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[期刊] 中国农业科学
[作者]
王庭璋 胡望雄 徐建红 薛庆中
基因组中约有20%的基因具有上游开放阅读框(upstream open reading frame,uORF),它位于成熟mRNA 5'端非编码区(5'-UTR)。本文简介了uORF同源群的挖掘方法、分类和进化,以及调控下游mORF翻译的研究进展。植物(拟南芥和水稻等)和昆虫(果蝇等)基因组中普遍存在保守肽uORFs,并且在序列多样性方面有相似之处。但它们在平均长度、基因组聚类、与甲基转移酶的关联性上有所不同。植物uORF的长度通常短于昆虫uORF。借助拟南芥和水稻全长cDNA序列比较,不同的uORF同源群对其下游如转录因子,信号转导因子、发育信号分子和翻译起始因子eIF5等编码基因的mORF...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
纪燕玲 韩魁 茅冬梅 陈永敢 王志伟
[目的]Epichlo?内生真菌能够产生抵御牲畜和害虫啃食的生物碱,其中部分生物碱由非核糖体肽合成酶(non-ribosomal peptide synthetase,NRPS)合成。本研究拟分析E. festucae基因组内的NRPS编码基因,并预测其功能。[方法]以E. festucae E2368菌株基因组数据为对象,综合运用HMMER和全局比对等分析方法以及ClustScan、NRPS/PKS analysis和NCBI等数据库进行信息比对。[结果]确认了E2368基因组中含有至少19个候选NRPS基因,其中11个未在Epichlo?内生真菌中报道。序列比对结果表明候选基因均为真菌中已报道的序列,但其中8个基因的功能未知;同时E2368基因组中存在环孢菌素合成酶基因扩增现象。构建候选NRPS基因所有A结构域氨基酸序列发育树,发现不同NRPS基因的A结构域会聚到同一分枝,而相同NRPS基因的A结构域则分散于不同分枝,说明采用简并引物扩增NRPS基因存在一定的局限性。[结论]对E2368基因组中NRPS基因的挖掘,将有助于解析NRPS基因的多样性,促进对新的天然产物的发现和生物合成途径的认识。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
贾继增 黎裕
种质资源是基因的载体,如何从种质资源中发掘出新的目标基因是21世纪植物育种所面临的最大挑战之一。近年来,随着植物基因组学的迅猛发展,新的基因发掘方法和技术不断涌现,新基因发掘也产生了各种新的思路和策略。笔者在回顾基因发掘历史的基础上,对中国的新基因发掘现状和问题进行了分析,并针对各种基因发掘方法和策略进行了评述,提出了开展新基因发掘的发展方向。
关键词:
基因组学 种质资源 基因发掘
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
王莉 张艳霞 史玲玲 刘玉军
植物次生代谢是植物在长期进化过程中与环境相互作用的结果,由初生代谢派生.萜类、生物碱类、苯丙烷类为植物次生代谢物的主要类型,其代谢途径多以代谢频道形式存在,具有种属、生长发育期等特异性.该文从植物次生代谢物的分类、代谢途径及代谢调控基因工程等方面展开论述,介绍了次生代谢物的生物合成途径,以及利用基因工程等技术对植物次生代谢途径进行遗传改良等方面的研究进展,为全面认识植物代谢网络、合理定位次生代谢及其关键酶、促进野生植物资源可持续利用等提供理论依据.
