为便于开展种猪采食性状研究及满足测定设备智能化发展需求，设计了一套基于物联网技术和web技术的种猪性能测定信息管理系统。系统选取CAN总线进行数据双向传输，采用B/S(Browser/Server)前后端分离架构，前端基于Reactjs技术栈，后端采用flask web框架和MySQL数据库进行系统开发；2次测定试验结果表明，系统数据传输可靠性高，各功能模块满足预期设计要求，满足种猪性能测定实际使用需求；以杜洛克种猪为研究对象，分析了采食性状与生长性状间的表型相关，并构建了种猪达100 kg体质量日龄偏最小二乘回归（partial least square,PLS）预测模型，交叉验证结果显示PLS测试集平均决定系数为0.68，平均MAE为3.2 d，使用试验数据对PLS模型进行测试，测试结果表明可以使用采食性状与生长性状结合对种猪生长速度进行提前预测。

根据猪Leptin基因的已知序列设计引物(序列号:U66254、AF026976),PCR扩增产物用变性高效液相色谱技术(DHPLC)和直接测序法进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,对其中的4个SNP位点(C3469T、C3952G、C4115T和C4227T)进行基因型与生长性状的关联分析。结果共获得35个多态位点,其中C4115T和C4227T位点在长蓝F2资源群中分别缺少1个基因型,且与各性状相关不显著;C3469T位点与猪的平均日增重存在极显著相关(P<0.01),TT型和CC型显著高于TC型;C3952G位点与猪的体长和眼肌面积等存在一定相关(P<0.1)。

以杜洛克猪、长白猪和大约克猪3个典型瘦肉型猪种为研究对象,分别以Saturation为日龄与体质量关系拟合,线性模型为体质量与背膘关系拟合的最适模型,分别制定出符合国情的瘦肉型猪早期目标性状(50 kg体质量日龄和背膘厚)的校正公式。对早期性状校正值与全期性状校正值的简单相关分析(CORR)和典型相关分析(CANCORR),相关系数均达到极显著,证明早期性状校正公式是适合的。早期性状与终测性状间具有显著相关性。选用典型综合指数模型分别进行早期和全期生长性状的综合评定,经Spearman秩相关分析达到极显著,说明在一定选择强度下,早期性状的表观选择与全期选择具有很高的一致性,早期选择是可行的。

【目的】获得猪POU1F1基因启动子区的多态信息,揭示其在不同品种中的分布特点,阐明其与生长性状的关联性。【方法】采用PCR克隆、DNA测序和PCR-RFLP技术进行POU1F1基因启动子区多态分析,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。【结果】在POU1F1基因1.5 kb的启动子区域内发现5个多态位点;其中,5 bp短片段插入或缺失突变的A等位基因频率在引入品种猪中最高,在培育品种中中等,在中国地方品种最低。一般线形模型分析表明,该多态位点与猪的生长性状存在显著相关。多重比较分析发现,AA基因型个体的体高、体长、胸围和体重显著高于AB和BB基因型个体(P<0.05),而AB和BB基因型...

ｇｈｒｅｌｉｎ是脊椎动物的一种脑肠肽，有促进摄食的功能，并能促进生长激素（ｇｈ）释放，参与能量平衡调控和糖类代谢。为探索ｇｈｒｅｌｉｎ基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性，针对大口黑鲈ｇｈｒｅｌｉｎ基因的启动子序列，实验采用直接测序法获得了２个ＳｎＰＳ位点：Ｓ１（Ａ－６４２Ｃ）和Ｓ２（Ａ－６３９Ｃ）。随机选取同批繁殖、同塘养殖的大口黑鲈采用ＳｎＡ ＰＳｈｏｔ方法进行ＳｎＰＳ位点检测和分型。结果显示，实验群体在ｇｈｒｅｌｉｎ基因２个ＳｎＰＳ位点上基本处于哈温平衡，Ｓ１和Ｓ２共组成５种双倍型（Ｄ１、Ｄ２、Ｄ３、Ｄ４和Ｄ５）。基因型与生长性状的相关性分析结果表明，Ｓ１位点ＡＣ型个体在体高与全长上显著．．．

