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[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
汤正辉 祝亚军 谭晓风 谭运德
应用ISSR分子标记对分布于河南省不同地区的连翘Forsythia suspensa 6个自然种群进行遗传多样性分析,结果表明,连翘具有较高的遗传多样性。12条引物共得到89个重复性好的位点,根据ISSR扩增结果,利用POPGENE 32软件进行分析,在物种水平上,多态位点百分率为94.38%;总遗传多样性指数H(Nei’s基因多样性指数)和I(Shannon信息多样性指数)分别为0.326 5和0.490 1。种群间遗传分化系数为0.274 3,遗传变异主要来自于种群内部。用NTSYS-pc 2.10e软件,根据遗传一致度构建样本间亲缘关系的UPGMA聚类分析,结果表明,33个样本可划分为2...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
关萍 马丹炜 王贵侠 石建明 陈放
该文利用ISSR分子标记技术,对分布于贵州的药用植物天麻的9个种群的遗传多样性水平和遗传结构进行分析,为传统的中药材天麻的遗传、育种及种质资源的保护和合理利用提供依据.该研究用12条ISSR引物共扩增出120条大小在200~1 600 bp清晰的谱带,其中97条具有多态性,总的多态位点百分率为80.83%,表明在物种水平上有较高的遗传变异;种群水平的多态性相对较低,多态百分率在17.5%~40.83%,平均25.56%.用POPGENE软件计算各种群间和种群内的遗传参数,结果表明:物种水平上的Nei’s遗传多样性(He)为0.042~0.153,平均0.073;Shannon信息指数为0.33...
关键词：
天麻 ISSR 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 林业科学
[作者]
张玉梅 徐刚标 申响保 吴雪琴 覃建庸 陈娟
利用ISSR分子标记分析来自11个天然珙桐种群的遗传多样性。从100条引物中筛选出5条引物能扩增出稳定、清晰且具多态性的条带,共扩增出77个条带。其中74个为多态,多态条带百分率(PPB)为96.10%;各种群PPB值为37.66%～63.64%,平均为54.07%。种内Shannon多样性指数(HSP)为0.4849,种群内Shannon多样性指数(HPOP)为0.1886～0.3274,平均为0.2774。这表明珙桐在物种和种群水平上均维持较高的遗传多样性。分子方差分析显示,种群间与种群内遗传变异分别占总遗传变异的46.22%,53.78%,种群间呈高度遗传分化。种群间遗传距离与对应的地理...
关键词：
珙桐 遗传多样性 ISSR 保护策略
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李丽霞 刘济明 黄小龙 骆畅 熊雪 柳嘉佳 邓明明 李佳
【目的】评价米槁天然种群的遗传多样性，为其遗传资源的保护和利用提供理论依据。【方法】采用ISSR分子标记，对采自贵州的8个米槁（Cinnamomum migao H.W.Li）天然种群及其62株个体的遗传多样性和遗传结构进行分析，基于遗传相似系数和遗传距离对8个种群进行UPGMA聚类分析，并对62株米槁建立PCoA散点聚类图。【结果】米槁8个天然种群通过19条引物扩增出167个多态性条带，多态性条带比例为89.78%。米槁种群间平均观测等位基因数为1.572 6，有效等位基因数为1.390 9，Nei’s
关键词：
米槁 天然种群 ISSR标记 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
陈昌生 谢潮添 纪德华 徐燕 郭留超
采用简单序列重复区间(ISSR)分子标记技术对福建省的3个野生坛紫菜(Porphyrahaitanensis)种群共60个个体进行了遗传多样性分析。15条引物共扩增出222个位点,其中186个位点具有多态性,多态位点百分率为83.78%,在种群水平上,多态位点百分率为80.18%~81.53%,平均为80.93%。期望杂合度、Shannon信息指数在物种水平上分别为0.3304和0.4834;在种群水平上分别为0.3089和0.4551,表明坛紫菜种群内存在着较高的遗传多样性水平,且在三个种群间没有明显差异。依据Gst值,坛紫菜的遗传变异主要发生在种群内的个体间(占93.5%),只有6.5%的...
关键词：
坛紫菜 ISSR 遗传多样性 遗传分化
[期刊] 林业科学研究
[作者]
张一 储德裕 金国庆 周志春 秦国峰
利用12个ISSR标记分析马尾松1代育种群体中78个不同产地来源的优良亲本遗传变异,发现基于ISSR标记扩增的多态位点百分率、Nei’s基因多样性指数和Shannon信息多样性指数均较高,表明马尾松1代育种亲本的整体遗传多样性水平较高。78个亲本之间遗传距离变化范围为0.115~0.776,平均遗传距离为0.371。亲本之间的ISSR遗传距离与亲本产地的纬向地理距离关系密切,纬度相差较大的亲本间ISSR遗传距离相对较大。利用部分参试亲本进行测交系交配并分析其中的优良杂交组合,发现大部分优良组合父本、母本产地的纬向地理距离较远,同时亲本间ISSR遗传距离也较大。根据本研究结果,应优先选择来自纬度...
