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[期刊] 华北农学报
[作者]
孙文英 张玉星 李秀根 王龙
遗传图谱是数量性状基因定位、基因图位克隆及分子辅助育种等研究的基础,而目前国内在梨树上这方面的研究尚属空白。试验以早美酥×八月红的杂交F192株实生苗为作图群体,采用了扩增稳定、多态性丰富的16对MseⅠ/EcoRⅠ引物组合,对分离群体进行AFLP多态性检测,共获得208条多态性带,其中偏离孟德尔遗传的比率29.8%(P
关键词:
梨 分子连锁图谱 AFLP
[期刊] 华北农学报
[作者]
崔江慧 薛薇 段西飞 王静华 常金华
利用感蚜高粱品种千三与抗蚜品种河农16杂交获得的100个F2单株作为图谱构建群体,以AFLP标记构建高粱连锁图谱。通过对192对AFLP引物组合进行筛选,共得到75对多态性引物,利用筛选出的75对引物进行选择性扩增,得到了154个AFLP多态性位点。经Map maker/EXP 3.0软件处理,构建了包含12个连锁群,93个遗传标记的连锁图谱,该图谱覆盖686 cM,平均图距为7.38 cM。
关键词:
高粱 连锁图谱 AFLP标记
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
石悦 于肖夏 于卓 杨东升 姜超 张明飞
【目的】对高丹草低氢氰酸含量及产量等重要性状进行QTL定位,构建其AFLP分子遗传连锁图谱,为分子标记辅助育种等研究奠定基础。【方法】以散穗高粱×红壳苏丹草杂种F2代305个分离单株为作图群体,利用AFLP分子标记技术先从供试AFLP引物中筛选适宜引物对,再用这些引物对对其供测群体进行PCR扩增;根据扩增原始数据,利用Join Map 3.0作图软件进行高丹草分子遗传连锁图谱构建。【结果】从113对AFLP引物组合中筛选出了25对多态性丰富、重复性好、条带清晰的适宜引物,对高丹草F2分离群体305个单株的
关键词:
高丹草 AFLP分子标记 遗传连锁图谱
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王磊 王龙 薛华柏 李秀根 李疆
【目的】利用已公开发表的梨和苹果的SSR(Simple Sequence Repeat)引物以及从梨转录组开发的SSR引物构建本研究作图群体的遗传连锁图谱,为后期梨重要性状qtl定位和分子标记辅助选择等奠定基础。【方法】以西洋梨品种‘红茄’(Red clapp FavoRite)为母本,东方梨品种‘晚秀’(manSoo)为父本,构建F1代作图群体。将所选用的SSR引物在亲本和4个子代个体进行pcR扩增,初步筛选出扩增结果符合Join map 4.0软件中"cp"作图模式要求的引物,随后在F1群体中检测,选用Join map 4.0软件对分离数据进行连锁分析,分别构建亲本的连锁图谱。以双亲图谱在...
