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[期刊] 中国农业科学
[作者]
丁新伦 谢荔岩 吴祖建
【目的】对水稻草状矮化病毒(Rice grassy stunt virus,RGSV)侵染寄主水稻后其叶片的差异表达蛋白进行筛选、鉴定和生物信息学分析,为进一步研究RGSV和寄主水稻互作的分子机制提供线索。【方法】采用双向荧光差异凝胶电泳(Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE)和Image Master 2D platinum 7.0分析软件寻找差异表达蛋白,MALDI-TOF-MS(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-fl...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
朱俊子 周倩 崔亚 高必达
2010年,由南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)引起的新水稻矮缩病在湖南省大面积爆发。为确定南方水稻黑条矮缩病毒的自然寄主范围,采集湖南省永州零陵、邵阳隆回、郴州宜章等地发病田块及附近的禾本科作物及杂草,提取RNA后,用自行设计的专利引物对,对其进行RT-PCR检测,发现高粱、野燕麦、牛筋草是新的SRBSDV自然寄主。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
张蔚明 刘燕娟 周倩 廖晓兰
南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)p10蛋白由其基因组片段S10编码,根据SRBSD海南分离物S10序列(EU523360)设计特异性引物扩增编码p10蛋白的片段,并亚克隆至原核表达载体pET-28a+,以大肠杆菌BL21plysS为宿主菌进行高水平表达,利用纯化的p10蛋白免疫兔子,制备了p10蛋白的特异性抗血清。ELISA检测显示,p10蛋白的抗血清可与来自湖南不同地区的白背飞虱病汁液发生强烈的血清学反应,表明该抗血清适用于田间SRBSDV的快速诊断。
关键词：
南方水稻黑条矮缩病毒 原核表达 抗血清
[期刊] 西南农业学报
[作者]
周国华 刘涛 张雪梅 张群宇 李晓芬
水稻ＺＨ－ｃｔ为ＺＨ１１在组织培养过程中发现一株突变单株，具有较好的苗期耐冷性，通过人工气候箱低温处理，应用蛋白质双向凝胶电泳（２－ＤＥ）检测其低温处理后的差异蛋白表达，并对进行分析。结果显示，共发现差异蛋白４６８个，对其中重复性好，表达量较高的１４个蛋白进行质谱分析，除２个没有检测到蛋白信号外，其余１２个分别为光合作用、能量代谢、渗透压调节、过氧化物酶等功能蛋白，为下一步进行耐冷的分子基础及反向遗传学分析提供了基础。
关键词：
冷处理 水稻 苗期 差异蛋白 表达
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张新建 高世强 吴茂森 何晨阳
【目的】揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)在侵染水稻叶组织早期的基因表达谱差异。【方法】采用GDPs-Finder计算法,设计了能够覆盖KACC10331基因组全部ORFs的定向引物(GDPs),对Xoo与水稻互作1、3和7d的总RNA进行反转录,对病菌cDNA探针进行Cy3/Cy5选择性标记,与含有371个Xoo致病相关基因的芯片进行杂交。【结果】在水稻侵染的不同时期,Xoo致病相关基因表达谱存在差异。与在NBY中生长相比,Xoo在侵染1、3和7d时分别有42个(18个上调和23个下调)、51个(29个上调和22个下调)和33个(16个上调...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
范国成 高芳銮 黄美英 谢荔岩 吴祖建 林奇英 谢联辉
为构建携带水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)主要内层衣壳蛋白S3基因和外层衣壳蛋白S8基因的重组杆状病毒,将目的基因(S3和S8)分别亚克隆到杆状病毒转移载体pFastBacDual多角体启动子(PH)和p10启动子的下游.经酶切和确证性序列测定,将其转化到DH10Bac感受态细胞中,获得重组杆粒rbpFBDS3-S8,采用脂质体转染法,将rbpF-BDS3-S8转染草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)Sf9细胞包装病毒,PCR筛选鉴定重组病毒.结果表明:Sf9昆虫细胞被侵染72 h后,倒置显微镜下观察到细胞增大,培养液和细胞内出现颗粒状物...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
牟少亮 曹蕾 官德义 方开星 何水林
利用cDNA-AFLP分析籼稻明恢86应答稻纵卷叶螟取食基因差异表达,发现1个与植物同源结构域(PHD)锌指蛋白高度同源的TDF,分离获得该TDF对应的粳稻全长cDNA.该全长cDNA与籼稻、玉米、蓖麻、葡萄、拟南芥和大豆等作物PHD锌指蛋白推定氨基酸序列的同源性分别为98.43%、86.01%、54.58%、57.02%、57.51%和55.88%.荧光定量PCR研究表明,日本晴(粳稻)叶片中该基因的表达也受稻纵卷叶螟取食的诱导,推测该基因与籼稻和粳稻应答稻纵卷叶螟取食密切相关.
