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[期刊] 西南农业学报
[作者]
胡中会 赵立华 孔宝华 陈海如 范静华 刘飞 李小鹏 蔡红 杨根华 秦西云 方敦煌
采用ISSR和RAPD 2种分子标记方法对来自不同地区的28份烟草赤星病菌进行遗传多样性分析,筛选后选用10个ISSR引物和10个RAPD引物,ISSR扩增出多态性条带112条,多态性条带百分率为86.82%,菌株间相似性系数为0.53～0.97;RAPD引物扩增出多态性条带70条,多态性条带百分率为81.39%,菌株间相似性系数为0.57～0.94;用SPSS17.0软件对2种标记遗传距离进行相关性分析,发现2种分子标记结果呈显著正相关,表明2种分子标记方法都适合于烟草赤星病菌遗传多样性研究,ISSR是一种多态性优于RAPD的标记技术。根据2种标记的结果,利用NTSYS软件按UPGMA方法进...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
聂琼 刘仁祥
利用SSR和ISSR标记分析23份烟草种质遗传多样性。结果表明:8个SSR引物和8个ISSR引物分别检测到66个和113个多态性位点。不同烟草种质之间的遗传相异系数在0.3259~0.8588(SSR)或0.1369~0.8161(ISSR)。以SSR、ISSR标记分别聚类以及两种标记混合聚类均在0.63处将23个材料分为4类:2个类群和2个独立个类Coker147、Val16或G140,一类群以红花大金元为基础聚类,另一类群以NC82为基础聚类。两种标记的结果相似,均可用来进行烟草种质资源的遗传多样性分析。
关键词：
烟草 SSR ISSR 聚类分析
[期刊] 中国农业科学
[作者]
肖炳光 杨本超
【目的】分析烟草种质的遗传多样性水平,揭示不同烟草类型间的遗传关系,为充分发掘、利用种质提供依据。【方法】对包括不同烟草类型的119份种质进行了ISSR分析,估算其遗传相似系数,利用UPGMA法作聚类图。【结果】利用21个ISSR引物共扩增出672条带,全部为多态性带,其中116条为普通烟草特有带。普通烟草种质间的遗传相似系数变化范围为0.779～0.945,其中烤烟种质间遗传相似系数变化范围在0.812～0.933之间;不同烟草类型基本可聚为相应的亚类或小类,引进烤烟品种与国内品种并未聚为各自类别。普通烟草与其它烟草种间遗传相似系数较小;普通烟草与其假定祖先种N.sylvestris聚为一类...
关键词：
烟草 ISSR 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
赵秀香 苏燕妮 伏颖 赵艳琴 孙宏伟 孙剑萍 吴元华
以烟草靶斑病菌（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ）基因组Ｄｎａ为模板，采用单因素和正交设计ｌ＿（１６）（４～５）相结合的方法对影响ｉｓｓＲ－ＰｃＲ反应的主要因子进行优化，并对采自东北三省烟区的２０个烟草靶斑病菌菌株进行ｉｓｓＲ分析，建立了适宜于病菌的ｉｓｓＲ分子标记的最佳反应体系，即２０μｌ的反应体系中含有模板Ｄｎａ ３０ｎｇ，Ｍｇ～（２＋）浓度２．０ＭＭｏｌ·ｌ～（－１），Ｄ ｎｔＰ浓度０．２０ ＭＭｏｌ·ｌ～（－１），ｔａｑ酶１．０Ｕ，引物浓度０．４μＭｏｌ·ｌ～（－１）。利用优化的反应体系从２０个ｉｓｓＲ引物中筛选出１３个多态性和重复性好的引物，对２０个烟草靶斑病菌菌株进行ｉｓｓＲ分．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
聂琼 黄锡才 蒙剑波 李希金 刘仁祥
为从分子水平上揭示烟草种质资源的遗传背景和亲缘关系,采用SRAP分子标记方法,对烟草属5个种共134份种质进行了遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:从228对SRAP引物中筛选出15对多态性、稳定性好的引物,15对引物在134个材料上共获得241条多态性条带,多态性比例为81.7%。134份材料间的遗传距离为0.0213～0.5802,遗传多样性较丰富。在遗传相似系数为0.57时,被聚为5个大类群,相同栽培类型的烟草并未明显的聚为一类。可较好地从分子水平反映这些烟草品种(系)间的遗传背景和亲缘关系。
关键词：
烟草 种质资源 SRAP 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
祁建民 周东新 吴为人 林荔辉 方平平 吴建梅
应用RAPD和ISSR标记,分别对来自非洲地区和中国的15份黄麻野生种(10个种),以及来自中国、印度、越南、日本等地的12份黄麻栽培品种基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果表明:(1)参与分析的所有RAPD和ISSR引物都对DNA模板浓度的梯度变化不敏感,对比RAPD和ISSR在PCR反应中的稳定性,ISSR优于RAPD;(2)25个RAPD和ISSR引物分别扩增出329条和283条带,多态比率分别为89.36%和92.5%,显然,ISSR检测出的多态性条带的能力优于RAPD;(3)RAPD和ISSR标记检测同组供试材料种间或种内的遗传相似性系数(GS)范围,分别为0.48～0.98和0....
