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[期刊] 中国农业科学
[作者]
曹辉 李燕歌 周春然 宁留芳 杨洪强
【目的】根区土壤微生物是影响根系环境的重要因素，炭化苹果枝是废弃果树枝条低氧高温热解产物，研究施用炭化苹果枝对苹果根区土壤细菌和真菌的群落结构及其多样性的影响，为炭化苹果枝的合理应用以及改善果园土壤生物学性状提供理论依据。【方法】在春季，将长势一致的２年生‘富士’苹果幼树（砧木为平邑甜茶）移栽到含有不同质量比（０—４％）炭化苹果枝的盆栽土壤中，于移栽１２０ ｄ后采集土样，提取基因组ｄＮＡ，通过ＰＣＲ扩增建立文库，利用Ｍｉｓｅｑ平台ｉｌｌｕＭｉＮＡ第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学分析土壤细菌１６ｓ Ｒ ＲＮＡ基因Ｖ３＋Ｖ４区域和真菌ｉＴｓ１区域的丰富度和多样性指数以及群落结构。【结果】从．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨光柱 黄文静 郑丽萍 何英云 张宴 孔宝华 李云国 赵升文 王顺富 李坤明 赵丛艳 李帆 马钧
【目的】揭示苹果感染根腐病后,根际土壤细菌群落结构、多样性变化。【方法】分别对感染根腐病和健康苹果植株根际土壤中细菌的16S rRNA基因V3～V4区进行扩增,并利用Illumina Hiseq高通量测序技术进行测序,分析苹果根腐病病株和健株根际土壤细菌物种组成及多样性。【结果】健康、患病苹果根际土壤共获得2526个OTU,主要分为31个门、70个纲、284个科、533个属,其中患病土壤特有260个OTU,健康土样特有103个OTU。α多样性分析显示,患病土壤中细菌多样性显著高于健康土壤。健康土样中,Actinobacteria的相对丰度显著高于患病土样,Acidobacteria显著低于患病土样。苹果根际土壤中,存在Pseudomonas、Bacillus、Arthrobacter、Erwinia、Flavobacterium、Rhizobium、Serratia和Microbacterium等促生微生物,健康土样中,有益菌Arthrobacter的相对丰度显著高于患病土样。【结论】苹果感染根腐病后,根际土壤细菌的物种多样性、群落多样性显著升高。放线菌门和酸杆菌门的平衡,可能对苹果根际土壤的健康有重要作用。苹果根际土壤中,存在大量的潜在植物促生细菌,是将来筛选土著生防菌的潜在资源。
关键词：
根腐病 苹果 根际土壤 多样性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
于潇玮 王创 王可 李欣艳 董雷 崔中利 曹慧
[目的]探究黏细菌Myxococcus sp. BS对烟稻轮作土壤真菌多样性和群落组装过程的调控，为烟稻轮作模式下通过施用黏细菌进行生防提供理论指导。[方法]以未处理（CK）、施用黏细菌菌剂（BS）和施用黏细菌+有机肥（BF）3个处理的烟稻轮作土壤为研究对象，采用高通量测序技术对烟稻轮作土壤真菌的群落多样性、组成、组装过程进行分析。[结果]黏细菌添加后，Chao1指数降低，且Shannon指数升高。BS和BF群落相似度较高，CK与BS、BF群落相似度较低。添加黏细菌后，在门水平上，被孢霉门（Mortierellomycota）、壶菌门（Chytridiomycota）和球囊菌门（Glomeromycota）的相对丰度降低；在属水平上，绿核菌属（Ustilaginoidea）和枝孢霉属（Cladosporium）的相对丰度增加，链格孢属（Alternaria）、腐质霉属（Humicola）和被孢霉属（Mortierella）的相对丰度逐渐降低。通过LEfSe分析可以得到不同处理间真菌丰度有显著差异的物种，即生物标记物种（biomarker），在CK中发生显著变化的真菌差异物种有7个，BS有5个，而BF有8个。3种土壤真菌群落组装过程均以随机性过程为主导，其中扩散限制贡献最大，且随机性过程贡献量在添加黏细菌后增加。[结论]向烟稻轮作土壤加入黏细菌后，改变土壤真菌群落组成和组装过程，并且使导致烟草赤星病和水稻褐变病的植物病原菌链格孢属（Alternaria）的相对丰度明显降低；与单独施用菌剂相比，以黏细菌配施有机肥效果更佳。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
