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[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郭晓令 姜志华 刘红林 黄月英
采用纯种大约克和纯种二花脸猪血样提取基因组DNA,分别用11种限制性内切酶消化,以非放射性狄高辛试剂盒标记4.8kb21-羟化酶(CYP21)基因为探针,经Southern杂交对猪的CYP21基因位点的限制性片段长度多态性(RFLPs)进行了研究。结果在BanⅠ、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ和TaqⅠ5种限制性内切酶位点检测出了RFLPs,且BanⅠ和KpnⅠ酶切位点的多态性为首次发现;而在其他6种酶切位点(ApaⅠ、BamHⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、ScaⅠ、XbaⅠ)没有发现RFLPs。用上述5种发现RFLPs的限制酶对无亲缘关系的12头大约克和12头二花脸猪进行RFLPs分析,各限制酶...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
单淇 董仕 吴海防 谷口顺彦
鳙鱼(Aristichthys nobilis)采自江西瑞昌、湖南长沙的天然群体以及天津宁河的人工繁殖群体共127尾,对其线粒体DNA的D-loop区段进行PCR扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切。酶切结果显示,在12种内切酶中,8种有酶切位点,2种个体间有变异,为AfaⅠ和HinfⅠ,共得到7种单倍型。依据单倍型频率的组成情况,计算出瑞昌与长沙、宁河群体间的Rogers遗传距离分别为0.728 3和0.500 7,长沙和宁河群体间的Rogers遗传距离为0.813 5。AfaⅠ的酶切类型C和HinfⅠ的酶切类型B组成的单倍型,在长沙群体中占87.5%,而在瑞昌和宁河群体中均为零。由此可以认为...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
李献梅 王小芬 崔宗均
末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)是以荧光标记引物PCR为基础,根据末端限制性片段长度区分出微生物群体组成的一种微生物群体图谱法。本文综述了该方法在群体微生物分析上的应用及DNA提取、PCR扩增、酶切和数据分析等步骤的技巧与优化,总结了科学应用该技术的要求以及和多重PCR、gyrB基因等相结合的观点。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
苟本富
采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测,比较了2种方法的多态性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,共获得108个AFLP标记,片段大小在100~2000 bp,得到33个多态位点,多态性位点百分率为30.56%;双酶切采用25对双酶切AFLP引物,在50~600 bp扩增出清晰条带658条,得到182个多态位点,占总扩增带的27.6%。对多态性片段进行统计,计算出不同品种间的相似系数和遗传距离。结果表明:硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远,且其它四种蔷薇的遗传距离均较近,这与蔷薇品种来源和培育史...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
于晓英 张秋明 易干军 霍合强 谭卫萍 李典范
为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG对 35个香蕉材料进行选择性扩增后 ,共得到扩增位点 10 7个 ,其中多态性位点 84个 ,多态性位点比例达到 78.5 % ,对 35个材料的区分率达到10 0 % .2 )在引物对EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG构建的香蕉AFLP指纹图谱中...
关键词:
香蕉 种质资源 鉴别 扩增片段长度多态性
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
于晓英 吴铁明 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南
为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获得高分子量基因组 DNA和 AFL P指纹图谱 ,其中以幼叶的 DNA产量和品质最好 ,CTAB法提取的 DNA纯度较高且程序简单
关键词:
萱草 扩增片段长度多态性 脱氧核糖核酸
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杜晓华 王得元 巩振辉
为了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18 bp的引物,引物的3′端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35℃的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20 ng,M g2+浓度为2.5 mm o l/L,dNTP s浓度为0.2 m...
