【目的】比较温室大棚中患白粉病的草莓(DRZ)与健康草莓(HRZ)植株根际土壤原核生物(细菌和古菌)群落的多样性与结构差异。【方法】基于土壤原核生物16S rRNA基因V3～V4变异区通用引物序列,应用高通量测序技术进行比较分析。【结果】在97%的相似水平下2个样本共获得OTU个数为2631,涵盖了2域2界39门82纲161目326科600属的原核生物;与健康样本相比,患病土壤原核生物的OTU数目及多样性指数均较低;在门分类水平上,变形菌门、放线菌门、酸杆菌门和拟杆菌门均为2个样本的优势菌群,两者群落种类大致相同,但群落相对丰度均发生显著变化(P<0.01),其中假单胞菌属、链霉菌属和"norank类群"可能是潜在的拮抗菌类群,沃尔巴克氏体属和立克次体属可能是寄生于温室草莓白粉病传播媒介中的类群。【结论】阐明了温室中患白粉病草莓与健康草莓根际原核生物的多样性变化,并解释了病害发生和传播的原因及草莓食用的安全问题,对防控白粉病的发生和快速筛选草莓白粉病拮抗菌提供理论依据。

【目的】明确健康与患根腐病草莓根际土壤、非根际土壤以及根内细菌群落组成与多样性。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序技术，分别对草莓根际土壤、非根际土壤及根内细菌16S rRNA基因的V3-V4区进行扩增并测序，分析健康与患根腐病草莓根际土壤、非根际土壤及根内细菌群落结构与多样性。【结果】健康与患根腐病草莓土壤及根内细菌多样性丰富，健康草莓组共鉴定出细菌30个门、78个纲、131个目、238个科、489个属，患根腐病草莓组共鉴定出细菌30个门、78个纲、131个目、233个科、483个属。门水平上，变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、放线菌门（Actinobacteria）和酸杆菌门（Acidobacteria）为根际和非根际土壤的优势菌门，放线菌门和拟杆菌门的相对丰度在健康与患根腐病草莓根际、非根际土壤中存在差异。根内样品中的优势菌门为变形菌门和蓝细菌门（Cyanobacteria），二者的相对丰度在健康与患根腐病草莓根内存在显著性差异。属水平上，鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）、新鞘氨醇杆菌属（Novosphingobium）、伯克霍尔德菌属（Burkholderia）、链霉菌属（Streptomyces）、芽单胞菌属（Gemmatimonas）和芽孢杆菌属（Bacillus）为根际和非根际土壤的优势菌属，且在健康与患根腐病草莓土壤中各优势菌属的相对丰度均存在显著性差异。根内样品的优势属为链形植物属（Streptophyta），其相对丰度在健康与患根腐病草莓根内存在显著性差异。样本比较分析表明，健康与患根腐病草莓根内细菌群落结构差异大于根际和非根际土壤。【结论】草莓植株发生根腐病后根际土壤和根内细菌群落丰富度和多样性均有提高，而非根际土壤细菌群落丰富度和多样性下降。健康与患根腐病草莓根际、非根际土壤及根内细菌群落组成差异性显著，其中链形植物属、链霉菌属、伯克霍尔德菌属和芽孢杆菌属等可能是防治草莓根腐病的重要菌属。

【目的】揭示卷丹百合感染根腐病后根际土壤真菌群落结构、多样性变化，为进一步探明根腐病的微生态发病机理和生防菌的筛选及应用提供理论依据。【方法】分别对连作多年地块上患根腐病和健康卷丹百合根际土壤中真菌的ITS1基因进行扩增，并采用高通量测序技术进行测序，分析健康与患病百合根际土壤真菌物种组成及多样性。【结果】α多样性结果显示，卷丹百合健康与患根腐病根际土壤中的真菌群落丰富度、均匀度和多样性无显著差异。PCA分析结果显示，患根腐病百合与健康百合根际真菌群落物种组成存在差异。患根腐病与健康百合根际真菌优势菌门为子囊菌门；散囊菌纲、银耳纲、刺盾炱目、银耳目、小疱毛壳科、丛赤壳科、外瓶霉属等在患病百合根际中相对丰度显著高于健康百合。LEfSe分析结果显示，子囊菌门与Ilyonectria分别在患病与健康百合根际土壤中差异最大；Arcopilus、角菌根菌属、Ascobolus、Paraphaeosphaeria等14类菌群为健康百合根际的标志物种。【结论】连作多年地块健康百合与患根腐病百合根际真菌群落结构有明显差异。卷丹百合根腐病的发生可能与根际土壤中真菌物种结构的改变，尤其是散囊菌纲、外瓶霉属等有害真菌的增殖密切相关。卷丹百合根际土壤中存在大量潜在益生真菌，是进一步筛选根腐病生防菌的潜在资源。

