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[期刊] 林业科学
[作者]
莫文娟 傅建敏 乔杰 雷莉莉 李芳东 袁德义 邱乾栋
利用ISSR分子标记对泡桐属21份种、变种及变型材料进行亲缘关系分析。结果表明:从100个ISSR引物中筛选出9个扩增产物电泳后带型清晰可辨的引物,共扩增出85条DNA片段,其中多态性带74条,多态位点百分率为87.05%,反映出泡桐属不同种质间遗传差异明显,其丰富的多态性与供试材料广泛的种质代表性有关;UPGMA法将研究材料分成毛泡桐组、白花泡桐组和川泡桐组3大组,地理分布较近的种质聚类在一起,表现出较密切的亲缘关系;在对兰考泡桐、山明泡桐、白花兰考泡桐、楸叶泡桐、圆冠泡桐、亮叶毛泡桐、毛泡桐、白花泡桐、川泡桐的亲缘关系分析及分类处理上,基本上与形态学、细胞学、同工酶的研究结果一致。最后对泡...
关键词:
泡桐属 ISSR 亲缘关系 聚类分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
季鹏章 汪云刚 张俊 唐一春 黄兴奇 王平盛
对张宏达系统山茶属茶组植物19种和变种,应用ISSR标记对其进行亲缘关系的分析。从100个ISSR引物中,筛选得到11个多态性较好的引物,ISSR反应共得到166条可重复条带,多态性条带有155条,多态位点百分率(PPB)是93.4%,分析揭示茶组植物的Nei’氏遗传距离(He)是0.2951,Shanon多样性指数是0.4520;基于Jaccard相似性系数的UPGMA树型图表明,茶组植物明显地分为2个主要的类群("三室类群"和"五室类群"),ISSR表型特征的主成分分析(PCA)也支持了聚类分析结果。指出与普洱茶C.assam ica进行种间杂交育种,应优先选择茶组植物中C.irrawad...
关键词:
ISSR 亲缘关系 茶组植物
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
赵阳 冯延芝 杨超伟 王保平 乔杰 殷世雨 周海江 李芳东
【目的】基于全基因组重测序技术(WGRS)开发的SNP标记,对泡桐属的种间亲缘关系和群体遗传结构进行解析,为揭示泡桐属植物的系统发育关系及进行分类提供理论依据。【方法】对泡桐属11个桐种的典型株进行全基因组重测序,评估数据质量;以白花泡桐基因组为参考,获得高质量SNP位点,并进一步通过VCF2Dis、MEGA11和fast STRUCTURE等软件对其进行主成分分析(PCA)、系统发育分析和群体遗传结构分析;采用cluster Profiler包对基因进行富集分析。【结果】通过WGRS技术对泡桐属11个桐种的典型株进行测序,11份材料比对至白花泡桐参考基因组的平均比对率为81.87%,通过有效过滤筛选后获得7 492 966个SNP位点。基于这些SNP位点估算材料间的遗传距离,种间的遗传距离为0.15~0.59,毛泡桐与白花泡桐的遗传距离最大为0.59,宜昌泡桐与山明泡桐,鄂川泡桐与山明泡桐的遗传距离最小,均为0.15。PCA、系统发育树和遗传结构分析结果均将泡桐属划分为3个类群,类群Ⅰ为毛泡桐;类群Ⅱ包括川泡桐和台湾泡桐;类群Ⅲ包括白花泡桐、楸叶泡桐、山明泡桐、鄂川泡桐、宜昌泡桐、华东泡桐、建始泡桐和兰考泡桐。高突变率基因被富集到细胞壁代谢、花粉代谢、次生代谢物代谢和形态建成相关的生物学过程。【结论】利用WGRS技术挖掘覆盖全基因组的SNP标记可以有效地对泡桐属植物的亲缘关系及遗传结构进行解析,为泡桐属种质资源的系统分类和高效利用奠定基础。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
代波 杜金友 杨俊明 黄印冉 张均营
采用ISSR分子标记技术对8份(品种、类型)榆属植物材料进行遗传多样性分析,从78个引物中筛选出12个具有扩增多态性的引物用于ISSR-PCR扩增,共扩增出74条带,其中多态性条带63条,占总扩增条带的85%。用NTSYSpc2.10e软件对ISSR扩增结果进行分析,结果表明,供试材料具有较丰富的遗传多样性。利用扩增条带存在赋值1,否则赋值0的数据分析方法建立金叶榆ISSR识别卡;利用UPGMA法进行聚类分析,将8份(品种、类型)植物材料按亲缘关系远近分为4类。
关键词:
榆树 遗传多样性 ISSR 生物技术
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李莉 彭建营 白瑞霞
【目的】从分子水平研究中国枣属植物的系统发育,探讨枣属属下种间及种下分类单元间的亲缘关系,为自然的中国枣属植物分类系统的建立提供新的分子证据,同时为中国枣种质资源的保护和利用提供科学依据。【方法】利用SRAP标记方法对原产中国的枣属全部14个种、11个枣品种和1个外类群的基因组DNA进行分析。【结果】筛选出的19对SRAP引物组合对26份供试材料共扩增出580条DNA带,其中570条为多态带(占98.28%),平均每个引物扩增多态性带30条。26份材料间的遗传相似系数变化范围为0.22~0.99。UPGMA聚类表明,26份材料在相似系数0.38处被划分为6个类群。【结论】SRAP标记技术能很好...