为研究SKIP基因对山羊生长发育的影响,并寻找与山羊生长性状相关的分子标记,利用绵羊与牛SKIP基因的同源序列设计引物,RT-PCR扩增得到一段长1 350bp的山羊SKIP基因表达序列,包括其完整编码区序列,编码449个氨基酸的蛋白。通过序列Blast比较和系统发育树的构建,发现山羊SKIP与绵羊SKIP序列相似性最高(99.52%)。利用生物信息学分析SKIP蛋白的理化性质,预测SKIP蛋白分子质量为52ku,等电点为5.18,包含典型的疏水区域和磷脂酰肌醇5-磷酸磷酸酶结构域,定位在细胞质(60.9

利用2b-RAD技术对119尾黄条(鱼师） (Seriola lalandi)个体进行测序，共获得黄条(鱼师）SNP分子标记26665个，对黄条(鱼师）个体的体质量和全长这2个重要生长性状进行全基因组关联分析，筛选与体质量和全长性状相关的SNP位点和候选基因。结果显示，黄条(鱼师）体质量性状中共筛选到17个体质量显著关联的SNP位点，找到17个可能的候选基因，全长性状共筛选到12个潜在显著关联位点，找到12个可能的候选基因。利用KEGG数据库对可能的候选基因进行Pathway分析，得知候选基因主要参与了细胞或组织生长发育相关的代谢通路调控过程，可能是影响黄条(鱼师）生长性状密切相关的重要候选SNP位点和功能基因，结果可为今后黄条(鱼师）种质资源可持续利用和育种提供遗传信息资料积累。

【目的】探讨ADIPOQ遗传变异对绵羊生长性状的影响，找到与宁夏优质肉羊培育中生长性状相关的分子遗传标记，为宁夏优质肉羊的分子辅助育种的研究提供依据。【方法】首先利用液相捕获测序技术获得ADIPOQ在杜泊羊、滩羊和小尾寒羊中的变异位点，同时采集383只3个品种的不同杂交后代群体耳组织，采用飞行质谱技术对确定的SNPs位点进行基因分型检测，并使用Haploview软件对多态性位点进行连锁不平衡分析和构建单倍型，与绵羊初生和3月龄的生长性状进行关联分析。【结果】共筛选到7个SNPs位点，且7个位点在杂交后代群体中均表现出多态性，SNP1—SNP7位点的优势基因型分别为CC、GG、GG、CT、AG、GG和AA，优势等位基因分别为C、G、G、C、G、G和A。X~2检验发现，所有位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（除SNP7位点在所有个体中偏离了平衡）。SNP1（F_2代除外）、SNP4、SNP5和SNP6位点在各杂交后代及所有个体中均处于中度多态（0.25≤PIC<0.50），SNP2和SNP3在F_2代及SNP7在H1代群体中均处于中度多态（0.25≤PIC<0.50），而在其他群体中处于低度多态（PIC<0.25）。连锁不平衡分析发现，SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成了两处强连锁，均构建出3种单倍型，组合后分别形成4和6种基因型，其中优势基因型分别为H1H1和H4H6。将SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成的单倍型再组合后产生13种基因型，其优势基因型为H1H1H4H6。单个位点关联分析表明：SNP1位点在F_1代群体中，GG基因型的初生胸围显著高于CG基因型（P<0.05），在H2代群体中，CC基因型的初生体斜长显著高于CG基因型（P<0.05）。SNP2位点在H_1代群体中，CC基因型的初生体高显著低于CG和GG基因型（P<0.05）。SNP3位点在F_1代群体中，AG基因型的3月龄体重显著高于GG基因型（P<0.05），在H_1代群体中，AA基因型的初生体高显著低于AG和GG基因型（P<0.05）。SNP4位点在F_1代群体中，CC基因型的3月龄体重显著高于CT和TT基因型（P<0.05），在F_2代群体中，CT基因型的初生体重和初生胸围显著高于TT基因型（P<0.05），在H_1代群体中，TT基因型的初生体重显著低于CC和CT基因型（P<0.05），在H_2代群体中，TT基因型的初生体高和初生体斜长显著高于CT基因型（P<0.05）。SNP5位点在F_2代群体中，AA基因型的初生体高和初生体斜长显著高于GG基因型（P<0.05）。SNP6位点的不同基因型在F_2代、H_1代和H_2代的初生体重、体高、体斜长、3月龄体高和胸围上均有不同程度的显著差异（P<0.05）。SNP7位点在H2代群体中，AA基因型的初生体斜长显著高于GA基因型（P<0.05）。联合所有群体进行分析时发现，SNP2位点CG基因型的初生体重和体斜长显著高于GG基因型（P<0.05），SNP4位点TT基因型的初生体重显著低于CC和CT基因型（P<0.05），SNP6位点AA基因型的初生体重显著高于GG和GA基因型（P<0.05）、初生胸围显著高于GG基因型（P0.05）。单倍型组合关联分析发现：H2H3基因型的初生体重和初生体斜长显著高于其他基因型（P<0.05）；而SNP5-SNP6单倍型组合中，H5H5基因型的初生体重显著高于H5H6和H6H6（P<0.05）、初生体高显著高于H5H6（P<0.05）、初生胸围显著高于H6H6（P<0.05），H4H4基因型的3月龄体重显著高于H5H5基因型（P<0.05）、3月龄体高和体斜长显著高于H4H6基因型（P<0.05）、3月龄胸围显著高于H4H5、H5H6和H5H5基因型（P<0.05）。SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成的单倍型再组合后，H2H3H4H4基因型的初生体重、体高、体斜长和胸围最高，与其他基因型有不同程度的差异，H1H1H4H6的3月龄体斜长显著低于H1H2H4H4和H2H2H4H4基因型（P<0.05）。【结论】ADIPOQ的遗传变异对绵羊的生长性状具有不同程度的影响，研究中的7个SNPs位点可以作为宁夏优质肉羊选育中生长性状的潜在分子标记。