关键词：
马尾松 ISSR 遗传多样性 杂交育种
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张俊卫 晏晓兰 包满珠
利用ISSR标记对梅花60个宫粉品种群品种进行了遗传多样性和亲缘关系分析,11个引物共扩增出106条DNA片段,其中多态性DNA带为93条,占总扩增片段的87.7%。引物扩增DNA片段数在6～13条之间,平均每个引物扩增DNA带数为9.6,扩增DNA片段大小在220～2500bp之间;品种间Nei's遗传距离介于0.081～0.543之间,显示宫粉品种群品种间的遗传差异较大;根据ISSR扩增结果,利用UPGMA法构建树状聚类图,聚类分析将60个品种分为2类,聚类群与品种来源有明显的相关性。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘慧芬 王静 黄建美 陈秋凤 陈蕃锦 马晓 朱国超 宋东萦 聂国兴 李学军
为了解人工养殖和选育活动对鳙(Hypophthalmichthys nobilis)遗传多样性的影响,利用线粒体COI基因对河南省鳙养殖群体的遗传多样性进行研究。165个样品共检测出14个单倍型,平均单倍型多样性为0.862 37,平均核苷酸多样性为0.002 23。AMOVA分析显示,大多数遗传变异存在于鳙群体内(97.65%),群体间的遗传变异为4.60%。系统发育树结果表明,养殖鳙群体交叉在一起,没有形成明显的地理格局分布。选择压力分析推测鳙养殖群体主要受到纯化选择作用,说明当前的人工选择对鳙线粒体基因的影响有限。河南省鳙养殖群体的遗传多样性差异较大,可能与其地理距离、异地引种有关。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
孙雪梅 赵才美 李友勇 程在全 尚卫琼 杨盛美 杨兴荣 矣兵 刘本英
【目的】探讨云南地方品种与野生茶树遗传多样性。【方法】应用ISSR标记对云南51份地方品种与16份野生茶树进行了遗传多样性分析。【结果】结果表明利用23个ISSR引物共扩增出223条带,其中多态性条带218条,多态位点百分比为97.76%。应用Nei-Li相似系数估算67份茶树资源间的遗传相似系数变化在0.659~0.736,平均为0.693,说明茶树资源间的遗传基础较窄。UPGMA法将67份茶树资源分成2个类群,主成分与聚类的分析结果一致,但主成分分析更直观地揭示资源之间的遗传多样性与亲缘关系。【结论】研究结果表明茶树地方品种与野生茶树之间的亲缘关系与地理分布没有明显的关系,可能与品种类型有关,有助于今后拓宽地方品种的遗传基础,为开发野生茶树的遗传潜力提供理论依据。
关键词：
云南﹔茶树﹔ISSR﹔遗传多样性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
汤正辉 祝亚军 谭运德 谭晓风
根据野外调查的样地资料,本文分析了分布于河南省伏牛山、熊耳山、太行山等林区的连翘群落的种类组成、群落外貌、结构特征及物种多样性等基本生物学特征。结果表明:群落共有维管植物52科105属127种,其中优势科为木犀科、蔷薇科、蝶形花科、壳斗科、菊科及毛茛科等;该群落是以连翘为主的单优种群落,生活型以高位芽植物占优,草本植物中地面芽占优势,群落季节相分明;垂直分化明显,一般分为乔木层、灌木层、草本层3层;草本层和灌木层植物种类较乔木层丰富,对连翘群落物种多样性具有较大影响,物种多样性的大小顺序依次为草本层>灌木层>乔木层。
关键词：
连翘群落 种类组成 群落特征 物种多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
汪曦 曾会玲 孟晓林 王先锋 宋东蓥 张建新 顾钱洪 汤永涛 周传江 聂国兴
小黄黝鱼[Micropercops swinhonis (Günther, 1873)]是中国特有的一种小型淡水虾虎鱼类,广泛分布于长江及以北各水系,其中在河南省各水系均有分布。为评估河南省小黄黝鱼种质资源现状及其遗传多样性,本研究对河南省境内黄河、长江、淮河和海河4个水系77尾小黄黝鱼样品进行线粒体COI基因的扩增。结果显示,河南省小黄黝鱼的平均单倍型多样性(H_d)为0.89088,平均核苷酸多样性(π)为0.00361,其中淮河水系华行村种群(HXC)核苷酸多样性最高(π=0.00433),黄河水系马颊河种群(MJH)核苷酸多样性最低(π=0.00078);系统发育树和单倍型网络图结果均显示小黄黝鱼并未按照水系形成明显的地理遗传支系;根据4个水系进行分组, AMOVA分析显示仅16.00%的变异来自于水系间,而78.43%遗传变异来自各群体内部;同样地,未预先设定分组情况的SAMOVA分析也得到了相似的结果,不支持小黄黝鱼具有明显的地理遗传结构的假设;种群历史动态分析显示,河南省小黄黝鱼种群呈逐步增长趋势; Fu’s FS中性检验与错配分析表明,河南小黄黝鱼种群可能经历过近期群体扩张事件,且该过程可能与气候变为暖湿型有关。
