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[期刊] 淡水渔业
[作者]
袁峻峰 公磊 葛东凌 张锦平 陈德辉 黄惠琴
利用选定的系 列选择性培 养基可以较 好地扫描水 体的微生物群 落组成和 群落结 构，我们称之为系列选择性培养基扫描法。该方法可以一次检出 水体常见的微生物菌株， 根据需要鉴定到属或种甚至株系； 可以准确 反映不同株系微生物的数 量， 便于进行 群落结构的分析和研究。利用该方法对一个小水体进行了研究， 系列选择性培养基检出微生物４８ 个菌株， 数量是普通营养肉汤数量的１０ 倍左右， 两者间有较好的相关性。
关键词：
系列选择性培养基扫描法,微生物群落结构
[期刊] 中国水产科学
[作者]
毛玉泽 颜婷茹 朱玲 蒋增杰 王巍 方建光
采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术研究了2007年夏季桑沟湾不同养殖区水体微生物群落结构特征。DGGE指纹图谱分析表明,不同站位之间既存在共同图谱,又具有各自的特征谱带,总体上可分为4个区,湾外区、湾口区,湾中区和湾底区,分别与非养殖区、海带养殖区、综合养殖区、贝类单养与网箱养殖区行相对应;扇贝养殖区和牡蛎养殖区微生物相似性最高为94%,贝类单养与网箱养殖区和非养殖区相似性最低为41%,仅在网箱区发现对含氮污染物有去除作用的玫瑰杆菌属(Roseobacter)。17个站位表层水样共获得30个优势菌群,选择比较明显的12条带进行回收、扩增和测序,与GenBank中已经登录的细菌种群的同源性进行...
关键词：
微生物群落结构 DGGE 桑沟湾 养殖区
[期刊] 淡水渔业
[作者]
赵翔刚 罗衡 刘其根 赵良杰 蔡林荣 戴亮亮 张真
为了研究养殖沙塘鳢(Odontobutis obscurus)对稻田水体及底泥的微生物群落结构及多样性的影响,2015年于浙江海盐江南四阡现代农业公司进行了沙塘鳢的稻田养殖实验,利用DGGE(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis)技术对养殖过程中的稻田水体及底泥中细菌的16S r DNA片段进行指纹图谱分析。DGGE条带测序分析结果显示:稻田水体及底泥共检测到包括α-变形菌亚门(Alphaproteobacteria)、β-变形菌亚门(Betaproteobact
[期刊] 淡水渔业
[作者]
唐永涛 赵良杰 杨洋 刘其根 凡迎春 吴杰洋
为了研究混养三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)和鲢(Hypophthalmichthys molitrix)鳙(Aristichthys nobilis)对池塘养殖水体微生物群落结构的影响,分别在浙江海盐、江西九江、上海浦东开展了罗氏沼虾-三角帆蚌混养、草鱼—三角帆蚌混养、罗氏沼虾-三角帆蚌-鲢鳙鱼混养三组系列实验。利用DGGE技术对养殖水体的16S r DNA进行指纹图谱分析。三组实验共鉴定出57条不同条带,每组实验中混养三角帆蚌或鲢鳙实验组的平均条带数均高于单养水体水样平均条带数。Shannon多样性指数分析结果显示,各养殖水体混养三角帆蚌、鲢鳙后,多样性指数均有所增加。PC...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李志斐 王广军 余德光 卢炳国 谢骏 郁二蒙 夏耘 种香玉
为探讨生物絮团对养殖水体水质和微生物代谢功能的影响,采用水质分析和Biolog-ECO技术,分析了葡萄糖强化养殖水体培育生物絮团的过程中水质指标和微生物碳代谢变化特征。结果显示:(1)成熟的生物絮团有效降低了养殖水体氨氮、亚硝酸盐氮、硝酸盐氮水平,并显著提高了养殖水体的总固体悬浮物(TSS)含量。(2)对照组和生物絮团组水体微生物样品平均颜色变化率(average well color development,AWCD)在培养108 h后趋于稳定,生物絮团组AWCD高出对照组18%;同时生物絮团系统水体微生物提高了对聚合物类和碳水化合物类的代谢强度;对比2组水体微生物代谢多样性指数发现,生物絮...
