[目的]探索欧拉型藏羊解偶联蛋白2(UCP2)和解偶联蛋白3(UCP3)基因的多态性及其与生长性状的关联性,为运用分子标记辅助育种方法提高欧拉型藏羊的生长性状提供理论依据。[方法]以239头成年欧拉型藏羊为试验对象,采用PCR产物直接测序技术检测UCP2和UCP3基因的遗传多态性,并将其与体质量、体高、体斜长和胸围生长性状进行关联性分析。[结果]在欧拉型藏羊UCP2基因上筛选出2个SNPs位点,分别为g.52130414C>T和g.52130584 G>A,其中g.52130414 C>T位点产生TT、CT和CC 3种基因型,g.52130584 G> A位点产生AA、AG和GG 3种基因型;在UCP3基因上筛选出1个SNP位点g.52157335 C>T,产生CC、CT和TT 3种基因型。基因多态性分析表明,3个SNPs位点均为错义突变位点,属于中度多态,且均符合Hard-Weinberg平衡适应性检验(P>0.05)。关联分析结果显示,UCP2基因g.52130414 C>T位点TT基因型欧拉型藏羊体质量显著高于CT基因型(PA位点AA基因型欧拉型藏羊体质量和体斜长均极显著高于AG和GG基因型(P<0.01),AA和GG基因型欧拉型藏羊胸围均显著高于AG基因型(PT位点CC基因型欧拉型藏羊体质量显著高于CT基因型(P<0.05),TT基因型欧拉型藏羊胸围显著高于CT基因型(P<0.05)。3个多态位点基因型组合分析发现,5个发生频率较高的双倍型中,D5型欧拉型藏羊体质量极显著高于D1、D2、D3型(P<0.01),体高显著高于D3型(P<0.05),体斜长显著高于D1、D3、D4型(P<0.05)且极显著高于D2型(P<0.01)。[结论]UCP2和UCP3基因多态性与欧拉型藏羊的部分生长性状显著相关,UCP2和UCP3基因可作为欧拉型藏羊生长性状选育的候选基因。D5双倍型为优势基因型,可在选育工作中优先考虑。

【目的】本文旨在分析偶联蛋白3(uncoupling protein 3, UCP3)和叉头转录因子1(Forkhead box O 1, FOXO1)基因的多态性及其合并基因型与早胜牛生长发育的相关性。【方法】采用DNA测序技术,检测419头早胜牛UCP3和FOXO1基因的多态位点,同时分析了单个多态位点不同基因型及合并基因型与早胜牛生长发育性状的关联性。【结果】在UCP3上检测到3个多态位点,分别命名为g.4439G>A,g.4899G>A和g.5575G>A,在FOXO1的3’侧翼区检测到1个突变,命名为g.92209C>T。关联性分析表明,g.4899G>A和g.92209C>T能够显著影响早胜牛的体重和胸围(P<0.01或P<0.05),优势基因型分别为GG和CC。通过合并基因型发现,组合基因型GG-GG-GG-CT的体重和胸围表现最佳,显著高于组合基因型GG-GA-GA-CC(P<0.01或P<0.05)。【结论】UCP3和FOXO1可能直接或间接影响早胜牛的生长发育,可尝试作为早胜牛分子标记辅助选择的候选基因。

【目的】探讨POU1F1基因的多态性与藏羊生长性状之间的关联性,寻找与藏羊生长性状相关的分子标记。【方法】利用DNA测序方法检测藏羊POU1F1基因的多态位点并对其进行基因分型,分析单一多态位点不同基因型及双倍型与藏羊生长性状的关联性。【结果】在POU1F1基因第4内含子上检测出1个多态位点g.14205G>A,在第5内含子上检测出2个多态位点g.15223G>A和g.15286A>G。关联性分析表明,g.14205G>A位点上AA基因型的体质量和体长分别极显著(P<0.01)和显著(PA位点上GG基因型