采用四引物扩增受阻突变体系PCR法对中华鳖的2个SNP位点进行验证,并统计其基因型频率。采用方差分析法分析2个SNP位点与中华鳖6个生长性状(体质量、背甲长、背甲宽、腹甲长、体高和裙边宽度)的差异。结果显示,只有A–1609G位点上的体高和裙边宽度有显著差异;这2个SNP位点的不同基因型共组成6种双倍型(去掉频率小于3%的双倍型D1、D6和D9),ANOVA分析结果表明这6种双倍型的6个生长性状间均存在显著差异,D4双倍型6个生长性状的均值最大,属于生长优势双倍型。筛选到的IGF2基因上的2个SNP位点具

探讨陆川猪和大白猪IGF-Ι基因多态性与生长性状的关系,以期为猪生产性状标记辅助选择侯选基因提供理论依据。试验采用PCR-SSCP技术,在陆川猪和大白猪群中进行了IGF-Ι基因的基因型频率检测及不同基因型的生长性状效应分析。结果表明,IGF-Ι基因对陆川猪和大白猪的断奶重和平均日增重影响显著(P0.05)。

采用家系选育与群体选育相结合的方法，以壳金性状和生长性状为主要选育指标，经过连续４代的选育获得了长牡蛎第４代壳金选育品系（Ｆ４）。本实验以Ｆ４代为亲本，采用巢式设计方法和人工授精技术，成功构建了２５个长牡蛎壳金全同胞家系，分别测定了每个家系生长到９月龄时３０个个体壳金性状颜色参数和生长性状，分析了２类性状的表型变异，并对壳金性状的遗传参数及与生长性状的相关性进行了分析。结果显示，壳金性状颜色参数Ｌ＊、ａ＊、ｂ＊、ΔＥ的遗传力分别为０．１３±０．０９、０．６９±０．１９、０．３０±０．１３、０．３８±０．１５；Ｌ＊、ａ＊、ｂ＊和ΔＥ之间的遗传相关和表型相关范围分别为–０．２５～０．３７、–０．１．．．