[目的]探究嫁接对番茄植株根际微生物群落组成的影响，旨在揭示嫁接提高番茄植株抗性的机制并为构建解决番茄连作障碍体系提供参考。[方法]基于高通量测序技术，以番茄品种新砧1号和宝砧1号为砧木，桃太郎品种为接穗进行以下处理：新砧1号实生植株（简称：新砧）；新砧1号×桃太郎嫁接植株；（简称：桃太郎/新砧）；宝砧1号实生植株；（简称：宝砧）；宝砧1号×桃太郎嫁接植株；（简称：桃太郎/宝砧）；桃太郎实生植株。（简称：桃太郎）。采集番茄实生与嫁接处理植株根际土壤，比较分析番茄各处理根际土壤细菌和真菌的群落组成。[结果]与新砧、宝砧、桃太郎处理植株相比，桃太郎/新砧和桃太郎/宝砧处理植株细菌和真菌群落在不同分类水平上可操作分类单元(OTU)数量均发生明显变化。与砧木和接穗实生植株相比，番茄嫁接植株根际土壤中拥有更丰富的微生物OTU和特有OTU数量。番茄实生与嫁接植株间在根际土壤细菌和真菌多样性与丰富度上无显著差异（P>0.05）。在门分类水平上，在桃太郎/新砧处理植株根际土壤中，放线菌门和厚壁菌门细菌丰度占比均高于新砧和桃太郎处理植株；在桃太郎/宝砧处理植株中，绿弯菌门、酸杆菌门、芽单胞菌门细菌丰度占比均高于宝砧和桃太郎处理植株。在属分类水平上，与新砧和桃太郎处理植株相比，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中鞘氨醇单胞菌属、芽孢杆菌属、链霉菌属、unclassified＿f＿＿Micrococcaceae、norank＿f＿＿norank＿o＿＿Gaiellales细菌属丰度占比增加；与桃太郎处理植株相比，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中增加特有优势菌属栖大理石菌属。与宝砧和桃太郎处理植株相比，桃太郎/宝砧处理植株根际土壤中，norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿Subgroup＿6、类诺卡氏菌、norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿Gitt-GS-136、norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿KD4-96、norank＿f＿＿JG30-KF-CM45属细菌丰度占比增加，同时增加特有优势菌属norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿JG30-KF-CM66菌属。在真菌门分类水平上，与番茄实生植株相比，嫁接植株根际土壤中油壶菌门真菌丰度占比提升，而子囊菌门真菌丰度占比下降。此外，桃太郎/新砧嫁接植株根际土壤中unclassified＿k＿＿Fungi菌门丰度占比增加，而桃太郎/宝砧嫁接植株根际土壤中unclassified＿k＿＿Fungi菌门丰度占比减少。在属分类水平上，与对应实生植株相比，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中，根囊壶菌属、unclassified＿k＿＿Fungi、分枝孢子霉属真菌的丰度占比增加，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中还缺失木霉属、曲霉菌属、unclassified＿o＿＿Eurotiales、unclassified＿o＿＿Sordariales等菌属，但与新砧处理植株相比，增加了镰刀菌属；在桃太郎/宝砧处理植株根际土壤中，根囊壶菌属、青霉属丰度占比增加，而分枝孢子霉属、木霉属、曲霉菌属、镰刀菌属、unclassified＿o＿＿Eurotiales、蛛网霉属等菌属缺失。[结论]与实生植株相比，嫁接不仅改变了番茄植株根际土壤微生物群落丰度占比，还改变了根际土壤微生物的群落组成。番茄嫁接植株根际土壤微生物群落组成的改良是嫁接植株抗性增强的重要原因之一。