[期刊] 水产学报
[作者]
李静 陈松林 邓思平 田永胜 沙珍霞 王清印 庄志猛 徐建勇 温海深
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevisGünther)为东北亚特有的名贵冷温性比目鱼类,为我国养殖业的新宠。半滑舌鳎雌鱼生长速度是雄性的2~3倍,若能实现单雌化养殖将大大提高养殖业的经济效益。本研究利用扩增片段长度多态性(AFLP)技术,应用64个引物组合,检测了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevisGünther)雌雄基因组DNA的多态性,筛选与半滑舌鳎性别相关的AFLP分子标记。实验经过3轮筛选和验证,4个引物组合扩增出7个雌性个体出现频率为100%的DNA片段,我们认为这7个标记是半滑舌鳎雌性特异的AFLP标记,分别命名为CseF382、CseF575、C...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
于晓英 吴铁明 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南
为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ,其中多态性条带 12 8个 ,占扩增条带总数的 6 2 .9% ,5个萱草材料具有较高的遗传多样性 ,并初步认为其中野生重瓣萱草可能来自于萱草H .fulva的自然突变
关键词:
萱草 扩增片段长度多态性 DNA指纹
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
吴珍芳 熊远著 邓昌彦 蒋思文 I.HARBITZ
脂蛋白脂肪酶(Lipoproteinlipase,LPL) 是影响动物脂肪沉积的关键酶之一。本文利用PCRSSCP法,对猪的LPL基因进行了多态性分析,发现其5’端区域存在DNA 多态性。脂肪型猪种梅山猪和通城猪表现出3种等位基因型(AA、AB、BB) ,其等位基因A和B的频率分别为0.76、0 .24 和0.77、0 .23 ;而瘦肉型猪种长白猪和大白猪表现出另外不同的3 种等位基因型( CC、CD、DD),其等位基因C和D 的频率分别为0.76 、0 .24 和0.72、0.28 。测序结果表明具四种等位基因纯合子的DNA 片段之间存在5 处碱基突变,分别表示为等位基因AATCCT,...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
邓益锋 张皎 侯加法
选择58周龄高产期伊莎笼养蛋鸡90羽,应用PCR扩增鸡IGF-I启动子上游7 kb处基因片段,用PstI消化产生限制性片段长度多态性,分析IGF-I多态性与胫骨、股骨、肱骨骨密度之间的关系。结果表明,伊莎蛋鸡PP、Pp、pp基因型频率分别为0.256、0.311、0.433,P和p等位基因频率分别为0.411 1和0.588 9。方差分析显示,肱骨的骨密度与IGF-I基因多态性相关,PP基因型组的骨密度和骨矿含量均显著大于pp基因型(P<0.05),股骨、胫骨基因型间无显著差异。PP基因型体质量显著大于Pp基因型。表明伊莎笼养蛋鸡IGF-I基因多态性和肱骨骨密度显著相关,P等位基因具有一定的优...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
熊统安 朱猛进 郭宏 樊斌 刘榜 余梅 赵书红 强巴央宗 王志刚 李奎
采用PCR-RFLPS方法,对中国藏猪ESR基因多态性进行了研究,并与太湖猪、金华猪、成华猪、内江猪、长白猪、大白猪等中外猪种的ESR基因频率、基因型频率作了对比分析。结果表明藏猪有3种ESR基因型,ESR等位基因之间的频率较其它猪种均衡,从而证明西藏猪选择压力较小,ESR基因的分布处于原始的自然状态。
关键词:
藏猪 雌性激素受体(ESR)基因 多态性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
孙梅 陈杰 赵茹茜 韦习会 刘红林