徐永杰 吴强盛 汪芳玲 徐雅雯 韩梦壮 肖之炎
【目的】探讨油茶和薄壳山核桃间作对土壤养分和真菌多样性的影响。【方法】以油茶单作模式（Cam）、油茶+薄壳山核桃间作模式（Cam&Car）和薄壳山核桃单作模式（Car）3种林地为研究对象，采用Illumina Miseq高通量测序等技术，分析0～30 cm林地土壤主要理化性质和酶活性、真菌群落组成结构和多样性以及真菌与土壤环境因子的相关性。【结果】间作模式林地土壤pH值和水解性氮、有效磷、有机质含量均居于Car单作模式和Cam单作模式之间。间作模式一定程度上提升了薄壳山核桃土壤酶活性，降低了土壤有效钾（AK）、有效硫（AS）、交换性钙（ECa）含量。3种模式土壤真菌测序共获得1 084个OTUs，共有OTUs数量为111个，特有OTUs的数量表现为Car> Cam&Car> Cam。3种模式共鉴定出8门11纲56目131科201属257种真菌，其中Saccharomycetes、Sordariomycetes、Agaricomycetes是3种模式共有优势菌纲，Wickerhamomyces是共有优势菌属。Alpha多样性分析表明，3种模式土壤真菌ACE指数存在显著差异，即Car> Cam&Car> Cam，而Shannon指数和Simpson指数没有显著差异。基于Bray-Curtis距离的土壤真菌群落组成主坐标分析结果表明，Cam&Car间作模式与Car单作模式和Cam单作模式均有交集，其中与Car单作模式交集较多。相关性分析结果表明，属水平主要真菌与土壤环境因子存在相关关系，其中与交换性钙含量、有效钾含量、有效硫含量存在显著性负相关。【结论】油茶与薄壳山核桃间作增大了林地养分消耗，但也一定程度上提升了薄壳山核桃土壤酶活性和微生物多样性。建议油茶和薄壳山核桃间作时，加大肥力管理，特别是含钙、钾和硫元素肥料的投入。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杨亚东 王志敏 曾昭海
【目的】通过对华北地区一年两熟种植模式下冬小麦生长季不同施肥和灌溉处理下土壤细菌群落的研究,揭示长期不同施肥和灌溉制度下土壤细菌数量、多样性和群落结构的变化规律。为科学施肥和灌溉,提高农田地力和维持土壤微生物多样性等提供依据。【方法】依托中国农业大学吴桥实验站,选取长期施肥和灌溉定位试验的6个处理冬小麦收获后耕层土壤为研究对象,分别为化肥+不灌溉(CI0)、化肥+拔节期灌溉(CI1)、化肥+拔节期灌溉+灌浆期灌溉(CI2)、有机肥+不灌溉(MI0)、有机肥+拔节期灌溉(MI1)和有机肥+拔节期灌溉+灌浆期
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
彭辉 周红敏 张弓乔 王宏翔
【目的】研究不同林龄红豆树土壤真菌群落结构及多样性，为红豆树人工林土壤质量动态变化和土壤微生物生态学机制的理解提供基础数据，为红豆树人工林的可持续经营提供依据。【方法】以红豆树幼龄林、中龄林和成熟林为研究对象，采用Illumina Miseq测序平台，分析了土壤真菌群落的Alpha多样性、真菌群落结构组成，群落多样性与环境因子的相关关系，并对土壤理化性质与真菌群落相关性进行分析。【结果】1）α多样性指数表明，幼龄林和中龄林、成熟林土壤真菌多样性差异显著，红豆树幼龄林土壤中真菌多样性高且分布均匀；成熟林土壤真菌的数量和丰度最大；2)3个林龄的土壤样品中共检测到真菌26个门，67个纲，101个目，127个科，145个属。