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[期刊] 林业科学研究
[作者]
秦倩 王楠楠 李金花 苏光灿
［目的］利用表型性状和分子标记，对我国油橄榄品种进行鉴定和遗传多样性研究，有利于种质资源保存和利用，对了解油橄榄品种的组成结构及未来的引种和育种工作都具有重要意义。［方法］以甘肃省陇南市１７个油橄榄品种为研究材料，利用表型上１５个数量性状、１８个质量性状和８个ＳＳＲ荧光标记分别进行多样性和聚类分析。［结果］各性状在品种间存在显著差异，数量性状和质量性状的表型多样性指数分别介于１．５７９ ２．０８９和０．３６２１．０９１，８个ＳＳＲ位点共检测到５１个等位基因变异，平均每个位点等位基因数为６．３７５个，利用表型性状和ＳＳＲ标记可以将１７个品种完全区分开。［结论］１７个油橄榄品种具有较丰富的表型和遗．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
徐悦 黄兰 李金花 邓煜 张建国 曾艳飞
[目的]该研究对我国油橄榄主产区甘肃省陇南市现有品种进行了的准确鉴定和遗传多样性计算，为我国油橄榄种质资源引种和驯化、育种及利用提供参考。[方法]利用13个SSR标记对来自83个油橄榄品种的110棵单株进行品种鉴定和遗传多样性分析，并对其中属于68个品种的90棵单株进行叶片、果实和果核形态性状的测定和分析，最后开展了基于表型性状和SSR标记的单株聚类和结果比较。[结果]陇南油橄榄表型数量性状和质量性状多样性指数分别为1.83和0.79;SSR分析发现83个品种包括78个不同的基因型，观测杂合度和期望杂合度分别为0.683和0.754；这些基因型可分为3大组，基因型所属分组与其起源地有一定相关性；我国选育品种的基因型大多与起源意大利的品种分组更近；与基于表型的聚类树相比，基于SSR基因型的聚类树更倾向于将同一品种的不同单株聚在同一支。[结论]陇南共有78种不同基因型的品种，SSR标记比表型鉴定品种更具准确性，且能反映亲缘关系。该地区油橄榄表型多样性和遗传多样性较高，引种品种主要是来自地中海西部和中部国家，国内选育品种与意大利起源的品种相似；为更多样化可考虑引种或选育更多起源国的品种。
[期刊] 林业科学
[作者]
李金花 俞宁
为研究我国53个油橄榄品种(13个引种驯化选育品种和40个引种品种)的遗传变异,利用SSR荧光标记技术对从甘肃的陇南、四川的西昌、广元和云南的永仁5个地点收集的107份材料进行遗传多样性分析。20对引物共检测出294个等位变异,每对引物的等位基因数在9～26之间,平均为14.7个;多态性信息量PIC值平均为0.73(0.33～0.89)。基于Jaccard系数的NJ法聚类分析结果表明,参试材料分为2大组,选育品种与引种品种未被分开,但大多数具有相同品种名称的材料被分在同一组中,无论是选育品种还是引种品种均具有高水平遗传多样性。对来自5个国家的油橄榄品种群体进行分子方差分析(AMOVA)结果表明...
[期刊] 林业科学
[作者]
占明明 杨毅 程子彰 苏光灿 胡伟 陈华萍 黄乾明
【目的】油橄榄作为重要的油料经济作物,其健康价值越来越受到人们的重视,相关产业在我国已初具规模。引种品种混乱和遗传关系不明确影响了我国油橄榄事业的进一步发展,因此我国油橄榄品种的遗传变异有待评估。【方法】采用SRAP技术对32个来自四川西昌市的油橄榄品种进行遗传多样性分析,其中5个油橄榄品种为国内育种品种,27个油橄榄品种为国外引种品种。利用改良的CTAB法提取得到32个油橄榄品种的基因组DNA。【结果】25对SRAP引物共扩增出293条多态性条带,平均每对引物扩增出11.72条多态性条带,平均多态性比率为90.75%;引物组合M5E5扩增出的多态性条带最多(37条);期望杂合度(He)为0....