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
梁玉琴 李芳东 傅建敏 乌云塔娜 吴硕
针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试剂盒较改良CTAB法提取的DNA质量高、杂质少,DNA得率略低,但其操作步骤简单,耗时短,毒害小,因其费用较改良CTAB法高,各实验室可根据自身条件选择适宜方法提取柿属植物DNA。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
陈韬 苏建明 章怀云 文祝友 何燕林 戴振炎
为克隆artemin基因上游调控序列,探明该基因表达的调控机理,分别用4种不同的具有平末端的限制性内切酶消化卤虫基因组DNA,然后与DNA接头连接,构建成无载体连接的卤虫GenomeWalkerDNA文库.利用基因组步行法,经2轮TD-PCR扩增出长度约750bp的artemin基因上游调控序列片段,扩增产物测序后得到2个长度分别为209bp和210bp的序列.序列分析表明:在3′-末端片段中,存在转录起始位点"TTATTT",TATA框位于-32~-38,CAAT框则位于-75~-78.此外,在这两个片段中还存在一些潜在的TFIIB识别元件,GC盒,AT富含元件,这些元件对于该基因的转录具有...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
尹伟伦 刘玉军 刘强
木本植物在转向生殖生长之前需要一段较长时间的营养生长 ,这一特点不利于对其进行遗传分析 .然而 ,随着分析手段的不断提高和建立在木本植物生物学特性基础上的基因定位方法的开发利用 ,发达国家木本植物基因组连锁图谱制作已全面启动 ,并正朝着连锁图谱应用及基因组基因构造分析的方向推进 .国内有关木本植物基因组研究尚未全面启动 ,这与我国日益增强的综合国力及整个领域的国际发展态势极不相称 .目前机遇和挑战并存 ,相关研究领域的学者应把握时机 ,选准目标 ,尽快开展木本植物基因组连锁图谱制作、应用及基因组基因构造分析方面的研究
关键词:
木本植物 基因组 连锁图谱
[期刊] 图书馆
[作者]
韩曾丽 田蓁子
红色家书中展现的革命信仰、家国情怀、民族精神生动描绘了共产党人的璀璨精神图谱。红色家书中关于共产党人和进步人士在不同时期、不同环境下有关阅读价值、阅读内容、阅读书目、阅读方法、阅读计划、阅读评价的论述,形成了系统的阅读思想。文章深入挖掘红色家书资源,整理、组织、统计红色家书中的阅读相关史料,以“为什么读、读什么、怎么读、读后的认知”这一阅读过程,分析红色家书中蕴含的阅读思想,指出要从个人、学校、社会三个层面探索红色家书中阅读思想的新时代内涵,激励当代人从历久弥新的阅读文化中树立正确的阅读观念,为学校的阅读推广、阅读教学、思政教育提供思路,促进全民阅读的深入推进。
[期刊] 世界农业
[作者]
陶文静 刘大钧
DNA指纹技术是1985年在人体遗传研究中发展起来的一种先进的遗传标记方法,它很快地在动物、植物、微生物上得到广泛的应用。随着DNA指纹技术的广泛采用,许多新的DNA指纹技术不断涌现。然而,这些技术基本上是在两个不同的基础上发展起来的,其一是基于经典...
[期刊] 情报理论与实践
[作者]
李珂 陈彦如 郑文蛟 化柏林
[目的/意义]为了解决互联网时代信息过载的问题,尝试从海量的新闻报道中自动抽取新闻事件,并按照事件发生的时间进行排序,向用户展示结果。[方法/过程]利用网络爬虫自动获取新闻文本,使用中心事件句判定和RoBERTa+MRC的方法进行实体抽取,从非结构化文本中抽取语义信息并生成结构化的新闻摘要。在此基础上,对摘要中的时间信息进行标准化处理,并按照时间顺序生成新闻时间线。[结果/结论]实验结果表明,中心事件句判定和RoBERTa+MRC相较于传统方法有更好的事件抽取效果,本文设计的新闻时间线展示系统能够帮助用户了解新闻事件的发展脉络,解释新闻主题的事件走向与演化规律。
[期刊] 图书馆论坛
[作者]
刘军
