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[期刊] 西南农业学报
[作者]
周晓罡 丁玉梅 张绍松 孙茂林 李建平
应用SignalP 3.0、TMHMM 2.0、THUMBUP、big-PI、TargetP1.01、Lipop 1.0、TatP 1.0等7种软件对植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000染色体基因组3448个氨基酸序列进行预测分析。结果表明,该物种染色体基因组分泌信号肽ORFs有178个,占其基因组编码ORFs的5.2%,其中有150个ORFs属于Ⅰ型分泌信号肽,28个ORFs属于Ⅱ型分泌信号肽。在178个ORFs中具RR-motif信号肽结构的有13个,其中11个属于Ⅰ型信号肽,2个属于Ⅱ型信号肽。通过软件预测未发现Comc型信号肽与细菌素-信息素型信号肽...
[期刊] 华北农学报
[作者]
陶晡 刘彬 司贺龙 赵斌 邢继红 董金皋
hrp基因是植物病原细菌中一类重要的致病基因,一般成簇排列。对14种已完成全基因组测序的植物病原细菌基因组中的hrp基因簇进行了大小、G+C含量、基因组成的BlastP比较。发现它们的大小在18～24 kb,由22～28个基因组成。欧文氏菌属和假单胞菌属的菌株中G+C含量较低,拉尔氏菌属和黄单胞菌属菌株的G+C含量较高。而且,各菌属的基因簇都有其独有的hrp基因,如假单胞菌属是hrpK1、hrpV、hrpA;欧文氏菌属是hrpT、hrpV、hrpA;拉尔氏菌属是hrpZ、hrpX、hrpY、hrpV;黄单胞菌属是hrpE、hrpD6、hpaA。其中,基因hrpA1、hrpA、hrpY和hrpE...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨俊誉 张志超 韩永花 李婕 张彧 黄琼
应用计算机技术和生物信息学的方法，采用Ｓｉｇｎａｌ Ｐ４．０、ｌｉＰｏ Ｐ１．０、ＴａｒｇｅＴ Ｐ１．０．１、ＴＭＨＭＭ２．０蛋白质分析软件对植物病原细菌ｒａｌＳＴｏｎｉａ ＳｏｌａｎａｃｅａｒｕＭ Ｐｏ８２质粒基因组的１６８０个ｏｒＦＳ编码的分泌蛋白信号肽氨基酸序列进行预测分析。结果表明，质粒基因组的１６８０个ｏｒＦＳ中有１０２个ｏｒＦＳ所编码的蛋白质具有ｎ－端信号肽序列，包括８５个Ⅰ型信号肽，１个Ⅱ型信号肽，１５个ＰｒｅＰｉｌｉｎ－ｌｉｋｅ信号肽和１个细菌素和信息素信号肽，所有的分泌蛋白中具有ｒｒ－ＭｏＴｉＦ信号肽结构的有１４个，且均为Ⅰ型信号肽。在１０２个具有可切割信号肽的分泌蛋白中，有．．．
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
涂立超 成国英 于大胜 杨国桂
对盆栽水稻采用针刺、喷雾、盆水等不同方法接种水稻细菌性条斑病病菌后 ,检测稻株发病和盆水中的噬菌体 ,结果表明 :未接种稻细条病菌的处理中 ,无稻株发病 ,盆水中也未测到噬菌体 ;3种接种处理均可引致稻株发病 ,并先后在其盆水中检测到噬菌体 ,说明噬菌体与致病菌有密切的伴随关系。在采用叶面喷雾和盆水接种稻白叶枯自然组合菌株B 1和单细胞系菌株Ⅳ 16试验中 ,B 1处理后能引起稻株发病 ,且在盆水中测到噬菌体 ;而Ⅳ 16处理后虽引起稻株发病 ,但盆水中无噬菌体 ,结果表明 :在人工接种条件下植物病原细菌噬菌体是由病菌中的溶原细胞传带而来的
关键词：
水稻 病原细菌 噬菌体
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
管雨 杨洋 张智俊 罗淑萍 汤定钦
从毛竹Phyllostachys pubescens幼嫩叶片中提取纯化得到高质量的基因组DNA,经限制性内切酶BamH I对它们进行梯度酶切,脉冲场电泳选择合适酶切DNA片段,与脱磷酸化处理过的质粒载体pCLD04541按质量比3∶1相互连接,转化大肠杆菌Escherichia coli DH10B感受态细胞进行蓝白斑筛选,挑取白色克隆,获得重组率较高的阳性克隆,构建了含有104个克隆的双元细菌人工染色体(BIBAC)基因组文库,并通过脉冲场电泳检测分析后确定,所构建的毛竹BIBAC文库平均插入片段为105 kb,约覆盖5倍毛竹基因组。该文库的构建为毛竹基因组研究做好了前期的基础工作。
[期刊] 华北农学报
[作者]
邢苗苗 田多成 李海龙 姚丽君 冀瑞琴 康俊根