关键词：
油橄榄 SRAP 遗传多样性
[期刊] 林业科学研究
[作者]
王楠楠 李金花 王长海 苏光灿 付永平
[目的]利用SSR标记对油橄榄品种自由授粉的子代进行父本分析,研究品种间的亲和性,确定品种适宜的授粉树,为油橄榄建园品种配置提供依据。[方法]以四川凉山州油橄榄园‘豆果’、‘鄂植8号’和‘九峰4号’3个品种的自由授粉子代为材料,利用12个SSR标记进行父本分析。[结果]每个SSR位点的等位基因数为512个,平均9.08个,其中,DCA11和GAPU103A等位基因数(12个)最多。试验群体中的平均观测杂合度为0.732,平均期望杂合度为0.709,平均多态性信息量为0.675。12个SSR标记在95%的置
关键词：
油橄榄 SSR标记 父本分析 亲和性
[期刊] 林业科学
[作者]
邱源 韩华柏 李俊强 侯春霞 王永清
采用RAPD技术对23个引种的油橄榄品种进行分类和鉴定研究。从80个10bp的随机引物中筛选出11个扩增效果较好的引物进行扩增,共产生127条带,其中78条为多态性带,占61.4%,平均每个引物扩增的DNA多态性带数为7.09条。4个品种具有特异的位点,可作为种质鉴定的依据。根据扩增结果构建反映品种间亲缘关系的UPGMA聚类图,23个品种可划分为2大类。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
邵文豪 王兆山 张建国
[目的]对我国甘肃武都油橄榄品种园主要栽培品种子代进行父本分析,鉴定真实父本,探讨品种亲和性,为品种园授粉品种的选择提供科学依据。[方法]以武都油橄榄品种园114份种质为候选父本,基于14对SSR荧光标记,利用Cervus 3.0软件检测亲本分析相关参数,对‘城固32’、‘豆果’、‘贺吉布兰克’和‘皮瓜尔’4个主要栽培品种子代进行真实父本鉴定。[结果]14个SSR位点多态性高,累积排除概率随位点数增加而增大。对于单亲已知类非父排除概率(NE-2P),14个位点的累积排除概率高达0.999。通过比较子代、母本和候选父本的基因型,计算出每个候选父本的似然对数比,即LOD值,对油橄榄4个品种部分子代真实父本进行鉴定,其中‘城固32’和‘皮瓜尔’子代的主要父本为‘豆果’,‘豆果’和‘贺吉布兰克’子代的主要父本为‘小苹果’。[结论]所选高多态性和高累积排除概率的SSR位点适用于对油橄榄品种子代进行父本分析,为4个品种部分子代鉴定出真实父本,其中仅‘城固32’具有一定的自交亲和性,这为品种建园时授粉品种的选择和配置提供重要依据。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王利锋 李会勇 唐保军 程泽强 王振华 铁双贵
【目的】分析河南省玉米地方品种的遗传多样性,为进一步改良利用提供合理方案。【方法】利用表型和SSR标记基因型,对88份有代表性的地方品种进行遗传多样性分析。【结果】这些地方品种农艺性状表现出较大差异,表型聚类将其划分为7个类群,大部分品种聚在一个类群内,但仍有部分品种独立成群。SSR分析表明,每对引物可以稳定检测到2～10个等位基因,40对SSR引物共检测到198个等位基因,平均每个位点4.95个等位基因,遗传相似系数为0.63～0.89。SSR标记聚类分析同样将此材料划分为7个类群,大部分品种仍主要集中在一个主群内。Mental测验结果表明,表型同基因型距离矩阵间存在极显著正相关(r=0.7...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李鸿雁 李志勇 米福贵 师文贵 蔡丽艳 王成海 邢建军
