【目的】研究福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌组织转录组差异表达水平,为地方山羊品种肉质、生长性状的遗传机制和遗传改良提供理论基础。【方法】分别测定周岁内羯羊育肥的福清山羊与努比亚黑山羊日增重(ADG)以及2个品种周岁背最长肌样品的肌内脂肪含量(inter-muscular fat,IMF);同时利用转录组测序方法对2个品种周岁背最长肌组织进行高通量测序,筛选品种间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs功能进行注释和测序结果的荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证。【结果】在羯羊育肥条件下,福清山羊周岁内ADG为65.6g·d~(-1),极显著低于努比亚黑山羊的127.4g·d~(-1)(Sig.=0.000);而福清山羊周岁背最长肌IMF含量为3.69%,极显著高于努比亚黑山羊的1.83%(Sig.=0.003)。2个品种6个样品的背最长肌转录组测序共得到44.76Gb Clean Data,各样品的Clean reads与参考基因组(山羊)的比对效率在84.65%-86.17%之间。DESeq分析发现了努比亚黑山羊和福清山羊背最长肌的DEGs 608个,其中上调基因61个,下调基因547个。608个DEGs中的518个基因能够被GO(gene ontology)数据库注释,148个DEGs能够被COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)数据库注释,418个DEGs能够被KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库注释。KEGG通路分析表明DEGs共富集到222条信号通路中,44条通路显著富集。经过文献检索和对筛选通路相关基因功能的分析,初步判断可能与羊肉质和生长性状相关的通路包括肌动蛋白细胞骨架调节(Regulation of actin cytoskeleton)、Jak-STAT信号转导通路{Janus kinase/signal transducer and activator of transcription(Jak-STAT)signaling pathway}、MAPK信号转导信号通路{mitogen-activated protein kinase(MAPK)signaling pathway}和Ⅰ型糖尿病通路(TypeⅠdiabetes mellitus);IGF1(Insulin-like growth factor 1,类胰岛素一号增长因子)、ACSL5(Long-chain fatty acyl-CoA synthetases 5,长链酯酰辅酶A合成酶5)、PCK2(phosphoenolpyruvate carboxykinase 2,磷酸烯醇丙酮酸羧激酶2)、PPARGC1A(Hepatic peroxisome proliferator-activated receptor gamma,coactivator 1 alpha,过氧化物酶体增殖激活受体γ共激活因子1α)、JAK2(Janus Kinase 2,Janus激酶2基因)、STAT4(signal transducer and activator of transcription 4,信号转导子和转录激活子4)、IRF8(interferon regulatory factor 8,干扰素调节因子8)、MAP4K1(mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1,有丝分裂原激活蛋白激激激激酶1)等DEGs可作为控制福清山羊肉质、生长性能的候选基因。进一步与参考基因组序列比对分析,共发掘707个新基因(转录本),其中15个基因(转录本)为2个品种的DEGs。经qRT-PCR验证,所选基因(转录本)表达变化模式与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。【结论】在转录组水平上筛选出了福清山羊和努比亚黑山羊周岁羯羊背最长肌组织的608个DEGs,发掘了707个新基因(转录本),初步认为肌动蛋白细胞骨架调节等4个信号通路在山羊肉质形成和生长发育过程中发挥了重要作用,为进一步探索山羊骨骼肌生长发育和IMF沉积的相关机理提供参考依据。

【目的】研究福清山羊与努比亚黑山羊发情期卵巢组织转录组差异表达水平,一方面为山羊繁殖性状形成的分子机制提供理论依据,另一方面为利用努比亚黑山羊杂交改良福清山羊提供可加快遗传进展的分子标记。【方法】利用转录组测序方法对福清山羊和努比亚黑山羊发情期卵巢组织进行研究,筛选品种间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs功能进行注释和若干基因荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证;同时通过与参考基因组比对,分析和筛选测序样品中存在的SNP/InDel。【结果】6个样品共得到46.68Gb Clean Data,DESeq分析发现了福清山羊和努比亚黑山羊发情期卵巢组织的DEGs149个(包含25个新转录本),其中表达上调53个,表达下调96个;初步认为输卵管素基因(oviductin,OVN)、类固醇合成快速调节蛋白基因(steroidogenic acute regulatory protein,STAR)、早期生长应答1基因(early growth response 1,EGR1)可作为福清山羊繁殖性能的候选基因。149个DEGs中的108个基因能被GO(gene ontology)数据库注释,30个DEGs能够被COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)数据库注释,91个DEGs能够被KEGG(kyoto encyclopediaof genes and genomes)数据库注释。KEGG通路分析表明DEGs共富集到21条信号通路中,6条通路显著富集。经过进一步的与参考基因组序列比对分析,共发掘1 506个新转录本。经qRT-PCR验证,所选基因(转录本)表达变化模式与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。【结论】在转录组水平上筛选出了福清山羊和努比亚黑山羊发情期卵巢组织的149个DEGs,发掘了1 506个新转录本,初步揭示了OVN、STAR和EGR1在山羊繁殖过程中可能发挥重要作用,为进一步探索山羊繁殖性状相关机理提供参考依据。

