用Wood模型对507头中国荷斯坦奶牛的第一胎日产奶量进行泌乳曲线拟合,用多性状非求导约束最大似然(MTDFREML)法对模型参数进行了遗传分析,使用SAS软件包对固定效应进行不同水平间差异显著性检验.结果表明:1)参数a,b,c的遗传力h~2分别为0.110 4,0.142 3,0.181 3,永久环境效应方差占表型方差比率c~2分别为0.075 2,0.065 0,0.053 3.2)参数a与b间的遗传相关为-0.251 3;a与c间的遗传相关为0.721 4;b与c间的遗传相关为0.406 1.3)参数a与b的永久环境相关系数为-0.329 7,呈负相关;a与c间的为0.700 1,呈强...

【目的】满足对奶牛个体营养需要量的精确预测,探索乳成分的分泌规律。【方法】以中国荷斯坦奶牛第三泌乳期305 d的产奶量为基础,从5 000—11 999 kg,按1 000 kg为间隔分为7个区间对196头奶牛进行分组,分别采用Wood、Gompertz经验模型和Dijkstra机理模型对每月测定并校正到标准日期的产奶数据进行模拟,通过SAS非线性参数估计和均方误差(MSE)分析,筛选得到了21套泌乳产量区间的泌乳曲线模型,并通过模型的参数揭示了每个区间的起始产量(y0)、达到泌乳高峰时的天数(tm)、高峰产量(ym)和泌乳持续力(r(th))等泌乳特性指标。【结果】通过分析模型参数及特性指标...

【目的】满足对奶牛个体营养需要量的精确预测,探索乳成分的分泌规律。【方法】以中国荷斯坦奶牛第二泌乳期305d产奶量为基础,从6000—13000kg,按1000kg为间隔分为7个区间对289头奶牛进行分组,分别采用Wood、Gompertz经验模型和Dijkstra机理模型对每月测定并校正到标准日期的产奶数据进行模拟。通过SAS非线性参数估计和均方误差(MSE)分析,筛选得到了21套泌乳产量区间的泌乳曲线模型,并通过模型的参数揭示了每个区间的起始产量(y0)、达到泌乳高峰时的天数(tm)、高峰产量(ym)和泌乳持续力(r(th))等泌乳特性指标。【结果】通过分析模型参数及特性指标的规律表明,上...

旨在分析不同动物模型对宁夏地区安格斯牛周岁生长性状遗传参数估计的影响，筛选出估计生长性状遗传参数的最佳动物模型。本研究使用包含或剔除母体遗传效应、母体永久环境效应及母体与直接遗传效应之间是否存在协方差来区分6种动物模型，借助DMU软件的DMU＿AI模块，利用约束最大似然法（AI-REML）估计安格斯牛周岁生长性状的遗传参数。利用赤池信息准则（AIC）和似然比检验（LRT）来确定最佳动物模型。结果表明：1）在不考虑母体效应的模型中（模型1），周岁体重、体高、体长和胸围的直接遗传力分别为0.59±0.02、0.52±0.03、0.20±0.04和0.52±0.03;2）在考虑母体加性遗传效应及其与直接加性遗传效应的协方差模型中（模型4），直接遗传力和母体效应的遗传力升高，总遗传力值降低；3）模型4估计的周岁体重、体高、体长和胸围的直接遗传力分别为0.77±0.01、0.73±0.03、0.33±0.04和0.70±0.03，母体效应遗传力分别为0.50±0.05、0.51±0.05、0.10±0.04和0.23±0.04，总遗传力分别为0.16±0.06、0.12±0.05、0.11±0.01和0.32±0.01。综上，基于本研究发现模型4对安格斯牛周岁生长性状的遗传参数估计效果最佳，为宁夏地区安格斯牛核心群的选育提高提供理论依据。

【目的】研究STAT5A基因多态性与中国荷斯坦牛泌乳性状的相关性,为进一步加快育种进程提供参考依据。【方法】利用PCR-SSCP技术对279头中国荷斯坦牛的STAT5A基因的P1和P2两个位点进行群体遗传学检测;计算其基因频率和基因型频率,并对多态性与泌乳性状进行相关性分析。【结果】发现在STAT5AP1和STAT5AP2两个位点上分别存在3种多态以及7种单倍型组合。STAT5AP1位点的AA、GG和AG的基因型频率分别为0.2401、0.1470和0.6129,A和G的基因频率分别为0.5466和0.4534,不同基因型对第1胎产奶量、乳蛋白率和第2胎乳蛋白率存在显著影响;STAT5AP2位...