供试的不同老鹰茶品种被病原菌侵染后,叶片中叶绿素含量、光合速率和蒸腾速率均随着感病程度的加剧而明显地下降,感病品种下降幅度大于抗性品种;而丙二醛含量随着感病程度的加剧而明显上升,感病品种增加的幅度比抗性品种大。老鹰茶叶片中叶绿素含量与其光合速率有显著的正相关关系。

【目的】研究云南香蕉枯萎病和健康植株根际土壤细菌群落结构组成差异,探索香蕉枯萎病发生的微生态机制,优化根际土壤微生物群落结构为其后续生态防控提供新策略。【方法】在云南香蕉枯萎病发生的蕉园,分别采集发病和健康植株的根际土壤,利用高通量测序技术研究细菌群落多样性、结构和组成的差异。【结果】香蕉植株根际土壤细菌多样性存在显著性差异,香蕉枯萎病植株的土壤细菌群落多样性高于健康植株。变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)等4个菌门是香蕉植株根际土壤中的优势门菌群。2种类型香蕉植株根际土壤中有厚壁菌门(Firmicutes)、棒状杆菌门(Rokubacteria)和硝化螺旋菌门(Nitrospirae)等5个门菌群差异显著。其中,厚壁菌门(Firmicutes)丰度健康植株较发病植株高,棒状杆菌门(Rokubacteria)和硝化螺旋菌门(Nitrospirae)丰度发病植株较健康植株高。属水平上,健康植株的优势属依次为芽胞杆菌属(Bacillus)、朱氏杆菌属(Chujaibacter)、芽单胞菌属(Gemmatimonadaceae)和鞘脂单胞菌属(Sphingomonas);发病植株的优势属依次为:芽胞杆菌属(Bacillus)、芽单胞菌属(Gemmatimonadaceae)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)和朱氏杆菌(Chujaibacter);芽胞杆菌属(Bacillus)、朱氏杆菌属(Chujaibacter)和土壤链霉菌属(Streptomyces)等5个菌属在2种类型香蕉植株根际土壤中差异显著,其中,芽胞杆菌属、朱氏杆菌属和土壤链霉菌属的丰度健康植株明显高于枯萎病植株。【结论】香蕉枯萎病和健康植株根际土壤细菌群落结构在一定程度上具有同源性,但部分菌群在2种类型植株根际土壤中的组成丰度有显著差异;差异菌群的功能多样性及与香蕉枯萎病病原菌的互作关系尚待明确。

【目的】研究白芍根腐病病株和健株土壤根际微生物群落结构变化，以及土壤环境因子、微生物群落与白芍根腐病之间的关系，为白芍根腐病的防治提供理论依据。【方法】采用野外调查研究方法，利用Illumina MiSeq高通量测序技术对白芍健株和病株的根际土壤微生物多样性进行测序，并运用土壤理化性质分析方法对土壤养分及酶活性进行分析。【结果】与白芍健株相比，病株根际土壤有机质含量显著增加24.7%，速效钾含量显著降低33.2%，土壤碱性磷酸酶、过氧化物酶显著增加54.4%、50.2%。病株根际土壤细菌丰富度和多样性减少，真菌丰富度和多样性增加。病株根际土壤细菌群落中变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidota）、Sumerlaeota的相对丰度显著高于健株，绿弯菌门（Chloroflexi）、放线菌门（Actinobacteriota）、Ethylomirabilota、厚壁菌门（Firmicutes）相对丰度显著下降。鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）、Chthoniobacter、Subgroup7、Saccharimonadales在病株根际土壤中的相对丰度高于健康植株。病株根际土壤真菌群落中子囊菌门（Ascomycota）相对丰度增加，担子菌门（Basidiomycota）相对丰度减少，接合菌门（Zygomycota）相对丰度则显著高于健株。土壤pH、有机质、有效磷、速效钾、水溶性盐、碱性磷酸酶、过氧化物酶、脲酶、蔗糖酶是影响白芍根际土壤微生物群落变化的重要因子，主要与细菌优势菌门Chloroflexi、Methylomirabilota、Actinobacteriota，真菌优势菌门Chytridiomycota、Basidiomycota、Ascomycota的变化密切相关。【结论】芍药根际土壤中土赤壳属（Ilyonectria）、白粉属（Erysiphe）、镰刀菌属（Fusarium）等有害真菌相对丰度显著增加、养分失衡、酶活性变化是导致白芍根腐病发病的重要原因。