关键词：
黄麻 RAPD ISSR 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宋培玲 李子钦 杨家荣
【目的】利用ISSR分子标记技术,对不同地理来源的棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,以了解其遗传关系。【方法】选用25条引物,对来自于我国11个省(市、自治区)的28个棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,研究各菌株间的遗传相似性。【结果】从25条ISSR随机引物中筛选出9条多态性好、条带稳定的引物,用其对28个棉花黄萎病菌株进行扩增,共获得1 989条谱带,其中1 908条为多态性条带,多态性比率为95.9%,表明ISSR标记对棉花黄萎病菌具有较高的多态性;通过对棉花黄萎病菌ISSR遗传相似系数的统计与分析,得到其相关系数r=0.88,该r值介于0.8和0.9之间,表明进化树符合较好,故将ISSR标...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王一伊 向秋燕 阎文昭 蒲志刚 邢小军 刘东阳 冯俊彦
本研究以国内外８３份主栽烟草品种为研究材料，利用ＴＲＡＰ分子标记技术扫描，对其遗传多样性及品种间的遗传关系进行分析。结果表明，４２对ＴＲＡＰ引物组合在８３份烟草种质中共扩增出２７１条清晰、稳定条带，其中１５５条条带具有明显多态性，平均多态性为５７．２％。每对引物可扩增产生２～１２条清晰条带，其中多态性条带数为１～７条，平均每对引物可产生多态性条带３．６９条。遗传相似性分析显示，８３个烟草种质间的遗传相似系数处于０．４１２到０．９０４之间；聚类分析结果显示，当遗传相似度（ＧＳ）为０．６８时，可将８３份烟草品种分为４大类。本研究结果表明，ＴＲＡＰ标记技术能有效地发现供试烟草材料的ＤＮＡ遗传多态性，．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
王晓东 高增贵 姚远 刘限 苏家 李婉莹
为明确辽宁省和安徽省玉米弯孢叶斑病菌的生理分化和遗传多样性及其近缘关系。利用UP-PCR、ISSR分子标记方法,对采集于辽宁省和安徽省30株玉米弯孢叶斑病菌进行了遗传多样性分析。从供试引物中筛选获得具有多态性好且稳定的UP-PCR引物4个、ISSR引物12个,分别扩增出27条谱带和76条谱带,多态性条带比率分别为77.78%和89.47%。聚类分析结果表明,UP-PCR阈值在0.662处菌株被分为7个类群,ISSR阈值在0.681处菌株被分为8个类群,玉米弯孢叶斑病菌存在丰富的遗传变异,与地理来源无明显相关性。从稳定性、可操作性和多态性水平来看,ISSR技术更适合于分析玉米弯孢叶斑病菌的遗传多...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
张铭真 李晓辉 王袁 邢雪霞 徐世晓 杨铁钊
从２００对ＳＳＲ引物中筛选出６９对条带清晰、多态性强的引物，对８０份烟草种质资源材料（来自多个国家和地区）的全基因组ＤＮＡ进行扩增，采用荧光ＡＢＩ–３５００ ｘｌ遗传分析仪进行多态性检测，结果 ６９对引物在烟草种质材料中共检测出５０３个多态性条带，平均每对引物可检测到的等位变异数为７．９１个，观测杂合度（Ｈｏ）平均值为０．２７６ ４，预期杂合度（Ｈｅ）平均值为０．５７４ ７。ＳＨＡＮＮｏＮ’Ｓ信息指数Ｉ为１．０８２ ６；ＮｅＩ’Ｓ多样性指数Ｈ为０．５７１ １、遗传分化系数ＦＳｔ为０．１４１ ６，基因流Ｎｍ为１．５１５ ３，遗传相似系数为０．５５～０．９０。说明８０份烟草种质的遗传多样性相对丰富．．．
关键词：
烟草 种质资源 简单序列重复 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
梁景霞 祁建民 方平平 王涛 陈顺辉 周东新 陶爱芬 梁康迳 吴为人
【目的】深化烟草种质资源遗传多样性研究,为种质利用改良烟草提供科学依据。【方法】应用ISSR分子标记方法,以烟草属6个种共96份有代表性的种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】(1)从90个ISSR引物中筛选出18个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得314条稳定的条带,其中多态性条带299条(占95.2%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数(GS),其GS在0.28～0.97之间,遗传多样性丰富。其中普通烟草栽培品种间的GS在0.62～0.98之间,平均为0.78,品种间的遗传基础相对狭窄,普通烟草栽培种与野生种及黄花烟的GS在0.28～...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李永祥 李斯深 李立会 杨欣明 李秀全
为了比较ISSR和SSR标记在披碱草属(ElymusL.)植物研究中的可应用性,用33个ISSR引物和137对小麦SSR引物对该属12个物种进行了分析。筛选出18个ISSR引物和14对小麦SSR引物可用于遗传多样性分析。12个物种的PCR分析表明,18个ISSR引物和14对SSR引物的多态性位点百分率分别为84%和91%,均表现出较高多态性,基于两种标记的种间聚类状况与物种的倍性水平和形态学相似程度存在较高一致性。在12个种间,ISSR的标记指数MI值(10.2)为SSR(4.3)的2.4倍,表明ISSR具有更大的标记效率;但在亲缘关系较近的肥披碱草、圆柱披碱草、麦宾草和披碱草等4个种间,SS...