[期刊] 水产学报
[作者]
江昊飞 李慷 石文智 车轩 刘兴国 鲁强 巴旭冰 刘利平
生物质炭膜架作为一种新型填料，具有较高的单位比表面积，有利于微生物膜的形成，在水产养殖尾水处理中具有广阔前景。然而，养殖过程中的环境变化和渔药的使用，对生物质炭膜架处理污水能力的影响尚不明确。实验设置了不同pH（E1：6.5、E2：7.5和E3：8.5）和常用渔药（F1：氟苯尼考，6 mg/L；F2：土霉素，20 mg/L）处理组，研究生物质炭填料系统去除氨氮效率及其附着生物膜微生物群落结构的变化。结果显示，（1）实验组与对照组中，硝化螺旋菌门（Nitrospirae）相对丰度均为最高；（2）E1、E2、E3组降氨氮速率分别为0.247、0.249、0.305 mg/(L·h)，均低于对照组（pH=8.2）：0.323 mg/(L·h)；低pH条件下硝化螺旋菌的相对含量略有降低，而脱氮硫杆菌相对含量没有显著差异。（3）F1、F2组降氨氮速率一致，均为0.172 mg/(L·h)，低于对照组0.323 mg/(L·h)；与对照组相比，实验组硝化螺旋杆菌与脱氮硫杆菌相对含量无显著变化，推测氟苯尼考和土霉素抑制了菌的活性，致使氨氮降解速率下降。研究表明，弱碱性水体有助于提高生物质炭填料净化水质能力，而氟苯尼考或土霉素的使用会影响生物膜上脱氮微生物的群落丰度和活力并抑制降氨氮能力。因此，使用抗生素类渔药治疗时，应结合其它水质调节措施来控制养殖水体的氨氮含量，最大化发挥生物质填料的净化养殖尾水效果。
[期刊] 水产学报
[作者]
江昊飞 李慷 石文智 车轩 刘兴国 鲁强 巴旭冰 刘利平
生物质炭膜架作为一种新型填料，具有较高的单位比表面积，有利于微生物膜的形成，在水产养殖尾水处理中具有广阔前景。然而，养殖过程中的环境变化和渔药的使用，对生物质炭膜架处理污水能力的影响尚不明确。实验设置了不同pH（E1：6.5、E2：7.5和E3：8.5）和常用渔药（F1：氟苯尼考，6 mg/L；F2：土霉素，20 mg/L）处理组，研究生物质炭填料系统去除氨氮效率及其附着生物膜微生物群落结构的变化。结果显示，（1）实验组与对照组中，硝化螺旋菌门（Nitrospirae）相对丰度均为最高；（2）E1、E2、E3组降氨氮速率分别为0.247、0.249、0.305 mg/(L·h)，均低于对照组（pH=8.2）：0.323 mg/(L·h)；低pH条件下硝化螺旋菌的相对含量略有降低，而脱氮硫杆菌相对含量没有显著差异。（3）F1、F2组降氨氮速率一致，均为0.172 mg/(L·h)，低于对照组0.323 mg/(L·h)；与对照组相比，实验组硝化螺旋杆菌与脱氮硫杆菌相对含量无显著变化，推测氟苯尼考和土霉素抑制了菌的活性，致使氨氮降解速率下降。研究表明，弱碱性水体有助于提高生物质炭填料净化水质能力，而氟苯尼考或土霉素的使用会影响生物膜上脱氮微生物的群落丰度和活力并抑制降氨氮能力。因此，使用抗生素类渔药治疗时，应结合其它水质调节措施来控制养殖水体的氨氮含量，最大化发挥生物质填料的净化养殖尾水效果。
[期刊] 水产学报
[作者]
江昊飞 李慷 石文智 车轩 刘兴国 鲁强 巴旭冰 刘利平
生物质炭膜架作为一种新型填料，具有较高的单位比表面积，利于硝化微生物群落的附着，污水净化能力较强，在未来人工湿地的应用中具有广阔前景。水产养殖过程中的环境变化和渔药的使用，是否会妨碍人工湿地中填料作用的充分发挥尚未明确。为研究外界因素对生物质炭膜架除污能力的影响，实验设置了不同pH (E1:6.5、E2:7.5和E3:8.5)和常用渔药(F1：氟苯尼考，6 mg/L;F2：土霉素，20 mg/L)处理组，研究生物质炭填料系统降氨氮效率及其附着生物膜微生物群落结构的变化。结果显示：(1)实验组与对照组中，硝化螺旋菌门相对丰度均为最高。(2) E1、E2、E3组降氨氮速率分别为0.247、0.249、0.305mg/(L·h)，均低于对照组(pH=8.2)[0.323 mg/(L·h)]；低pH条件下硝化螺旋菌的相对含量略有降低，而脱硫杆菌相对含量无显著差异。