【目的】本研究旨在对西藏牦牛MyoD1基因多态性与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状进行关联性分析,以期获得对牦牛重要经济性状具有显著效应的遗传标记。【方法】本研究利用DNA池直接测序、PCR-RFLP与生物信息学技术,对西藏帕里(PL)、斯布(SB)、申扎(SZ)和类乌齐(LWQ)4个牦牛类群(品种)共148头个体的MyoD1基因内含子2及外显子3部分序列进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状的关联性。【结果】①西藏牦牛MyoD1基因外显子3上存在(C1710T)XmaI酶切位点,多态性检测均存在CC、CT和TT 3种基因型,T/C频率分别为:0.308/0.692、0.400/0.600、0.605/0.395和0.527/0.473,处于中度多态。②适合性检验表明,西藏4个牦牛类群MyoD1基因多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。③利用最小二乘拟合线性模型,对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围和体重)进行差异显著性检验,申扎牦牛该位点TT和CT基因型在生长性状上差异显著(P<0.05),CT基因型胸围均高于CC和TT基因型。【结论】可以将MyoD1上的C1710T基因座作为牦牛经济性状选育的一个重要遗传标记,用于育种改良。

【目的】探讨ADIPOQ遗传变异对绵羊生长性状的影响，找到与宁夏优质肉羊培育中生长性状相关的分子遗传标记，为宁夏优质肉羊的分子辅助育种的研究提供依据。【方法】首先利用液相捕获测序技术获得ADIPOQ在杜泊羊、滩羊和小尾寒羊中的变异位点，同时采集383只3个品种的不同杂交后代群体耳组织，采用飞行质谱技术对确定的SNPs位点进行基因分型检测，并使用Haploview软件对多态性位点进行连锁不平衡分析和构建单倍型，与绵羊初生和3月龄的生长性状进行关联分析。【结果】共筛选到7个SNPs位点，且7个位点在杂交后代群体中均表现出多态性，SNP1—SNP7位点的优势基因型分别为CC、GG、GG、CT、AG、GG和AA，优势等位基因分别为C、G、G、C、G、G和A。X~2检验发现，所有位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（除SNP7位点在所有个体中偏离了平衡）。SNP1（F_2代除外）、SNP4、SNP5和SNP6位点在各杂交后代及所有个体中均处于中度多态（0.25≤PIC<0.50），SNP2和SNP3在F_2代及SNP7在H1代群体中均处于中度多态（0.25≤PIC<0.50），而在其他群体中处于低度多态（PIC<0.25）。连锁不平衡分析发现，SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成了两处强连锁，均构建出3种单倍型，组合后分别形成4和6种基因型，其中优势基因型分别为H1H1和H4H6。将SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成的单倍型再组合后产生13种基因型，其优势基因型为H1H1H4H6。单个位点关联分析表明：SNP1位点在F_1代群体中，GG基因型的初生胸围显著高于CG基因型（P<0.05），在H2代群体中，CC基因型的初生体斜长显著高于CG基因型（P<0.05）。SNP2位点在H_1代群体中，CC基因型的初生体高显著低于CG和GG基因型（P<0.05）。SNP3位点在F_1代群体中，AG基因型的3月龄体重显著高于GG基因型（P<0.05），在H_1代群体中，AA基因型的初生体高显著低于AG和GG基因型（P<0.05）。SNP4位点在F_1代群体中，CC基因型的3月龄体重显著高于CT和TT基因型（P<0.05），在F_2代群体中，CT基因型的初生体重和初生胸围显著高于TT基因型（P<0.05），在H_1代群体中，TT基因型的初生体重显著低于CC和CT基因型（P<0.05），在H_2代群体中，TT基因型的初生体高和初生体斜长显著高于CT基因型（P<0.05）。SNP5位点在F_2代群体中，AA基因型的初生体高和初生体斜长显著高于GG基因型（P<0.05）。SNP6位点的不同基因型在F_2代、H_1代和H_2代的初生体重、体高、体斜长、3月龄体高和胸围上均有不同程度的显著差异（P<0.05）。SNP7位点在H2代群体中，AA基因型的初生体斜长显著高于GA基因型（P<0.05）。联合所有群体进行分析时发现，SNP2位点CG基因型的初生体重和体斜长显著高于GG基因型（P<0.05），SNP4位点TT基因型的初生体重显著低于CC和CT基因型（P<0.05），SNP6位点AA基因型的初生体重显著高于GG和GA基因型（P<0.05）、初生胸围显著高于GG基因型（P0.05）。单倍型组合关联分析发现：H2H3基因型的初生体重和初生体斜长显著高于其他基因型（P<0.05）；而SNP5-SNP6单倍型组合中，H5H5基因型的初生体重显著高于H5H6和H6H6（P<0.05）、初生体高显著高于H5H6（P<0.05）、初生胸围显著高于H6H6（P<0.05），H4H4基因型的3月龄体重显著高于H5H5基因型（P<0.05）、3月龄体高和体斜长显著高于H4H6基因型（P<0.05）、3月龄胸围显著高于H4H5、H5H6和H5H5基因型（P<0.05）。SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成的单倍型再组合后，H2H3H4H4基因型的初生体重、体高、体斜长和胸围最高，与其他基因型有不同程度的差异，H1H1H4H6的3月龄体斜长显著低于H1H2H4H4和H2H2H4H4基因型（P<0.05）。【结论】ADIPOQ的遗传变异对绵羊的生长性状具有不同程度的影响，研究中的7个SNPs位点可以作为宁夏优质肉羊选育中生长性状的潜在分子标记。

