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[期刊] 海洋水产研究
[作者]
汪文俊 王飞久 陈松林 孙修涛 王翔宇 邢士超 王俊
对来自东海-黄海海区10个站位以及青岛沿岸4个站位共14个站位的浒苔样品依据形态学特征,归类分离获得70个样品,对其ITS+5.8S rDNA区进行PCR扩增、测序和分析,并与NCBI数据库中相应序列进行了比对。结果表明,70个样品具有完全相同的ITS和5.8S rDNA序列,说明青岛沿岸漂浮的大量浒苔与东海-黄海海区的浒苔为同一个来源。聚类分析显示,浒苔ITS区的变异程度与地理间隔距离呈正相关,我国海域浒苔与日本海域浒苔聚类一起,与英国海域浒苔相聚较远,与美国海域浒苔距离最远。
关键词：
浒苔 地理株 ITS区 系统关系
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
张晓雯 唐启升
浒苔(Ulvaprolifera)不仅是绿潮暴发的主要生物种类，也是海洋中重要的碳汇生物。浒苔生长速度快、繁殖方式多样、抗逆能力强，能够在短时间内形成大规模生物量，本文在此基础上评述了中国近海浒苔生物在生长和漂移过程中的固碳特点：浒苔具有独特的高pH诱导HCO_3~–利用机制，可提高HCO_3~–的吸收效率，并促进漂浮浒苔对空气中CO_2的吸收，同时，C_4固碳途径增强了漂浮浒苔在高光辐射时的碳固定效率，这种多样化的碳吸收和碳固定模式，使漂浮浒苔光合固碳能力增强，漂浮状态下可以快速积累生物量。以上特点使得浒苔的固碳效率显著高于主要养殖藻类，如海带、裙带菜和紫菜等。2007年以来，黄海海域连续15年暴发世界上最大规模浒苔绿潮，最大分布面积年均在3万km~2以上，最大覆盖面积年均超过500 km~2，浒苔生物量年均在150万t以上，据此估算，2008―2020年净碳汇量为2.5～27.5万t，年均超过7.8万t，高于主要养殖藻类，如江蓠、紫菜和裙带菜的年均固碳量，仅次于海带的年均固碳量。浒苔巨大的生物量和强大的碳固定能力使其成为一个潜在的、不可忽视的海洋碳汇和碳储途径，建议浒苔绿潮暴发时，进一步加强浒苔打捞力度和资源化利用程度，实现碳利用和去富营养化的双赢，推动浒苔碳汇产业早日加入碳市场，使其成为一个新的低碳经济增长点。
关键词：
浒苔 固碳特点 碳汇评估 碳汇扩增途径
[期刊] 水产学报
[作者]
范美华 孙雪 王日昕 廖智 徐年军
实验以大型绿藻浒苔为材料,克隆了其抗氧化系统关键酶锰超氧化物歧化酶(manganese superoxide dismutase,Mn SOD)和过氧化氢酶(catalase,CAT)基因的部分片段,利用荧光定量PCR技术研究了Mn SOD和CAT对温度和水杨酸作用的响应规律。结果获得浒苔318 bp的Mn SOD基因,该Mn SOD推测的氨基酸序列与裂片石莼Mn SOD相似性最高为89%;获得了229 bp的CAT基因,该浒苔CAT编码氨基酸序列与裂片石莼和雨生红球藻CAT序列相似性分别为99%和93%。在利用M n SOD和CAT氨基酸序列构建的系统树中,浒苔均先与裂片石莼聚类,再与其他绿...
