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[期刊] 中国水产科学
[作者]
王双毅 梁利群 常玉梅 孙博
为了探究瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)极端盐碱环境下的适应机制,采用比较基因组学的研究方法,分别对来自内蒙古高盐碱湖泊达里湖(53.57mmol/L,pH9.6)和来自松花江流域的瓦氏雅罗鱼各5尾样本进行了基因组重测序,重点对两个种群全基因组水平的插入/缺失(insertion-deletion,InDels)位点进行了比较分析。测序共得到486.57 G高质量数据, 3243686532个clean reads,平均测序深度为51.34 X。序列比对后进行InDels调用共获得非冗余InDels位点983528个。种群比较分析获得差异InDels位点8176个,整合差异InDels和两个种群基因组强选择信号区域,共获得与盐碱适应相关的InDels位点325个,关联候选基因176个。富集分析显示,176个候选基因主要在离子转运、酸碱平衡和炎症免疫反应等生物学过程发挥重要作用。利用EasyCodeML、MEME和FEL3种模型,对离子转运和酸碱平衡等盐碱适应关键调控过程的候选基因abcc1、atp2b1、slc4a4、slc7a2和aqp4进行了进化分析和选择压力检测,结果显示净化选择均对候选基因起主导作用,但abcc1、atp2b1、slc4a4和slc7a2的受选择位点表现出不同程度的正向选择,并且部分位点处于关键功能结构域中。蛋白三维结构分析显示, SLC4A4和SLC7A2两个蛋白的少数位点与配体结合位点重合或非常接近,推测盐碱胁迫环境介导的正向选择压力驱动了对这些位点的选择。本研究可为瓦氏雅罗鱼盐碱适应候选基因的深入挖掘及育种新型分子标记的开发提供参考和依据。
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾丽 张凤琴 孙彩霞 张永旺 赵小兵 石利东 连瑞军 梁文刚 班顺利 马晓棠
将15万粒瓦氏雅罗鱼受精卵移植到呼和浩特市"2814"项目区的盐碱池塘,以研究其在盐碱池塘环境下的养殖技术与生长速度。经过120d的养殖,其生长速度比在达里湖自然生长要快2～3倍,这为内蒙古自治区在池塘养殖上增加了一个新的优良养殖品种。
关键词：
瓦氏雅罗鱼 孵化 池塘养殖
[期刊] 淡水渔业
[作者]
艾克达·热合曼 黄晶 邹宇婷 张立民 常玉梅
对国内3个不同养殖群体瓦氏雅罗鱼的生长可量性状、抗氧化酶活性、肌肉营养成分、群体遗传多样性和遗传结构，采用凯氏定氮、索氏抽提和水解氨基酸等现行国家标准进行分析与评价，旨在为瓦氏雅罗鱼优异种质的筛选、新品种选育及池塘养殖提供数据支撑。结果表明，3个养殖群体的瓦氏雅罗鱼生长情况良好，且在平均体重、平均体长和平均全长无明显差异；在抗氧化酶活方面，肇东(ZD)群体过氧化氢酶活性(CAT)和总抗氧化能力(T-AOC)均高于呼兰(HL)和沈阳(SY)群体，说明酶活性受不同养殖环境、喂食的饲料以及种质因素的影响；各种质群体水分(73.9～76.3%)、灰分(1.17～1.37%)、粗蛋白含量(16.70～19.57%)和粗脂肪含量(1.90～7.70%)有显著差异；3个群体瓦氏雅罗鱼中共检测出17种氨基酸，总量(TAA)为13.96%～15.76%;ZD群体EAAI指数(64.83)、AAS(6.5)和CS(4.82)评分均高于HL和SY群体；23种脂肪酸中包括7种饱和脂肪(SFA)、6种单不饱和脂肪酸(MUFA)和10种多不饱和脂肪酸(PUFA),其含量分别为0.39%～1.36%、0.71%～3.74%、0.48%～2.08%;通过全基因组测序(WGS),在全基因组水平检测SNP,进而计算群体遗传学参数，用以评估群体遗传多样性水平。研究结果表明，3个养殖群体瓦氏雅罗鱼的遗传多样性水平较低，应针对此现象采取科学有效的措施，加强瓦氏雅罗鱼渔业资源的保护和修复。综上所述，3个群体瓦氏雅罗鱼肌肉营养成分较均衡，符合FAO/WHO标准，均为符合人们营养需求的优质蛋白质，其中ZD和HL群体的瓦氏雅罗鱼肉质更鲜美多汁，可作为瓦氏雅罗鱼繁育以及新品种培育的优质资源。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
