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[期刊] 中国水产科学
[作者]
鲁翠云 张晓丽 顾颖 李超 董在杰 冯建新 程磊 孙效文
用微卫星标记分析了鲤鱼(Cyprinus Carpio L.)的2个品种福瑞鲤和豫选黄河鲤选育群体的遗传结构,并揭示了雌雄个体间遗传距离的分布规律。结果表明,23个微卫星标记在福瑞鲤(Fr,n=192)和豫选黄河鲤(yX,n=96)中各检测到160个和131个等位基因。福瑞鲤的平均有效等位基因数(n_e)、观测杂合度(H_o)、期望杂合度(H_e)和多态信息含量(piC)分别为4.559、0.695、0.741和0.702,群体处于高度多态水平(piC≥0.5);豫选黄河鲤的4项遗传多样性参数分别为3.620、0.665、0.642和0.600。虽然豫选黄河鲤同样处于高度多态水平(piC≥0....
[期刊] 淡水渔业
[作者]
顾颖 鲁翠云 张芹 李超 屈长义 王兆平 程磊 孙效文 冯建新
用35个镜鲤微卫星QTL标记评估了豫选黄河鲤(Cyprinus Carpio var.haemaTopTerus)群体的遗传结构,并评估了不同基因型与生长性状(体重、体长、体高和体厚)的相关性,筛选了在群体中具有性状优势的基因型。35个微卫星标记在288个豫选黄河鲤个体中的扩增结果显示,各标记等位基因数为3~13,平均每个标记6.828 6个;平均有效等位基因数为4.520 8;平均观测杂合度为0.603 0;平均期望杂合度为0.701 9;平均多态信息含量为0.665 6,群体整体处于高度多态水平(piC>0.5)。利用spss19.0的GLm模型分析标记与性状的相关性,共17个微卫星标记与...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
鲁翠云 杜雪松 郑先虎 李超 程磊 孙志鹏 孙效文 陈忠
为了评估金边鲤(Cyprinus carpio var.Jinbian)群体的遗传组成,制定合理的繁殖配组策略,本研究用24个QTL标记分析了金边鲤亲本群体的遗传结构及雌、雄个体间遗传距离。结果显示:在192尾样本中共检测到184个等位基因,群体平均等位基因数(N_o)、有效等位基因数(N_e)、观测杂合度(H_o)、期望杂合度(H_e)和多态信息含量(PIC)分别为7.667、3.941、0.590、0.707和0.670,表明群体处于高度多态水平(PIC≥0.5),具备进一步选育优良品种的遗传潜力。经Bonferroni校正的Hardy-Weinberg平衡检验显示,金边鲤群体有10个位点显著或极显著偏离平衡,多数位点表现为杂合子缺失。在此基础上统计了金边鲤雌、雄个体间的遗传距离在0.1231~1.8563之间,遗传距离呈正态分布,且中间值位于0.7~0.9,占38.36%,结合聚类图将192个个体划分为3个繁殖组,组间呈现出显著的遗传分化,交叉配组能够有效避免近亲繁殖。研究结果为金边鲤选育、繁殖配组及持续利用提供参考。
[期刊] 水产学报
[作者]
程清清 顾钱洪 方冬冬 李学军 周传江 孟晓林 聂国兴
为了解河南省境内黄河水系和卫河水系棒花鱼和条的鱼类遗传多样性现状,利用线粒体细胞色素b(cytb)基因,对这两种鱼类开展群体遗传学研究。结果显示,棒花鱼和条群体多态性较低;系统发育树和单倍型网络图结果显示棒花鱼和条均由3个线粒体谱系组成;棒花鱼和条种群间均存在明显的遗传分化,种群间中等偏低的基因流解释了两种鱼类均具有较低的遗传多样性和明显的种群分化;群体历史动态分析显示,棒花鱼和条种群数量分别在距今约0.019百万年和0.026百万年开始锐减。鉴于群体多态性,种群分化和群体历史动态研究,这两种鱼
[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘娟 袁林聪 李伟斌 白寿有 李进荣 蔡实旺 尹馨玉 孔令富 武祥伟
杞麓鲤(Cyprinus carpio chilia)是云南特有水产种质资源,为研究杞麓鲤保种群体的遗传结构,本研究开发了15个多态性高的杞麓鲤微卫星(SSR)分子标记,并对保种群体进行了SSR分析。结果显示:杞麓鲤保种群体40个个体的平均等位基因数为7.8个,有效等位基因数为3.2~8.9,期望杂合度为0.696 4~0.900 0,多态信息含量为0.647 6~0.877 0,保种群体遗传多样性水平较高。基于突变模型与等位基因分布均检测到了保种群体的瓶颈效应,近交系数F_(is)为0.249 7,保种群体存在近交现象,并且10个SSR位点偏离Hardy-Weinberg平衡。结果表明杞麓鲤保种群体的遗传多样性较高,但经历了瓶颈效应,不利于继续保种。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李盛文 贾智英 柏盈盈 李池陶 石连玉
应用35对多态性较高的微卫星标记对鲤新品种——松浦红镜鲤(Cyprinus carpio var.songpu red mirror carp)的保种群体进行了遗传结构研究。结果显示,在91尾松浦红镜鲤个体中,共检测到140个等位基因,每个位点等位基因数3~6个,平均有效等位基因数为3.042 6;期望杂合度范围为0.375 0~0.827 4,均值为0.649 3;多态信息含量范围为0.396~0.912,均值为0.586 9;哈迪-温伯格平衡检验结果表明群体处于不平衡状态;平均固定系数为-0.026,说明该群体存在杂合子过剩现象;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计...