【目的】了解昆明地区冬草莓主要栽培品种白粉病病原菌的种类和离体后病原菌种群的变化。【方法】2019年2-4月在昆明市草莓白粉病爆发区3个不同地点取样,基于Illumina MiSeq高通量测序,对昆明地区3个冬草莓主要栽培品种章姬、红颜、桃香的白粉病患病部位表面的真菌群落组成与结构进行了分析,并将离体白粉病样品在人工气候箱中培养,温度25℃,光强1500 lx,光照时间12 h·d~(-1),培养7 d,检测长出的真菌群落组成,进而对比两类样品真菌群落组成与结构的变化。【结果】6个样品的真菌群落组成与结构分析结果基本相同,即在属水平上进行真菌群落组成与结构分析均显示98.8%以上是叉丝单囊壳属Podosphaera。2个离体白粉病样品在灭菌培养皿内培养7 d后,HL(地点3的红颜白粉果实和叶片)样品上长出许多浅绿色的粉状霉菌,其真菌群落组与结构分析显示为Penicillium(88.80%)、Cladosporium(9.38%)、Acremonium(1.44%)、others(0.25%);而ZH(地点2的章姬果实和叶片)样品上长出许多黑色粉层的霉菌,真菌群落组成与结构为Aspergillus(86.87%)、Acremonium(4.11%)、Cladosporium(1.25%)、others(0.23%)。实验结果表明,样品培养之后真菌群落组成与结构发生了显著变化。【结论】昆明地区冬草莓栽培种的白粉病病原菌为叉丝单囊壳属Podosphaera,不同草莓品种和感染部位的白粉病病原菌相同,是首次报道中国西南地区草莓白粉病病原菌种类。草莓白粉病病原菌感病的部位离开母体植株后,感染部位表面很快生长出其他真菌菌落,原白粉病原菌不再是优势菌群,说明草莓白粉病病原菌是活体营养寄生菌。该病原菌还表现出侵染周期长、侵染不同品种的不同组织的特性。

【目的】运用蛋白质组学比较研究白粉病不同抗病性葡萄蛋白质组构成的差异,找出白粉病感病蛋白和抗病蛋白。【方法】以抗病葡萄植株"6-12-4"和感病植株"6-12-2"为材料,在人工接种白粉菌后0(接种前),2,4d取叶片样品,提取其总蛋白,通过双向电泳技术,找到不同抗病性葡萄接种白粉菌后不同时间表达有差异的蛋白质点,对其中表达差异明显的蛋白质点进行回收和纯化,并进行MALDI-TOF质谱鉴定。【结果】从供试样品中共获得26个差异表达的蛋白质点,其中10个表达有明显差异的蛋白质经质谱鉴定后有7个为阳性斑点,3个为阴性斑点。蛋白质肽质量指纹鉴定结果表明,7个阳性斑点中有2个是假定蛋白,2个是未命名蛋...

