的关联性进行分析。[结果]牦牛SMAD4基因在内含子区域存在6个突变位点,其中g.393A>G、g.555A>G、g.6525A>G和g.18360C>T均存在3种基因型,g.582A>T和g.6492C>T均存在2种基因型。连锁不平衡分析发现,6个位点间不存在强连锁不平衡效应。单倍型分析发现,在14种不同的单倍型中,单倍型H_1的发生频率最高。关联性分析表明,g.393A>G位点与体斜长、胸围和管围均显著相关(PG位点与体斜长显著相关(PT位点与体质量和体高均显著相关(PT位点与体高显著相关(PG位点与体质量显著相关(PT位点与胸围显著相关(P<0.05)。基因型组合发现,单倍型H_1H_(14)可能是影响牦牛生长性状的最优组合。[结论]牦牛SMAD4基因内含子区域上的6个位点与生长性状显著关联,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张小白 昝林森 王洪宝 郝瑞杰 杨彦杰
【目的】研究秦川牛THRSP基因第一外显子184bp处C/T错义突变与部分肉质性状的关系。【方法】选取405头相同饲养条件下无亲缘关系的18～20月龄的秦川牛,利用PCR-SSCP技术对THRSP基因进行个体基因型分析;运用SPSS统计软件中的GLM模型分析该SNP与93头秦川牛部分肉用性能指标的相关性。【结果】该位点引发THRSP基因第51个氨基酸由缬氨酸(GTG)变为丙氨酸(GCG)。多态信息含量为0.3583,属于中度多态,杂合度为0.4676,有效等位基因数为1.8783。卡方检验显示该位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.01)。相关分析结果显示,该位点基因型与嫩度...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
胡怡菲 昝林森 王洪宝 黄磊 钟昕 李常青
【目的】研究秦川牛生长激素基因第2外显子的多态性,及其与部分体尺性状指标的相关性。【方法】以502头2周岁左右秦川牛为研究对象,利用PCR-RFLP技术检测生长激素基因上存在的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与秦川牛体尺性状的关联性。【结果】在GH基因第5外显子中发现了2处SNPs,分别为错义突变和同义突变。位点1经AluⅠ酶切后产生AA、AB和BB 3种基因型,A、B等位基因频率分别为0.825 7和0.174 3;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体之间在体高、胸围、体斜长和尻长上差异显著。位点2经Afl...
[期刊] 华北农学报
[作者]
王华 魏玉兵 童建伟 张明军 王建福 王欣荣 成述儒
为从分子水平研究甘肃境内典型养殖模式下甘肃高山细毛羊、小尾寒羊、藏羊、蒙古羊和滩羊５个绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３基因多态性与屠宰性能和肉品质的相关性，探讨以ＰＲＫＡＧ３为候选基因，提高绵羊屠宰性能和肉品质的可能性。采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术对５个绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３基因外显子４，５和内含子４多态性进行检测，并就ＰＲＫＡＧ３基因多态性与９月龄屠宰性能和肉品质进行相关性分析。结果表明，在ＰＲＫＡＧ３基因２ ６８９ ｂＰ处发生了Ａ＞Ｇ的突变，位于第４内含子第２３ ｂＰ处，表现出３种基因型，ＡＡ、Ａｂ和ｂｂ。纯合度（Ｈｏ）分别为０．６７，０．６９，０．７６，０．６９，０．５９，杂合度（Ｈｅ）分别为０．３３．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
牛富彪 王丽君 杨菁 陈玲 王洪亮 贺花 刘小林
【目的】以秦川牛糖原磷酸化酶基因PYGM为候选基因,研究其在秦川牛生长和胴体性状形成中的作用。【方法】以300头(24±2)月龄纯种秦川牛为试验材料,通过DNA测序和PCR-RFLP技术,研究PYGM基因的多态性对秦川牛个体宰前活体质量、胴体质量、体高、体斜长和屠宰率共5个性状的影响;运用RT-PCR技术分析PYGM基因在秦川牛成体和4~5月龄胎牛2个阶段的肺脏、心脏、肝脏、舌、背最长肌及脾脏6种组织中的表达情况。【结果】半定量RT-PCR检测结果显示,PYGM基因在秦川牛胎儿和成年时期的心脏、舌及背最长肌组织中的表达量均显著高于其他组织。并在该基因中筛查到了2个新的单核苷酸变异(SNP)位点...
[期刊] 华北农学报
[作者]
宋姗姗 刘宗岳 丛波 刘琳玲 宋兴超 彭英华
为了研究胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)基因外显子2和外显子11的单核苷酸多态性,分析该基因变异与水貂生长性状的关联性,以红眼白水貂、金州黑水貂和咖啡水貂共计235个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR产物克隆和Sanger测序技术,筛查IGF-1R基因SNP位点,将差异位点与不同种群的水貂生长性状进行关联分析。结果表明,红眼白、金州黑水貂的外显子2和外显子11上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 1782G> A;咖啡水貂在外显子2上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 218T> A,在外显子11检测到1个SNPs:c. 1782G> A。c. 207G> A和c. 1782G> A都属于无义突变。c. 218T> A位点属于有义突变,氨基酸发生改变,脯氨酸变为精氨酸。关联分析表明:c. 207G> A与金州黑水貂和咖啡水貂体长性状显著相关(P A与咖啡水貂的体长和体质量显著相关(P A位点GG基因型是水貂体长的优势基因型;合并基因型GGGA和GGAA可能是影响金州黑水貂体长体质量的有利基因型,认为IGF-1R基因可能是影响水貂生长性状的候选基因。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
樊月圆 富国文 昝林森 李卫真 王绍卿
以6个牛品种(秦川牛、南阳牛、郏县红牛、鲁西牛、安格斯和夏南牛)共计717个个体为研究对象,采用PCR-SSCP方法与DNA测序相结合的方法,对PPARδ基因全部编码区及部分内含子区域的SNPs位点进行检测,并分析了SNPs位点与秦川牛的部分胴体、肉质性状的相关性。结果表明,在检测样本中,未检测到编码区的突变,仅在PPARδ基因第2内含子上发现了1个61 C→T的突变。χ2检验显示,在该位点,南阳牛和夏南牛处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),其余4个群体均处于Hardy-Wein-berg不平衡状态(P<0.05);除夏南牛群体处于中度多态,其余5个群体均属于低度多态;相...
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