利用SSR分子标记对分布在我国的7个毛红椿群体进行了遗传结构研究。结果表明:毛红椿群体具有较低水平的遗传变异;毛红椿群体的等位基因的平均数为6.1,有效等位基因数平均为2.7,平均期望杂合度为0.600 6;毛红椿群体遗传分化系数(FST)平均值为0.185 4,在FST值的基础上估算毛红椿群体间的基因流(Nm)为1.098 3。采用平均距离方法(UPGMA)对7个群体进行了聚类,对各群体遗传距离与地理距离的相关分析表明:群体间遗传距离与地理距离显著相关。分析了毛红椿濒危的原因,并提出了保护策略。

利用8对微卫星标记对分布于我国的3个毛红椿天然居群的遗传结构进行研究。收集毛红椿3个天然居群209个单株材料并对每个单株的位置进行定位,运用空间自相关分析研究毛红椿居群的空间遗传结构,了解该物种的进化历程和濒危机制,并为制定有效的保护策略和措施提供科学依据。研究结果表明:1)居群等位基因的平均数为5.3,有效等位基因数平均为2.6;2)观察杂合度平均为0.5990,期望杂合度平均为0.5893;3)空间自相关分析结果揭示毛红椿宜丰天然居群在0~240m存在着显著的空间遗传结构;4)宾川和师宗居群内遗传变异在空间上为随机分布,不存在明显的空间遗传结构;5)导致居群内空间遗传结构形成的原因,包括花...

[目的]研究毛红椿天然群体遗传多样性取样策略,为其种质资源收集、保存和遗传多样性保护等提供参考依据。[方法]利用8对微卫星分子标记进行毛红椿天然群体遗传多样性和空间自相关分析,综合制定其天然群体合理取样策略。[结果]毛红椿天然群体等位基因数平均为7.5个,期望杂合度(H_e)和多态性信息指数(PIC)均值分别为0.643 7和0.636 0,基因分化系数(G_(ST))均值为0.290 7。在遗传多样性取样策略方面,提出了根据毛红椿群体基因分化系数来确定取样群体遗传变异所占总变异比例的运算公式为1-(G_(ST))~(n-1),其中,n为取样群体的数量。当取样群体达到4个时,基本上能包括该树种97.5%的遗传变异;同时确定了目标群体的选择方法,应选择与其它群体间基因分化系数均值较大的4个群体,即贵州册亨(CH)、浙江遂昌(SC)、浙江仙居(XJ)和云南师宗(SZ)。通过构建云南宾川(BC)、云南师宗(SZ)和江西宜丰(YF)群体内取样单株数量与基因多样性和等位基因之间的捕获曲线,确定了群体内取样单株数量应达到15个以上;毛红椿天然群体内300～520 m范围内的单株间存在相似关系,超出此范围个体间差别较大,说明在进行群体内单株取样时,单株间距应大于520 m。[结论]取样群体数量、群体间遗传分化系数、群体内单株数量以及单株间距离等影响了毛红椿取样群体的遗传多样性。毛红椿天然群体遗传多样性取样策略为取样群体4个、每个群体最少取样15个单株,单株间距大于520 m。