(3) F1、F2组降氨氮速率一致，均为0.172mg/(L·h)，低于对照组[0.323 mg/(L·h)]；与对照组相比，实验组硝化螺旋菌与脱硫杆菌相对含量无显著变化，推测氟苯尼考和土霉素抑制了菌的活性，致使氨氮降解速率下降。研究表明，弱碱性水体有助于提高生物质炭填料净化水质的能力，而氟苯尼考或土霉素的使用会影响生物膜上脱氮微生物的群落丰度和活力，并抑制降氨氮能力。因此，使用抗生素类渔药治疗时，应配合其他水质调节措施来控制养殖水体的氨氮含量，保证养殖对象安全，最大化发挥生物质填料的养殖尾水净化效果。
[期刊] 华北农学报
[作者]
樊芳芳 焦晓燕 刘佳琪 郭珺 王劲松 武爱莲 白文斌 平俊爱
为研究高粱、玉米残体腐解特征及腐解进程中秸秆腐解微生物群落功能多样性的变化，设置残体类型(高粱茎叶、玉米茎叶、高粱根系、玉米根系)、土壤类型(潮褐土、黄壤土)、氮处理(调节碳氮比、不调节)3个变量，通过2次试验分析不同腐解条件下残体的腐解特征(干物质降解率、碳矿化特征、纤维素、半纤维素和木质素的降解率),并使用BIOLOG-ECO板分析秸秆腐解微生物群落代谢多样性。结果表明，高粱、玉米残体腐解速率均表现出前期快后期慢的特征，表明在相同土壤和氮处理条件下，残体干物质降解率及碳矿化速率表现为高粱茎叶>玉米茎叶>高粱根系>玉米根系；由第2次试验可知，潮褐土条件下腐解60 d,高粱茎叶+N处理、玉米茎叶+N处理的干物质降解率分别为55.50%,48.00%,而高粱根系+N处理和玉米根系+N处理的干物质降解率分别为31.25%,16.75%。在相同土壤和氮处理条件下，同一作物根系的半纤维素、纤维素的降解率低于茎叶，腐解90 d,潮褐土条件下高粱根系+N处理对半纤维素、纤维素降解率分别比高粱茎叶+N处理降低了23.70,18.80百分点。对秸秆腐解微生物代谢多样性的分析表明，腐解30 d秸秆腐解微生物代谢活性最高，腐解90 d微生物代谢活性最低；与30 d相比，在腐解第1天，秸秆腐解微生物群落对胺类、酚酸类代谢能力较低，第90天秸秆腐解微生物群落对碳水化合物、氨基酸类、多聚物类代谢能力均明显降低。由此可见，在该试验条件下，高粱残体比玉米残体更易腐解，调节碳氮比可在一定程度上加速残体腐解，秸秆腐解30 d微生物代谢多样性最高。
[期刊] 林业科学
[作者]
字洪标 向泽宇 王根绪 阿的鲁骥 王长庭
【目的】研究青海省7种林分类型土壤微生物群落组成的变化规律,从微生物的角度为该区森林土壤资源的科学管理与评价以及林分结构调整和生态系统更新、恢复与重建提供科学依据。【方法】利用常规实验室分析和磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acids,PLFAs)分析法对青海省云杉、白桦、落叶松和山杨组成的7种不同林分类型(大通青海云杉天然林A、大通白桦次生林B、湟中白桦青海云杉天然混交林C、乐都落叶松白桦天然混交林D、民和山杨人工林E、循化山杨白桦次生林F、尖扎青海云杉天然林G)表层土壤(020 cm
[期刊] 淡水渔业
[作者]
程莹寅 吴山功 郑英珍 王微微 邹红 李文祥 王桂堂
为研究主养草鱼池塘底泥微生物多样性,采用细菌通用引物27F和1492R扩增了湖北石首一草鱼(Cteno-pharyngodon idellus)养殖池塘底泥细菌16S rDNA片段,构建了底泥细菌16S rDNA克隆文库,并对该文库中的微生物群落进行了分析。结果显示,该文库的Shannon多样性指数(H')为3.85,Schao1丰富度指数为185,Evenness均匀度指数(E)为0.96。池塘底泥中主要的细菌类群为:变形菌门(Proteobacteria)(53.66%)、厚壁菌门(Firmi-cutes)(14.63%)、酸杆菌门(Acidobacteria)(7.32%)、拟杆菌门(B...
