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[期刊] 海洋渔业
[作者]
李媛媛 王珊珊 郭晓雨 崔宇通 王云慧 王儒晓 李钊霞 蔡建平 张运发 曲江勇
采用聚合酶链式反应和直接测序的方法研究了中国海矮拟帽贝(Patelloida pygmaea) 13个地理种群环境因子对其遗传多样性的影响。137个样本的COI部分序列(601 bp)中共发现217个多态位点,转换颠换比1. 25,界定30个单倍型。汕头种群呈现较高的遗传多样性,威海种群呈现较低的遗传多样性。与环境因子相关性分析发现,矮拟帽贝遗传多样性与年均温度、年均降水量、年均水汽压呈显著正相关(P
[期刊] 中国水产科学
[作者]
杜晓东 李广丽 刘志刚 叶富良 王如才
用形态特征比较与同工酶电泳分析相结合的方法 ,对产于我国北部湾和大亚湾的野生合浦珠母贝 (Pincta damartensii)的遗传多样性进行研究。结果表明 ,在贝壳形态方面 ,北部湾种群的平均壳长与壳高都略大于大亚湾种群 ,壳高与壳长呈乘幂相关 ,壳宽与壳长呈对数相关。大亚湾种群的壳宽指数、壳重指数和肥满度指标都大于北部湾种群。用聚丙烯酰胺梯度凝胶电泳检测由 2 6个位点编码的 12种同工酶 ,2种群都显示出较高的多态性 ,北部湾种群多态位点的比率为 38.4 6 % ,大亚湾种群则为 4 6 .15 %。都表现出明显的杂合子缺失现象 ,北部湾种群的平均杂合度 (0 .0 999)小于大亚...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
鲁云风 王茜 黄文波 史利华 吴克亮
【目的】基于微卫星标记特点,采用计算机模拟技术,探讨畜禽保种群遗传多样性的变化过程。【方法】选择30个均匀分布于基因组、具有4—10个等位基因的标记位点,位点间无相互作用;模拟产生的畜禽保种群公母比例为1﹕5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定,世代间无重叠,群体有效大小分别为Ne=10、20、50、100和200,保种繁殖50个世代,1 000次重复。采用多态性位点数(num-p)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ae)、观测基因杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、稀有等位基因数(RA)、缺乏丰富位点数(NRP)作为遗传多样性度量指标。【结果】保种群体的遗传多样性总体...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
刘颉 李婧 陈敏 骆有庆 陶静
利用AFLP分子标记技术分析我国重大外来入侵害虫美国白蛾8个群体的遗传多样性及遗传分化。结果表明:5对AFLP引物共扩增出564个位点,其中多态位点为548个,多态位点百分率(P)为97.16%,Nei's遗传多样性指数(h)为0.2910,在物种水平上美国白蛾具较高的遗传多样性;AMOVA显示美国白蛾有较高的遗传分化,群体间变异占31.05%,群体内变异占68.95%,遗传分化指数(Fst)为0.3105;美国白蛾8个群体平均遗传相似度为0.8927,平均遗传距离为0.1147。聚类分析结果表明,沈阳、济南、烟台和寿光群体亲缘关系较近,天津、济宁群体聚为一类,而廊坊、北京群体分别独立分支。进...
关键词：
美国白蛾 AFLP 遗传多样性 遗传分化
[期刊] 水产学报
[作者]
杨智鹏 于红 于瑞海 孔令锋 李琪
我国脉红螺自然资源日趋衰减,为制定相应保护措施,需要对脉红螺遗传多样性及遗传结构进行分析研究。本实验利用9个微卫星标记分析了我国沿海脉红螺9个群体的遗传多样性和遗传分化水平。遗传多样性分析结果显示,群体平均等位基因丰度(AR)为8.6~9.5,期望杂合度(HE)为0.705~0.777,观测杂合度(Ho)为0.498~0.626。遗传分化分析结果显示,群体间遗传分化指数(FST)范围为0.012 2~0.093 6,各群体间没有显著的遗传分化,遗传距离(DC)为0.212~0.349。本研究结果表明,我国沿海脉红螺群体具有较高的遗传多样性,各群体间没有显著分化。
关键词：
脉红螺 微卫星 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 林业科学
[作者]
高宝嘉 杜娟 高素红 刘军侠
采用微卫星技术对入侵中国的5个美国白蛾种群进行遗传多样性和遗传分化及影响因素的研究。用10对微卫星引物对300个样品DNA进行PCR扩增,并进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分析。5个美国白蛾种群的多态位点百分率P=98.36%;多态位点百分率的大小顺序为:沧州种群、烟台种群、秦皇岛种群、丹东种群、石家庄种群;美国白蛾整个群体的遗传分化:34.38%的变异存在于种群间,65.62%的变异存在于种群内,遗传距离变化范围为0.1386～0.3224。用UPGMA法对Nei's遗传距离作聚类分析的结果表明:种群的分化程度与分化时间和入侵来源密切相关。影响美国白蛾种群遗传多样性与遗传分化的主要因素是经度、平原比率...
