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[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)  [作者] 郑艳茹  翟玉山  邓宇晴  成伟  程光远  杨永庆  徐景升  
针对已公布的18个甘蔗花叶病毒(SCMV)全基因组序列,利用MEGA 5.1分析了其11个蛋白(P1、HC-Pro、P3、6K1、CI、6K2、VPG、NIA-Pro、NIb、CP-C和多聚蛋白)编码基因所受的选择压,并结合其编码蛋白的功能,预测了部分基因在SCMV进化过程中的角色和变异位点.结果显示:P1和CP-N端的变异性程度较大,P1蛋白多样性最高;CP-C端变异性和多样性均较低;PIPo受到的选择压最小,但多样性最低,可能是由于PIPo与P3共用一段编码序列.来源于甘蔗的SCMV多聚蛋白的第2 853、2 897和2 904个氨基酸位点(在CP中部)分别为T、r和E,而来源于玉米的SC...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 薛春生  肖淑芹  王国英  陈捷  
[期刊] 中国农业科学  [作者] 吕香玲  王邦太  史利玉  石红良  谢传晓  李新海  张世煌  
【目的】玉米矮花叶病(由甘蔗花叶病毒引起)是中国和欧洲玉米产区的重要病害,开展分子标记辅助育种可以明显提高抗病育种效率。【方法】本文采用改进的BSA法(bulked segregant analysis,BSA)构建玉米抗感自交系DNA池,结合AFLP技术筛选多态性标记,转化后获得实用性强的SCAR标记,并借助100份自交系抗性鉴定结果对SCAR标记进行相关验证。【结果】获得了2个多态性稳定的AFLP标记P66M38-220和P55M51-240,其中将P66M38-220转化为SCAR112标记,此标记与甘蔗花叶病毒抗性高度相关。【结论】改良BSA法是一种发掘性状基因紧密连锁标记的有效方法;...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)  [作者] 韩凤英  谢荔岩  连玲丽  林奇英  
从福建霞浦海域分离、筛选到6株对烟草花叶病毒(TMV)具有体外钝化活性的菌株,其中,菌株9和10的抑制率较高,分别达95.26%和92.18%.进一步测定2株菌对TMV的抑制增殖活性,结果表明,菌株9和10可明显抑制TMV的增殖,其抑制率分别为36.29%和35.08%.通过对2株菌的形态特征、生理生化反应及16S rDNA序列的分析,将菌株9鉴定为蜡样芽孢杆菌,菌株10鉴定为水生海洋芽孢杆菌.
[期刊] 华北农学报  [作者] 翟玉山  彭磊  杨永庆  邓宇晴  程光远  郑艳茹  徐景升  
为探索甘蔗条纹花叶病毒与甘蔗的互作机制,利用酵母双杂交技术筛选与SCSMV互作的甘蔗因子基因,利用PCR技术克隆了SCSMV的HC-PRo、P3N-PIPo、CP和VPg的编码区,构建到酵母双杂交诱饵载体P gBKT7上,获得了P gBKT7-HC-PRo、P gBKT7-P3N-PIPo、P gBKT7-CP和P gBKT7-VPg 4个诱饵载体。结果显示,将重组质粒转化酵母Y2Hgold酵母菌株后,酵母菌株在Sd/-TRP平板上生长良好,表明重组诱饵质粒表达产物对酵母细胞无毒性;在Sd/-TRP/X-α-gal平板上长出白色菌落未变蓝,在Sd/-leu、Sd/-TRP/-ade、Sd/-T...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)  [作者] 高三基  陈平华  洪健  陈如凯  
利用电镜技术对感染甘蔗黄叶病毒蔗叶组织超微结构进行观察表明,韧皮部伴胞及叶肉细胞内的线粒体、叶绿体等细胞器及细胞核都发生了明显的病理变化.线粒体形态异常,有的肿大、内嵴模糊,严重者内嵴消失,空泡化,仅剩未被消解的残骸;叶绿体被膜破裂,严重者被膜完全消解,基粒类囊体和基质片层消失,基质外流.维管束鞘细胞中的叶绿体被膜和基质片层也遭到破坏,淀粉粒增多、膨大;细胞核形态变为不规则,局部核膜破裂,核内染色质分布不均匀,呈降解状.