利用Bi PASA技术检测了二花脸猪OB基因的多态性 ,并且分析了其与母猪产仔性能的相关性。结果显示 ,OB基因在第 371 4碱基处存在G/T替换 ,经Bi PASA检测后分别定义为等位基因G和T。在二花脸母猪群中 ,等位基因G和T的频率分别为 0 339和 0 6 6 1。方差分析发现 ,G/G基因型个体的头胎产仔数以及平均产仔数略低于G/T型和T/T型个体 ,但相互之间无显著差异 ;在最高产仔数性状上 ,G/G型个体显著低于G/T型和T/T型个体 (P
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘晨曦 王彬彬 蒲广 张倩 曹旸 王欢 高琛 牛培培 李平华 黄瑞华
【背景】MUC13基因是调控致使仔猪断奶前腹泻的产肠毒素大肠杆菌F4ac感染的主效基因,该基因上rs319699771位点(G/A突变)能准确鉴别易感和抗性个体,其中GG型是抗腹泻基因型,苏淮猪抗腹泻性能分子选育是通过选留GG型个体来实现。但在选留抗腹泻GG型个体时是否会对苏淮猪其它重要经济性状如生长、胴体、肉质产生不利影响尚未明晰。【目的】旨在分析该位点是否与其它性状关联,以确定基于MUC13基因rs319699771位点抗腹泻性能的分子选育是否会对苏淮猪其它经济性状产生不利影响。【方法】以313头体重为87.61±0.54 kg的苏淮育肥猪为试验动物,屠宰测定其胴体和肉质性状,以261头日龄为161.1±0.5 d苏淮后备猪为试验动物,测定其生长、体尺性状,同时采集相应苏淮育肥猪和后备猪群耳组织样提取组织DNA,经过多重PCR反应进行MUC13基因rs319699771位点多态性检测,采用SAS软件中一般线性模型分析MUC13基因rs319699771位点多态性基因型和苏淮猪肉质、胴体和生长性状的关联性。【结果】MUC13基因rs319699771位点多态性检测结果显示,苏淮猪育肥群公、母猪群体MUC13基因rs319699771位点的抗腹泻G等位基因频率分别为0.695和0.634,抗腹泻优势GG型频率在苏淮猪育肥群公、母群体中分别为0.467和0.373;该位点抗腹泻G等位基因频率在苏淮后备群公、母猪群体分别为0.690和0.705,抗腹泻优势GG型频率在后备群公、母猪群体中分别为0.508和0.480,说明苏淮猪抗腹泻等位基因频率较高,通过分子选育提升苏淮猪抗腹泻GG型频率的可行性强。MUC13基因rs319699771位点多态性与苏淮猪经济性状关联分析结果显示:育肥猪群体该位点多态性与胴体、肉质性状均无显著关联(P>0.05),可见在苏淮猪育肥猪群体内加大对抗腹泻MUC13基因rs319699771位点的选育不会影响到苏淮育肥猪的胴体和肉质性状;苏淮后备猪群体该位点多态性与腿臀围指标存在极显著关联(P<0.10),GG型个体相较于AA、AG型个体有提升趋势,对于这三个性状来说,有利基因型都是GG型,说明选留该位点GG型进行苏淮后备猪抗腹泻选育的同时还可以提升苏淮后备猪生长相关性状。【结论】据此,苏淮猪群体MUC13基因rs319699771位点抗腹泻等位基因频率较高,进行抗腹泻选育的可行性强,同时对于苏淮猪群体,不仅可通过选留提升MUC13基因rs319699771位点GG型频率来提高抗腹泻能力,还能同时实现对苏淮猪群腿臀围、日增重的选育提升。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
汪登强 危起伟 罗晓松 方耀林
使用长PCR技术扩增鲟形目(Acipenseriformes)15个种的核糖体DNA(rDNA)18S rRNA基因与28S rRNA基因之间约2.5 kb的片段,并用7个限制性内切酶对该片段进行限制性位点分析。结果显示,使用LATaqDNA聚合酶及GCBuffer结合长PCR技术能够很好地扩增鲟形目鱼类的rDNA。根据酶切图谱可确定93个限制性位点,其中21个为保守位点,72个多态信息位点。HhaⅠ酶切的带型在所有个体中完全一致,提示这些位点对保持rDNA的功能有重要作用。一些酶的酶切产物长度之和大于扩增产物的长度,暗示鲟形目鱼类个体内存在多个rDNA等位基因。对种间遗传距离进行计算,并构建...
关键词:
鲟形目 rDNA PCR 限制性位点
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