关键词:
枣属植物 亲缘关系 SRAP 聚类分析
[期刊] 林业科学研究
[作者]
程蓓蓓 于雪丹 郑勇奇
通过ITS-rpl16序列和mat K序列的分子分析,对中国现有金合欢属的各亚属间的亲缘关系进行了研究,结果表明:我国现有广义金合欢属的14个种大致被聚为相思亚属、皮刺亚属和金合欢亚属3大类,原产中国的3种皮刺亚属的种聚成1支,表明印度金合欢和羽叶金合欢关系更近,二者再与儿茶形成姐妹类群。基于选自美洲、非洲、澳大利亚和中国乡土种(印度金合欢、羽叶金合欢和儿茶)共40个金合欢属种和1个外类群的mat K序列建立的系统发育树表明:皮刺亚属和相思亚属的亲缘性关系比与金合欢亚属的亲缘关系更近,相思亚属和金合欢亚属均是单系类群,而皮刺亚属属于并系类群;中国的几个乡土种都与非洲一些种的亲缘关系较近,聚为1...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
唐艳梅 易自力 邓果特 杜凤 项伟 郑铖 刘清波 刘福来 肖亮
以芒、五节芒、荻和南荻4种芒属植物共36份种质为材料,分别采用流式细胞仪和压片法对倍性及核型进行分析。结果表明:4种芒属植物中,南荻的荧光值最大,其次为芒,荻的荧光值最小,但不同种间无显著性差异;南荻的荧光值变异系数最大(37.73%),五节芒的荧光值变异系数最小(4.41%),说明南荻的倍性最丰富,而五节芒的倍性最稳定;芒属植物染色体基数为19(x=19),36份种质中有33份材料属二倍体(2n=2x=38)型、2份材料属三倍体(2n=3x=57)型、1份材料属四倍体(2n=4x=64)型,表明自然界中芒属植物主要以二倍体存在,偶见三倍体和四倍体;不同种之间的核型参数有差异,但都是由中部和近中部着丝粒染色体组成,且芒和五节芒的核型都为"2B"型,而荻和南荻大部分为"2C"型,说明芒和五节芒亲缘关系近,而荻和南荻亲缘关系近。对核型参数进行聚类分析,可将36份芒属植物材料分为3类:第Ⅰ类为芒类群,主要为芒和五节芒;第Ⅱ类为荻类群,主要包括荻和南荻;第Ⅲ类则为多倍体类群。
关键词:
芒属 染色体 核型分析 亲缘关系
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李晓玲 程岁寒 杨进
本文采用10对SRAP引物,对10份续断属植物样本进行遗传亲缘关系分析。结果表明,10对引物共扩出566条谱带,平均每对引物扩增出56.6条带,片段大小为150~2000 bP,其中多态性条带为362条,平均每对引物扩增的多态性条带为36.2条,平均多态性条带百分率为64%,结果表明续断属植物具有丰富的遗传变异。UPGMA聚类分析表明10份续断属植物分为2个大类和4个亚类,大头续断和深紫续断有一定的亲缘关系,与其它续断属植物间遗传差异较大;日本续断、恩施续断、大理续断和川续断遗传亲缘关系较近,其中大理续断和川续断聚为一个小类群,支持大理续断并入川续断。
关键词:
续断属植物 SRAP 遗传亲缘关系
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
高洪晓 杨凯 刘建斌
为探讨丁香属植物种间、欧丁香品种间以及丁香属与女贞属之间的亲缘关系,本研究使用8对选择性扩增引物对丁香属14个种、欧丁香种的37个品种和女贞属3个种进行了AFLP分析。利用Ntsyspc软件对扩增结果进行分析,以遗传相似性系数为基础,计算Nei遗传距离并采用UPGMA法进行聚类。结果表明:AFLP扩增共产生447条带,其中多态性条带395条,多态率为88.4%,各样品间的遗传距离在0.01~1.44之间。聚类结果与传统的分类结果基本一致,不同之处在于:部分欧丁香品种与顶生花序系的种聚类为一个分支;短花冠管组的种聚类于长花冠管组的内部;长花冠管组的种内部巧玲花系与顶生花序系的种聚类有交叉现象;女...