常玉梅 闫浩 苏宝锋 孙博 张立民 梁利群
本研究旨在为池养雅罗鱼肌肉营养成分的评定和规模化配合饲料的配制提供基础数据。选取达里湖瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii,简称DL)、松花江瓦氏雅罗鱼(L.waleckii,简称SHJ)、高体雅罗鱼(L.idus,简称GT)以及种内杂交种(达里湖瓦氏雅罗鱼♀×松花江瓦氏雅罗鱼♂,简称DS)和种间杂交种(达里湖瓦氏雅罗鱼♀×高体雅罗鱼♂,简称DG)各15尾,每种鱼等量分成3组,测定其背部肌肉的一般营养成分、氨基酸和脂肪酸含量。结果显示:1)除水分含量无明显差异外,5种养殖雅罗鱼的灰分、粗蛋白和
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王楠 常玉梅 唐然 何强 张利民 梁利群
本研究以来自达里湖(碱水)和松花江(淡水)的瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)杂交F2为实验材料,通过碱度耐受实验进行性状测定,以39对多态的EST-SSR和SSR为标记,对77个F2个体进行基因分型,根据Fisher确切概率法对F2基因型和耐碱性状进行关联分析。结果发现,有2个标记与耐碱性状显著相关(P
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
何强 常玉梅 苏宝锋 孙博 孙效文 梁利群
采用封闭流水式呼吸室法，研究了不同浓度碳酸盐碱度（以下简称ＣＡ，１０、３０、５０、７０、９０、１１０ ｍｍｏｌ／ｌ）对体质量为（８４．６２±６．７０）ｇ的达里湖瓦氏雅罗鱼耗氧率、氨氮排泄率、血氨含量及排氨基因Ｒｈ家族（ＲｈＡｇ、Ｒｈｂｇ、ＲｈＣｇ１和ＲｈＣｇ２）在鳃组织中表达量的影响。结果表明，随着碱度的升高，瓦氏雅罗鱼的耗氧率和排氨率均表现为先下降后上升的趋势，且都显著低于对照组（Ｐ＜０．０５）。在ＣＡ９０时，耗氧率和排氨率均达到最低值，表明ＣＡ９０可能是达里湖瓦氏雅罗鱼所能承受的最大碱度胁迫。相反，随着碱度的升高，瓦氏雅罗鱼的血氨含量呈现先上升后下降的趋势，在ＣＡ９０时达到峰值。然而在ＣＡ．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
李乾 梁利群 艾克达·热合曼 孙博 张立民 董志国 常玉梅
为了掌握瓦氏雅罗鱼精子活力及其受精率的最适盐度、碱度和pH的范围,通过设置不同NaCl盐度(1‰,2‰,3‰,4‰,5‰,6‰,7‰,8‰)、NaHCO_3碱度(10,20,30,40,50,60,70 mmol/L)、pH值(5.0,5.5,6.0,6.5,7.0,7.5,8.0)梯度范围的溶液及淡水对照组(盐度0、碱度0、pH值6.67)激发达里诺尔湖瓦氏雅罗鱼精子活力,观察了不同处理组精子状态,并对其激烈运动时间、快速运动时间及寿命进行了测定,同时测定了受精卵在不同盐度、碱度和pH溶液中的受精率。结果表明:盐度在0～4‰,瓦氏雅罗鱼精子激烈运动、快速运动时间及寿命呈逐渐上升趋势,4‰达到最长;碱度在0～50 mmol/L,精子激烈运动、快速运动时间及寿命随碱度增加而延长,50 mmol/L达到最大;pH值5.0～7.0,精子激烈运动、快速运动时间及寿命随pH值的升高而延长,pH值7.0达到最大;受精率分别在盐度4‰、碱度30 mmol/L、pH值6.5达到最高,不同盐度和碱度组的受精率显著低于淡水对照组。综上,基于对不同盐度、碱度和pH值对瓦氏雅罗鱼精子活力及其受精率的分析结果,建议在开展瓦氏雅罗鱼全人工繁殖及杂交育种过程中,尽量选择盐度在0～4‰,碱度为0～30 mmol/L,pH值6.0～7.0的盐碱水体或淡水中进行,可以获得较高的受精率及苗种成活率。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