[期刊] 水产学报
[作者]
应成琦 张婷 李信书 田千桃 霍元子 马家海 徐韧 王金辉 何培民
2008年6-7月在青岛近海海域再次发生大量浒苔漂浮现象,并且江苏连云港、如东近海海域也发生了浒苔漂浮现象。实验分别对青岛、连云港、如东海域采集样本进行了nrDNA的ITS全长序列和18S rDNA序列分析及相似性比对。结果表明,青岛、连云港、如东海域主要漂浮种类QD-01(青岛)、QD-02(青岛)、QD-03(青岛)、LY-01(连云港)、RD-02(如东)5个样品的ITS全长序列相似性为100%,表明青岛、连云港、如东三地沿海浒苔漂浮主要种类为同一种浒苔。18S rDNA序列分析结果也支持这个判断。根据相似性比对和BLAST分析结果,如东海域浒苔漂浮种类还发现少量另外2种绿藻(RD-01...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
蔡春尔 姚彬 沈伟荣 何培民
应用生物化学技术对采自象山港海区的条浒苔进行了蛋白质、粗脂肪、粗纤维、灰分、矿物质元素、氨基酸、脂肪酸、叶绿素等含量测定和分析,结果表明:条浒苔的蛋白质、粗脂肪、粗纤维、灰分含量分别为22.10%、1.18%、5.65%、31.99%;矿物质中钠、钙、钾、锌、镁含量分别为0.804%、0.656%、0.546%、0.053%和0.162%,氮和磷含量分别为4.498%和0.286%;含17种氨基酸,其中必需氨基酸含量6.11%,占氨基酸总量的38.33%,含13种脂肪酸,其中有11种为不饱和脂肪酸,占脂肪酸总量的52.43%,高度不饱和脂肪酸EPA(C20∶5)占脂肪酸总量的3.76%;叶绿素...
关键词：
条浒苔 营养成分 测定与分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘志文 韩旭 周索童 王丽 李宪臻 陈温福
对杂草稻的nrDNA ITS片段的PCR扩增条件进行了优化并测定,建立的PCR最优体系为:20μL反应体系含1μL模板DNA,0.125 mmol/L dNTPs,0.5μmol/L正反向引物,1 UTaq酶,2.0μL 10×TaqPCR Buffer;退火温度为57℃。这样的条件下充分保证了ITS PCR产物的质量和纯度要求,直接测序结果为600 bp左右,与网上结果十分类似,表明结果准确可靠。这些ITS片段的系统学信息将为杂草稻的起源进化提供有力的分子水平证据。
[期刊] 海洋渔业
[作者]
赵晓惠 施锦婷 张建恒 康新宇 丁晓玮 何培民 文钦琳 杨晓倩
由于浒苔染色体制备难度较大,至今还没有准确染色体数目及核型分析报道。以引发我国黄海绿潮优势种浒苔(Ulva prolifera)为研究对象,采用酶解-荧光法制备浒苔染色体,并比较分析染色体制备过程中秋水仙素预处理时间、酶解时间和滴片高度等3个关键因素对染色体制片效果的影响,以建立浒苔染色体制备方法。结果表明:用质量浓度为0.2%的秋水仙素处理12 h,染色体浓缩程度适宜,分散均匀,形态清晰;用质量浓度为2%的纤维素酶、果胶酶、离析酶,混合酶解20 h效果最好,能去除细胞壁、细胞膜和多糖物质;30 cm高度下滴片,能使细胞分散均匀,可以获得质量较高的浒苔染色体。核型分析显示,浒苔雌、雄配子体染色体数目为9条,孢子体染色体数目为18条。研究结果可为未来浒苔遗传特征分析以及浒苔功能基因定位研究奠定基础。
关键词：
浒苔 配子体 孢子体 染色体 核型分析
[期刊] 水产学报
[作者]
应成琦 尹顺吉 林森杰 沈轶 何培民
对缘管浒苔光合作用第一关键酶Rubisco大亚基基因(rbcL)全长cDNA序列进行了克隆分离。首先应用RT-PCR方法获得了rbcL大片段cDNA序列,序列长度为1101bp,并进行了测序分析。然后分别应用5′RACE方法和3′RACE方法获得2个克隆序列,其序列长度分别为371bp和579bp,并进行了测序分析。在此基础上,将3个片段序列进行拼接,获得了Rubisco大亚基全长cDNA序列(1472bp),其中包括1425bp的编码区序列及47bp的前导序列(NCBI登录号:DQ813496),并推断出蛋白质序列(474个氨基酸)。对序列进行了相关生物信息分析和同源性比对,结果显示与已克隆...