关键词：
披碱草 ISSR SSR 遗传多样性
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
郑向华 邓海滨 刘琼光 陈泽鹏 陈永明 李华平
从广东省韶关和梅州2个烟草产区采集了来自8个县市的共38个烟草青枯菌菌株,对病菌的生物型、致病型和遗传多样性进行了测定,结果表明广东烟草青枯菌全部为生物型Ⅲ。通过在红花大金元,K326,岩烟97和系3等4个烟草鉴别品种上的致病性反应,将广东烟草青枯菌分为强致病力、中等致病力和弱致病力3种致病型,其中以中等致病力菌株为主,占78.9%;强致病力菌株占13.2%;弱致病力菌株占7.9%。从116个RAPD通用引物中筛选出10条引物,用于对38个烟草青枯菌株DNA的RAPD分析,扩增条带表现出明显的多态性,条带主要聚集在0.3～4.0 kb之间。聚类分析这38个菌株可分为2个组群,即组群A和组群B。...
关键词：
烟草青枯菌 生物型 致病型
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李晓晖 黎颖菁 黄荣韶 蒋明廉 王海华
采用SCoT和ISSR两种分子标记技术对7份凉粉草种质资源进行遗传多样性分析。结果显示:筛选出的8条SCoT引物共扩增出90个位点,多态性比率为83.33%,遗传相似系数变化范围为0.47～0.83;筛选的10条ISSR引物共扩增出100个位点,多态性比率为70.0%,相似系数变化范围为0.61～0.80。聚类分析结果显示,7份凉粉草种质资源被分为三大类,两种分子标记的分类结果基本一致,表明SCoT和ISSR两种分子标记均适用于凉粉草种质资源的遗传多样性研究。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐志婷 许玲玲 薛龙海
【目的】附球菌（Epicoccum）引起的叶斑病在多花黑麦草上普遍发生，本文研究西南不同地理来源附球菌菌株的遗传差异性和亲缘关系。【方法】以贵州花溪、重庆南川和合川、云南曲靖、四川崇州5个地区获得的37株代表性Epicoccum菌株为材料，利用真菌基因组DNA提取试剂盒提取供试菌株的基因组DNA；用35条ISSR引物对不同地理来源的8株菌株进行预扩增，之后选用其中扩增条带数多的引物对所有参试菌株进行扩增，将数据整理成0、1矩阵，利用NTSYSpc（Version2.10e）、PopGene（Version 1.32）和GenAIEx6.51软件分别进行聚类分析和主成分分析。【结果】35条ISSR引物中，有6条多态性丰富，条带清晰；供试6条引物共扩增出63条多态性条带，多态性比例为100%。菌株间的遗传相似系数为0.3100～0.9300。当遗传相似系数为0.4180时，37株Epicoccum被划分为5个类群。5个居群的平均遗传一致度（I_(N)）和平均遗传距离（D）分别为0.9168和0.0871，37株供试菌株的平均基因多样性指数（H）和Shannon’s信息指数（I）分别为0.3628和0.5388，均高于5个居群的平均值（0.3121和0.4606），相对应的遗传分化系数（Gst）为0.1289，基因流值（Nm）为3.3794。【结论】从聚类分析结果可知ISSR类群划分与菌种分类之间存在一定相关性，不同地理来源的菌株之间遗传相似性较高；主成分分析（PCoA）结果表明遗传多样性与菌株的地理来源不存在明显相关性。
关键词：
多花黑麦草 附球菌 ISSR 遗传多样性
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