[期刊] 中国农业科学  [作者] 廖富荣  林武镇  陈细红  陈青  陈红运  黄蓬英  方志鹏  吴媛  沈建国  林石明  
【目的】对一批荷兰进境番红花种球(Crocus sativus)进行病毒鉴定,以防止危险性病毒传入危害。【方法】根据已报道的马铃薯Y病毒科(Potyviridae)通用引物(Sprimer和M4T),采用RT-PCR方法对一批番红花种球样品进行检测,取其中一个RT-PCR产物进行克隆测序,利用Gen Bank上的基本局部比对搜索工具(Basic Local Alignment Search Tool,BLAST)和MEGA 6中的基于对数期望的多重序列比较(Multiple Sequence Compar
[期刊] 华北农学报  [作者] 董家红  于嘉林  韩成贵  方守国  刘仪  
通过RT PCR,获得了小麦黄花叶病毒罗田分离物28kD蛋白基因的cDNA克隆pUW28 10。序列分析结果表明,小麦黄花叶病毒不同分离物的28kD蛋白基因的核苷酸序列存在一定的差异:湖北罗田和河南潢川分离物在第326,327和336位较四川雅安、江苏扬州及日本分离物缺少3个核苷酸(nt),前两者核苷酸长度为762nt,后三者为765nt;不同分离物核苷酸序列同源性从92 1%到96 9%,相应的氨基酸序列同源性从89 8%到97 3%。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 陈永对  李宏光  刘春明  董家红  肖俊华  张仲凯  
及时剔除带毒烟苗是防控烟草花叶病的重要一环,该研究采用TAS-ELISA检测与电镜负染色法复检相结合,对2011年红河烟区1308份苗期样品进行TMV检测。结果表明,红河烟区不同育苗点烟苗TMV检出率差异较大,平均检出率为2.52%;不同烤烟品种烟苗带毒率也有差异,烟苗TMV阳性率与品种的抗性无直接相关性,而与育苗地点和育苗环境有关。该研究对筛选无毒壮苗,切断TMV传播途径、减少TMV对大田烟苗的感染具有重要意义。
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 姚明华  李宁  王飞  叶志彪  
采用完全双列杂交的方法对6份抗感差异的辣椒抗黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)遗传规律进行研究,估算其抗CMV的遗传力和配合力等遗传参数。结果表明:辣椒对黄瓜花叶病毒株系CMV-HB的抗性由多基因控制,以加性效应为主;抗性的正反交效应不显著,配制杂交组合要选择双亲均具较高抗性的亲本。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 尹跃艳  端永明  徐兴阳  邱仕芳  张廷金  丁铭  董家红  张仲凯  
烟草花叶病毒在烟草种植上为害严重。在烟草育苗前期,对育苗基质、水源、漂盘残根、育苗棚周围植物及烟草种植区病株残体、土壤用烟草花叶病毒TAS-ELISA试剂盒检测。结果表明,在水源、漂盘残根、烟草种植区病株残体、土壤中均可检测到烟草花叶病毒,在育苗棚周边8个科的14种植物中检测到烟草花叶病毒,此类毒源可能成为苗期烟草花叶病发生蔓延的初侵染源。
[期刊] 中国农业科学  [作者] 孙现超  邱并生  
【目的】获得大麦条纹花叶病毒中国株(BSMV-CH)基因组RNA1的全长cDNA,进行序列分析,明确与国外报道株系间的亲缘关系和分类地位【。方法】以自然侵染BSMV-CH的大麦叶片中提取的总RNA为模板,用RT-PCR方法获得BSMV-CH RNA1的全长cDNA,克隆到载体pMD18并测序,用DNAstar软件将获得的序列与GenBank登录的BSMVRNA1序列进行对比,分析各株系序列RNA1之间的同源性,构建系统发育树分析BSMV-CH与国外株系间的亲缘关系。【结果】BSMV-CH的RNA1全长为3795bp(GenBank注册号:AY789693),基因组RNA15′端有一个甲基化的帽...
[期刊] 华北农学报  [作者] 张宗英  徐建美  韩成贵  张振臣  李大伟  于嘉林  
采集河南省驻马店市13个不同田块小麦样品,利用RT-PCR、ELISA和Western Blotting检测技术进行检测,结果表明,该地有小麦黄花叶病毒的存在与分布。对检测为阳性的一个分离物全序列进行cDNA克隆和测序,与已报道WYMV河南潢川、江苏扬州、四川雅安和日本分离物的全序列进行比对,RNA1核苷酸一致性为97.1%~98.4%;RNA2为95.1%~98.4%;氨基酸一致性分别为94.8%~97.8%和94.2%~98.2%。利用软件MEGA4.1对上述五个RNA1和RNA2的全序列分别进行进化树分析,结果表明,驻马店分离物与潢川亲缘关系最近,而与四川雅安亲缘关系最远。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 王芳  鄢波  俞立  陈利  张仲凯  黄兴奇  
从云南省弥勒县采集典型病株接种蔓陀萝,植斑分离,经免疫电镜(IEM)鉴定为TMV(Tobaccomosaicvirus),在红花大金元品种中以TMV普通株作对照进行致病力测定,确定为强毒株系。以烟草花叶病毒RNA云南强毒株系为模板,根据国内外研究结果自行设计、合成寡核苷酸引物,通过RT—PCR体外扩增,E.coli菌株DH5α克隆,获得了云南烟草54KD(TMV复制酶)全基因片段。顺序分析表明:该基因含1425个核苷酸,编码475个氨基酸,与国外发表的U1株系比较,DNA同源率为99.0%,氨基酸同源率为98.9%,与国内普通株比较,DNA同源率为99.1%,氨基酸同源率为98.9%。
[期刊] 林业科学  [作者] 闫文凯  林文武  杨文婷  杜雅馨  吴祖建  杨靓  
【目的】研究BaMV福州分离物BaMV-TMS1及其携带的卫星RNA(satBaMV)分离物satBaMV-TMS1的全基因组特征,明确其系统发育关系;对BaMV进行c DNA侵染性克隆构建方法的改进,为其反向遗传学体系的快速建立提供简便的方法。【方法】根据已报道的BaMV和satBaMV全长序列保守区分别设计2对和1对扩增引物,从感染BaMV的竹叶中扩增、克隆获得BaMV-TMS1和satBaMV-TMS1的全长序列,并进行序列特征分析和系统发育树构建。采用多片段无缝克隆方法将扩增得到的2个病毒DNA片
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