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[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
姜志华
采用聚合酶链反应（ＰＣＲ）及ＰＣＲ产物的直接序列分析方法，对猪生长激素基因第二外显子区遗传变异的序列基础进行了研究。ＰＣＲ扩增片段长度为２３０ｂｐ，包含全部的生长激素基因的第二外显子区序列（１６１ｂｐ）。共分析了６头二花脸和６头长白猪，结果表明：在猪的生长激素基因第二外显子区，共有７处碱基替换，依次为５０７处的Ｃ／Ｔ替换、５２０处的Ｃ／Ｔ替换、５４６处的Ｇ／Ａ替换、５５５处的Ｇ／Ａ替换、５５６处的Ｃ／Ａ替换、５９５处的Ｃ／Ｔ替换及６３４处的Ｃ／Ｔ替换。只有５０７、５４６、５５５和５５６处的突变可引起氨基酸序列的变异，其余均为无意义突变。采用ＧＣＧ软件包对限制酶酶切图谱进行分析，结果表明引起氨基...
关键词：
猪 生长激素基因 第二外显子 序列 突变
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张涛 路宏朝 陈锐 周建军
【目的】通过分析不同动物和中国几个地方马种生长激素基因序列,为宁强矮马起源和矮化形成机制的研究提供分子水平的试验依据。【方法】通过PCR扩增宁强矮马生长激素基因并进行测序,用DNAMAN软件对不同动物的生长激素基因序列进行比对分析。【结果】马品种间29个位点发生遗传变异,编码区11个位点发现遗传多态现象。以蒙古马生长激素氨基酸序列为标准,宁强矮马仅在1765位点的变异导致氨基酸发生改变。以生长激素的mRNA序列为基本数据进行聚类分析,宁强矮马和德保马67的同源性为100%,与百色马的同源性为99.8%,与蒙古马的同源性为99.7%。【结论】马属动物生长基因序列与猪和狗的同源性较高,宁强矮马17...
[期刊] 水产学报
[作者]
贡成良 曹广力 薛仁宇 张传溪
序列分析表明:欧洲鳗鲡GH基因从ATG到TAG共计2393bp,有4个外显子、3个内含子,推测编码209个氨基酸。第一内含子存在3个重复单体构成的微卫星序列。同源性分析表明:欧洲鳗鲡GH可分为5个结构域,GDI-GD4区域与GH的活性有关,为GH与其受体专一性结合区域,GD5区域与GH分子的结构、稳定性有关。进化分析表明,鱼类GH分可成3个不同的组,欧洲鳗鲡GH基因属Ⅰ组,Ⅱ组可分含4个内含子基因及含5个内含子基因二个亚组,Ⅲ组GH基因有5个内含子。推测原始的GH基因在进化过程中,通过丢失或增加内含子导致基因歧化。
[期刊] 华北农学报
[作者]
李军星 王一成 袁秀芳 徐丽华 曹会敏 申世川 张鲁滨
CDT毒素是多种革兰氏阴性致病菌的毒力因子。为了阐明CDT毒素在副猪嗜血杆菌不同菌株中的分布及其遗传变异情况,本试验对从浙江省不同地区猪场临床发病猪中分离到的41个副猪嗜血杆菌分离株进行了CDT基因PCR扩增,并对其中21个分离株CDT 3个亚基进行了基因测序及氨基酸序列分析。结果表明:所有41个临床分离株中都可以检测到CDT 3个亚基的基因,其中cdtA蛋白的氨基酸序列在不同副猪嗜血杆菌菌株中最为保守,同源性≥97.8%;cdtB及cdtC蛋白氨基酸序列变化较大,同源性均≥92.1%。其中cdtB亚基与牛DNase I活性关键位点的氨基酸残基具有一致性,且这些位点的氨基酸残基在不同菌株中高度...