子囊菌门和担子菌门丰度占真菌总量的74.2%～90.2%。中龄林和成熟林土壤真菌群落结构相似度较高。3个林龄土壤中前3位优势菌纲为：银耳纲、粪壳菌纲和散囊菌纲。RDA分析表明土壤速效钾、有效磷、全钾和pH是影响真菌群落的主要因子。【结论】土壤真菌群落结构和多样性指数在不同林龄间有一定差异，幼龄林和中龄林、成熟林的群落结构差异显著，中龄林和成熟林的真菌群落结构多样性差异较小。随着林龄的增大真菌多样性增加，本研究结果为不同林龄红豆树土壤肥力和土壤微生物群落结构研究提供理论支撑。
关键词：
真菌群落 土壤养分 红豆树 高通量测序
[期刊] 农业现代化研究
[作者]
万宇宸 李树凤 索全义 温增欣 李梦琪
土霉素作为养殖业中常用的一种促生长抗生素，极易在畜禽粪便中残留,直接还田可能对土壤微生物繁殖和作物生长带来潜在威胁。然而，现有研究多集中在高浓度梯度下，未能完全适用于实际生产情况，有必要研究土霉素在实际残留量下对细菌群落多样性的影响，为有机肥的安全施用提供理论依据。本研究设置土霉素添加量0.2 mg/kg，利用高通量测序技术分析细菌群落组成、结构变化和显著富集物种类型。结果表明，随时间推移土霉素显著改变了细菌群落结构，使厚壁菌门、放线菌门的相对丰度增加，增加幅度为1.1%～5.0%；同时，使变形菌门、绿湾菌门和拟杆菌门的相对丰度降低，降低幅度在2.0%以下。与对照组（CK）相比，添加土霉素处理（OCK）中高温放线菌科细菌显著富集。本研究证明了0.2 mg/kg土霉素能改变土壤细菌群落物种相对丰度，导致群落结构差异，并且显著富集了高温放线菌。这为探寻对抗生素污染具有指示作用的微生物提供新思路，并为有机肥的安全施用提供科学依据。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
钟壹鸣 张昂 王志勇 秦晓威 廖丽 吉训志 鱼欢
【目的】研究槟榔间作香露兜对土壤细菌群落结构和多样性的影响，明确间作模式影响土壤细菌群落的关键环境因子，为优化槟榔间作香露兜模式及热带农田经济的发展提供理论依据。【方法】通过大田试验的方法，在海南省兴隆热带植物园内建立包括槟榔单作、香露兜单作和槟榔间作香露兜种植模式的试验样地，测定土壤理化性质、养分含量、土壤细菌丰度与多样性等指标，以槟榔和香露兜单作为对照，探究槟榔间作香露兜模式对土壤细菌群落结构和多样性的影响。【结果】槟榔间作香露兜模式下土壤养分含量降低，土壤逐渐趋于酸性且盐离子浓度提高；土壤细菌群落的ACE指数、Chao1指数和Shannon指数显著降低(P<0.05,下同),pH、电导率、全磷、容重是影响土壤细菌群落变化的主要环境因子。在3种种植模式下细菌优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Acidobacteriota)、酸杆菌门(Actinobacteriota)和绿弯菌门(Chloroflexi),间作后变形菌门、放线菌门和酸杆菌门的相对丰度均出现降低，绿弯菌门相对丰度则提高。其中，放线菌门相对丰度与土壤容重呈显著正相关；绿弯菌门相对丰度与电导率和有机质呈极显著正相关(P<0.01,下同),与全磷呈极显著负相关，与全钾呈显著负相关。【结论】槟榔林下间作香露兜不影响细菌OTU总数，但通过降低pH及提高电导率而显著降低土壤细菌群落多样性指数；间作模式通过提高土壤容重降低全磷、全钾及有机质含量，而降低变形菌门、放线菌门和酸杆菌门的丰度，却提高了绿弯菌门的丰度。可见，尽管槟榔间作香露兜体系显著降低土壤养分含量，但能改善槟榔林原位土壤细菌区系的丰度及多样性，对维持槟榔林土壤健康及促进槟榔与香露兜相关产业发展具有积极意义。
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵存鹏 郭宝生 刘素恩 王兆晓 耿昭 王凯辉 耿军义