以贵州黑山羊和黔北麻羊为材料,根据山羊MSTN基因序列(GenBank登录号:EF588035)设计1对引物,用PCR-RFLP法对该序列进行多态性分析。结果表明:PCR扩增片段207 bp处存在TTTTA的插入,导致出现1个DraI酶切多态性位点,黑山羊纯合野生型(AA)为优势基因型,杂合型(AB)和纯合突变型(BB)为非优势基因型,A等位基因为优势基因;黔北麻羊纯合野生型(CC)为优势基因型,杂合型(CD)和纯合突变型(DD)为非优势基因型,C等位基因为优势基因。

为黑山羊品种的选育及临床珍断提供参考依据,测定了5月龄、8月龄、1岁、2岁和3岁贵州黑山羊母羊的15项血液生理指标。结果表明:5个年龄段的白细胞中单核细胞数量(MON)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白含量(MCH)、平均红细胞血红蛋白浓度(MCHC)、平均血小板体积(MPV)、血小板体积分布宽度(PDW)等6项指标无显著性差异,其他9个血液生理指标在不同年龄间存在一定的差异。但各年龄段的血液生理指标与平均值相比,除8月龄的白细胞中淋巴细胞数量(LYM)、3岁的血红蛋白浓度(HGB)和1岁的白细胞中中性粒细胞比率(GRA%)外,其他指标间无显著性差异。所测定的15项血液生理指标的平...

采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16S rDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338 830条,聚类后得3 400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰

【目的】克隆大足黑山羊PHLDA2(pleckstrin homology-like domain,family A,member 2)基因序列,分析其组织表达特征、印记状况以及与胎盘性状的关系,为深入研究该基因在山羊胎盘中的功能积累数据。【方法】根据人、牛和猪PHLDA2的保守区域设计引物以RT-PCR方法扩增大足黑山羊该基因部分c DNA序列,进一步利用5′-和3′-RACE技术获得全长c DNA序列;利用ORF Finder和Prot Param等在线工具分析PHLDA2基因序列特征;采用Real-time PCR方法分析PHLDA2在大足黑山羊心、肝、脾、肺、肾、大脑、肌肉、脂肪、舌和...

【目的】旨在克隆大足黑山羊卵泡抑素(follistatin)的基因序列,并研究其在不同组织中的表达差异。【方法】采用RT-PCR方法从大足黑山羊卵巢组织总RNA中克隆出follistatin的cDNA序列,用相关软件进行序列分析,并利用real-time PCR技术检测follistatin基因在不同组织中的表达。【结果】序列分析表明,大足黑山羊follistatin的cDNA序列全长为1 217 bp,包括该基因完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)1 035 bp,编码344个氨基酸。与牛的核苷酸序列比对同源性高达98%。real-time PCR结果表明,fol...

试验旨在研究运输时间对沂蒙黑山羊生理指标的影响,探求合理的运输方式。选用24月龄体重在30 kg左右的成年沂蒙黑山羊45只,随机分成3组,每组设3个重复,每个重复5只。采用短时间(运输1 h)、中等时间(运输3 h)、长时间(运输5 h)3种运输时间运输沂蒙黑山羊,分析其血液常规指标和生化指标的变化。结果表明:运输5 h组中皮质醇、促肾上腺皮质激素浓度和乳酸脱氢酶活性显著高于运输1和3 h组(P<0.05);血糖浓度随运输时间的延长显著降低(P

旨在研究低蛋白日粮对山羊胴体品质和肌肉氨基酸与脂肪酸组成以及肌源性调节因子基因表达的影响。选取24头生长期湘东黑山羊母羊，随机分为正常蛋白日粮组(CON组，CP:10.77%,n=12)与低蛋白日粮组(LP组，CP:5.52%,n=12),预试期25 d,正试期45 d。结果表明，LP组肌肉屠宰后24 h的肉色L~*值显著升高，而肌肉pH值和失水率等无显著差异；骨骼肌Ⅰ型、Ⅱ型肌纤维比例无显著差异，仅LP组半腱肌肌纤维总平均横截面积呈现降低的趋势；LP组股外侧肌中缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸、谷氨酸及总必需氨基酸的含量显著降低，异亮氨酸、蛋氨酸、天冬氨酸、精氨酸和总氨基酸含量呈现下降趋势；半腱肌中谷氨酸的含量显著降低，苏氨酸和丝氨酸的含量呈现下降趋势；LP组半腱肌中二十碳二烯酸和二十二烯酸的含量显著降低；外侧肌中总多不饱和脂肪酸、油酸、花生四烯酸的含量显著降低；背最长肌中油酸的含量显著降低；LP组半腱肌MYOD基因表达显著下调。综上表明，饲喂低蛋白日粮不影响肌纤维类型的转化与横截面积；日粮蛋白质缺乏会降低骨骼肌中氨基酸的沉积，同时减少肌肉多不饱和脂肪酸的沉积，影响山羊肌肉风味。

