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[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 张志远  吕鑫莹  赵家悦  王哲鹏  
为从遗传参数估计和FSHR基因序列变异关联分析角度定量评估遗传效应对略阳乌鸡开产日龄的决定性,以同一批次孵化的675只略阳乌鸡母鸡为对象,测定开产日龄、开产到30周龄、40周龄和56周龄产蛋数,用单变量动物模型估计开产日龄的遗传力,用双变量动物模型估计开产日龄与产蛋数间遗传相关。用Sequenom MassARRAY法检测FSHR基因内3个错义突变Thr46Ile、Lys151Arg和Met335Thr的基因型,用单变量线性混合模型检测这些变异与开产日龄的关联性。结果表明:1)略阳乌鸡的平均开产日龄为(147.5±7.8)d,其中,75%的鸡会在151日龄前开产。30周龄平均产蛋数为(28.0±7.6)枚,40周龄平均产蛋数为(58.6±15.0)枚,56周龄平均产蛋数为(75.1±20.4)枚。2)略阳乌鸡开产日龄的遗传力为0.08(95%置信区间:0.017~0.21)。开产日龄与各阶段产蛋数存在强负遗传相关性(rA=-0.98,95%置信区间:-1.0~-0.7),但呈现出中等偏弱的表型相关性(rp=-0.59~-0.21)。各阶段产蛋数间存在较强的遗传(rA=0.99,95%置信区间:0.84~1.00)和表型相关(rp=0.48~0.79)。3)在3个FSHR错义突变中,第46位Thr和第335位Met不保守,但第151位Lys在鸟类和哺乳动物中完全保守。3个错义突变与略阳乌鸡开产日龄的关联性均不显著(P>0.05)。综上,遗传效应对开产日龄的决定性较低,但开产日龄与产蛋数存在较强遗传相关性。这些结果建议,饲养管理是开产日龄更为有效的调控手段;依据开产日龄对产蛋数进行间接选择具有可行性,但选择准确性会随产蛋周期的延长而降低。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 孙俊丽  文信旺  黄英飞  张冰  韦凤英  廖玉英  
关键词:
[期刊] 淡水渔业  [作者] 颜元杰  金武  闻海波  马学艳  薛婷  孙成飞  何义进  邴旭文  
为了解梨形环棱螺(Bellamya purificata)生长性状的加性遗传方差,利用3个群体随机交配的69个全同胞家系(1 204个个体)作为选育基础群体。幼螺达到60日龄时,测量它们的壳高、壳宽、壳口高、壳口宽、体螺层高、体质量6个生长性状,并利用贝类标签进行个体标记。结果显示:壳高、壳宽、壳口高、壳口宽、体螺层高、体质量这6个性状的遗传力分别为:0. 372±0. 078,0. 389±0. 080,0. 408±0. 081,0. 395±0. 080,0. 443±0. 085,0. 444±0. 086。这6个性状的表型相关和遗传相关的范围为:0. 878~0. 955和0. 848~0. 967。结果表明:梨形环棱螺60日龄生长性状有足够的遗传方差,可以对它们进行遗传改良,预期能够获得较好的遗传进展。这6个性状之间的表型相关和遗传相关均较紧密,可以通过对体质量进行选择,同时改良其它性状。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 孙俊丽  文信旺  黄英飞  张冰  韦凤英  廖玉英  
采用PCR-RFLP技术检测135只东兰乌鸡中NPY基因的多态性,并分析其对300日龄产蛋数的影响。结果表明,在该东兰乌鸡群体中发现了NPY基因的3种基因型(AA、AB、BB),不同基因型对300日龄产蛋数影响显著(P<0.05),AA型个体的产蛋数显著高于BB型个体(P<0.05)。因此,该NPY基因多态位点可以作为影响东兰乌鸡产蛋数的分子标记。
[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 高清  胡丽蓉  张海亮  张帆  杨圳  林逍然  徐青  郭刚  刘巧香  王雅春  