为了改善冀中南地区多年连作棉田的土壤环境,分析棉花-小麦-玉米两年三熟轮作种植制度对土壤速效养分和真菌多样性的影响。依托河北省南宫市棉花原种场试验点,采用定期采集土壤样品,测定土壤中的有效磷、速效钾、全氮含量及提取各样品中的总DNA,借助Illumina Hi Seq 2500高通量测序平台,研究不同种植模式对土壤真菌的群落结构、丰度等的影响,分析养分变化和群落变化的相关性。结果表明:轮作模式土壤速效磷、全氮残留含量比连作棉田显著增加,而土壤速效钾则差异不明显。轮作模式和连作模式土壤中的分类单元(Oper
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
胡兰 杨威 徐婧 徐秀德 张万民 张丹 张明会
用棉隆与生化黄腐酸处理茄子设施土壤,在茄子定植期、开花期、结果期和收获期4个时期分别采集茄子根际土壤进行土壤中真菌多样性测定。结果表明:从采集的土样中共分离获得真菌2010株,鉴定出25属57种真菌,其中曲霉菌(Aspergillius spp.)、镰孢菌(Fusarium spp.)和青霉菌(Penicillium spp.)为优势种群。从不同处理的土壤含菌量上看,在茄子的不同生长期中,棉隆与生化黄腐酸混合处理土壤中的真菌含量低于单用棉隆处理。不同处理的土壤中真菌种群多样性水平存在显著差异,棉隆与生化黄腐酸混合处理的土壤真菌多样性指数和丰富度为最低。
关键词：
棉隆 生化黄腐酸 保护地 土壤真菌多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
侯建伟 邢存芳 邓晓梅 陈芬
【目的】研究不同pH花椒园土壤细菌群落结构及其与土壤化学性质的关系,为提高土壤质量及促进花椒生长提供依据。【方法】在300 hm~2花椒园中,分别采集低pH区(pH≤5.5)、中pH区(5.5碱解N>有效P>速效K。相关性分析表明,花椒根区土壤pH与拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度呈显著负相关关系,与放线菌门(Actinobacteria)、蓝藻菌门(Cyanobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)相对丰度呈显著或极显著正相关关系;土壤C/N与放线菌门(Actinobacteria)、蓝藻菌门(Cyanobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度呈显著或极显著正相关关系;土壤碱解N与放线菌门(Actinobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexi)相对丰度呈显著正相关关系;土壤速效K与变形菌门(Proteobacteria)相对丰度呈显著正相关关系;土壤有效P与蓝藻菌门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度呈显著正相关关系。【结论】土壤pH、C/N、碱解N、有效P和速效K对细菌群落结构变化的影响较大,土壤pH改变了花椒根区土壤细菌的群落构成和多样性,是决定花椒根区土壤细菌群落多样性的首要因子。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
林耀奔 叶艳妹 刘书畅 杨建辉
为了研究不同农地整治措施对土壤细菌的影响,通过高通量测序技术,对不同农地整治措施下土壤细菌多样性与种群结构进行对比分析。结果表明:(1)从细菌多样性来看,实施农地整治的样点土壤细菌多样性显著提高;(2)从细菌种群结构来看,实施田块归并、平整土地、筑造沟渠以及土壤培肥等措施有效提高了甲基暖菌属(Methylocaldum)、亚硝化单胞菌(Nitrosomonas)、脱硫线菌属(Desulfonema)等有益菌属的丰度;(3)通过与土壤环境因子的相关性分析,酸碱度、铜和铅含量是影响农地整治区土壤细菌多样性与结构的重要因素。该研究证实了农地整治对提高土壤细菌多样性和改善土壤质量的重要作用,也为农地整治工作的开展提供了科学依据。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