关键词：
稻纵卷叶螟 PHD锌指蛋白 表达分析
[期刊] 中国农业科学
[作者]
邓若磊 谷俊涛 路文静 徐海荣 曹云飞 肖凯
【目的】阐明水稻铵转运蛋白基因OsAMT1;4和OsAMT5的编码蛋白特征、功能和表达。【方法】采用生物信息学技术,揭示目的基因的编码蛋白特征;通过铵离子吸收缺陷的酵母突变体功能互补技术,鉴定上述基因编码蛋白的功能;采用RT-PCR技术,研究基因的表达特征。【结果】OsAMT1;4和OsAMT5的编码阅读框为1497bp和1377bp,分别编码498和458个氨基酸残基。OsAMT1;4和OsAMT5均具有11个跨膜域,分别归属与AMT1和AMT2亚家族。OsAMT1;4和OsAMT5均具有使NH4+吸收缺陷的酵母突变体重新恢复吸收NH4+的能力。OsAMT5在叶中特异表达,随NH4+浓度增加...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
黄越敏 胡红红 武从庆
为鉴定逆境应答相关转录因子,以1个水稻EST为基础,通过RT-PCR分离到了1个编码锌指蛋白的转录因子新基因的全长cDNA,命名为OsZF19。该基因编码171个氨基酸,包含zf-AN1和zf-A20两个锌指结构域,预测的该基因启动子区含有逆境应答顺式元件。Northern杂交分析表明,OsZF19的确受到高盐和植物激素ABA胁迫的诱导,而在干旱胁迫早期显著地诱导表达,胁迫后期OsZF19的表达量轻微下降。试验结果表明,OsZF19可能在水稻对干旱和高盐逆境的应答反应中发挥作用。
关键词：
水稻 锌指蛋白 非生物逆境 基因表达
[期刊] 华北农学报
[作者]
蔚亚楠 黎志彬 龚亚菊 鲍锐 桂敏 杜光辉 刘家迅 吴丽艳
为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制，以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象，通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法，首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标，即过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)的活性和可溶性蛋白(SP)含量的变化。结果确定接种大丽轮枝菌后12,24 h为蛋白组分析取样的关键时间点；在此基础上，利用iTRAQ技术分析M239在接种大丽轮枝菌后根部蛋白的变化。结果发现，与清水接种(CK)相比，M239接种大丽轮枝菌后12 h有463个差异表达蛋白(DEPs),其中305个下调，158个上调；接种后24 h,有456个DEPs被病原菌诱导表达，包括296个下调，160个上调。这些蛋白主要富集在碳代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、次生代谢物的生物合成、丙酮酸代谢、新陈代谢等途径。通过与已报道的黄萎病抗性材料的研究结果进行对比分析发现，M239在响应大丽轮枝菌的侵染过程中，参与防御响应的蛋白数量和代谢通路较少，未能形成有效的防御网络，最终表现为感病。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
郭宝生 师恭曜 王凯辉 刘素恩 赵存鹏 王兆晓 耿军义 华金平
目的发掘陆地棉Dirigent-like蛋白基因家族,明确不同黄萎病抗性品种间该基因家族成员的多态性及表达差异。方法利用Illumina Hiseq 2000测序平台,通过RNA-Seq测序技术,获得黄萎病菌侵染陆地棉抗病品种和感病品种的Dirigent-like蛋白基因家族成员Unigene序列;采用生物信息学软件对其进行核苷酸序列及编码蛋白的多重比对和系统进化分析;针对该家族成员设计特异的quantitative real-time PCR引物,在Applied Biosystems 7500 Real Time PCR System上使用SYBR green PCR试剂盒标记反应产物,棉...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
郑璐平 林辰 吴祖建 谢联辉
通过RT-PCR克隆获得水稻条纹病毒(RSV)编码的蛋白NS2和拟南芥柯浩体蛋白Atcoilin的cDNA,将两者分别与表达载体pEarley102(带青色荧光蛋白,CFP)和pEarley101(带黄色荧光蛋白,YFP)同源重组.将构建好的重组载体分别转化到农杆菌EHA105中,通过农杆菌接种法将两者共同注射到本氏烟叶片表皮细胞中进行表达.在共聚焦显微镜下观察,NS2-CFP与Atcoilin-YFP能重叠在一起,表明RSV NS2定位于柯浩体.
