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[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
燕丽萍 吴德军 王因花 刘翠兰 王开芳 吴红 任飞 李庆华
为了探讨白蜡属植物种间、品种间亲缘关系以及同品种不同区域间的基因型差异,利用荧光AFLP分子标记技术,采用8对Pst I/Mse I引物组合对90个白蜡种质进行了DNA遗传多样性分析。结果表明:8对引物组合扩增出1 630条带,其中多态性条带1 399条,平均多态位点百分率为85.8%,平均有效等位Ne基因数为1.258 8,Nei’s平均遗传多样性指数为0.171 7;Shannon平均信息指数为0.286 9,表明白蜡属种间具有丰富的遗传多样性。采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析,结果表明,白蜡属植物种的聚类结果与传统的分类结果基本一致,绒毛白蜡及新品种(鲁蜡1号-鲁蜡4号)、美国紅梣及新品种(鲁蜡5号、鲁蜡6号)、美国白蜡及新品种(红叶白蜡、秋紫白蜡、秋火白蜡和秋欢白蜡)聚为一类;秦岭梣、庐山白蜡、花曲柳、中国白蜡、和窄叶白蜡聚为一类;不同之处在于花具花萼的象蜡树和对节白蜡与花无花萼的欧洲白蜡、水曲柳、新疆小叶白蜡和狭叶白蜡聚类为一类,象蜡树和水曲柳的亲缘关系较近,对节白蜡和象蜡树的起源与分类学地位有待于进一步的研究。说明AFLP标记技术能较好地揭示白蜡属种质资源的亲缘关系及演化规律,为种的分类及亲缘关系分析提供有力参考依据。
关键词：
白蜡属 优良种质 亲缘关系 AFLP
[期刊] 林业科学
[作者]
臧德奎 陈红 郑林 郭先锋
用AFLP技术对29个木瓜属品种的亲缘关系进行分析。用8对引物(EcoRⅠ+3/MseⅠ+3)对基因组DNA进行选择性扩增,共获得1095条扩增带,其中1035条具有多态性,多态带百分率达94.52%,揭示木瓜品种具有丰富的遗传多样性。采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析。结果表明:品种间的相似系数在0.4650～0.8339之间,具有相似形态特征的品种优先相聚,29个品种可以划分为4类,且基本对应着贴梗海棠、日本木瓜、木瓜海棠和傲大贴梗海棠,但品种‘猩红与金黄’宜归入贴梗海棠内,而‘碧雪’的分类地位值得进一步探讨。说明AFLP标记技术能较好地揭示...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
李永涛 董玉峰 王振猛 张鹏远 王卫东 荀守华 秦光华 姜岳忠
为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对Pst I/Mse I引物组合从44份楸树种质中共扩增出1 087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1 043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(I)分别为1.321 0、0.200 3和0.320 4,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.502 2～0.791 9间,平均为0.652 7。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
徐曼 李厚华 郭亦博 赵冰 王亚杰 高艳
【目的】在分子水平上探究苹果属海棠野生种、栽培种及相近属植物之间的亲缘关系,为分类学研究、海棠育种提供参考。【方法】选用4对AFLP引物(M-CTC/E-AGC,M-CTA/E-ACG,M-CAT/E-ACT和MCAA/E-ACG),分析苹果属海棠9个野生种、8个栽培种以及4个山楂属植物和2个梨属植物的遗传多样性。【结果】(1)共扩增出条带114条,其中多态性条带108条,多态位点百分率达94.7%,供试材料表现出丰富的遗传多样性。(2)供试材料在相似系数为0.73时被分为3组,分别为苹果属组、山楂属组和梨属组,因此AFLP分子标记的方法可以将苹果属与梨属、山楂属完全区分开。(3)秦巴山区野生...