常玉梅 何强 孙言春 梁利群 孙效文
为了从不同层面解析达里湖瓦氏雅罗鱼（Ｌｅｕｃｉｓｃｕｓ ｗａＬｅｃｋｉｉ）耐高碱的生理机制，本研究对达里湖瓦氏雅罗鱼在２个时间段（２２ ｄ和６０ ｄ）和３个不同浓度碳酸盐碱度（１８ ｍｍｏＬ／Ｌ、３０ ｍｍｏＬ／Ｌ和５０ ｍｍｏＬ／Ｌ）胁迫下的１５种血浆游离氨基酸（ＰＦａａｓ）含量的变化趋势进行了分析。结果显示，血浆ＰＦａａｓ总量随着碱度的上升而显著增加，而且随着胁迫时间的延长，由必需氨基酸增量为主转向非必需氨基酸增量为主；作为能量代谢的主要底物，非必需氨基酸中的脯氨酸（Ｐｒｏ）和缬氨酸（ＶａＬ）含量随着碱度的增加而显著增加（Ｐ＜０．０５），尤其是Ｐｒｏ在碱度胁迫组中的含量增幅为对照组的２３倍．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
窦新杰 常玉梅 唐然 孙效文 陶然 王楠 梁利群 张丽霞
利用mt DNA COⅠ基因片段(有效长度635 bp)对来自达里湖(DL)、岗更湖(GG)、呼伦湖(HL)、黑龙江(HLJ)、松花江(SHJ)和乌苏里江(WSL)6个地理群体共72个样品进行了遗传多样性和遗传结构分析。从碱基组成来看,6个地理群体在COⅠ区段上的A+T含量(52.37%)明显高于G+C含量(47.67%),符合脊椎动物的碱基组成特点;从各项遗传参数来看,达里湖流域2个群体(DL和GG)的遗传多样性低于黑龙江流域4个群体(HL、HLJ、SHJ、WSL);6个群体共检测到20个单倍型,并共享1个单倍型,达里湖流域群体共享1个单倍型,黑龙江流域群体共享1个单倍型。虽然达里湖流域和黑...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
徐悦 梁利群 孙博 常玉梅
为探究碱水环境中自然优势种瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)的耐碱离子调节机制，采用胰蛋白酶消化法对其鳃细胞(Gill cells ofLeuciscuswaleckii，LWG)进行体外培养，确定该类原代和传代细胞培养的适宜条件并进行耐受实验，用以对瓦氏雅罗鱼在碱生境中的生长特性进行论证。结果表明：瓦氏雅罗鱼原代鳃细胞培养在15℃，含有10%胎牛血清(Fetal bovine serum，FBS)的DMEM培养基（Dulbecco's modified eagle medium）中可获得稳定、良好的培养效果；36 h～72 h即可传代，稳定传代后的细胞命名为：LWG细胞。传代培养过程中，36 h时LWG细胞生长代谢旺盛可用于后续实验。碱水生境中，为缓解碱离子对鱼体造成的损伤，鳃细胞将启动渗透压胁迫应答机制。本研究对LWG细胞进行碱胁迫实验并检测其细胞活性和功能后发现：LWG细胞在25～50 mmol/L NaHCO_(3)浓度下耐受3h时，增殖率约60%并初现细胞凋亡。由此推断，在25～50 mmol/L的碳酸盐碱度胁迫下，LWG细胞具有强渗透压的碱度耐受性并促使细胞发生凋亡现象。对LWG细胞原代培养条件的摸索，将为探索瓦氏雅罗鱼碱胁迫下渗透压应激响应机制和相关基因功能的验证提供相对稳定的实验材料。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
池炳杰 常玉梅 闫学春 曹顶臣 高玉奎 柳玉海 李勇 梁利群
选用5个瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii Dybowski)微卫星标记和13个草鱼微卫星标记,对分别采自内蒙古境内的达里湖和乌苏里江抚远江段的各15尾野生瓦氏雅罗鱼个体进行STR-PCR分析。结果显示,18个微卫星标记共检测到111个等位基因,平均每个基因座扩增得到6.1667个等位基因,观测杂合度(H o)0.1000～0.9333,平均为0.5315;期望杂合度(H e)0.0966～0.9328,平均为0.6298;多态信息含量(PIC)0.0905～0.9113,平均为0.5774;乌苏里江群体的平均等位基因数和平均观测杂合度分别为5.5556和0.5778,达里湖群体...
