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[期刊] 中国农业科学
[作者]
冯霞 林春花 康迅 金洋 刘晓 何其光 刘文波 缪卫国 郑服丛
【目的】Pbs2是MAPK信号途径HOG-MAPK通路的重要成员之一,在植物病原菌渗透压调节方面发挥着重要作用。橡胶树白粉病菌(Oidium heveae)是专性寄生菌,论文借助橡胶树炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides),研究橡胶树白粉病菌OhPbs2的功能。【方法】采用同源克隆方法,分别以橡胶树白粉病菌基因组DNA和c DNA为模板,PCR扩增OhPbs2;利用生物信息学分析该基因的结构域,对该基因和其他真菌的7个同源蛋白序列进行系统进化分析,并利用MEGA6中最大简
[期刊] 中国农业科学
[作者]
安泽伟 谢黎黎 王其同 李雅超 程汉 胡彦师 黄华孙
【目的】克隆橡胶树转录因子HbERF1,分析其在橡胶树中响应非生物胁迫的表达模式,并通过在拟南芥中过表达鉴定其生物学功能,为橡胶树抗逆育种提供基因储备。【方法】利用RACE技术从巴西橡胶树中克隆到HbERF1全长序列,通过qRT-PCR技术分析其在非生物胁迫下的时空表达特性;通过农杆菌介导法转化拟南芥,利用Southern杂交和qRT-PCR技术对过表达植株进行鉴定,并分析过表达植株在干旱、高盐和PEG等胁迫条件下的表型及相关基因的表达特性,验证HbERF1的生物学功能。【结果】橡胶树转录因子HbERF1没有内含子,GenBank登录号为JQ914647,cDNA序列全长为1 178 bp,包...
关键词:
巴西橡胶树 转录因子 非生物胁迫 ERF
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘文波 秦春秀 薛文华 梁鹏 邬国良 林春花 缪卫国 郑服丛
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
康桂娟 黎瑜 曾日中
利用RT–PCR和实时荧光定量PCR技术,对巴西橡胶树膜结合转录因子Hb NTL2进行克隆和表达,并通过酵母试验进行转录激活功能分析。结果表明,Hb NTL2基因的开放阅读框为1 380 bp,编码一个由459个氨基酸组成的蛋白,该蛋白属于NAC转录因子家族中的ANAC001亚族;在第6~172位氨基酸之间含有典型的NAC结构域,第433~453位氨基酸具有跨膜结构域,是膜结合NAC转录因子;Hb NTL2具有转录激活功能,转录激活区在C–末端;Hb NTL2在叶片的表达高于在橡胶树的其他部位,受割胶、茉莉酸(JA)和乙烯(ET)处理以及低温胁迫诱导。综合分析结果表明,Hb NTL2可能参与调...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王岳坤 阳江华 丁丽 黄红海 桂红星
【目的】克隆橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的全长cDNA,通过生物信息学和基因表达分析,为基因功能研究奠定基础。【方法】根据橡胶树PEPC基因片段序列设计引物,通过RACE获得cDNA全长,用DNAMAN软件预测编码多肽序列,用Prot Param工具分析多肽基本理化性质,用NCBI-Blast工具搜索同源的核酸及多肽序列,用Clustal X2.0软件比对不同植物来源的多肽序列,并用MEGA 6.06软件构建系统进化树,用Real-time RT-PCR分析基因表达模式。【结果】从橡胶树胶
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
聂智毅 黎瑜 康桂娟 蔡海滨 曾日中
依据橡胶树胶乳转录组数据,利用RT–PCR技术鉴定了一个快速碱化因子(rapid alkalinization factor,RALF)家族基因cDNA序列。该cDNA长度为767 bp,开放阅读框长度为411 bp,编码136个氨基酸。序列比对显示该RALF基因与AtRALF34有较高相似性,因而命名为HbRALF34。以热研7–33–97无性系橡胶树为材料,采用实时荧光定量PCR对不同组织及乙烯、茉莉酸、伤害、过氧化氢、高盐、低温、干旱等处理下HbRALF34的表达模式进行分析。结果表明:HbRALF
[期刊] 西南农业学报
[作者]
叶劲秋 刘文波 林春花 郑服丛 缪卫国
【目的】本研究拟通过神经网络建模来预测橡胶树白粉病病害流行趋势。【方法】采用人类专家综合利用传统经验方法预报病害的相关经验数据作为神经网络的样本,选用误差反向传播神经网络结构,以Adam算法为训练算法,成功训练得到了橡胶树白粉病神经网络预测模型。【结果】其拟合优度达88.11%,田间试验验证的实际符合率为87.88%。【结论】本研究建立的橡胶树白粉病神经网络预测模型在提供防治建议上已具备与橡胶树白粉病专家相当的水平。研究结果为进一步结合互联网通信技术和数据库管理技术,以训练完成的神经网络模型作为预测算法,建立橡胶树白粉病预测预报专家系统、实现橡胶树白粉病害预测预报流程的自动化和智能化奠定了基础。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
曹新文 王秀珍 李永梅 赵李婧 马海霞 闫洁
【目的】法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,fps)是天然橡胶生物合成的甲羟戊酸途径中的关键酶,获得橡胶草fps基因并转化野生橡胶草,为研究fps基因在橡胶草橡胶生物合成过程中的调控作用奠定基础。【方法】采用同源克隆的方法获得橡胶草fps基因全长c dna序列,并对该基因进行生物信息学分析。对橡胶草和其他18种不同高等植物的fps氨基酸序列进行多序列比对及进化树分析。提取橡胶草不同组织:根、叶柄、叶、花梗、花和种子rna,对fps基因进行组织特异性表达分析,并对不同生长时期的橡胶草fps表达量进行比较,分析橡胶草生长过程中fps的调节作用。将该基因在野...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘建汀 谢贵水 莫业勇 杨礼富 邹智
采用RT-PCR技术从橡胶树的叶片中分离到一条852 bp的c DNA,该序列包含一个798 bp的开放读码框(ORF),21 bp的5’UTR和33 bp的3’UTR;ORF预测编码265个氨基酸,理论分子量为28.64 k Da,等电点为5.55,属于叶绿体定位的类囊体膜蛋白;蛋白含有1个保守的叶绿素结合结构域,3个跨膜螺旋和2个C端螺旋,1个三聚化基序,以及多个叶绿素和类胡萝卜素结合位点,隶属于LHCB1亚家族;蛋白与蓖麻(Ricinus communis)、葡萄(Vitis vinifera)和棉花(Gossypium hirsutum)中同源蛋白的相似性都在95%以上,显示出高度的保...