【目的】基于前期绵羊肉用性状ＧＷＡＳ研究结果，旨在探讨ＲＩＰＫ２基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响，找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记，同时对ＧＷＡＳ结果进行验证。【方法】在３４３只乌珠穆沁绵羊试验群体中，选取其中３０个个体的血液ＤＮＡ样本，以相同浓度组成池ＤＮＡ，设计引物对ＲＩＰＫ２基因外显子及其上下游１ ０００ｂＰ的调控区进行ＰＣＲ扩增，ＰＣＲ产物检测为目的条带后测序。使用ＤＮＡＭＡＮ和ＣｈＲｏＭＡＳ２软件对测序峰图进行分析，采用飞行质谱方法对检测到的ＳＮＰ位点及前期ＧＷＡＳ得到的ＳＮＰ位点进行基因型分型。使用ｈＡＰｌｏｖＩｅＷ软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用ＳＰＳＳ（２．．．

【目的】探究家兔血管生成素样蛋白4(angiopoietin-like protein 4,ANGPTL4)基因第6外显子内的多态性及其与家兔部分生长性状的关联性。【方法】采用PCR产物测序法检测家兔ANGPTL4基因外显子内的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并应用PCRRFLP酶切分型技术对3个家兔品种(天府黑兔、伊拉兔和新西兰兔)共495个群体样本进行酶切分型,分析SNPs与3个家兔品种部分生长性状的关联性。【结果】ANGPTL4基因第6外显子中共检测发现3个遗传变异位点(c.823 G>A为非同义突

为研究阿片黑皮质素前体（ＰＯＭＣ）在动物采食和能量平衡中的作用，采用ＤＮＡ测序技术，对关岭黄牛９２头个体的ＰＯＭＣ基因的多态性进行研究，并分析多态位点与关岭黄牛生长性状的相关性。结果表明：在扩增片段为８７０ ｂＰ的产物中，发现位点１３８，４３０，６４４，６６８ Ｃ→Ｔ突变，位点６９３ Ａ→Ｇ突变。多态性结果显示，除４３０ Ｃ→Ｔ突变位点处于哈代－温伯格不平衡状态（ＨＷＥ）（Ｐ０．０５），５个突变位点的多肽信息含量（ＰＩＣ）均为中度多态。相关性分析结果表明，６４４ Ｃ→Ｔ和６６８ Ｃ→Ｔ突变位点的不同基因型与关岭黄牛体斜长表现出差异性显著。

【目的】本文探讨了FTO基因多态性与不同绵羊群体生长性状的相关性。【方法】采用飞行质谱技术检测了FTO基因在杜泊羊和滩寒杂交群体中的多态性及其与生长性状的相关性。【结果】FTO基因的rs160915957位点的AA基因型个体体重在杜泊和滩寒绵羊群体中分别为极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)低于GG型个体。GG型绵羊胸围最大,且GG型杜泊羊胸围显著大于滩寒羊GG型个体(P0.05);不同基因型间,滩寒群体绵羊体高大于杜泊羊,但只有AA型个体在2个群体间显著差异(P0.05)。FTO基因的rs160

【目的】本研究旨在探讨SMPX基因在麦洼牦牛中的遗传多态性,并筛选其SNP位点,分析突变位点不同基因型与其生长性状的相关性,为牦牛优良性状定向选育提供依据。【方法】以89头健康成年的麦洼牦牛为试验材料,采用DNA混合池技术辅以直接测序法筛选候选基因的SNPs,同时利用SPSS 19.0软件对不同基因型与牦牛生长性状进行关联分析。【结果】在麦洼牦牛SMPX基因的3个外显子区域未发现突变位点,在启动子区域共检测到2个SNPs,分别为G532A和C1481G,多态信息含量(PIC)均属中度多态(0.25

关键词： 麦洼牦牛  SMPX基因  多态性  生长性状  关联分析