【目的】利用荧光SSR研究中国糜子的遗传多样性与群体遗传结构,为糜子品种改良、种质创新和资源利用提供依据。【方法】用不同地理来源且表型差异较大的6份糜子材料对SSR引物进行筛选,通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳获得条带清晰、稳定性好、多态性高的糜子SSR引物,对筛选出的引物5′末端进行6-FAM、HEX、ROX和TAMRA荧光标记,利用基因分析仪检测不同等位变异的扩增片段大小,并以此来分析131份糜子材料的遗传多样性和群体结构。【结果】从202对SSR引物中共筛选出22对扩增稳定、多态性好的SSR引物,能同时适用于传统变性PAGE胶电泳和荧光SSR标记-全自动分析检测技术。22对SSR引物共检测出128个主要等位变异,平均每个位点5.82个;基因多样性指数变化范围为0.3572—0.8132,平均0.6284;多态性信息含量为0.2934—0.8150,平均0.5874;Shannon多样性指数为0.5427—1.7681,平均1.2062。不同生态区糜子种质间遗传距离的变化范围为0.0764—0.7251,平均0.3121,遗传一致度的变化范围为0.4843—0.9265,平均0.7465。其中,北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的遗传距离最小,遗传一致度最高,亲缘关系较近。UPGMA聚类分析显示,北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的材料聚为一类,个体间聚类,东北春糜子区的育成品种和农家种聚类结果一致,黄土高原春夏糜子区的育成品种在多个组群中都有出现。通过绘制K与△K的关系图,K=4时,△K最大,据此将131份糜子材料划分为4个类群,类群Ⅰ代表北方春糜子区;类群Ⅱ主要来自东北春糜子区;类群Ⅲ主要是北方春糜子区,群组Ⅳ主要是黄土高原春夏糜子区。各群体中大部分品种亲缘关系单一,少数品种含有其他组群的遗传成分。基于遗传距离的聚类分析与群体遗传结构分析结果基本一致,表明糜子的遗传差异与地理来源相关。【结论】北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的遗传多样性比较丰富,东北春糜子区的育成品种主要以农家种为遗传背景选育而来,黄土高原春夏糜子区在育种过程中引种资源广泛,与其他生态区存在基因交流。

本研究利用10个微卫星标记对广东和台湾红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)养殖群体进行遗传多样性分析,并对2个红螯螯虾群体的平均等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)等进行计算。结果显示:在2个红螯螯虾群体中共检测到83个等位基因,广东群体的平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)分别为2.619、0.438、0.505,台湾群体的平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)分别为2.829、0.492、0.592。广东群体和台湾群体的平均多态信息含量(PIC)分别为0.465和0.538。红螯螯虾2群体的Shannon指数(H)均大于1,群体间的遗传分化指数(F_(st))为0.0969。研究结果表明:红螯螯虾广东和台湾养殖群体的遗传多样性较丰富,且2个群体的遗传分化较大,通过群体间的杂交可有效避免近亲繁殖。

【目的】白蜡是北方重要的盐碱地造林树种，了解白蜡居群的遗传多样性和群体结构对于白蜡种质资源的有效保护和开发利用至关重要。【方法】利用筛选的SSR标记，对来自9个不同地理区域的共380份白蜡种质资源进行遗传分化分析、分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析。【结果】12对SSR引物在所有白蜡中都能进行扩增，等位基因(N_a)共51个，平均每对引物观察到4.287个等位基因，PIC为0.119 7～0.750 9，平均为0.532 9，高于0.5；白蜡居群的群体内近交系数(F_(is))平均为0.016，群体近交系数(F_(it))平均为0.091，显示杂合频率高，居群近交较多，群体分化率(F_(st))平均为0.095，存在中度程度的遗传分化，基因流(N_m)平均为4.199，居群间基因交流非常丰富；AMOVA分析结果表明9个白蜡居群的遗传差异主要来源于个体间(91%)；群体结构分析结果显示，9个来自不同地理区域的白蜡居群中存在3个不同的基因库，居群间在进化上相对独立，存在一定程度的遗传混合，遗传组分相对单一，与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。【结论】12个SSR标记多态性较好、稳定性较高，能有效鉴别来自9个不同地理区域白蜡居群的380份种质资源，并揭示种质的遗传多样性和群体遗传结构，可为白蜡的种质保存和育种提供有价值的科学依据。