大口黑鲈为肉食性鱼类,传统养殖过程中使用大量的冰鲜鱼为饵料,冰鲜鱼的使用不仅增加了养殖成本,而且多余的冰鲜鱼残饵还会给环境带来严重的污染。为了保护环境并降低养殖成本必须减少冰鲜鱼的使用量,本实验以选育适合人工配合饲料饲喂大口黑鲈为研究目标,用人工配合饲料作为饵料驯化大口黑鲈幼鱼,在驯食后14和16 d,测定其体质量、全长、体高等生长指标。同时在大口黑鲈转录组测序分析获得的SNP位点中,选择其所在序列的基因功能与能量代谢有相关性的7个SNP位点进行SNaPshot分型,用SPSS 19.0进行卡方分析标记与生长性状的相关性。结果发现,序列Unigene031044中的C1332G位点、Unigene085384中的A741G位点和Unigene022319中的A284G位点在体质量、全长及体高性状上存在显著差异。这3个SNP位点所在的基因经预测分别与雌二醇17β脱氢酶12B (hsd17b12b)基因、长链酰基辅酶A合成酶家族成员1(acsl1)基因和琥珀酸脱氢酶组装因子2(sdhaf2)基因具有很高的同源性,推测上述3个SNP位点的变异可能影响了基因表达产物对脂肪酸代谢或三羧酸循环的调节功能,与大口黑鲈对人工配合饲料的利用能力存在密切的相关性。本研究筛选得到的与驯食相关的SNP位点为大口黑鲈功能基因多态性的进一步研究,及加快大口黑鲈食性改良与驯化育种的遗传研究提供了科学的参考依据。

为了筛选可用于遗传选育的标记，用微卫星标记分析了梭鲈快速生长品系F3群体的遗传结构，评估了不同基因型与生长性状（体质量、全长、体长、体高、体厚、头长、吻长、尾柄高、尾柄长）的相关性。遗传结构评估结果显示：群体平均等位基因数为4.5，观测杂合度为0.746(0.520～0.954)，期望杂合度为0.691(0.441～0.851)，平均多态信息含量为0.641(0.412～0.843)，群体处于高度多态水平（PIC>0.5）。基因型与性状关联分析结果显示38个微卫星标记与至少1个性状表现出不同程度的相关性（P<0.05），其中HLJSL018、HLJSL021、HLJSL022等21个标记与相应性状的相关性达到极显著水平（P<0.01）。9个性状检测到2～21个显著相关的微卫星标记，与体长呈显著相关的标记最少（HLJSL039和HLJSL042）(P<0.05)；与尾柄高呈显著相关的标记最多（21个），其中HLJSL018、HLJSL021和HLJSL022等11个标记与其呈极显著相关（P<0.01）。与体质量呈显著相关的标记有8个，其中HLJSL018和HLJSL067与其呈极显著相关（P<0.01）。以高于总体均值且比例达5%以上为优势基因型的筛选标准，在38个标记共获得195个优势基因型，每个标记获得1～10个优势基因型，其中HLJSL073获得优势基因型最少，HLJSL079获得优势基因型最多。本研究评估了梭鲈选育群体的遗传结构，获得了与性状显著相关的标记，研究结果可用于指导梭鲈遗传选育。

根据草鱼(Ctenopharyngodon idella)EST-SNP库中预测的柠檬酸合酶基因的1个Contig序列,设计引物扩增该基因的部分序列,然后采用PCR产物直接测序法筛选SNP突变点。测序的序列经比对后,共筛选到2个在内含子10上的SNP突变点:A-386G和C-499G。随机选择同批繁殖和同塘混养的144尾草鱼对2个SNP位点用Snapshot方法进行检测和分型,并统计基因型频率。A-386G位点的AA基因型占47.10%,AG基因型占38.41%、GG基因型占14.49%;C-499G位点的CC基因型占31.85%,CG基因型占46.67%,GG基因型占21.48%,均属于中度...

采用灰色关联分析方法对牙鲆(Paralichthys olivaceus)10个选育家系的9个生长性状与体质量的关联度进行分析和评价。首先对体质量与生长性况进行数列无量纲化处理,计算出每个生长性状与体质量的关联系数和关联度,根据灰色关联度构建两两比较判断矩阵定量分析各生长性状对体质量的影响度。结果显示,每个生长性状与体质量的关联度由大到小依次为:全长(0.875 8)、体长(0.859 3)、尾柄高(0.830 7)、躯干长(0.827 7)、头长(0.803 5)、尾长(0.781 2)、体高(0.740 2)、吻长(0.665 7)和尾柄长(0.654 0)。体质量的主控因素为:全长、体长...