【目的】从促生微生物角度分析蓝莓根际土壤微生态结构，改良蓝莓种植土壤。【方法】利用高通量扩增子的测序方法对北高丛蓝莓根际土壤微生物多样性进行分析。利用选择性培养基、比色法等实验方法分析蓝莓根际可培养细菌的促生特性。【结果】土壤样品中有10个细菌门、3个真菌门的相对丰度大于1%，13个细菌属和11个真菌属的相对丰度大于1%；Occallatibacter OTU6、Paraburkholderia OTU3以及Chujaibacter OTU945是细菌OTU相对丰度最高的序列，Pseudogymnoascus OTU1、Fusarium OTU7、Lentinus OTU2是真菌OTU相对丰度最高的序列。蓝莓根际土壤可培养细菌的促生效能分析结果表明，12株蓝莓根际可培养细菌为能够分泌生长素的促生菌，其中L7菌株产生的生长素最多；12株菌均能在解磷培养基上生长，且具有显著解磷圈，其中菌株L42的解磷能力最强；菌株L11和L17具有一定分解硅酸盐的能力；菌株拮抗实验结果表明，L17菌株与L21、L26、L37、L40及L42菌株之间不存在生长抑制作用，菌株L21与菌株L26、L40之间存在强烈抑制作用。16SrDNA测序结果表明，12株促生菌分别属于变形菌门下的布丘氏菌属（Buttiauxella）、伯克霍尔德菌属（Paraburkholderia）以及假单胞菌属（Pseudomonas）。【结论】蓝莓根际微生物群落结构多样性与其他经济作物差异显著，筛选出的促生菌具有良好的解磷效应及生长素产生能力，为后续蓝莓根际微生物菌肥开发提供实验基础。

采用稻/稗共培抑草圈土壤盆栽法研究化感水稻PI312777和非化感水稻Lemont与稗草共培下水稻化感潜力、根际土壤酶活性及土壤微生物群落的变化.结果表明，化感水稻PI312777显著抑制12 cm处稗草的生长，PI312777根际土壤过氧化物酶和蔗糖酶活性高于Lemont,稗草根际土壤的蔗糖酶、脲酶活性降低；PI312777根际土壤微生物对氨基酸类、糖类和酚酸类碳源的利用程度显著高于Lemont,稗草根际土壤微生物对氨基酸类、多聚物类、酚酸类、羧酸类的利用率显著下降.相关性分析表明，水稻对稗草的抑制率与水稻根际土壤的过氧化物酶和蔗糖酶活性显著负相关，与水稻根际土壤微生物对羧酸类、多聚物类和酚酸类碳源的利用率相关，与稗草根际土壤微生物对氨基酸类和酚酸类碳源的利用率相关.水稻对稗草的化感作用与供体和受体植株根际的土壤酶活性和土壤微生物种群变化密切相关，对水稻化感作用的微生态起重要的调节作用.

目的病毒核酸分离是病毒基因组解析的基础,本研究旨在建立草莓病毒的dsRNA分离方法,获得草莓主要病毒的部分基因组序列。方法采用改进的dsRNA分离方法,对草莓病毒指示植物和栽培品种中的病毒dsRNA进行分离,通过琼脂糖凝胶电泳和RT-PCR来鉴定。结果不同草莓品种中病毒dsRNA的含量不同,试管苗叶片中dsRNA含量高于露地苗幼叶,而露地苗幼叶中dsRNA含量明显高于完全成熟叶。dsRNA对DNaseⅠ具有很强的耐性;当酶解缓冲液中含0.5mol·L-1NaCl时,dsRNA对RNaseA具有较强的耐性。利用DNA凝胶回收试剂盒,能够有效回收凝胶中的dsRNA片段。应用RT-PCR技术,从凝胶...