关键词:
松浦红镜鲤 微卫星 群体遗传结构 保种
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾智英 李飞 李池陶 石连玉
松浦鲤作为鲤鱼的一个培育品种,在我国北方地区的鱼类养殖实践中占有重要地位,为了促进该品种优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用,本研究应用29对多态性较高的微卫星标记对松浦鲤保种群体进行了遗传结构研究。结果显示:在194尾松浦鲤个体中,共检测到166个等位基因,平均有效等位基因数为5.724 1,平均多态信息含量为0.584 9,平均期望杂合度为0.572 2;哈迪-温伯格平衡检验结果群体处于不平衡状态;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为69.8。该研究表明人工选择压力对松浦鲤保种群体造成了较大影响,虽然其仍具有较丰富的遗传多样性,但由于经历了瓶颈效...
关键词:
松浦鲤 保种 微卫星 遗传结构
[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘娟 袁林聪 杨剑虹 孔令富 李伟斌 白寿有 李进荣 刘林江 尹馨玉 高旭 王婷 武祥伟
为了掌握元江鲤(Cyprinus carpio yuankiang)3个连续选育世代群体遗传结构变化情况,采用微卫星分子标记分析了群体遗传多样性水平和遗传结构。结果显示:15个微卫星位点在3个群体中共获得116个等位基因,平均7.73个/位点,每世代平均等位基因数从7.266 7减少至5.066 7,观测杂合度从0.768 0降低至0.758 5,多态信息含量从0.763 4降低至0.745 1,遗传多样性水平降低。相邻世代间的遗传距离从0.080 6减小至0.044 9,遗传相似性从0.846 4增加至0.874 7,遗传相似性逐步提高。相邻世代间的遗传分化系数(F_(st))从0.068 1降低至0.023 0,世代间的遗传分化已处于低分化水平,人工选育已对元江鲤育种群体的遗传结构产生了显著影响。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李潇轩 郑端端 罗明坤 杨志强 郭珺 王兰梅 董在杰
为探讨不同体色锦鲤和“福瑞鲤2号”遗传多样性及变异情况,基于mtDNA D-loop序列对6种颜色(全白、全红、红白、大正三色、白写、绯写)锦鲤、2个“福瑞鲤2号”(青灰和红色)及2个杂交鲤群体(青灰♀×红白锦鲤♂、红白锦鲤♀×青灰♂),共150尾个体进行序列分析。结果发现,全长932bp的D-loop序列,A、T、G、C含量为33.2%、32.8%、14.2%和19.8%。所有个体共检测34个变异位点,呈18个单倍型。其中,红白和绯写存在2个优势单倍型,全白和青灰“福瑞鲤2号”均存在2个特有单倍型,青灰、红色“福瑞鲤2号”共享1个优势单倍型。10个鲤群体间遗传距离0.001~0.018,遗传分化指数(F_(st))0.011~0.933。分子方差(AMOVA)分析群体间变异67.17%,群体内变异32.83%,呈极显著(P<0.01)分化水平。研究表明,绯写、全白和大正三色3个锦鲤群体具较高遗传多样性,白写、“福瑞鲤2号”(青灰和红色)及杂交鲤遗传纯度较高,结果丰富了不同体色鲤种质资源遗传数据,为后期种质资源利用和遗传选育提供参考。
[期刊] 海洋渔业
[作者]
纪达 杨玉梅 姚俊杰 王益海 张书海
为探究鲤(Cyprinus carpio)养殖群体遗传多样性与遗传分化现状,基于线粒体DNA Cyt b基因,采用PCR扩增与直接测序法,对贵州7个鲤养殖群体进行遗传多样性及遗传结构分析评价。结果显示,152尾个体共界定了16种单倍型,7个养殖群体整体单倍型多样性指数(H_(d))、核苷酸多样性指数(P_(i))分别为0.792、0.00323。单倍型网络图(Network)显示,7个养殖群体间没有形成明显的谱系结构和地理结构。AMOVA分析结果显示,群体间和群体内变异分别占41.63039%和 58.36961%,遗传变异系数F_(ST)为0.41630,达到极显著差异(P<0.0001)。基因流N_(m)值显示,除松浦镜鲤与松浦红镜鲤群体,金背鲤与建鲤群体N_(m)值分别为2.238、4.805外,其余种群间N_(m)值均