关键词:
橡胶树 叶绿素结合蛋白 Lhcb2亚家族
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘辉 韦永选 邓治 代龙军 杨洪 李德军
为阐明巴西橡胶树WRKY转录因子基因Hb WRKY41的分子特征及表达特性,利用RT-PCR方法从巴西橡胶树中克隆了该基因。Hb WRKY41开放阅读框1 020 bp,编码339个氨基酸,预测蛋白分子量为38.48 k Da,理论等电点为5.52。Hb WRKY41含有1个WRKY保守结构域和1个C_2HC型锌指结构,与蓖麻、棉花、大豆及拟南芥WRKY41蛋白聚为一类,属于Ⅲ类WRKY转录因子家族成员。实时荧光定量PCR检测结果表明,Hb WRKY41在巴西橡胶树根、树皮、胶乳、叶和花等组织中均有表达,
[期刊] 中国农业科学
[作者]
范玉洁 林飞鹏 安泽伟 唐朝荣
【目的】从橡胶树中克隆Glutathione-S-transferase(GST)基因的cDNA和基因组DNA,进行序列、结构和系统进化分析,研究胁迫条件和激素处理下的表达谱。【方法】利用产排胶机理课题组构建的胶乳EST数据库,通过PCR技术克隆橡胶树GST基因的cDNA和基因组DNA;在线预测蛋白质保守功能域和亚细胞定位,构建系统进化树,利用实时荧光定量PCR分析割胶、伤害、低温、激素和死皮病等因素对该基因表达的影响。【结果】从橡胶树胶乳中克隆到1个GST基因的全长cDNA(793 bp),编码25.4 kD(219aa)蛋白,命名为HbGSTU1;克隆了HbGSTU1的基因组DNA(1 3...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
邹智 杨礼富
半胱氨酸蛋白酶是一类重要蛋白水解酶,其广泛参与植物的生长发育及各种生物与非生物胁迫的应答。根据EST序列信息设计引物,从橡胶树的根中分离到1条1 056 bp的c DNA。该序列包含1个1 023 bp的开放阅读框(ORF),13 bp的5'UTR和20 bp的3'UTR。ORF预测编码340个氨基酸,相对分子质量为37 350,等电点为5.24,属于液泡定位的分泌型蛋白。该蛋白含有1个Inhibitor_I29和1个Peptidase_C1A结构域,可归为木瓜蛋白酶C1家族。该蛋白与蓖麻(Ricinus communis)和杨树(Populus trichocarpa)中同源蛋白的相似性都在...
关键词:
橡胶树 半胱氨酸蛋白酶 根特异性表达
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘静 李国华 周明 许丽月 肖春云
对橡胶树白粉菌分生孢子在不同温度、pH值、光照、湿度和碳源条件下的萌发率进行了研究。结果表明,分生孢子萌发的适宜温度范围为23~28℃,最适温度25℃;适宜的pH范围为6~8;在连续黑暗的条件下分生孢子萌发率最高;不同的湿度对分生孢子的萌发的影响无明显差异;分生孢子在麦芽糖中萌发率最低。在保湿和自然条件下,测定白粉菌分生孢子在4、10、20、23、28℃存活时间,结果表明,保湿条件下白粉菌孢子存活时间较自然条件下长,温度对孢子存活时间有很大影响,4℃下白粉菌分生孢子9 d后还有存活的孢子,而28℃下白粉菌分生孢子6 d后就全部死亡。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
吴春太 苏运 魏孝民 李维国 黄华孙
对由中国热带农业科学院橡胶所选育的5个主栽品种和3个幼态无性系的叶绿素含量、光合速率和白粉病抗性等进行比较。结果表明,除热研7–20–59外,其余材料间叶绿素a含量、叶绿素b含量、总叶绿素含量、类胡萝卜素含量和叶绿体色素含量差异不显著,叶绿素总含量与光合速率呈显著正相关,与SPAD值无显著相关,其中叶绿素a含量与光合速率和白粉病抗性均呈显著负相关。
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