细菌人工染色体(BAC)文库是克隆甘蓝抗病优质重要基因的基础,以抗枯萎病、富含硫代葡萄糖苷的结球甘蓝自交系R4P1为材料,美国Epicentre公司的CopyControlTMpCC1BACTM为载体,构建了甘蓝细菌人工染色体文库。该文库有73 344个克隆,插入片段平均大小约97 kb,空载率<3%,覆盖甘蓝基因组约10.9倍,筛选到甘蓝任一基因的概率为99.99%,这些结果表明,构建的文库质量较好,可用于后续分析。构建的甘蓝BAC文库不仅可用于枯萎病基因的克隆,而且为克隆其他重要的功能基因及基因组学等的研究奠定了基础。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
耿波 关云涛 孙效文
为了开展鲤基因组研究,深入研究遗传连锁图谱遗传标记的定位及数量性状的定位和克隆,并最终为分子育种提供服务,本实验构建了鲤的BAC基因组文库。通过采集黑龙江野鲤(Cyprinus caxpio haematopterus)全血细胞制备琼脂糖凝胶包埋块的方法获得了高分子量(HMW)DNA。通过BamHⅠ部分酶切和PFGE电泳分离选择获得100～300kb的DNA片段,用电洗脱和透析的方法对产物进行浓缩和纯化。纯化的HMWDNA连接到大小为7.2kb的克隆载体pEZBAC上。为了评估构建的文库的质量使用一系列引物对文库进行了验证。本研究首次构建黑龙江野鲤的BAC文库,该库含有46656个克隆,插入片...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨佩文 文孟良 李元广 番华彩 郭志祥 金桂梅 刘树芳 曾莉
在开展云南山地香蕉根际和内生真菌分离及其次生代谢产物生物活性筛选过程中,获得一株对香蕉枯萎病菌具有强拮抗作用的真菌(Cordana musae,AGR0073)。分别用乙酸乙酯和石油醚对菌株发酵液进行活性物质的提取分离,并分别通过正相硅胶柱层析、反相C18硅胶柱层析、凝胶(Sephadex LH-20)柱层析和制备HPLC纯化,从菌株发酵液中分离获得具有抗真菌活性的化合物FM 9-1。通过1H-NMR和13C-NMR波谱分析以及结合相关文献对比,将该化合物鉴定为单端孢菌素(Trichothecin,TCN),这是首次从Cordana musae代谢产物中分离出该化合物。抑菌活性测定表明,化合物...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李勇军 李宏光 E.Schliephake H.Budahn 朋金娥 刘春明 张绍松
根结线虫是许多农作物的重要病原,在农业生产中常极大地降低农作物的产量和质量。本研究中选用了7种不同染料,分别对侵入寄主根系组织初期的J2幼虫、雌虫产生的卵块团、雌虫尾部会阴花纹、及鉴别J2幼虫的死虫与活虫的染色方法进行了探索,这些方法便于有效了解和识别病原在侵染寄主不同阶段的形态。试验结果表明,溴酚蓝溶液对侵入根系的J2幼虫具有良好的染色效果;对于根系上的卵块团与雌虫的会阴花纹,cochenille red A或phloxine B溶液的染色效果较清晰;用甲基蓝与吖啶橙溶液分别对J2幼虫染色后,可相应地在可见光和荧光显微镜下判别J2幼虫中的死虫。
关键词：
根结线虫 染料 染色 方法
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
徐菱菱 王丽 陈龙男 谢福莉 李友国
采用形态观察、16S rDNA序列和部分特异基因排列分析鉴定从植物根际土壤中分离的1株根际细菌HNA3;采用平板对峙试验和抑菌率计算方法测定其对供试植物病原真菌的拮抗谱和拮抗能力;通过摇瓶发酵和酸沉淀方法研究相关抗菌活性物质的产生条件及其分离方法;采用表面活性检测和有关功能编码基因的序列分析初步鉴定抗菌活性物质成分的性质。结果表明:HNA3菌株为1种解淀粉芽孢杆菌Bacillus amyloliquefa-ciens;BPY(牛肉膏蛋白胨酵母粉)培养基是适合HNA3生长和产生相关抗菌活性物质的适宜培养基;活性物质存在于发酵除菌液中,可通过酸沉淀方法分离获得。活性物质具有较高的稳定性和抗逆性,属...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李红霞 陆悦健 王建新 周明国
克隆了小麦赤霉病菌 (Fusariumgraminearum)、油菜菌核病菌 (Sclerotiniasclerotiorum )、辣椒炭疽病菌 (Col letotrichumgloeosporiodies)和番茄灰霉病菌 (Botrytiscinerea) 4种病原菌的 9个菌株的 β 微管蛋白基因 ,进而与典型模式菌粗糙麦孢霉 (Neurosporacrassa)进行序列比较。结果表明 ,4种病原真菌 β 微管蛋白序列与粗糙麦孢霉具高度同源性 ;油菜菌核病菌、辣椒炭疽病菌和番茄灰霉病菌的 β 微管蛋白 198位氨基酸由Glu突变为Ala ,是导致上述病原菌产生对多菌灵 (MBC)抗药性的...