为探究奶牛血浆催乳素(Prolactin, PRL)浓度的群体特征及其在不同环境条件和生理阶段下的变化规律,估计牛血浆PRL浓度的遗传参数,探究PRL、PRLR和TRH基因多态性与血浆PRL浓度之间的相关性,本研究于2014和2017年对北京地区某规模化牧场的472头泌乳期荷斯坦牛进行血浆PRL浓度测定,共获得1 169条数据。首先,采用固定模型分析采样季节、胎次、挤奶前后和泌乳阶段对奶牛血浆PRL浓度的影响;然后,采用重复力动物模型估计血浆PRL浓度的遗传参数;此外,通过扫描PRL、PRLR和TRH基因的多态位点,对血浆PRL浓度进行基于多态位点和单倍型的关联分析。结果显示:1)泌乳期荷斯坦牛血浆PRL平均浓度为224.29 mIU/L,胎次、采样季节和泌乳阶段对血浆PRL浓度有显著或极显著影响,血浆PRL浓度随胎次和泌乳阶段的推移而逐渐升高,春季和夏季时奶牛血浆PRL浓度极显著高于秋季和冬季(P<0.01);2)血浆PRL浓度的遗传力为0.02,为低遗传力性状;3)PRL和PRLR基因基因中未发现与血浆PRL浓度显著相关的SNP位点,TRH基因的rs137596325、rs109144892、rs108991567、rs109468305和rs109330999与血浆PRL浓度显著或极显著相关;4)对3个基因的SNP进行连锁不平衡分析发现,PRLR基因上的单倍型块与血浆PRL浓度具有显著相关的趋势(P<0.1),TRH基因中的2个单倍型块与血浆催乳素浓度显著相关。综上,本研究获得了荷斯坦牛血浆PRL浓度的群体特征、遗传参数,探究了与血浆PRL浓度分泌相关基因的多态性及与其显著关联的分子标记,为深入理解血浆PRL浓度的遗传基础提供参考。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 吴芸   李盼盼   闫吉美   黄锡阳  
【目的】探明赤水乌骨鸡品种群体的遗传多样性和起源进化特点,为赤水乌骨鸡的种质资源评估、遗传资源保护和利用提供理论依据。【方法】采用PCR扩增及测序技术对60只赤水乌骨鸡的Cytb基因进行全长序列研究,采用生物信息学方法进行遗传多样性及起源进化分析。【结果】赤水乌骨鸡Cytb基因序列全长为1 143 bp,碱基T、C、A和G的平均占比分别是24.1%、36.4%、27.5%和12.0%。Cytb基因序列分析发现共有13个突变位点,均为颠换,单倍型多样性(Hd)为0.796,核苷酸多样性(Pi)是0.00191,平均核苷酸差异(K)为2.180。单倍型网络图显示在赤水乌骨鸡Cytb基因序列的9种单倍型中Hap3和Hap2为优势单倍型。赤水乌骨鸡Cytb基因9种单倍型与红色原鸡5个亚种Cytb基因序列构建的系统发育树表明Hap1与GGS12聚为一类,Hap2与GGM1聚为一类,Hap6、Hap7和Hap3聚与GGM3形成一个小分支,Hap8和Hap9与GGS3、GGS4和GGM2聚在一起形成一个分支,Hap4和Hap5则是自成一支。【结论】赤水乌骨鸡群体遗传多样性较高,可能起源于原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)和原鸡印度亚种(Gallus gallus murghi)。
[期刊] 中国农业科学  [作者] 李学武  刘燕  王瑞军  王志英  娜清  李宏伟  王振宇  徐冰冰  苏蕊  张燕军  刘志红  李金泉  
【目的】内蒙古绒山羊是经过长期自然选择和人工选育而成的优秀地方品种。主要产于内蒙古西部地区,分布于二郎山、阿尔巴斯和阿拉善左旗3个地区。产绒量和抓绒后体重均是绒山羊重要经济性状,并且属于数量性状,数量性状受微效多基因控制,本研究通过数量遗传学方法对内蒙古绒山羊产绒量和抓绒后体重进行遗传参数评估,旨在研究内蒙古绒山羊不同毛被类型对产绒量和体重的遗传参数的影响,为绒山羊育种提供理论依据。【方法】内蒙古白绒山羊种羊场1990—2014年间54 044只绒山产绒量、体重和毛长的重复数据为研究材料。按照不同羊毛长度将绒山羊分为3个类型:短毛型(≤13 cm,SSL)、中间型(13 cm22 cm,LSL)。利用Excel对不同毛被类型内产绒量和抓绒后体重进行表型分析,然后将处理好的数据利用SAS9.2的REG程序计算不同毛被类型内毛长对产绒量和体重的回归系数,确定不同毛被类型对产绒量和人体重的影响。最后采用WOMBAT软件的AIREML算法对不同毛被类型内产绒量和抓绒后体重进行方差组分分析和遗传参数估计。【结果】对不同类型产绒量和体重进行基本统计分析,发现长毛型毛长均值比中间型和短毛型分别增加了6.20 cm和13.40 cm。长毛型产绒量较中间型和短毛型高105.03 g和59.85 g。长毛型体重较中间型和短毛型分别高8.78 kg和10.06 kg。长毛型的产绒量(721.15g)最高,体重最大(41.98 kg)。毛长和产绒量的变异系数随着毛长的增加在减小,但是体重的变异系数随着毛长的增加而增加。产绒量和体重的变异系数均在27%以上,说明产绒量和体重均具有较高的提升潜力。经过回归分析发现不同毛被类型内产绒量和体重对毛长的线性回归均存在极显著差异。短毛型、中间型和长毛型毛长对产绒量的回归系数分别为-4.63、1.92和21.07。短毛型、中间型和长毛型毛长对体重的回归系数分别为0.04、0.32和1.94。