[期刊] 林业科学
[作者]
赵杼祺 胡振宏 何鲜 黄志群
木质残体分解是森林碳循环过程中的重要环节，而微生物是影响其分解的关键因素，近年来，木质残体微生物群落构建机制已逐渐成为森林生态系统碳循环研究中的重要议题。然而当前对木质残体微生物构建的研究内容较为零散，基于此，本文进行了综述。1）微生物通过在木质残体不断定殖和竞争维持了其群落的动态平衡。木质残体微生物来源主要包括残体自身、大气以及土壤。定殖过程在分解的各个阶段均会发生，主要包括微生物进入基质后发生的竞争和资源捕获。2）土壤、木质残体特性、气候是影响木质残体微生物群落形成的三个重要因素，三者均会作用于微生物源和定殖过程。3）土壤环境会影响其微生物群落，也会改变与其接触的残体水分和养分等特性。木质残体特性的差异会影响资源的可得性进而影响微生物群落。随着分解进行，微生物群落形成会从初期以随机过程主导转变为确定过程为主导。气候会通过温度与湿度两种气候因子作用于土壤与木质残体，表现形式主要为大气候、小气候及全球气候变化。该领域在未来研究中需要注意的问题有：1）关注早期定殖者及不同分解阶段土壤微生物优势类群对木质残体微生物群落形成过程的影响。2）加强木质残体资源变化情况与对应微生物群落中优势物种功能特性的研究。3）将木质残体分解与全球气候变化和养分循环联系起来。4）选择靶向宏基因组联用等技术辅助进行研究。综上，本文总结了森林木质残体微生物群落形成机制研究的基本思路、框架与前景，为森林生物多样性保护、生物地球化学循环功能的维持以及森林固碳提供了一定的科学参考。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
胡方正 孙大川 郭衍硕 姚妙兰 刘文畅 谭洪新
为了解硝化型和光合自养型生物絮团对于泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)的养殖效果,设置清水组(CW组)、硝化组(BFT组)和光合自养组(ABFT组)生物絮团养殖泥鳅45 d,比较泥鳅的生长和消化酶活性、两类絮团的营养组成情况,以及养殖水体和泥鳅肠道微生物的群落结构。结果显示,BFT组和ABFT组的饲料转化率、特定生长率和末均重没有显著性差异(P>0.05)。与CW组相比,两实验组的饲料转化率显著降低;BFT组的终末密度与CW组相比没有显著性差异(P>0.05)。与CW组相比,BFT组和ABFT组生物絮团可以提供(36.69±1.17)%和(40.20±1.05)%的粗蛋白;与BFT组相比,ABFT组的生物絮团粗脂肪含量显著提高(P<0.05),并且促进脂肪酸由饱和向不饱和转化。ABFT的泥鳅胰蛋白酶和脂肪酶的活性显著高于另外两组(P<0.05)。微生物群落分析表明,添加藻类对成熟生物絮团Alpha多样性指数、群落门水平和属水平没有显著影响。泥鳅摄食生物絮团会导致肠道菌群sobs指数显著降低。BFT组肠道的优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)和绿弯菌门(Chloroflexi);ABFT组为变形菌门和蓝藻门(Cyanobacteria)。属水平上,ABFT组检测到高水平的气单胞菌属(Aeromonas)。本研究表明,硝化型和光合自养型生物絮团养殖均适合作为泥鳅绿色健康养殖的新模式。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
徐慧敏 陈曦 孟顺龙 周剑 范丁月 范立民 宋超 裘丽萍 李丹丹 方龙香 张露
鱼菜共生技术模式是一种高效绿色健康的循环农业模式，对于解决水产养殖污染、淡水资源紧张和水产品质量安全等问题具有重要意义。在鱼菜共生系统中，微生物在营养元素转化和动植物生长健康调节等方面发挥着关键作用，深刻影响着鱼菜共生系统中的生态平衡。近年来，随着分子生物学技术和生物信息技术等快速发展，鱼菜共生系统中的微生物群落多样性、组成及部分功能特征已经得到了关注。本文首先对鱼菜共生技术模式的发展情况进行了简介，其次对近年来与鱼菜共生系统相关的微生物群落多样性、组成、功能及其环境驱动因素等研究进展进行了总结论述，同时，对目前相关研究中存在的限制性进行了讨论，最后对未来研究需要加强的发展方向进行了展望，以期为鱼菜共生技术模式的未来发展提供微生物角度的见解。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
徐慧敏 陈曦 孟顺龙 周剑 范丁月 范立民 宋超 裘丽萍 李丹丹 方龙香 张露
鱼菜共生技术模式是一种高效绿色健康的循环农业模式，对于解决水产养殖污染、淡水资源紧张和水产品质量安全等问题具有重要意义。在鱼菜共生系统中，微生物在营养元素转化和动植物生长健康调节等方面发挥着关键作用，深刻影响着鱼菜共生系统中的生态平衡。近年来，随着分子生物学技术和生物信息技术等快速发展，鱼菜共生系统中的微生物群落多样性、组成及部分功能特征已经得到了关注。本文首先对鱼菜共生技术模式的发展情况进行了简介，其次对近年来与鱼菜共生系统相关的微生物群落多样性、组成、功能及其环境驱动因素等研究进展进行了总结论述，同时，对目前相关研究中存在的限制性进行了讨论，最后对未来研究需要加强的发展方向进行了展望，以期为鱼菜共生技术模式的未来发展提供微生物角度的见解。
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