关键词:
丁香种 欧丁香品种 AFLP 多样性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
吴国盛 陈发棣 陈素梅 赵宏波 房伟民
对18份菊属植物、2份亚菊属植物及2个两属间杂种的24个形态性状和1个生物学性状进行统计,并对获得的信息数据运用数量分类学聚类方法进行聚类分析。结果表明:Dendranthema arcticum与其他菊属植物的形态相差较大,单独成一类,其他21份材料聚为一类;野菊与菊花脑、异色菊与甘菊、龙脑菊与那贺川野菊两两间形态相似;毛华菊与日本野生菊属植物有较近亲缘关系,日本野生菊属植物较我国野生菊属植物进化;亚菊属矶菊与纪伊潮菊间形态相似,且与菊属植物形态相近,表明两属间有很近亲缘关系。本研究的形态性状聚类结果与传统分类结果基本吻合,表明所涉及的性状指标可以作为菊属系统发生关系研究的有效辅助指标。
关键词:
菊属 亚菊属 形态学 聚类分析 亲缘关系
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
龚本海 郭燕舞 姚崇怀
采用不连续双垂直板(20cm×20cm)聚丙烯酰胺凝胶电泳法,对泡桐属5种植物的SOD同工酶和可溶性蛋白质进行分析,发现楸叶泡桐杂合性较高;白花泡桐较原始;推测山明泡桐是兰考泡桐和毛泡桐的杂交种,从而为泡桐属植物的分类提供了生化上的参考佐证。
关键词:
泡桐属,SOD同工酶,可溶性蛋白质,分类
[期刊] 林业科学
[作者]
马浩 张冬梅 李荣幸 邓华平 陈新房
分别用最佳线性无偏预测和最佳线性预测方法预测了泡桐属植物的育种值。结果表明 ,根据亲缘相关距阵对育种值的最佳线性无偏预测结果没有显著影响 :数据量较大时 ,可用小区平均值取代单株值 ,同时也可用最佳线性预测代替最佳线性无偏预测方法预测育种值 ;预测育种值与真正育种值之间的相关系数与预测育种值之间的方法或误差方差存在极显著的相关关系 ,可用前者作预测育种值的精度指标。通过比较毛泡桐种源所预测育种值之间的方差和误差方差可以得出 :在对研究材料评选时 ,最佳线性预测比最小平方估算法具有优越性 ,但当重复数大于 5次 ,每个小区内的植株多于 6时 ,这两种预测方法的精度非常接近
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
吴菲菲 张志宏 代红艳 张叶 常琳琳
以8个山楂种的39份种质资源为试材,采用10对叶绿体DNA(chloroplast DNA,cp DNA)通用引物对总DNA进行扩增,并用7种限制性内切酶对PCR扩增产物酶切。结果表明:5对引物(cp01、cp03、cp04、cp05、cp10)在山楂属植物上扩增出特异谱带,2种限制性内切酶(Hinf I和TaqI)的酶切产物在供试材料间存在差异。山楂属种间存在较为丰富的cp DNA PCR-RFLP多态性,但山楂(C.pinnatifida)不同基因型间未检测到变异位点。麻核组(Sect.Sanguineae)的甘肃山楂、光叶山楂、毛山楂、辽宁山楂和羽裂组(Sect.Pinnatifidae...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
潘远智 庞博 孙振元 陈强
利用RAPD标记对采自四川西南的龙池、康定、木格措和理塘等地的13种报春花属植物亲缘关系进行了分析。结果表明:28个引物从85份材料中共扩增出250条DNA带,大小约为130~1 800 bp,每个引物可扩增4~15条,平均扩增9条,其中多态性带为209条(83.6%);材料间平均遗传距离为0.660 2;采用UPGMA法可将供试材料聚为4类,除中甸海水仙、雅砻粉报春、卵叶报春和高穗花报春各自聚在一起外,其余种均不能完全区分开。研究结果更支持将偏花报春归为灯台报春组,而粉报春组和脆蒴报春组均与其它报春组间差异较明显。聚类可以区分龙池居群与康定、木格措和理塘居群,但不能区分后三者,可见不同生态地...
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