[期刊] 林业科学
[作者]
梁玉琴 张嘉嘉 梁晋军 李芳东 韩卫娟 傅建敏
【目的】对河南省柿种质资源的遗传多样性进行分析,揭示河南省柿种质资源的遗传多样性程度,分析不同资源之间的亲缘关系,并进行种质资源鉴定,判断同名异物和同物异名品种。【方法】以柿近缘种君迁子、油柿、浙江柿、美洲柿、金枣柿及柿变种野柿共计9份材料作为对照,从已发表的柿属植物SSR引物中,筛选出多态性较高的,对来自河南省不同地区的柿主栽品种(18份)、农家品种(55份)及野生资源(20份),共计93份资源进行遗传多样性分析。【结果】利用17对SSR引物对102份材料进行PCR扩增,共得到159个不同的DNA片段(即条带),平均每对引物9.35个,范围为5~14个,扩增条带最多的引物有2对,分别来自位点...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
冯梦霞 汤永涛 刘如垚 闫雪朦 胡博 聂国兴 周传江
日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是一种经济价值较高的淡水虾类,广泛分布于我国各淡水水体,其在河南境内各水系均有分布。随着水产养殖业的发展、水域生态环境的变化及人为因素的影响,日本沼虾的种质资源也逐渐受到影响。为评估河南境内水系日本沼虾的种质资源现状及其遗传多样性,本研究利用线粒体COI基因对河南境内18个地理群体135尾日本沼虾开展种群遗传学研究,样品覆盖河南境内的长江、黄河、淮河和海河4个水系。结果显示,河南境内日本沼虾18个地理群体共包含27个单倍型,群体平均单倍型多样性(Hd)为0.78574,平均核苷酸多样性(π)为0.01059,其中淮河水系日本沼虾群体平均遗传多样性最低,长江水系日本沼虾群体平均遗传多样性最高,且各水系群体均显示出高Hd低π的特点。AMOVA分析显示,日本沼虾遗传变异主要来源于日本沼虾群体内(66.03%),群体间遗传变异为40.22%。系统发育树和单倍型网络均未显示出明显的水系分化。中性检验、错配分布及贝叶斯天际线分析表明,日本沼虾群体近期没有发生种群扩张,群体相对稳定。本研究可为河南境内日本沼虾种质资源的保护和合理开发利用提供参考。
[期刊] 华北农学报
[作者]
毛培春 孟林 田小霞
应用ISSR分子标记技术,对收集自我国北方4省区的20份马蔺种质材料进行遗传多样性分析,结果显示,利用筛选出的多态性强、重复性好的14条ISSR引物,共扩增出303条带,其中241条带呈多态性,多态性位点百分率为77.29%。遗传相似系数(GS)为0.340 2～0.824 7,分布幅度较广,遗传多样性丰富。利用非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类,当GS为0.587 6时,可将20份马蔺种质材料划分为3个类群。主成分分析(PCA)的结果与UPGMA聚类分析结果一致,表明20份马蔺种质材料的遗传距离与其野生分布的地理距离存在较密切相关关系。
关键词：
马蔺 ISSR 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘永财 孟林 张国芳 毛培春 张德罡
利用ISSR标记对15份新麦草(Psathyrostachys juncea)种质资源进行遗传多样性检测。为获得稳定的新麦草ISSR反应体系,对反应条件中的dNTP、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度等因子进行了优化,建立起的最佳反应体系为:25μL的反应体系中含有dNTP 2.5μL、Taq酶0.2μL、Primers 1μL、Mg2+1.5μL、2.5μL 10×Buffer、2μL模板DNA和ddH2O 15.3μL。ISSR标记结果显示,筛选出的重复性好、谱带清晰的ISSR引物8条,共获得84个扩增位点,其中多态性位点72个,多态性比率(PPB)为85.7%。通过遗传相似系数(GS)...
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