运用多性状非求导约束最大似然法(multiple traits derivative free restricted maximum likelihood,MTDFREML),对湖南正虹种猪场和益阳市农科所种猪场(益农种猪场)大白母猪1998-2004年的共7 736胎次的繁殖性状育种记录进行遗传参数估计.2个猪场繁殖母猪的总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生窝重(LWB)和21日龄窝重(LW21)的遗传力分别为0.23,0.18,0.21,0.27,母体遗传效应占表型方差百分率为0.09～0.15,窝效应占表型方差百分率为0.08～0.38.繁殖性状间遗传相关为0.37～0.78,永...

【目的】探究荷斯坦牛泌乳早期(6—35 d)体细胞数(SCCel)的群体特征及其与不同泌乳阶段体细胞数(SCC)及产奶量(MY)之间的关系,并对荷斯坦牛泌乳早期体细胞评分(SCSel)进行遗传参数估计,以期为我国荷斯坦牛乳房炎抗性选育提供新的思路。【方法】收集了141个牧场2008—2018年182 378头牛的2 783 046条生产性能测定记录。质控后,共得到150 864头牛的1 869 976条测定日记录。将有表型的母牛至少向上追溯三代(父母、祖父母、外祖父母),通过追溯,获得用于遗传分析的系谱文件,共包含6 451头公牛和103 452头母牛。利用SAS软件的GLM过程分析了牧场测定规模、测定季节、测定年份、泌乳天数、胎次等因素对SCSel的影响;利用SAS软件的REG过程分别分析了SCSel与不同泌乳阶段的SCS和日产奶量之间的回归关系;基于DMU软件,使用单性状重复力动物模型、单性状动物模型和双性状动物模型分别估计了SCSel的遗传参数。【结果】荷斯坦牛产后前2周SCCel变化幅度较大,荷斯坦牛SCCel随着泌乳天数的增加呈逐渐下降的趋势;牧场规模、测定季节、胎次和泌乳天数均对SCSel有显著影响(P<0.01),回归系数范围为0.06—0.19;SCSel与泌乳期各测定日产奶量之间均存在极显著的回归关系(P

［目的］本文旨在建立拟合中国荷斯坦牛泌乳曲线的数学模型，计算出一套可靠的３０５ ｄ产奶量校正系数。［方法］分别使用Ｗｏｏｄ不完全伽玛模型、逆多项式模型、Ａｌｉ－ＳｃｈＡｅｆｆｅｒ模型、六次多项式回归模型、Ｗｉｌｍｉｎｋ模型和Ｐｏｌｌｏｔｔ模型对７１个奶牛场４３ ８１２头中国荷斯坦牛的６０９ ７８４条测定日记录进行了拟合。参数的估计使用ＳＡＳ ９．２软件中的非线性回归过程迭代求解实现。［结果］６种数学模型的拟合度（ｒ２值）为０．９４０～０．９４７。其中，六次多项式回归模型的拟合度（ｒ２值）最大，模型估计误差标准差最小，在本次试验中拟合效果最好。［结论］用六次多项式回归模型计算出各泌乳时间的累积产．．．