[期刊] 华北农学报
[作者]
李宪伟 郑洪亮 赵宏伟 王敬国 刘化龙 孙健 李宁 雷蕾 邹德堂
为了发掘影响粳稻芽期耐盐碱性状的优异等位变异及相关的载体材料用于品种耐盐碱潜力改良,以不同地理来源的176份粳稻种质组成的自然群体为研究材料,针对水稻直播的种植方式,直接采用黑龙江省大庆地区的标志性中度苏打盐碱土进行芽期胁迫处理,分别对胁迫13,18 d的地上部钠离子浓度(SNC)、地上部钾离子浓度(SKC)、地上部钠钾比(SNK)及18 d的盐碱害级别(SDG)进行调查。同时鉴定了这176个品种154对SSR标记的基因型,利用STRUCTURE 2.2软件进行了群体结构分析和连锁不平衡分析,通过TASSEL 3.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行标记与性状的关联分析,并进一步挖掘优异变异及相关载体材料。结果表明,研究中自然群体被划分为3个亚群,且每个亚群内均存在不同程度的连锁不平衡;在关联分析的过程中,共检测到13个与粳稻芽期耐盐碱性显著关联的位点,其中,有8个位点在TASSEL 3.0软件的2种模型条件下同时被检测到,对这8个位点进行进一步的鉴定得到了24个优异等位变异。通过比较图谱发现,2种模型条件下同时检测出的8个与耐盐碱性状显著关联的位点中,有7个为前人已经报道过的位点,而RM1219在前人研究中未见报道,且RM1219同时与3个耐盐碱性状显著关联,可能是一个新的与粳稻芽期耐盐碱性相关联的位点。
关键词：
粳稻 耐盐碱 关联分析 芽期
[期刊] 中国农业科学
[作者]
董明 再吐尼古丽·库尔班 吕芃 杜瑞恒 叶凯 侯升林 刘国庆
【目的】探究高粱耐盐胁迫响应机制,挖掘高粱耐盐胁迫基因,为高粱耐盐育种提供理论基础。【方法】以高粱感盐品种L甜和耐盐品种石红137为供试材料,采用水培试验。待高粱植株长至三叶一心期,使用2%NaCl溶液对幼苗进行盐胁迫,分别设置0(对照)、1和24 h处理,每个处理3次重复。测定不同处理样品株高、根长、干物重、Na~+含量和叶绿素相对含量(SPAD值),并依托Illumina HiSeq 2000平台进行转录组测序分析。利用FPKM方法计算基因表达量,在差异表达基因检测过程中,将差异表达倍数(fold change)≥2且FDR
关键词：
高粱 盐胁迫 转录组 基因挖掘
[期刊] 华北农学报
[作者]
王祥银 孙良玉 刘靖 肖榕
单核苷酸多态性(SNP)是基因组中普遍存在的遗传变异,是一种重要的遗传标记。为了解拟环纹豹蛛转录组中响应温度胁迫的SNP候选位点及SNP所在基因SNP-Unigenes的功能注释,主要采用SOAPsnp软件对拟环纹豹蛛在不同温度胁迫条件下的转录组测序结果进行SNP检测,并把SNP所在基因SNP-Unigenes比对到GO、COG、KEGG数据库,获得SNP-Unigenes的注释及参与的功能情况。结果表明:拟环纹豹蛛转录组SNP位点分布在7 421条SNPUnigenes上,共存在402 910个SNP位点,SNP发生频率为1/301 bp;功能注释分类揭示拟环纹豹蛛在低温胁迫和高温胁迫条件下,SNP-Unigenes主要参与蛋白质转运、核糖体代谢、氧化磷酸化和氨基酸代谢功能,从而补偿热应力下蛋白质的损伤,加快拟环纹豹蛛对温度变化的适应。综上,筛选到拟环纹豹蛛响应温度胁迫相关的SNP位点或SNPUnigenes,为将来深入研究拟环纹豹蛛响应温度胁迫的分子机制提供基础数据。
关键词：
拟环纹豹蛛 温度胁迫 单核苷酸多态性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
池炳杰 梁利群 刘春雷 常玉梅 王山 韩启霞 高国强
为了解滩头雅罗鱼[Tribolodon brandti(Dybowski)]对NaCl浓度、碱突变的适应能力,在水温为22~25℃,采用单因子静态急性毒性实验法对滩头雅罗鱼3月龄幼鱼进行NaCl、碱适应性研究。结果表明,在pH 7.3±0.2、碱度1.11 mmol/L时,NaCl浓度对实验鱼12 h、24 h、48 h和96 h的半致死浓度(LC50)值分别为28.81 g/L、28.57 g/L、28.51 g/L和28.40 g/L,安全值(SC)为8.52 g/L。在pH 8.5±0.5时、NaCl浓度为3.1~7.4 g/L时,碱度对实验鱼12 h、24 h、48 h、72 h和96...
关键词：
滩头雅罗鱼 NaCl浓度 碱度 适应性
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