【目的】揭示中国扁蓿豆种质资源的遗传多样性,为扁蓿豆种质资源的收集、保护及更好地利用提供参考。【方法】利用15个表型性状(株高、叶长、叶宽、荚果长、荚果宽、种子长、种子宽、千粒质量、花序花朵数、单枝花序数、花序种子数、叶型、花色、叶色和生长习性)和16对SSR标记,检测来自中国7个省(市)的44个扁蓿豆种质资源的遗传多样性。【结果】表型性状分析结果表明,15个扁蓿豆表型性状表现出较大差异;花序种子数、种子长、种子宽和单枝花序数等性状是居群间和居群内差异较大的性状,是造成表型差异的主要因素;表型聚类将44个扁蓿豆划分为8个类群,大部分材料聚在第Ⅱ类群内,但仍有部分材料独立成群。SSR标记分析结果...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
薛丽 刘晓霞 王晨合 张建国 饶国栋
【目的】Ⅲ类过氧化物酶（PRX）是一类植物特有的氧化还原酶，在植物生长发育和胁迫响应方面具有十分重要的作用。本研究拟探讨油橄榄Ⅲ类PRX基因家族的进化和表达模式，旨在为油橄榄分子育种提供参考。【方法】利用生物信息学方法鉴定并分析了油橄榄Ⅲ类PRX基因家族的系统发育关系、分组、染色体分布、复制基因、基序分布、基因结构图、顺式作用元件分布和在不同组织和不同非生物胁迫下的表达，并对部分成员基因进行了实时荧光定量PCR验证。【结果】（1）鉴定得到了106个OePRX基因，根据其与拟南芥和毛果杨PRX蛋白序列的系统进化关系分为了14个组。（2）OePRX基因不均匀地分布于23条染色体上；片段复制是该基因家族扩张的主要动力，且复制基因在进化过程中受到了较强的纯化选择；与拟南芥相比，油橄榄PRX基因与毛果杨PRX基因的亲缘关系更近。（3）同一组中OePRX蛋白的等电点、分子量、基序分布、基因结构、信号肽分布、在不同组织中的表达模式均比较保守；OePRX基因启动子中含有较多的生长发育元件和激素应答元件；在油橄榄干热胁迫和水涝胁迫下，38%的OePRX基因显著差异表达。【结论】油橄榄OePRX基因家族明显的进化扩张和多变的表达模式暗示了其功能的复杂性，尤其是复制基因的新功能化对油橄榄在地中海地区的广泛分布具有十分重要的适应性意义。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘晨 高明伟 刘超 何俊娜 吴健 僧珊珊 钟雄辉 吴晨雨 张凤勤 义鸣放
为进一步研究唐菖蒲杂交育种亲本选配和杂种的早期鉴定，以２１个唐菖蒲品种为试材，对这些品种的表型性状特征进行聚类分析，并利用ＳＲＡＰ技术对其构建指纹图谱。结果表明：２１个品种的表型性状表现出一定的遗传多样性，变异６．７８％～１４７．２９％。经过对ＳＲＡＰ－ＰＣＲ反应条件的优化，从１００对引物中筛选出１６对引物适用于唐菖蒲ＰＣＲ反应；通过对２１个品种ＳＲＡＰ标记的试验与分析，共在４６８个位点上扩增出条带，多态性位点４１１个，平均每个引物组合扩增多态性条带２５．７个；基于ＳＲＡＰ标记的ＵＰＧＭＡ聚类分析显示，２１个品种间ＪＡＣＣＡＲｄＰ’Ｓ相似系数０．４６～０．７５。将２种聚类结果进行比较发现，唐菖．．．
关键词：
唐菖蒲 表型性状 SRAP标记
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
罗莎 李冰洁 付雅琪 孔晨 杨佳维 高星 赵婷婷 王浩任 张延龙 史倩倩
【目的】采用色斑表型性状分析和保守DNA序列多态性(conserved DNA-derived polymorphism,CDDP分子标记技术相结合的方法,揭示牡丹花瓣基部色斑的遗传起源。【方法】利用19个色斑表型性状和CDDP分子标记对191份牡丹材料的花瓣色斑进行遗传多样性分析,利用Origin软件进行表型性状变异分析和系统聚类,采用Pop Gene 2.4软件计算分子标记多样性指数和多态性位点率等,利用NTSYS软件非加权组平均法(UPGMA)绘制聚类树状图,并进行一致检测和Mantel检测。