【目的】为了解花菜类种质的遗传基础，分析种质群体的亲缘关系，为花菜育种提供参考。【方法】选用22对SSR引物，利用毛细管电泳荧光检测技术对96份花菜类种质材料进行遗传多样性分析，根据Nei’s遗传距离和非加权配对法（UPGMA）进行聚类分析以及以Structure软件的混合模型聚类法推断材料构成群体的遗传结构。【结果】22对引物在96份材料中共扩增出91个等位位点，平均每对引物为4.136个。从22对引物中筛选出了10对条带清晰、稳定性好的多态性引物，可用于花菜类作物种质资源的鉴定和研究。根据花球性状，将材料分为青花菜（24份）以及花椰菜（72份）2个组群，经多态性分析，2个组群的观察等位基因数值（Na）分别为2.727和3.091；有效等位基因数（Ne）分别为1.910和1.841；Shannon′s 指数（I）分别为0.675和0.667，说明这2个组群的遗传多样性均不够丰富。聚类分析也将96份材料分为2个组群，第Ⅰ组为24份青花菜材料，包括1份西兰苔杂交种和23份青花菜杂交种；第Ⅱ组为72份花椰菜材料，包括29份花椰菜自交系、36份花椰菜杂交种和7份花椰菜主栽品种。花椰菜自交系被分到了4个亚群，但在各亚群中材料之间的遗传距离较小，杂交组配时，选用不同亚群的自交系进行组配，以获得更大的杂交优势。群体结构分析中，当K=2时△K出现明显的峰值，最大值为1658.48，为最佳群体组群数，与聚类分析结果基本一致。且96份材料的Q值均大于0.6，说明该花菜资源的遗传结构较为单一。【结论】所参试材料种质群体内遗传多样性不够丰富，遗传背景单一，亟需重视对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用，加强种质材料共享和交流，促进花菜种业发展。

【目的】分析高原粳稻主栽品种的遗传状况,寻找与农艺性状相关联的分子标记,为水稻新品种选育提供参考。【方法】在2种海拔条件下调查81份高原粳稻主栽品种的农艺性状,并利用48个SSR标记对供试品种进行多态性扫描和群体遗传结构分析,在此基础上采用Tassel 2.1 MLM(MixedLinear Model)方法进行SSR标记与农艺性状的关联分析。【结果】37个SSR标记在供试品种间具有多态性,共检测出139个等位变异,变异范围为2～10个,平均3.76个。群体遗传结构分析将供试品种分为2个亚群,关联分析表明,在P<0.05水平,2种环境下均检测出RM1195和RM209分别与株高和千粒重相关联,RM267、RM332、RM490、RM583和RM590与结实率相关联,各标记对表型变异的解释率在0.074～0.352。而在P<0.001水平,只有RM332与结实率相关联,该分子标记位于11号染色体上。【结论】检测出的7个标记可以为高原粳稻杂交配组及分子标记辅助育种提供理论依据。

【目的】枣原产中国，种质资源丰富。对来自中国２２个省区不同用途的２５５个枣品种进行ＳＳＲ分析，揭示这些不同产地来源的枣种质资源之间的亲缘关系和群体遗传结构，为枣种质资源的科学管理和分子标记辅助育种提供参考。【方法】利用改良ＣＴＡＢ提取供试枣种质的基因组ＤＮＡ，以前期枣基因组测序挖掘出的ＳＳＲ引物为基础，进行高效率引物筛选，并利用ＳＳＲ分子标记技术对２５５份枣种质资源的基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增，然后利用８％聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染后显色。根据条带有无统计数据，计算出多态性位点百分率（ＰＩＣ），用ＮＴＳＹＳ软件进行ＵＰＧＭＡ聚类分析；利用ＳＴＲＵＣＴＵＲｅ软件分析群体遗传结构，计算出最适群体．．．

为分析中、韩、俄沿海刺参(Apostichopus japonicus)种质遗传结构，本研究采用SSR指纹图谱技术对中国青岛、烟台，韩国浦项、群山、木浦，俄罗斯符拉迪沃斯托克的8个不同地理种群的刺参群体进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果显示，13个微卫星座位的平均观察杂合度(H_(o))和平均期望杂合度(H_(e))分别为0.47和0.80。13个位点的多态信息含量(PIC)为0.465(AJ06)～ 0.909(AJ09)，除AJ06为中度多态性(0.25

关键词： 刺参  SSR标记  遗传多样性  指纹图谱