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年份: 2019(1)

作者: 兵(1); 勤(1); 周(1); 季(1); 徐(1); 政(1); 明(1); 浩(1); 航(1); 芷(1); 蒋(1); 郑(1); 馨(1)

学科: 刚(1); 竹(1)

机构: 中心(1); 亚(1); 亚热(1); 亚热带(1); 共建(1); 农(1); 农林(1); 利用(1); 协(1); 协同(1); 同中心(1); 国家(1); 国家重点(1); 培(1); 培育(1); 大学(1); 实验(1); 实验室(1); 室(1); 家(1); 林(1); 森(1); 森林(1); 江(1); 浙(1); 浙江(1); 浙江省(1); 热带(1); 省(1); 竹(1)

基金: 2018(1); 2018r412004(1); 31470615(1); 31870656(1); 31870656,31470615(1); 412004(1); r(1); 人才(1); 划(1); 创(1); 创新(1); 国家(1); 基金(1); 大学(1); 大学生(1); 学生(1); 家(1); 新(1); 新苗(1); 暨(1); 江(1); 活动(1); 浙(1); 浙江(1); 浙江省(1); 省(1); 科学(1); 科学基金(1); 科技(1); 自然(1)

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毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定

[期刊] 浙江农林大学学报 [作者] 蒋政勤周明兵郑浩季航徐芷馨

长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照(30, 50, 70 Gy),甲基化抑制剂(50, 100, 150μmol·L-1),高温(42℃),低温(4℃),高盐(0.1, 0.2, 0.3 mol·L~(-1))等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测,PHRE7在INT, RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2～0.3 mol·L-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1～0.2 mol·L~(-1))的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。图7表2参42

关键词：植物学毛竹 LTR反转录转座子生物信息学逆境胁迫转录活性

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