关键词：
植物病原真菌 多菌灵 抗药性 突变
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
郑明慧
肠杆菌科细菌在自然界普遍存在,分布于空气、水、土壤、人体、动物、植物中。可存在于人体,引起肺炎、脓毒症、菌血症等疾病,是人体的条件致病菌;可存在于昆虫体内,侵染并杀死昆虫;还可侵染植物,引起杨树溃疡病、梨火疫病、榆树湿心病等。此外,肠杆菌科还可作为生物农药、固氮微生物等,对植物代谢、植物生长、有害生物防治等起着积极作用。因此,对肠杆菌科细菌的研究有着重要意义。肠杆菌科菊迪卡氏菌(Dickeya chrysanthemi)、解淀粉欧文氏菌(Erwinia amylovora)等细菌可以侵染蝴蝶兰、海棠、梨树
关键词：
肠杆菌科 系统进化 多项分类 入境 截获
[期刊] 中国农业科学
[作者]
周莲 王杏雨 何亚文
群体感应是微生物之间相互交流的一种重要联络方式,它协助细菌能感应群体密度从而调节基因表达。20世纪80年代以来,多种群体感应信号及其传导机制得以阐明。DSF(diffusible signal factor)是近年来在野油菜黄单胞菌中首先鉴定的1个新型群体感应信号,化学结构为顺式11甲基2十二碳烯酸,其信号传导途径包括RpfC/RpfG双组分感应系统、二级信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)、全局性转录因子Clp等。在野油菜黄单胞菌中,DSF群体感应信号调控3类生物学功能:一是促进致病相关基因的表达;二是抑制生物膜形成;三是促进黄单胞菌作出代谢调整,适应高群体密度环境。RpfF是DSF信号生物合...
关键词：
黄单胞菌 群体感应 DSF
[期刊] 华北农学报
[作者]
欧阳乐军 黄真池 沙月娥 陈良 谢先荣 曾富华
N-酰基高丝氨酸内酯是革兰氏阴性细菌致病过程中的关键信号分子,芽孢杆菌中广泛存在的aiiA基因编码AHL-Lactonase能够水解信号分子AHLs。研究利用PCR方法从枯草芽孢杆菌中克隆了aiiA基因,序列分析表明,该基因由753个碱基组成,编码含有250个氨基酸残基的蛋白质,核苷酸序列与已报道aiiA的同源性为87%～96%。将该基因置于诱导型启动子PPP3调控下,连接到植物表达载体pCAMBIA1301中,成功构建了aiiA基因的植物诱导表达载体pCAM-PPP3-aiiA,为进一步通过转基因技术研究该基因的功能奠定了基础。
[期刊] 华北农学报
[作者]
武予清 韩松 李素娟 刘爱芝 常洪雷 刘玉霞 顾一民
用棉籽饼的用甲醇提取液(以棉籽饼与70%甲醇1∶1提取),对9种植物病原菌进行了室内抑菌作用测定,其中,对苹果轮纹病病菌和苹果炭疽病菌较好,10倍的浓度48 h分别达到63.27%和61.07%;对黄瓜灰霉病菌和小麦赤霉病菌10倍的浓度72 h分别达到71.70%和66.67%。色谱分析及显色反应表明,其主要成分为槲皮素及其糖苷和缩合单宁,提取液中总黄酮类化合物的含量为1.48 mg/mL。
关键词：
棉籽饼 提取液,抑菌作用 化学成分
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