为探究奶牛血浆催乳素(Prolactin, PRL)浓度的群体特征及其在不同环境条件和生理阶段下的变化规律，估计牛血浆PRL浓度的遗传参数，探究PRL、PRLR和TRH基因多态性与血浆PRL浓度之间的相关性，本研究于2014和2017年对北京地区某规模化牧场的472头泌乳期荷斯坦牛进行血浆PRL浓度测定，共获得1 169条数据。首先，采用固定模型分析采样季节、胎次、挤奶前后和泌乳阶段对奶牛血浆PRL浓度的影响；然后，采用重复力动物模型估计血浆PRL浓度的遗传参数；此外，通过扫描PRL、PRLR和TRH基因的多态位点，对血浆PRL浓度进行基于多态位点和单倍型的关联分析。结果显示：1)泌乳期荷斯坦牛血浆PRL平均浓度为224.29 mIU/L,胎次、采样季节和泌乳阶段对血浆PRL浓度有显著或极显著影响，血浆PRL浓度随胎次和泌乳阶段的推移而逐渐升高，春季和夏季时奶牛血浆PRL浓度极显著高于秋季和冬季(P<0.01);2)血浆PRL浓度的遗传力为0.02,为低遗传力性状；3)PRL和PRLR基因基因中未发现与血浆PRL浓度显著相关的SNP位点，TRH基因的rs137596325、rs109144892、rs108991567、rs109468305和rs109330999与血浆PRL浓度显著或极显著相关；4)对3个基因的SNP进行连锁不平衡分析发现，PRLR基因上的单倍型块与血浆PRL浓度具有显著相关的趋势(P<0.1),TRH基因中的2个单倍型块与血浆催乳素浓度显著相关。综上，本研究获得了荷斯坦牛血浆PRL浓度的群体特征、遗传参数，探究了与血浆PRL浓度分泌相关基因的多态性及与其显著关联的分子标记，为深入理解血浆PRL浓度的遗传基础提供参考。

【目的】通过拟合泌乳曲线对影响宁夏地区荷斯坦牛测定日产奶量的诸多因素进行分析,并采用随机回归测定日模型估计遗传参数,为后续估计乳成分和体细胞数遗传参数及个体育种值估计奠定基础,同时也为制定适合该群体的优化育种方案提供参数。【方法】收集了2009—2013年间,宁夏地区24个牛场38 592头荷斯坦牛原始DHI数据,共包含550 078条测定日产奶量记录。质控标准为:产犊月龄为22—36 mo、泌乳天数为5—305 d及日产奶量为5.9—53.3 kg。质控后,共得到14 320头母牛的127 478条测定

为了有效地防控奶牛乳房炎,并掌握其发病原因,试验利用一般线性模型,分析了品种、年龄、胎次、泌乳月和采样季节诸因素对奶牛乳房炎的影响。结果发现:乳用牛比乳肉兼用型牛更容易患乳房炎;随着年龄的增长,奶牛乳房炎的发病率上升;在潮湿多雨的季节里,奶牛更容易得乳房炎;随着泌乳月的加大、胎次的升高乳房炎发病率有上升的趋势。

为分析娟姗牛泌乳曲线的特征及其305d产奶量的影响因素，并重点比较娟姗牛和荷斯坦牛两品种泌乳曲线间的差异，本研究收集了河北地区某规模化牧场2017年1月—2021年1月共1 721头娟姗牛和6 093头荷斯坦牛的日产奶量连续监测记录，利用Wood模型对奶牛的个体泌乳曲线进行拟合，并根据曲线特征确定了高峰奶、高峰日、日产奶量变化速率、各泌乳阶段产奶总量等指标对泌乳曲线进行剖析。利用SAS 9.4软件的GLM过程分析了胎次、产犊季节等因素对娟姗牛305d产奶量的影响及两群体泌乳曲线间的差异。结果表明：1)Wood模型对娟姗牛泌乳曲线的拟合效果较好，泌乳曲线拟合度（R2）可达0.86;2）娟姗牛305d产奶量受胎次、产犊季节等因素影响显著（P<0.05），较高胎次及春季产犊的娟姗牛305d产奶量更高；3）娟姗牛和荷斯坦牛的泌乳曲线在高峰奶、高峰日及日产奶量变化速率等方面均表现出显著差异（P<0.05），娟姗牛的高峰日较荷斯坦牛提前了39.84天，而高峰奶占总产奶量的比例较荷斯坦牛高0.036%，且娟姗牛的泌乳主要集中于泌乳前期（1～99d），在泌乳后期（200～305d）产奶量显著降低（P<0.05）。综上，本研究利用连续测定的日产奶量记录全面揭示了娟姗牛的泌乳特征，同时通过与荷斯坦牛泌乳曲线的比较为研究娟姗牛与荷斯坦牛的种间差异提供了有用信息，为今后利用连续监测的日产奶量记录进行奶牛产奶性能的遗传选育和牛群的精准管理提供了参考。