采用努比山羊 (♂ )与浏阳黑山羊 (♀ )进行杂交 ,获得杂交浏阳黑山羊 .为探讨杂交后代的机能代谢状况 ,测定了杂交一代和亲本浏阳黑山羊的 19项血液生理生化指标 .结果表明 ,两组间 RBC,Hb,GOT,GPT,AKP,TL,Tch,Glu,TP,A,G,Na+ ,Ca2 + ,Pi和 Cl- 等 15项指标值基本相近 ;WBC,AMY,K+ 和 Mg2 + 等 4项指标 ,两组间虽有显著或极显著差异 ,但其变化幅度均在正常值范围内

利用基因分型测序(GBS)对60只湘东黑山羊(9只公羊、51只母羊)进行基因组测序，获得湘东黑山羊染色体上的SNP数据和连续纯合子片段(ROH)数据。通过SNP数据进行基于G矩阵的基因组亲缘关系分析和NJ聚类分析，构建了湘东黑山羊的群体家系结构，并通过ROH数据得到了群体平均近交系数。结果表明，60只湘东黑山羊的平均测序深度为9.15X，与参考基因组比对率平均为99.59%；在SNP检测过程中3只母羊不符合基因型数据质控标准，将其过滤，以此获得其他57只黑山羊29条染色体上153 046个SNPs位点和1937个ROH片段，构建的湘东黑山羊家系，共建立了8个家系，其中 9只公羊和6只母羊被分为7个家系，42只母羊被单独分类；基于ROH片段分析的湘东黑山羊群体中每个个体的近交系数均值为0.047，说明湘东黑山羊公羊在繁育过程中有较大的利用空间。

选择体重相近的乐至黑山羊阉公羊35只,随机分为5组,每组7只,试验组以不同比例蚕沙(25%、50%、75%和100%)替代精料,对照组精料不加蚕沙,各组粗料相同(青贮玉米秸+大豆秸),进行为期90 d的饲养试验,在饲养试验中期采用全收粪尿法进行消化代谢试验,研究蚕沙对山羊采食量、日粮干物质、能量及蛋白质消化代谢的影响。结果表明:①25%~75%蚕沙组可以极显著增加山羊精料、粗料和总干物质采食量(P0.05),50%~100%蚕沙组极显著低于对照组(P<0.01);③各蚕沙组的氮表观消化率均极显著地低于对照组(P<0.01...

一、制约黑山羊产业规模发展的因素剖析马山全县11个乡镇都养殖黑山羊,主要分布在白山、古零、古寨、金钗、里当、加方、百龙滩等中东部石山地区,少量分布在周鹿、林圩、乔利、永州等丘陵地区。2011年,黑山羊饲养量9.46万只,存栏4.25万只,出栏5.21万只,羊肉产量820吨。全县养殖黑山羊1511户,能繁

【目的】本研究旨在搞清楚金堂黑山羊FSH信号调节机制的作用模式。【方法】将10只生殖周期相同的健康空怀的金堂黑山羊成年母羊随机分成2组,一组为对照组,一组为试验组。在发情后的第2天对试验组金堂黑山羊进行FSH肌肉注射100IU,并在注射24 h后,摘取金堂黑山羊的卵巢;对照组发情后的第3天摘取卵巢。分别提取它们的总RNA,进行表达谱测序。【结果】经测序分析:对照组和试验组分别得到有效序列30 906 038和27 763 272条;经统计分析后,得到归一化序列30 216 946和27 124882条,与

为明确季节和生长阶段对舍饲海南黑山羊采食量的影响,本试验选择不同生长阶段海南黑山羊,在夏季和冬季进行饲养实验,对其采食量进行测定。结果表明:不同季节和不同生长阶段海南黑山羊采食量均存在差异;季节影响海南黑山羊采食量,对酸性洗涤纤维(ADF)采食量有显著影响,对粗脂肪(EE)采食量有极显著影响;生长阶段对海南黑山羊干物质(DM)、有机物(OM)、粗蛋白(CP)、粗脂肪(EE)、中性洗涤纤维(NDF)和酸性洗涤纤维(ADF)采食量有极显著的影响;季节和生长阶段存在明显的互作效应,对DM、OM、CP、EE、NDF和ADF的采食量均有极显著的影响。本试验可为海南黑山羊高效养殖提供理论依据。