即长毛型的毛长对产绒量和体重的回归系数最高,说明长毛型个体对产绒量和体重的影响较大。遗传参数估计结果表明短毛型、中间型和长毛型产绒量的遗传力分别是0.14、0.22和0.33,短毛型和中间型的遗传力为低遗传力,长毛型为中等遗传力。短毛型、中间型和长毛型体重的遗传力分别是0.10,0.11和0.12,属于低遗传力。长毛型产绒量和体重遗传力最高。从遗传相关来看,产绒量与体重(-0.20—0.26)、产绒量与毛长(-0.11—0.37)和体重与毛长(0.21—0.43)的遗传相关随着毛长的增加而增加。【结论】长毛型个体产绒量和体重的表型值最高,并且长毛型个体的体重和产绒量的遗传力最高,长毛型产绒量和体重的遗传相关也最大,因此,选择长毛型个体留种可以加快绒山羊产绒量和体重的遗传进展,实现羊毛对产绒量和体重的间接选择。
[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 郭军  王克华  曲亮  沈曼曼  窦套存  胡玉萍  
为评估如皋黄鸡选育群个体间亲缘关系远近程度,分析105日龄体重遗传力。收集2011—2014年连续4代如皋黄鸡有称重记录的育成期母鸡资料,整理后得到7 550条个体记录。对非105日龄体重进行校正处理。应用Endog软件计算近交相关参数,包括个体近交系数(Fi)、个体近交速率(ΔFi)、平均亲缘关系(AR)以及每个世代Fi和AR平均值。应用AiREML算法剖分表型方差组分,计算遗传力时考虑了近交、批次以及母本日龄对表型方差的影响,将加性遗传、母体遗传列入随机效应,以AiC值、BiC值选择最优模型。结果表明选育群个体近交系数平均值为0.44%、亲缘关系平均值为1.58%;个体近交系数适合以3阶协...
[期刊] 水产学报  [作者] 刘宝锁  张天时  孔杰  王清印  栾生  曹宝祥  
对来自40个家系的753尾大菱鲆个体进行耐高温实验,测定其生长和耐高温性状。基于是否考虑全同胞家系效应,建立了两种动物模型,用于估算大菱鲆生长和耐高温性状的遗传参数。利用WOMBAT程序采用平均信息约束极大似然法估计各模型中性状的方差组分,用似然比检验法进行不同模型的差异检验。方差组分分析结果显示,估计体质量遗传参数时,采用模型Ⅰ效果较好,相应遗传力为(0.22±0.09);估计肥满度时,两模型间差异不显著,其遗传力范围为(0.21±0.18)~(0.39±0.11);估计耐热性时,采用模型Ⅰ比较理想,遗传力为(0.026±0.034)。表型和遗传相关分析结果表明,体质量与肥满度、耐热性的表型...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 杨明路  张海亮  罗汉鹏  黄锡霞  张翰林  章施施  王炎  刘林  郭刚  王雅春  
【目的】探究基于奶牛智能项圈系统产生的发情指数和活动峰值指标的群体规律及其影响因素,对其进行遗传参数估计,并利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘与奶牛发情相关指标的遗传标记,以期为从遗传育种角度制定选育策略提高奶牛繁殖力提供有用信息。【方法】试验以北京市某规模化牧场健康的泌乳期荷斯坦牛为研究对象,收集了该牧场2017年7月至2020年5月2 074头泌乳牛的发情记录,包括发情指数和活动峰值,同时收集了试验牛的产犊记录;采用SAS 9.4中MIXED过程,分析了非遗传因素对发情指数和活动峰值的影响;基于DMU软件DMUAI模块,使用双性状动物模型估计了发情指数与活动峰值的遗传力及遗传相关,并计算了发情指数与常规繁殖性状的近似遗传相关;以逆回归育种值为关联分析的表型,利用Farm CPU软件分别对发情指数和活动峰值进行了GWAS。【结果】荷斯坦牛发情指数为(71.77±19.13)au,活动峰值为(105.94±30.73)au/2h。发情指数遗传力为0.04±0.01,活动峰值遗传力为0.19±0.04,均为低遗传力性状;发情指数与活动峰值之间的遗传相关为0.45±0.03;发情指数与经产牛首末次配种间隔、首次产犊日龄和青年牛首末次配种间隔的近似遗传相关分别为0.37、-0.41、-0.55。两个性状的GWAS共找到7个在全基因组水平上显著的SNP位点,分别位于7条染色体上,显著位点附近(300 kb内)共发现基因31个。【结论】通过项圈系统获得的发情指数和活动峰值是可遗传的,两者之间存在中等遗传相关,活动峰值为中低遗传力,且能够一定程度上反映奶牛的发情指数,活动峰值和发情指数为研究奶牛的发情行为以及提高母牛的繁殖力提供了新的方向。GWAS鉴定到的候选基因PTGS1(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase1)和NDUFA8(Ubiquinone Oxidoreductase Subunit A8)的功能与供体胚胎总数有关,VEGFA(Vascular Endothelial Growth Factor A)基因功能与奶牛繁殖有关,可作为奶牛发情相关指标的候选基因进行深入研究。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 张春杰  程相朝  李银聚  吴庭才  王淑芳  