关键词：
副猪嗜血杆菌 CDT 同源性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李程鹏 孙一丁 刘辉 曾千春 王炎炎 马继琼 杨奕 许明辉
ＯｓＨＭＡ２是水稻根和地上部一个主要的Ｚｎ和Ｃｄ的转运蛋白，在水稻基因组ＯｓＨＭＡ２位点存在ＯｓＨＭＡ２类似基因ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ，编码蛋白包含水稻Ｐ１Ｂ型ＡＴＰ酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的２７份亚洲栽培稻和８份野生稻基因ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ编码区序列进行了测序分析，以了解水稻ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ序列的多样性，为发掘基因资源提供信息。ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ核苷酸序列和氨基酸序列分析表明，在４７１ＢＰ的编码序列内发现了６个变异位点；ＴＡｊｉＭＡ＇ｓｄ检验表明均不显著，说明这些位点属中性进化状态；６个变异位点中，第１５、７８、１３２、２１４、４１７位点碱基不引起氨基酸的变．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
张焱如 乌尼尔夫 芒来
为进一步探明三河马遗传分化,参考牛(M57764)、羊(AF002110)、猪(M17704)、人(J03071)和鼠(X12630)等哺乳动物GH基因序列,设计一对特异引物,用PCR方法从三河马基因组中扩增出一条长约2kb的DNA片段。PCR产物经pGEM-Teasy载体转化感受态DH5α株大肠杆菌,获得重组克隆子。DNA测序表明:三河马生长激素基因DNA序列长1923bp,含完整的5个外显子和4个内含子,与猪、狗、牛、羊的GH的cDNA序列同源性分别为94.47%,92.63%,90.06%和90.37%。其cDNA所编码氨基酸与猪、狗、牛、羊同源性分别为97.21%,96.74%,88....
关键词：
三河马 GH基因 克隆 序列分析
[期刊] 中国水产科学
[作者]
江世贵 张殿昌
根据生长激素(growthhormone,GH)基因的保守性序列设计1对引物,利用RT PCR技术从鲮(Cirrhinamolitorella)脑垂体组织中克隆出鲮生长激素成熟肽cDNA片段,将纯化的DNA片段克隆到pUCm T载体上。克隆的鲮GHcDNA开放阅读框全长567bp,编码由188氨基酸残基组成的生长激素成熟肽。序列分析结果表明,鲮GH成熟肽氨基酸序列与另2种鲮—印鲮(Cirrhinamrigal)和南亚野鲮(Labeorohita)的成熟肽氨基酸序列同源性分别为87%和83%,与鲤的成熟肽氨基酸序列同源性为96%,并对9个科的17种鱼进行了分子系统进化树分析,结果与根据传统的形态...
关键词：
鲮 生长激素 分子克隆 序列分析
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王发新 连总强 吴旭东 魏大为 肖伟 李力
利用长片段PCR及T-A克隆技术,从兰州鲇(Silurus lanzhouensis)基因组DNA中首次克隆兰州鲇GH基因全序列并提交至Genbank获得登录号KM215221,同时,使用DNAstar等生物信息学软件进行序列分析研究。兰州鲇GH基因全长2 067 bp,由5个外显子和4个内含子组成,完整编码序列(Complete coding sequence,CDS)为603 bp。5个外显子大小分别为10、140、117、132和204 bp;4个内含子大小分别为229、103、565和103 bp;内含子与外显子的连接区序列遵循基因组成规则。编码区编码1条由200个氨基酸残基组成的蛋白...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
刘长国 罗军 郑新民 杨公社 苟德明
比较生长激素(GH)基因在不同物种间的相似性,设计引物,用PCR方法从波尔山羊基因组中扩增出一条长约2.0kb的DNA片段,然后用PMD-18T载体在感受态DH5α株大肠杆菌中获得GH基因克隆子。DNA测序结果表明,波尔山羊GH基因DNA序列全长1951bp(不含引物序列),含完整的5个外显子编码区。应用ClustalW软件进行同源性分析,结果表明,波尔山羊GH基因与Tokara山羊、澳洲美利奴羊和黄牛的GH基因的相似度分别为98.5%,97.0%和95.4%;内元比外元的变异程度高,在5个外元中,第一外元的保守性最高,其他区域的变异程度随物种亲缘关系的增大而升高,在分子水平上符合物种进化原...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
马志杰 魏雅萍 钟金城 马蕊霞 陈雪梅 字向东 陈生梅
【目的】对藏绵羊生长激素(GH)基因进行了克隆和序列分析,以期为进一步开展藏绵羊GH基因与其生长发育性状的相关分析以及基因定位、表达调控等研究提供理论基础。【方法】用特定引物对藏绵羊GH基因进行PCR扩增、克隆和测序,使用DNAMAN4.0、BioEdit 7.0.0、DnaSP 4.10.1等生物信息学软件进行序列分析和比较基因组学研究。【结果】藏绵羊GH基因(GenBank登录号EF077162)由5个外显子和4个内含子组成,完整编码序列(Complete coding sequence,CDS)全长为654 bp。5个外显子大小分别为13,161,117,162和201 bp;4个内含子...