[期刊] 水产学报
[作者]
王晔 龚芳芳 陈淑敏 张玉琦 李勇勇 娄永江
以浙江沿海浒苔为原料，采用连续浸提和电感耦合等离子发射光谱（ICP-OES）相结合的方法，在分析了不同海域浒苔中铝含量的基础上，重点探究了浒苔中铝的分布及存在形态，并对浸提条件进行了优化。其优化浸提参数为：将浒苔粉碎至20～30目，采用0.8 mol/L的HCl溶液60 ℃下浸提60 min，0.8 mol/L NaOH溶液70 ℃下浸提60 min。结果表明，浒苔总铝含量高达1585.25～1776.48 mg/kg，主要以有机铝和活性铝存在。有机铝主要为可溶多糖结合态铝（Al_(osu)）、小分子蛋白铝（Al_(pros)）、海藻胶结合态铝（Al_(swg)）、大分子蛋白态铝（Al_(pro)）、纤维态铝（Al_(ofi)），分别占总铝的1.77%～2.70%、12.65%～17.11%、39.76%～42.08%、20.31%～22.23%、11.99%～14.51%；活性铝主要为羟基态铝（Al(OH)~(2+)、Al~(3+)等）、AlF和可溶性有机铝（Al_(osm)），占总铝的8.57%～11.38%。实验结果可为浒苔的食用安全性评价和铝限量的标准制定提供科学依据。
[期刊] 水产学报
[作者]
周新倩 杨锐 吴小凯 黄艳花
为研究浙江近海浒苔Ｕｌｖａ ｓｐｐ．（ＥｎｔＥｒｏｍｏｒｐｈａ ｓｐｐ．）外生细菌多样性，采用传统的形态学和１６ｓ ｒＤｎａ测序分析的方法，从舟山朱家尖、宁海国华电厂和奉化南沙３个地区分离到可培养的浒苔外生细菌及其周围海水细菌６５株。根据细菌菌落特征和革兰氏染色结果等将分离到的细菌分为２６种表型。１６ｓ ｒＤｎａ序列测序比对发现：菌株与不动杆菌属（ａｃｉｎＥｔｏｂａｃｔＥｒ）、交替单胞菌属（ａｌｔＥｒｏｍｏｎａｓ）、弧菌属（ｖｉｂｒｉｏ）、假交替单胞菌属（ｐｓＥＵＤｏａｌｔＥｒｏｍｏｎａｓ）、微小杆菌属（ＥｘｉｇＵｏｂａｃｔＥｒｉＵｍ）、芽孢杆菌属（ｂａｃｉｌｌＵｓ）、赤细菌属（Ｅｒｙｔｈｒｏ．．．
关键词：
浒苔 16S rDNA 外生细菌 多样性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
曾强 关钦泽 王思琪 李齐发 杜星
[目的]本文旨在扩增猪CYP11A1基因编码区，鉴定并分析其核心启动子区，探究猪CYP11A1基因的转录调控机制。[方法]通过基因克隆测序技术获得猪CYP11A1基因编码区全序列，并对其序列特征进行分析；利用荧光素酶活性试验鉴定猪CYP11A1基因核心启动子区，并通过生物信息学分析猪CYP11A1基因核心启动子区上潜在的甲基化位点与转录因子结合位点；同时，利用Western blot、qRT-PCR以及染色质免疫沉淀（ChIP）等分子生物学手段解析转录因子NR2C1对猪CYP11A1基因的转录调控功能。[结果]猪CYP11A1基因的编码区序列全长为1 563 bp，在哺乳动物的进化过程中高度保守；猪CYP11A1基因的核心启动子区为-398 bp～-108 bp（转录起始位点为+1），序列特征分析发现猪CYP11A1基因核心启动子区上包含多个潜在的转录因子的结合元件，包括NR2C1、SOX10、NFIX和ELF5等；另外，转录因子NR2C1可促进猪CYP11A1基因核心启动子区活性，同时显著上调体外培养的猪卵巢颗粒细胞中CYP11A1基因的表达。[结论]哺乳动物CYP11A1基因在进化过程中高度保守，NR2C1作为转录因子能够促进猪卵巢颗粒细胞中CYP11A1基因的转录。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