[目的]DSSAT-CROPGRO大豆花期模拟模型(简称CROPGRO-Soybean-Flower模型)是量化开花时间与光周期关系的生理生态过程模型。本文旨在通过单核苷酸多态性(SNP)标记对CROPGRO-Soybean-Flower模型的品种参数(cultivar parameter, CP)进行遗传解析。[方法]以183个江淮大豆种质为试验材料,于2011—2018年获得南京、当涂、盐城等10个环境的花期数据和消除环境效应的花期最佳线性无偏预测值(best linear unbiased prediction, BLUP)。将开花时间性状分解为临界短日照时数(critical short day, CSDL)、光周期敏感性(photoperiod sensitivity, PPSEN)和出苗到开花时长(emergence to flowering time, EMFL)3个CROPGRO大豆花期模拟模型的品种参数。利用供试大豆材料的实测花期以及BLUP值,采用GLUE(generalized likelihood uncertainty estimation)方法对模型的品种参数进行校准,根据模拟结果选择合适的品种参数集。利用混合线性模型(mixed linear model, MLM_Q+K)、mrMLM(multi-locus random-SNP-effect mixed linear model)模型等7种全基因组关联分析方法,对花期BLUP值、CROPGRO-Soybean-Flower模型品种参数集与60 712个SNP标记进行定位研究,在显著关联SNP位点上下游500 kb区间内筛选候选基因,并通过生物信息学网站和前人研究结果预测其功能。[结果]利用BLUP值校正CROPGRO-Soybean-Flower模型的品种参数,模型模拟结果的均方根误差的均值(average root mean square error, ARMSE)为1.65 d,比利用实测花期校正的ARMSE降低1.82 d。选用花期BLUP值校正的3个模型的品种参数集作为全基因组关联分析的数据集,检测到花期BLUP值、CSDL、PPSEN和EMFL的显著关联QTN(quantitative trait nucleotide)个数分别为6、10、5和1,所定位的SNP位点可解释0.424%～19.221%的CROPGRO-Soybean-Flower模型品种参数变异。被检测到的22个QTN中,有72.73%已被前人研究报道与大豆开花时间、光周期敏感性、生殖生长时期等性状有关。对候选基因功能预测发现:Glyma05g06220、Glyma05g31710、Glyma07g01601、Glyma08g40330、Glyma14g40030与拟南芥中昼夜节律调控、细胞分裂素响应、开花调控等基因同源,推测这5个基因参与大豆开花调控。[结论]与实测花期相比,利用BLUP值校准CROPGRO大豆花期模型品种参数的方式在区域尺度上更为合理;模型品种参数体现了大豆花期光反应的遗传特性,相关的SNP标记可以作为进一步构建基于基因的CROPGRO大豆花期模拟模型的基础标记数据。

利用中国水产科学研究院北戴河中心实验站2006~2009年间牙鲆选育家系240日龄生长性状的测定记录,对4种不同动物模型估计的生长性状遗传参数进行了比较分析。不同模型分别包括了加性遗传效应、母体遗传效应和全同胞效应。利用MTDFREML程序采用非求导约束极大似然法(DFREML)估计各模型中的方差组分。用似然比检验对不同模型的差异进行检验。结果显示,对于牙鲆240日龄体重、体长和体高,母体遗传效应和全同胞效应都有显著的影响,应用模型Ⅳ进行分析,体重、体长和体高的遗传力分别为0.30、0.32和0.39。体重与体长、体高的正向遗传相关分别为0.93和0.95;体长与体高的正向遗传相关为0.90。

【目的】应用随机回归模型分析如皋黄鸡产蛋数的方差组分和遗传参数。【方法】收集２００９－２０１２年如皋黄鸡的生产记录，包括９ ２９８只蛋鸡的４６ ３２７条月产蛋记录。应用随机回归模型分析时将Ｌｅｇｅｎｄｒｅ多项式嵌入加性遗传效应、永久环境效应以及固定效应，各产蛋月以不同的残差效应处理。加性遗传与永久环境效应分别以１～４阶Ｌｅｇｅｎｄｒｅ多项式评估，以ＡＩＣ、ＢＩＣ以及残差值选择最优模型。利用ＷＯＭＢＡＴ软件以平均信息约束最大似然法（ＡＩｒｅＭＬ）分析表型方差组分。【结果】如皋黄鸡月产蛋数遗传力为０．０５～０．３２；开产第２月产蛋数遗传力最低，第１～２月的产蛋数遗传力在０．１以下，第３～７月产蛋数．．．