关键词：
海棠 AFLP 分子标记 亲缘关系 分类
[期刊] 华北农学报
[作者]
李艳梅 段会军 马峙英
利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析。结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0.24~0.99之间,平均相似系数为0.70,说明西瓜品种间遗传基础狭窄。用NTSYS软件进行聚类分析,57个西瓜品种被划分为2个类群。其中类群1包括1个野生西瓜,类群2均为栽培种。在类群2中引进的资源聚在一起,杂交种和双亲或其一聚在一起。此外,本研究表明,AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,能够揭示西瓜品种间的差异,是鉴定西瓜品种的有...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杨友才 周清明 尹晗琪 朱列书
【目的】揭示烟草种质资源的遗传多样性及亲缘关系。【方法】选用4对AFLP选择性扩增引物(EcoRI+3/MseI+3)对48份烟草材料的基因组DNA进行选择性扩增。【结果】共获得321条扩增带,其中174条具有多态性,平均多态检出率为54.2%。对AFLP扩增结果采用UPGMA法进行聚类分析,可以将48份烟草资源分为两大类群,即黄花烟草群和普通烟草群,普通烟草可进一步分为4组;48份材料的遗传距离变幅在1.41～11.0之间。【结论】AFLP标记技术能较好地从分子水平揭示中国烟草种质资源的遗传背景、亲缘关系及演化规律。
关键词：
烟草 遗传多样性 亲缘关系 AFLP
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孔秋生 李锡香 向长萍 邱杨 沈镝
利用筛选出的8对引物对56份来源于不同国家和地区的栽培萝卜种质的亲缘关系进行了AFLP分析,共扩增出327条带,其中多态性带128条,多态性位点百分率39.1%,显示出栽培萝卜种质之间存在着较丰富的遗传多样性。系统聚类分析将供试材料分为5类9组,主坐标分析将其分为4类7组,2种分类方法所获结果基本一致。基于分子标记的分类与种质的表型基本吻合。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杜传印 王玉军 李斯深 李常保 刘洪祥 田纪春
【目的】研究烤烟种质的亲缘关系,以期为烤烟种质的鉴别、创新及合理利用等提供理论依据。【方法】利用AFLP荧光标记技术,采用8对E+3和M+3引物组合对39份来自不同国家的烤烟种质的亲缘关系进行分析。【结果】8对引物共产生901条谱带,其中813条呈多态性,多态性条带百分率达90%;39份材料之间的遗传相似系数在0.51～0.89,当相似系数为0.75时,可以将全部试材分为6类。【结论】8对引物能将39份烤烟种质完全分开;聚类结果表明烤烟种质具有较近的亲缘关系,供试材料间的聚类与地理来源没有相关性。
关键词：
烤烟 亲缘关系 AFLP分析
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
高洪晓 杨凯 刘建斌
为探讨丁香属植物种间、欧丁香品种间以及丁香属与女贞属之间的亲缘关系,本研究使用8对选择性扩增引物对丁香属14个种、欧丁香种的37个品种和女贞属3个种进行了AFLP分析。利用Ntsyspc软件对扩增结果进行分析,以遗传相似性系数为基础,计算Nei遗传距离并采用UPGMA法进行聚类。结果表明:AFLP扩增共产生447条带,其中多态性条带395条,多态率为88.4%,各样品间的遗传距离在0.01~1.44之间。聚类结果与传统的分类结果基本一致,不同之处在于:部分欧丁香品种与顶生花序系的种聚类为一个分支;短花冠管组的种聚类于长花冠管组的内部;长花冠管组的种内部巧玲花系与顶生花序系的种聚类有交叉现象;女...
关键词：
丁香种 欧丁香品种 AFLP 多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
贾会霞 吴立栓 胡建军 卢孟柱
利用毛细管电泳-AFLP技术,采用EcoRⅠ+3/MseⅠ+3和PstⅠ+2/MseⅠ+3引物组合,对从国内外搜集的37份柳树种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。11对引物共扩增出1580条条带,多态性条带数为1399条,多态率在80.65%～94.67%之间,表明柳树种质间的遗传多样性较高。采用NTSYS-pc2.10e软件对37份种质进行聚类分析和主成分分析,在相似系数0.63时,37份种质分为2大类,一类是乔木柳,一类除小乔木康定柳外,其余都为灌木柳。聚类分析和主成分分析结果与传统形态分类基本一致,但筐柳组中簸箕柳P295和沙柳基因组水平上差异较大,P295与银芽柳亲缘关系较近。研究结...