关键词：
藏绵羊 生长激素基因 克隆 序列分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨学明 张立 黄光华 何荆州 朱佳杰 蒋和生
应用RT-PCR技术从革胡子鲶(Clarias lazera)脑垂体RNA中扩增出生长激素(growth hormone,GH)基因cDNA片段,并克隆到质粒载体pMD18-T,鉴定测序。克隆的革胡子鲶GHcDNA开放阅读框全长603bp,编码由200个氨基酸残基组成的生长激素前体。5个科7种鲶形目鱼类GH基因序列同源比较结果表明,7种鲶形目鱼类间GH基因序列的同源性很高,平均为92.4%,大口鲶和鲶之间的同源性最高,为98.5%,革胡子鲶和鲶之间的同源性最低,为89.4%。并据此构建了鲶形目鱼类间的系统进化树,聚类分析结果与鲶形目鱼类传统的分类进化地位基本一致。
关键词：
革胡子鲶 生长激素 基因克隆 同源比较
[期刊] 海洋渔业
[作者]
阮燕如 周文漪 李贵生 章群
测定了连云港、舟山、防城群体34 ind军曹鱼(Rachycentron canadum)线粒体细胞色素b基因883 bp序列,共检测到5个变异位点,发现6个单倍型,平均单倍型多样性(h)和核苷酸多样性(π)分别为0.324和0.000 4,总体表现出较低的遗传多样性;其中连云港群体遗传多样性最高,单倍型多样性和核苷酸遗传多样性分别为0.473±0.162和0.000 57±0.005 93;而舟山群体没有任何变异。连云港与舟山、防城群体间的FST值分别为0.029(P=0.00)与0.042(P=0.00),舟山与防城群体间的FST为-0.048 03(P=0.00),表明连云港与其它两个群...
关键词：
军曹鱼 细胞色素b 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
梁春花 刘霞 罗玉柱 孙雪婧 高雪晋 杨阳 曾国敏 杜晓华
为研究甘肃河西的临泽、甘州、凉州、金昌、高台5个地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传多态性及其变异特征,采用PCR-SSCP方法检测了283头西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子和部分内含子的多态性,并对群体内各等位基因进行了测序。结果显示:5个地区西门塔尔杂交类群共检测出5个等位基因(A、B、C、D、E),表现为6种基因型(AA、BB、AB、AC、AD、AE)。5个地区西门塔尔杂交类群均能检测到AA、BB、AB 3种基因型,且甘州、凉州、高台西门塔尔杂交类群还分别检测到AC、AD、AE 3种基因型。A等位基因频率在5个群体中最高,为优势等位基因。对不同SSCP带型的对应片段进行测序...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
杨慧荣 赵会宏 刘丽 陈彦珍 林权卓 黄宏辉
利用PCR技术扩增得到珠江和长江水系共29个赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)线粒体DNA D-loop基因片段,并测定其序列。对599 bp的D-loop基因序列进行分析,共检测到24个单倍型,25个单突变位点,39个简约信息位点。在81个突变位点中,转换位点50个,颠换位点14个,插入或缺失位点17个;A+T的含量(68.8%)明显高于C+G的含量(31.2%)。5个水域个体间的遗传变异率在0到6.03%之间。单倍型多样性(H)为0.977 8,平均核苷酸差异数(K±SD)为17.271 0,核苷酸多样性(π)为0.029 7。对5个群体D-loop序列进行分化指数...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
季从亮 储明星 陈国宏 周国利 朱颜
采用 2种限制性内切核酸酶MnlⅠ和RsaⅠ ,对常年发情的小尾寒羊和湖羊以及季节性发情的多赛特羊和萨福克羊共 14 6只绵羊褪黑激素受体 1a(MTNR1A)基因外显子 2的 82 4bp扩增产物进行PCR RFLP分析。结果表明 :1)MTNR1A基因外显子 2的 6 0 5位碱基处表现出MnlⅠ酶切多态性。小尾寒羊、萨福克羊和湖羊只出现 2种基因型 :AB(30 3bp ,2 36bp/ 6 7bp)、BB(2 36bp/ 6 7bp ,2 36bp/ 6 7bp) ;多赛特羊出现 3种基因型 :AA(30 3bp ,30 3bp)、AB(30 3bp ,2 36bp/ 6 7bp)、B...
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