利用数据挖掘技术对图书馆文献管理集成系统数据库进行深度挖掘,研究读者阅读需求偏好特点,是图书馆实现个性化服务的一个重要环节和基础性工作,既拓展了图书馆的服务领域,也是图书馆的发展趋势。在实际挖掘中采用C4.5决策树算法具有更好的算法效率、准确率和鲁棒性。
关键词:
数据挖掘 决策树 阅读需求偏好
[期刊] 情报科学
[作者]
周群
【目的/意义】图书馆纸电阅读推广,深入挖掘读者数据,有利于图书馆图书馆实现全民阅读文化推广活动。【方法/过程】图书馆为适应新媒体时代读者阅读方式的转换,构建纸电阅读同步推广系统,应用先进网络技术挖掘与关联图书馆读者纸电图书阅读数据与网络阅读社区读者阅读数据,分析读者爱好,推送图书书目,深化阅读推广。【结果/结论】图书馆应用该系统推广阅读,实现全民阅读的互动性、个性化和成效性。
关键词:
全民阅读 纸电图书阅读 图书馆 数据挖掘
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
李建运 姚国琼 王飞 朱文 李子涵 孙正海 辛培尧
【目的】多巴双加氧酶(4,5-DOPA dioxygenase extradiol)是甜菜色素生物合成途径的关键酶之一,能催化多巴分解形成甜菜醛氨酸,也是最可能与三角梅最终的花色形成相关的酶蛋白。克隆三角梅多巴双加氧酶基因的开放阅读框(ORF),对其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析,探讨三角梅花色变化机理和甜菜色素代谢途径。【方法】以三角梅品种‘绿叶樱花’的苞片为材料,提取其RNA,并进行逆转录,之后快速转化完成基因的克隆和基因PCR扩增,最后对其编码的氨基酸序列进行保守区预测、信号肽分析、磷酸化位点预测、跨膜信号预测、同源性比对、构建系统进化树以及二、三级结构预测,研究其氨基酸序列的结构和功能。【结果】‘绿叶樱花’的多巴双加氧酶基因ORF序列长801 bp,编码266个氨基酸。ORF序列所编码的氨基酸序列具有cd07363保守结构域,其编码蛋白是一种稳定的酸性亲水蛋白,分子量为29 734.76 kD,等电点为6.26,二级结构包含了11个α螺旋、7个β转角、20个β折叠结构,具有4个磷酸化位点,没有跨膜结构,可能只在细胞质内发挥作用。该序列还与66个序列高度同源,与同科的‘金心双色’、胶果木和梭房叶子花有着相同的进化分支,符合自然进化规律。【结论】‘绿叶樱花’多巴双加氧酶开放阅读框ORF的氨基酸序列属于第三类雌二醇双加氧基因家族,具有该基因家族具有的保守氨基酸序列,表明多巴双加氧酶基因在生成甜菜色素植物中具有独特的保守性,且属于稳定、酸性的亲水蛋白,没有跨膜结构,可能只在细胞质内发挥作用。三角梅中控制花色变化的主要是甜菜色素,研究三角梅甜菜色素合成途径中的关键酶,解析其甜菜色素的合成代谢机制,可为三角梅花色形成机制提供理论参考,有望在今后的工作中,利用转基因手段丰富三角梅花色。
[期刊] 税务研究
[作者]
赵世忠
随着科学技术的快速发展,国内外在科技领域的交流与协作逐渐增多,大量先进技术被引人国内,人们开始重视起科技英语翻译工作的重要性。在当前的科技英语内容中,涉及到的领域较多,如医学、化学、计算机、机械等。许卉艳和刘秀梅编著的《科技英语阅读与翻译》(知识产权出版社)作为高等院校英语专业教材,有助于打造科技英语阅读与翻译教学的新思路。该书的两位作者均具有多年的科技英语研究和教学经验。该书的出版,给高校专业英语教学带来了全新的教
[期刊] 草业科学
[作者]
王丹 周美亮 李金博 孙占敏 吴燕民
CRISPR/Cas9系统作为新一代基因组编辑技术,一经问世就受到广泛关注。CRISPR/Cas9系统具有对特定基因位点进行精确修饰(包括敲除、插入、替换等)的强大功能,同时具有操作简单、效率高、适应性广等技术优势,目前已在微生物、植物、动物以及人类基因治疗等整个生命科学领域得到应用。本文简要介绍了CRISPR/Cas9技术的发展历程、作用机理、技术优势、功能及应用领域,总结该技术在植物领域的基因组定向编辑中的研究进展。并提出了这项技术在草类植物基因功能分析、基因代谢调控途径与遗传改良等方面的应用前景,为
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