【目的】获得抗烟草黑胫病效果较好的生防菌，并研究其对根际土壤中病原菌和微生物群落的影响。【方法】采用土壤微生物诱集法分离植烟土壤中的微生物，结合平板拮抗和温室盆栽试验筛选烟草黑胫病生防菌，利用16S rDNA 序列分析法鉴定，通过MGB探针实时荧光定量PCR技术检测烟草根际土壤中疫霉菌孢子数，借助Illumina高通量测序平台分析烟草根际土壤中细菌和真菌的群落结构多样性。【结果】从20份土壤样品中共分离出土壤细菌120株，获得了抗烟草黑胫病效果较好的2株芽孢杆菌79-14 和05-1506，其抑菌率分别为76% 和72%，防效分别为64%和76%；施入芽孢杆菌79-14 和05-1506后，烟草根际土壤中疫霉菌孢子数分别为3.02×10~(4)个/g和8.13×10~(3)个/g，均比对照降低了2个数量级；芽孢杆菌79-14和05-1506提高了烟草根际土壤真菌群落物种丰度和多样性，但降低了其细菌群落物种丰度和多样性；烟草根际土壤细菌群落中，优势类群主要是变形菌门、放线菌门和厚壁菌门等，变形菌门和拟杆菌门相对丰度高于对照，放线菌门相对丰度低于对照；烟草根际土壤真菌群落中，优势类群主要是子囊菌门、壶菌门和被孢霉菌门等，子囊菌门、罗兹菌门和担子菌门相对丰度高于对照，壶菌门和被孢霉菌门相对丰度低于对照。【结论】筛选到抗烟草黑胫病效果较好的芽孢杆菌79-14 和05-1506，它们降低了烟草根际土壤中疫霉菌孢子数量，改变了烟草根际土壤细菌和真菌的优势种群比例，提高了烟草根际土壤真菌群落的多样性和丰富度，但降低了其细菌群落物种丰度和多样性，对烟草黑胫病的防控具有重要的应用价值。

本文试验采用液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)法对5批次草莓样品进行10种农药残留检测,并对其进行微生物整体水平调查和典型微生物分离。结果表明,其中多菌灵、嘧霉胺和腐霉利在4批次样品中有均检出。分离鉴定得到5种细菌和4种真菌,其中的少动鞘氨醇单胞菌为草莓常见细菌,白粉菌、灰葡萄球孢菌为草莓常见致病真菌。对分离真菌和细菌进行对抗试验,发现某些细菌和部分真菌在草莓中共生。本研究显示在一定的农药施用条件下草莓表面微生物菌群状况,此结果将为草莓农药施用,食用危害分析和关键控制提供理论基础。

【目的】为改善云南烟区植烟土壤微生态环境及从土壤生防菌筛选等角度防治烟草黑胫病提供基础数据及理论依据。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术分析了健康与患病烟株根际土壤真菌群落结构。【结果】健康烟株根际土壤（ZCTY）和患病烟株根际土壤（HJTY）真菌OTU数分别为1809个和1479个，同时ZCTY的OTU数、特有OTU数分别是HJTY的1.22、1.62倍，且HJTY中的真菌物种量、丰富度和多样性显著降低，ACE、Chao1和Shannon指数较ZCTY分别降低了31.87%、30.47%和0.68%；同时，优势种属中的Soilcoccozyma、镰刀菌属(Fusarium)、Spiromastix和青霉属(Penicillium)在两组间存在显著差异，较ZCTY相比，HJTY中的Soilcoccozyma、镰刀菌属和青霉属相对丰度分别增加了177.06%、54.32%和144.27%，而毛壳菌属(Chaetomium)等有益菌属显著减少，且Spiromastix是HJTY的特有菌属；烟株根际土壤真菌群落与土壤理化因子（pH、有机质、碱解氮、有效磷、速效钾）变化存在一定的相关性，其中油壶菌属与有机质、碱解氮均呈显著负相关，镰刀菌属与碱解氮呈显著正相关，Soilcoccozyma与pH呈显著负相关，与速效钾呈显著正相关，Plectosphaerella与碱解氮、有效磷呈显著负相关，而青霉菌属与碱解氮、有效磷呈显著正相关，外瓶柄霉属(Exophiala)与有机质呈显著正相关。【结论】烟株根际土壤真菌多样性、丰富度的降低及群落结构的改变是烟株患黑胫病后的重要指征之一，其中镰刀菌属、被孢霉属(Mortierella)、青霉属等相关病原菌及腐生菌显著增加，毛壳菌属等有益菌属显著减少，且根际土壤真菌群落受到土壤微生态环境中生物因子和非生物因子的共同影响。