熊川 李小林 李强 郑林用
为了解野生羊肚菌的生境,研究其菌塘土壤细菌群落的结构与多样性,运用PCR–DGGE技术,对采集于凉山州冕宁县野生羊肚菌发生地的8个羊肚菌菌塘土样和2个非菌塘土样进行分析。结果表明:羊肚菌菌塘土壤与非菌塘土壤细菌群落的结构差异和多样性差异较大;菌塘土壤的多样性指数(H)和丰度(S)比非菌塘土壤的高;菌塘土壤中Thermosporotrichaceae、Myxococcaceae和Rhodospirillaceae等3科细菌在羊肚菌菌塘土壤中占据优势地位;羊肚菌菌塘土壤细菌多样性程度总体优于非菌塘土壤。
关键词：
羊肚菌 土壤 细菌 群落结构
[期刊] 草业科学
[作者]
邓錡璋 王绍明 邱成书 刘红玲
为揭示大田中丛枝菌根(AM)真菌对植物根围细菌群落的影响，本研究以甘草(Glycyrrhiza uralensis)为对象，设置接种摩西球囊霉(Glomus mosseae)、接种根内球囊霉(Glomus intraradices)和不接种对照(CK) 3个处理进行田间试验，采用高通量测序技术分析不同接种处理之间细菌群落多样性、结构、功能和形成差异的驱动因子。研究结果表明，接种AM真菌(Gi和Gm)显著改变了土壤养分含量，接种后速效磷含量和pH显著高于CK处理(P <0.05)，但Gi中糖类物质代谢和脂质代谢的功能菌的相对丰度显著低于Gm和CK，这表明Gi可能会抑制土壤糖类物质代谢和脂质代谢，并且AM真菌接种可能是通过影响甘草根围磷的有效性从而影响土壤细菌群落的分布。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张朋朋 胡雯 管增辉 王朝 马学海 邹养军
[目的]探究陕北榆林山地苹果园种植不同草种对土壤理化性质以及细菌群落的影响,筛选适宜榆林山地气候条件的草种,为山地苹果园生草及土壤有效管理提供试验依据。[方法]以2年生优系苹果为试材,在行间种植三叶草(Trifolium repens L.)、黑麦草(Lolium perenne L.)和紫花苜蓿(Medicago sativa L.),以传统清耕为对照,研究不同生草处理对苹果园0～20和20～40 cm土层土壤理化性质(pH,有机质、全氮、速效磷、速效钾含量,含水量,体积质量)、酶活性(β-1,4-葡萄糖苷酶(βG)、碱性磷酸酶(AKP)、纤维二糖水解酶(CBH)和β-1,4-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(NAG))及细菌群落的影响。[结果]在0～20和20～40 cm土层,与清耕处理相比,生草处理降低了山地苹果园土壤pH和体积质量,其中紫花苜蓿处理土壤pH和体积质量降低幅度最大,其次是三叶草和黑麦草。在0～20和20～40 cm土层,与清耕处理相比,生草处理提高了土壤含水量以及有机质、全氮、速效磷和速效钾含量,增加土壤βG、AKP、CBH和NAG活性,其中紫花苜蓿处理的效果较佳。在0～20和20～40 cm土层,不同生草处理的OTUs数、香浓(Shannon)指数、辛普森(Simpson)指数、Chao1指数、PD指数均高于清耕处理,其中黑麦草处理各指标均较高,其次是紫花苜蓿。在0～40 cm土层,不同生草处理与清耕处理土壤细菌门和属水平优势菌群相对丰度差异较大;与清耕处理相比,黑麦草处理土壤细菌部分属水平优势菌群相对丰度明显增加,对细菌优势属的提升效果最为明显,紫花苜蓿次之,三叶草作用效果较差。[结论]综合来看,陕北榆林山地苹果园行间种植紫花苜蓿的处理效果最佳,可显著提高土壤综合肥力。
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