[期刊] 林业科学
[作者]
王铁娟 李伟琼 张淑艳 孟翔飞
差不嘎蒿(Artemisia halodendron)也称盐蒿,是菊科(Compositae)蒿属(Artemisia)的多年生半灌木,为中旱生沙生植物。可生长于流动沙丘的背风坡、半流动沙丘、半固定沙地、固定沙地和干旱坡地,在半流动、半固定沙地优势作用明显(李进,1991;常
关键词：
差不嘎蒿 ISSR 遗传多样性 遗传分化
[期刊] 水产学报
[作者]
董志国 李晓英 王普力 王文进 张庆起 阎斌伦 孙效文
为探明分布于中国四大海区的天然三疣梭子蟹群体遗传多样性与遗传分化状况,实验以大连(DL)、东营(DY)、连云港(LYG)、舟山(ZS)、湛江(ZJ)和漳州(ZZ)6个三疣梭子蟹地理群体为研究对象,采用线粒体控制区D-loop全基因序列为分子标记,对中国海三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性及群体遗传结构进行了分析。结果发现,在用于分析的1 141 bp的D-loop全基因序列中共有185个变异位点,129个简约信息位点。60个个体中共计48个单倍型,单倍性多样性指数和核苷酸多样性指数显示中国沿海三疣梭子蟹群体具有较高的遗传多样性,而且三疣梭子蟹在过去没有出现很强的选择效应,群体大小稳定。6群体三疣梭...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
徐龙鑫 杨胜林 李爱萍 乜玉丽 杨海兵 戴焰
【目的】利用线粒体细胞色素b(mtDNA Cytb)基因为标记,从分子水平探讨中国5个矮马136个样本的遗传多样性和系统进化研究,为中国矮马的开发利用以及生物多样性保护提供基础资料。【方法】对矮马样本mtDNA Cytb基因进行PCR扩增和测序,运用现代生物信息学方法进行数据处理。【结果】共检测到27个单倍型,40个多态位点,约占分析位点总数的3.51%。云南矮马具有最高的单倍型多样度(Hd)(0.869),最低的为四川矮马(0.740),核苷酸多样度(Pi)最高的为贵州矮马(0.00435),最低的为宁强矮马(0.00227),各群体间的遗传多样性相差不大。系统发育树和NETwork图中每一...
关键词：
中国矮马 Cytb 遗传多样性 系统进化
[期刊] 水产学报
[作者]
舒妙安 周宇芳 朱晓宇 赵晓枫 郭晓令
利用17对微卫星引物对我国沿海7个拟穴青蟹野生群体(杭州湾、三门湾、闽江口、东山湾、珠江口、北部湾、清澜港)进行了遗传多样性分析。结果表明,17个位点在所有青蟹群体中均为高度多态(PIC>0.5),共检测到253个等位基因;7群体的平均等位基因数(A)为9.41～10.94,平均有效等位基因数(Ne)为5.42～6.87,平均杂合度(H)为0.511～0.563,群体遗传多样性水平较高。分子方差分析(AMOVA)结果显示,94.13%的遗传变异存在于群体内,5.87%的遗传变异存在于群体间,两两群体间FST值为0.035 5～0.081 7(P<0.01),表明群体间遗传分化水平中等偏低。Ha...