关键词：
水稻条纹病毒 NS2 柯浩体 细胞定位
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
江彤 何志龙 李祥宇 张享享
［目的］测定水稻黑条矮缩病毒（Ｒｉｃｅ ｂｌａｃｋ－ｓｔＲｅａｋｅｄ ｄｗａＲｆ ｖｉＲｕｓ，Ｒｂｓｄｖ）安徽分离物全基因组序列，分析Ｒｂｓｄｖ安徽分离物与Ｒｂｓｄｖ其他分离物以及斐济病毒属（ｆｉｊｉｖｉＲｕｓ）其他成员之间的分子差异，为明确Ｒｂｓｄｖ遗传变异与进化规律提供重要信息。［方法］采用Ｒｔ－ＰｃＲ法从安徽玉米粗缩病样本中扩增Ｒｂｓｄｖ的全基因组，克隆、测序并进行序列分析。［结果］获得Ｒｂｓｄｖ安徽分离物全基因组序列。序列比对发现，Ｒｂｓｄｖ安徽分离物与其他Ｒｂｓｄｖ各个分离物ｓ１到ｓ１０的序列相似性较高，为８７．６％～９９．５％，其中与Ｒｂｓｄｖ韩国分离物（Ｒｂｓｄｖ－ｋＯＲ）序列相．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孙现超 李勇 周常勇 青玲
【目的】构建普通烟草铁氧还蛋白I(ferredoxin I,Fdn-Ⅰ)原核表达载体,表达可溶性Fdn-Ⅰ蛋白,并制备其多克隆抗体,分析Fdn-Ⅰ在ToMV侵染烟草叶片内的表达情况。【方法】以Fdn-Ⅰ全长cDNA为模板,用PCR扩增Fdn-Ⅰ,克隆至原核表达载体pEGX-6p-1,构建Fdn-Ⅰ与GST融合表达载体pEGX-Fdn-Ⅰ,重组质粒转化原核表达菌株BL21,优化GST-Fdn-Ⅰ可溶性表达条件后大量表达蛋白,用GST亲和层析法纯化获得可溶性GST-Fdn-Ⅰ蛋白,免疫家兔制备多克隆抗体。ELISA测定抗体效价,Western印迹法检测抗体的特异性和ToMV侵染前后烟草叶片内Fdn...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
宛柏杰 林文武 吴锦鸿 陈晓敏 吴祖建 张洁
利用ＲＴ－ＰＣＲ的方法从感染水稻矮缩病毒（ＲｉＣｅ ｄｗａＲｆ ｖｉＲｕｓ，Ｒｄｖ）的水稻中克隆该病毒的运动蛋白基因ｓ６和外壳蛋白基因ｓ８，通过ＧａＴｅｗａｙ系统进行原核表达，获得表达载体Ｐ ｄｅｓＴ１７－Ｐｎｓ６和Ｐ ｄｅｓＴ１７－Ｐ８，将表达载体转化ｅ．Ｃｏｌｉ ＲｏｓｅＴＴａ，经ｉＰＴＧ诱导表达后获得分子质量约为５９和４６ ｋｕ含Ｈｉｓ标签的融合蛋白．以诱导表达的目的蛋白为抗原，免疫注射新西兰大白兔制备多克隆抗体．结果表明，ｗｅｓＴｅＲｎ ｂｌｏＴ检测制备的Ｐｎｓ６和Ｐ８抗体可特异性检测Ｒｄｖ，间接ｅｌｉｓａ测定Ｐｎｓ６和Ｐ８抗体的效价均约为６ ４００倍，并建立了可靠、灵敏、特异的ｄｏＴ．．．
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