 应用RT-PCR法,对分离于当地典型发病乌鸡群的IBDV(WJ株)进行了VP2基因的克隆与序列分析,并和相关毒株进行了比较。结果表明,WJ株与标准血清 型STC株的核苷酸和氨基酸的同源性只有91.39%和92.74%,而与超强毒株UK661和从当地鸡群中分离的超强毒株HN01株的核苷酸和氨基酸的同源性则较高,其中,与其核苷酸同源性分别为95.43%和95.87%,与其氨基酸同源性均为96.77%。且该毒株的VP2基因序列完全具备超强毒株的主要特征。由此说明,分离于当地发病乌鸡群的IBDV为超强毒株,并和当地流行的鸡IBD超强毒株有较高的同源性,但也有明显的差异。
[期刊] 林业科学研究  [作者] 李芳东  乌云塔娜  杜红岩  
以杜仲35个无性系为研究材料,以5 a的性状测定数据为基础,对杜仲无性系叶片性状、树皮性状、果实性状、产量进行了遗传参数估计和改良效果分析。结果表明:叶片性状、树皮性状、果实性状、产量性状的重复力均较高,为0.54~0.97。表型变异系数叶片性状和树皮性状的较低,而果实性状和产量性状的相对较高。分别根据叶片含胶率、树皮含胶率、果实含胶率和产量筛选出了4个高产胶无性系,其遗传改良效果分析结果表明,叶片含胶率、树皮含胶率、果实含胶率和产量的遗传增益分别为21.10%、54.95%、12.17%和55.22%。说明这些性状的遗传改良效果均较好,所筛选出来的无性系可以大大提高产胶量和果实产量,该研究为...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)  [作者] 郑嫩珠  董晓宁  郑丽祯  陈晖  李慧芳  朱志明  宋卫涛  缪中纬  孙世坤  
利用筛选出的6个微卫星标记对福建德化黑鸡、白绒乌鸡、金湖乌鸡、河田鸡以及江西泰和乌鸡等优良地方鸡种进行遗传多样性分析.结果表明,所选的6个微卫星标记均呈高度多态(平均多态信息含量即PIC均大于0.5).5个地方鸡种的平均杂合度为0.716-0.729,均具有较高的杂合度,表现出丰富的遗传多样性.采用邻结法(NJ)对Ne i氏遗传距离(DA)进行聚类分析,结果表明,5个鸡种被聚为2类,泰和乌鸡与河田鸡先聚为一小类(DA=0.0957),然后再与金湖乌鸡聚为一类(DA=0.1553);德化黑鸡与白绒乌鸡则聚为另一类(DA=0.1980).聚类结果基本反映了各鸡群的地理分布和选育现状.
[期刊] 西南农业学报  [作者] 李程鹏  孙一丁  刘辉  曾千春  王炎炎  马继琼  杨奕  许明辉  
OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsHMA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息。OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471BP的编码序列内发现了6个变异位点;TAjiMA'sd检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变...
[期刊] 上海海洋大学学报  [作者] 杨慧荣  赵会宏  刘丽  陈彦珍  林权卓  黄宏辉  
利用PCR技术扩增得到珠江和长江水系共29个赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)线粒体DNA D-loop基因片段,并测定其序列。对599 bp的D-loop基因序列进行分析,共检测到24个单倍型,25个单突变位点,39个简约信息位点。在81个突变位点中,转换位点50个,颠换位点14个,插入或缺失位点17个;A+T的含量(68.8%)明显高于C+G的含量(31.2%)。5个水域个体间的遗传变异率在0到6.03%之间。单倍型多样性(H)为0.977 8,平均核苷酸差异数(K±SD)为17.271 0,核苷酸多样性(π)为0.029 7。对5个群体D-loop序列进行分化指数...
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