关键词：
拟穴青蟹 野生群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
陈锦华 汪小凡 梁述平
采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和等位酶分析方法 ,研究了矮慈姑一个自然居群的遗传多样性。根据 9个酶系统 16个等位酶位点的检测结果 ,表明矮慈姑的遗传多样性属中等水平。矮慈姑自然居群的多态位点百分率P =2 5 .0 ,平均每位点等位基因数A =1.4 375 ,平均多态位点等位基因数Ap =2 .5 0 0 ,等位基因有效数Ae=1.30 93,平均预期杂合度He=0 .132 7,平均观察杂合度Ho =0 .194 8,固定指数F =- 0 .4 6 84。实际观察到的杂合体比率高于理论预期杂合体比率 ,居群表现为杂合体过量。
关键词：
矮慈姑 等位酶 遗传多样性 自然居群
[期刊] 水产学报
[作者]
常玉梅 孙效文 梁利群
中国鲤具有悠久的养殖历史和重要的经济价值,无论是天然种群还是养殖品种,年产量远超过其它鱼类。近几十年来,养殖新品种的开发获得成功,大大提高了产量,改善了品质。但是由于盲目的开发利用,许多重要的鲤养殖种类的种质资源遭到破坏。"江西三红"(Cyprinuscarpiovar.xingguonensis、Cyprinuscarpiovar.wuyuanensis、Cyprinuscarpiovar.wananensis)、黄河鲤(Cyprinusycarpiovar.)和黑龙江野鲤(Cyprinuscarpiohaematopterus)是中国鲤几个具有代表性的养殖品种和野生种,在我国鲤鱼遗传育种研...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
郭小兵 黄志鑫 张天祥 丁建红 高云云 付雅君 胡德夫 刘刚
【目的】研究林麝饲养种群的遗传多样性现状及遗传结构，为指导种群遗传管理及其饲养种群种质保护与利用提供理论依据。【方法】遴选陕西省宝鸡市凤县的片仔癀麝场和逢春麝场，汉中市留坝县的太子岭麝场，采用分子粪便学的方法，采集220份新鲜的粪便样品，成功获得112条mtDNA控制区序列，计算单倍型多样性和核苷酸多样性。【结果】在3个林麝繁育基地共检测到96个变异位点，均为简约信息位点，突变形式为转换和颠换，未出现插入和缺失现象；共获得36个单倍型，单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.957 8和0.039 5，单倍型多样性以片仔癀麝场最高，为0.953 9，留坝群体最低，为0.842 8；饲养种群间出现显著的遗传分化，其中，太子岭麝场和逢春麝场的遗传分化系数FST(0.137 7)最高，而太子岭麝场和片仔癀麝场的FST(0.077 2)最低。【结论】饲养林麝种群较之众多濒危有蹄类饲养种群的遗传多样性高，但林麝饲养种群之间基因交流较少，建议实施基于非损伤取样的粪便mtDNA分析技术对群体内和群体间进行遗传管理，保护饲养林麝种群现有的遗传多样性。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
孙嵬 张柱亭 类成平 董辉 钱海涛 丛斌
应用线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列对10个地理种群黄胫小车蝗(Oedaleus infernalis Saussure)的遗传多样性及遗传分化进行了初步研究。结果表明:在获得的168条序列样本中,共发现了14个变异位点,定义了15种单倍型。总单倍型多样性指数Hd为0.462,种群内单倍型多样度在0.125~0.625范围之内。总群体的Fst为0.0812,Gst为0.0991,Nm为4.55,表明黄胫小车蝗各地理种群之间存在着较为充分的基因交流。分子方差分析(AMOVA)结果表明,黄胫小车蝗的遗传差异主要发生在种群内部,占方差比率的91.53%。单倍型中介网络图及系统树显示,各种群中的单...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
姚理想 周娜 沈和定 刘宸
基于CO I序列,对中国沿海5个平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)群体的遗传多样性及遗传分化进行了分析,84个样本中共检测出单倍型41个,多态性位点117个。总体来说,平疣桑椹石磺具有高的单倍型多样性(0.835±0.039)和核苷酸多样性(0.0572±0.0060)。分子方差分析(AMOVA)表明,65.98%的变异存在于种群间,34.02%的变异发生在种群内。群体间遗传分化固定指数(Fst)、基因流(Nem)及遗传距离分析表明,平疣桑椹石磺已产生了明显的群体间分化。厦门(XM)、湛江(ZJ)和广西(GX)群体间无明显分化,基因流较大(Nem>5),而海南(HN)、苍南...
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