胡茂林 吴志强 常剑波
利用RAPD(随机扩增多态)标记分析湖内鲤、鲫群体遗传多样性,从40个随机引物中各筛选出8个引物适合鲤、鲫群体RAPD扩增。在鲤群体中,共检测出60条带,其中多态性带42条,多态位点比率为70.00%;而在鲫群体中,共检测出61条带,其中多态性带40条,多态位点比率为65.57%。用POPGENE软件分析实验数据,结果显示:湖内鲤群体的遗传多样性水平(He=0.230 1,H0=0.391 0)和鲫群体的遗传多样性水平(He=0.218 6,H0=0.375 8)都较高,都有较大的遗传变异。而在鲤、鲫群体内,雌性群体与雄性群体相比较,其各自的遗传多样性很接近。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
徐建堂 祁建民 林培清 张高阳 陶爱芬 方平平
为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)非编码区的序列特征,采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为模板,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻cpDNA非编码区序列进行PCR扩增,优化cpDNA非编码序列PCR的扩增条件,应用4种限制性内切酶(EcoRⅠ、HindⅢ、TaqⅠ、AulⅠ)酶切扩增片段.结果表明:所筛选的通用引物适用于红麻cpDNA非编码序列扩增,扩增产物经1.5%琼脂糖电泳检测,片段大小为400-2000 bp,共扩增cpDNA片段大小约13000 bp.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,只有cp4引物对cpD...
[期刊] 水产学报
[作者]
汪桂玲 朱琴 李家乐
SRY基因是人类及哺乳动物睾丸决定因子的最佳候选基因,HMG盒是SRY基因编码蛋白质的唯一功能区,在性别决定中极其重要且高度保守,许多进化程度上明显不同的物种中都能检测出SRY基因的HMG盒,即Sox基因。斑节对虾是一种重要经济虾类,其性别决定机制研究薄弱,至今未找到性染色体。本研究根据人的SRY基因的HMG盒保守区的核苷酸序列,设计了1对兼并引物,通过PCR扩增出斑节对虾的Sox基因,并对扩增产物进行SSCP分析。结果表明,斑节对虾雌雄个体均存在Sox基因,从雌雄个体中均扩增出约350bp和220bp两条基因片段,推测其中350bp片段含内含子,SSCP结果显示斑节对虾内存在Sox基因家族的...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
汪登强 危起伟 罗晓松 方耀林
使用长PCR技术扩增鲟形目(Acipenseriformes)15个种的核糖体DNA(rDNA)18S rRNA基因与28S rRNA基因之间约2.5 kb的片段,并用7个限制性内切酶对该片段进行限制性位点分析。结果显示,使用LATaqDNA聚合酶及GCBuffer结合长PCR技术能够很好地扩增鲟形目鱼类的rDNA。根据酶切图谱可确定93个限制性位点,其中21个为保守位点,72个多态信息位点。HhaⅠ酶切的带型在所有个体中完全一致,提示这些位点对保持rDNA的功能有重要作用。一些酶的酶切产物长度之和大于扩增产物的长度,暗示鲟形目鱼类个体内存在多个rDNA等位基因。对种间遗传距离进行计算,并构建...
关键词：
鲟形目 rDNA PCR 限制性位点
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