[期刊] 林业科学
[作者]
文亚峰 谢碧霞 何钢 潘晓芳
利用荧光AFLP分子标记技术对27个人心果品种(类型)及4个蔓妹人心果品种资源的亲缘关系进行研究。9对引物(PstⅠ-MseⅠ)共扩增得到1131条带(75~500 bp),其中多态性带1 096条(96.90%)。28个品种(类型)具特征性条带,特征带大小为350~500 bp。品种间多态性比例在22.19%~45.89%之间,遗传相似性系数为0.40~0.87。UPGMA聚类结果将31个品种聚为蔓妹人心果类群(MAM)和2个人心果类群(SAP1和SAP2)。在遗传相似性系数0.52处,4个蔓妹人心果品种首先被区分开,单独聚为一类(MAM)。人心果类群中,11个美国品种和10个国内地方类型在...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张春英 林同香 戴思兰 张秀英
利用３６ 个１０ 碱基随机引物首次对７ 个桃花（ Ｐｒｕｎｕｓ ｐｅｒｓｉｃａ） 近缘种和３０ 个品种进行ＲＡＰＤ 反应．对选出１０ 个引物扩增出的具有多态性、可重复的、清晰的５６ 条带进行数据统计分析．ＵＰＧＭＡ聚类结果表明：毛桃（ Ｐｒｕｎｕｓ ｐｅｒｓｉｃａ） 和新疆桃（ Ｐ． ｆｅｒｇａｎｅｎｓｉｓ） 之间具有很近的亲缘关系，并与桃花品种间亲缘关系最近；寿星桃、垂枝桃类品种在聚类图上分别较早地聚合在一起，表明其类内具有较近的亲缘关系；直枝桃类品种没有在树系图上聚合成一类，表明直枝桃花品种群演化关系较为复杂，多样性较丰富．该文还从分子生物学角度探讨了桃花品种的演化关系和‘白花山碧’桃的起...
[期刊] 华北农学报
[作者]
郭荣雨 路曼 宋晓飞 孙成振 李晓丽 闫立英
为了解旱黄瓜种质资源的遗传多样性及亲缘关系，利用黄瓜全基因组测序的４５０对ＳＳＲ引物对３８份旱黄瓜种质资源进行了多样性和聚类分析。结果表明：７２对引物共扩增出１３３个等位变异，平均每个ＳＳＲ位点的等位基因数为１．８５个，变幅为１～４个。３８份旱黄瓜种质资源的相异系数分布在０．２１５～０．７０４，其中６４５７与佳美旱黄瓜、选丰与佳美旱黄瓜、新宝与绿之秋亲缘关系较远，而ｇｆｃＳ与四季翠绿、玉翡翠与翠玉、真把握与唐山秋瓜、真把握与皇家绿秀亲缘关系较近。在阈值为０．５４处，可将这３８份黄瓜种质资源划分为Ⅰ、Ⅱ类。在阈值为０．４８处，可将Ⅰ类再分为Ⅰ＿Ａ、Ⅰ＿Ｂ、Ⅰ＿ｃ、Ⅰ＿Ｄ４个亚类，Ⅱ类可再分为Ⅱ＿．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
谭雪 郭爽 郑少薇 刘自珠 林锦英 林春华
利用RAPD标记对31份菜薹种质资源进行亲缘关系分析。15条引物共扩增出66条谱带,其中多态性谱带43条,多态性谱带比率为65.15%,平均多样性指数为0.302 2。菜薹种质间遗传距离为0.046 5～0.526 1,遗传相似系数为0.590 9～0.954 5。UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数为0.74处,将31份菜薹种质分为四大类,与传统分类结果相比,有一致性但也存在差异。
关键词：
菜薹 种质资源 亲缘关系 RAPD
[期刊] 华北农学报
[作者]
林建丽 朱正歌 王建成 高建伟
利用200个随机引物对21份白菜类蔬菜种质资源材料的基因组DNA进行了扩增,研究了它们的亲缘关系。结果表明,有22个随机引物可得到稳定的RAPD谱带,扩增带总数为135条,其中多态性带为125条,多态性比例为92.6%。系统聚类分析结果显示,在遗传距离(D)=0.25处,可将供试材料分为2类10组,其中第1类包括5个甘蓝品种,另外还包括芜菁;而第2类包括白菜和芥菜2个亚类。这表明芜菁和白菜的亲缘关系较远。芜菁和散白菜的杂交后代与芜菁和其他白菜的杂交后代形态相似,不能从形态学上为李家文的"杂交起源"假说提供佐证。推测白菜可能起源于野生小白菜的原始类型,在向北方传播的过程中相互杂交,经过长期的自然...
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白菜类蔬菜 RAPD 种质资源 聚类分析
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