【结果】牡丹色斑表型变异分析结果表明:牡丹花瓣色斑性状发生了强变异,尤其是色斑颜色变异系数较大。表型性状聚类结果显示,紫斑牡丹与其他种或品种牡丹交集较多,且与西北牡丹品种关系最为密切。利用17条CDDP引物扩增191份牡丹材料的花瓣DNA,共扩增出401条条带,多态性位点率达到96.91%。在色斑群体水平上,有效等位基因数为1.375 9,Nei’s基因多样性指数为0.212 2,Shannon-Wiener信息指数为0.332 4,说明牡丹花瓣色斑在分子水平上具有丰富的遗传多样性。聚类结果显示,紫斑牡丹和卵叶牡丹、四川牡丹聚在一起,三者亲缘关系较近,紫斑牡丹对现有牡丹栽培品种的色斑性状产生了较大影响,可能是牡丹品种色斑的主要来源。将表型性状聚类和CDDP分子标记聚类的遗传矩阵进行Mantel检验,得出相关性系数为0.55,表明两种聚类结果有相似之处,均能很好地体现牡丹花瓣色斑的遗传来源。【结论】紫斑牡丹是牡丹品种色斑的主要来源,卵叶牡丹和四川牡丹也对牡丹品种色斑的形成有影响。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
张耀元 任彦鑫 禾璐 张雁明 张彬 王兴春 李红英 韩渊怀
利用表型性状和ＳＳＲ标记对山西省４１份青狗尾草资源进行遗传多样性分析。在表型水平，通过分析每份资源的株型、穗型、叶型等１４个表型性状指标的测定结果，发现山西青狗尾草资源具有较为丰富的表型多样性，其中叶片绿色的深浅即叶绿素含量遗传多样性指数最高，为２．７６，其余性状遗传多样性指数也大多保持在２．０左右；大多数青狗尾草的穗型为纺锤形，籽粒颜色和形状分别是青色和纺锤形。通过表型聚类可将山西青狗尾草资源划分为３个类群：第１类主要表现为株高、穗数等整体指标居中；第２类主要表现为植株小，穗数少，单株干重低等；第３类主要表现为植株高大，穗数多，穗重等。聚类分析发现表型多样性与山西特定生态地理区划有一定相关性．．．
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
冷春晖 娄永峰 谢三秀 朱柯帆 宋晓琛 肖复明
【目的】从表型和分子2个角度评估江西信丰县国家杉木良种基地杉木2代种子园的遗传多样性，明确种子园的遗传背景，为后期种子园的改良（去劣疏伐）、重建（亲本选择与配置）等提供依据，同时为开展杂交育种提供遗传信息。【方法】以江西信丰杉木2代种子园内51个建园无性系为研究对象，通过分析8个种实表型性状掌握种子园不同无性系间种实性状的差异，同时利用SSR标记从DNA水平进行遗传多样性评估。【结果】供试51个无性系在种实表型性状和DNA水平上均存在明显的变异和较丰富的遗传多样性。8个表型性状变异系数为10.53%～37.04%，其中球果和种子的平均变异系数分别为18.99%和14.01%，种子的变异系数较小，表明种子的稳定性要比球果的高；种实性状的Shannon-Weaver多样性信息指数平均为2.060，表明种实性状的多样性较丰富。在DNA水平，14个SSR标记在51个无性系中共扩增出68个等位位点，平均Shannon’s信息指数、平均Nei’s遗传多样性指数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.925、0.506、0.486和0.511，表明信丰杉木2代种子园遗传多样性较丰富。基于种实表型性状和SSR标记均可将51个无性系分为两大类群，但两者的具体聚类结果存在较大差异，Mantel检验显示种实性状与SSR标记之间不存在相关性（r=0.064,P=0.870> 0.05）。【结论】信丰杉木2代种子园遗传多样性较丰富，具有再选择空间和改良潜力。
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