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
李可 马徐发 谢鹏 高萌 郭焱 谢从新 侯杰
利用16对多态性微卫星标记对新疆额尔齐斯河干流北湾河段、支流哈巴河以及乌伦古湖拟鲤(Rutilus rutilus)3个地理群体的遗传多样性及遗传结构进行了分析。结果显示,16个微卫星位点的平均多态信息含量PIC、期望杂合度He和等位基因数AN分别为0.902 9、0.916 8和18.937 5,遗传参数均反映出3个群体较高的遗传多样性水平。乌伦古湖群体的遗传多样性水平略低于哈巴河和北湾群体。主成分分析表明,影响乌伦古湖群体与哈巴河和北湾群体间遗传多样性差异的主要因素可能为盐度。遗传分化指数和UPGMA聚类分析显示3个群体间均未发生种群遗传分化。分子变异分析(AMOVA)显示个体间的变异贡献率为88.47%,仅少部分变异来源于群体间(1.83%),表明拟鲤3个群体间的遗传变异水平较低。
[期刊] 水产学报
[作者]
孙小异 张建森 施永红 王建新 龚永生 朱根荣
采用综合育种技术育成的建鲤,呈长体型,美观适中,青灰色,具有鲜明的品种特征。建鲤生长优势十分显著,其个体增重较荷包红鲤、元江鲤和荷元鲤分别高141.55%250.82%、80.46%96.71%和40.34%42.53%;群体增重分别高154.41%256.70%、93.30%100.38%和42.08%44.57%,并显著高于其它鲤鱼和杂交鲤,普遍能增产30%以上,当年可养成商品食用成鱼。建鲤还具有其它许多优良特性,能自繁自育,遗传性状稳定,其主要遗传性状稳定性和一致性可达99%以上,LDH与EST同工酶具有一定的特异性和稳定性。
关键词:
建鲤,品种,遗传特性
[期刊] 水产学报
[作者]
郭伟华 隋正红 胡依依 李彬彬
遗传连锁图谱的构建是实现分子标记辅助育种与数量性状定位的必要手段,为构建龙须菜(Gracilariopsis lemaneiformis)遗传连锁图谱提供多态性分子标记,本实验共采用400对SSR引物和91对RSAP引物对组合,对龙须菜两个F1代配子体作图群体的亲本进行了多态性标记筛选,并对4个亲本间的遗传距离进行了评估。得到的SSR多态性标记在GL-F3/GLM8间为15个,GL-F6/GL-M9间为8个;多态性RSAP标记在GL-F3/GL-M8间为88个;GLF6/GL-M9间为93个。分析了基于SSR、RSAP技术的两对亲本间的遗传距离,SSR结果显示GL-F3/GL-M8间遗传距离为...
关键词:
龙须菜 SSR RSAP 亲本 多态性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
赵新春 贾智英 李盛文 李池陶 石连玉
【目的】研究易捕鲤的群体遗传结构,为其优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用奠定基础。【方法】提取96尾易捕鲤个体的鳍条基因组DNA,以其为模板,利用30对微卫星标记进行PCR扩增,根据基因型,利用生物信息学软件对各种遗传参数进行分析。【结果】在96尾易捕鲤个体中,共检测到154个等位基因,每个位点的等位基因数3~9个,平均有效等位基因数为4.060 7;期望杂合度为0.596 9~0.871 0,平均为0.740 0;多态信息含量为0.628 0~0.855 0,平均为0.702 2,说明此品种具有较丰富的遗传多样性;哈迪-温伯格平衡检验结果表明,群体处于不平衡状态;群体平均固定系数为-0...
关键词:
易捕鲤 微卫星 遗传结构 保种
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
王成辉 李思发 赵金良
采用聚丙烯酰胺凝胶水平电泳,分析了兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤和瓯江彩鲤的8种同工酶和1种肌蛋白。结果发现,荷包红鲤的多态位点比例最高(21.05%),瓯江彩鲤和玻璃红鲤相等(15.79%),兴国红鲤最低(10.53%);群体平均杂合度期望值为0.0458~0.0742,平均杂合度观察值为0.0440~0.0748;聚类分析表明,兴国红鲤、玻璃红鲤和瓯江彩鲤为同一分支,荷包红鲤为另一分支。
关键词:
红鲤 群体 同工酶 遗传差异
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