关键词:
梨 SSR 连锁图谱 整合图谱
[期刊] 华北农学报
[作者]
徐晴 张桂华 韩毅科 魏爱民 杜胜利 张显
以野生黄瓜品种和普通栽培黄瓜品种作亲本获得的142个F2群体为材料,采用AFLP,SRAP,SSR等分子标记进行遗传分析,构建了包含10个连锁群,有159个标记组成的黄瓜遗传连锁图谱,其中包括112个AFLP标记,39个SRAP标记和8个SSR标记。该遗传图谱覆盖基因组长度743.11 cM,平均图距4.67 cM。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
窦玉潭 李宝
以甜柿禅寺丸和涩柿磨盘柿杂交,用获得的F1代分离群体的96个单株为实验材料,以AFLP标记尝试构建柿属植物的AFLP分子标记连锁图谱。先用2个亲本筛选引物,从256对AFLP引物组合中筛选得到了27对多态性好的引物。用筛选得到的27对引物对2个亲本及其F1群体进行AFLP分析,共得到多态性标记447个,其中符合孟德尔定律的标记有400个,占总多态性标记的89.5%。符合1∶1分离比率的多态性标记共有300个,在禅寺丸中得到147个,在磨盘柿中得到153个。符合3∶1比率的多态性标记有100个。用Mapmaker 3.0软件和拟测交策略,分别构建了禅寺丸和磨盘柿的分子标记AFLP连锁图谱。禅寺丸...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
骆晚侠 张李 杨凯 李奕松 赵波 李明 万平
【目的】以小豆SSR为锚定标记,将公开发表的豇豆SSR、普通菜豆SSR和EST-SSR标记定位整合到小豆遗传连锁群中,构建中国小豆遗传图谱,为小豆基因定位、图位克隆和分子标记辅助选择育种提供更多可用的分子标记。【方法】用1 473对SSR和EST-SSR引物进行PCR扩增,包括906对豇豆SSR、123对普通菜豆和196对小豆SSR引物及248对普通菜豆EST-SSR引物,筛选亲本间多态性标记,验证栽培小豆HB801×AG109及GM892×AG110的F2分离群体。【结果】整合和构建了含有145个SSR和EST-SSR标记小豆遗传连锁图谱,包括59个小豆SSR标记,新增63个豇豆SSR、9个...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
杨杨 王怀银 沈晋良
利用AFLP分子标记方法,对抗Bt棉棉铃虫(Helicoverpa armigera)抗性品系和敏感品系回交BC1代(F1(YCR♀×YCS♂)♀×YCR♂)群体进行连锁图谱的构建。经23组AFLP引物的选择性扩增,共得到406个多态位点,χ2检验后有217个为有效位点。利用Mapmaker/Exp(Version 3.0b)软件进行连锁分析,其中126个标记分属35个连锁群,连锁群标记数变化范围为2~11个,平均每个连锁群标记数为3.6个,该图覆盖的基因组长度为1 138.4 cM(图距单位),连锁群长度变化范围为4.0~166.1 cM,连锁群的平均长度为32.53 cM。连锁图谱的构建为...
关键词:
棉铃虫 分子标记 AFLP 连锁图谱
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
周丽青 杨爱国 刘志鸿 王清印 吴彪 孙秀俊 郑利兵 郑言鑫
基于近年来他人构建的遗传连锁图谱,对2011–2013年2–5月期间采集的雌性、雄性及雌雄同体虾夷扇贝进行性别相关AFLP分子标记筛选。从雄性和雌性遗传连锁图谱上选取合计18对引物组合,经3批次试验,有8对引物扩增出性别相关的条带,其中Eb Mc、Ej Mf和Ei Mk重复性好,有4对引物扩增出雌雄同体特异性条带,5对引物扩增出雌性特异性条带。结果表明,基于高密度遗传连锁图谱筛选性别相关分子标记的方法简单可行,雌雄同体的基因组DNA与雌性和雄性存在显著差异,可能是一个单独的群体。
[期刊] 林业科学
[作者]
苏晓华 张绮纹 郑先武 张香华
利用随机扩增DNA多态性RAPD方法,在美洲黑杨(P.deltoidesMarsh)×青杨(P.cathayanaRehd.)3代谱系中分析分子标记,构建出第1张美洲黑杨×青杨分子连锁图谱。共从300个10mer随机引物中筛选出79个适合引物,检测出可供构图的分离标记180个。该图谱由20个连锁群,110个RAPD标记组成。总图距为覆盖基因组总长度的7035%,标记间的平均间距为1727cM.连锁群长度在371~1898,相应标记分别在3~10。本图谱为杨树抗病、虫和其它性状基因定位提供了框架结构,为实现杨树分子遗传育种迈进了最重要的一步。
关键词:
分子连锁图,RAPD,美洲黑杨,青杨
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
王宣朋 孙效文 李文升 张天奇 李超
利用JoinMap 4.0软件包,以德国镜鲤选育系为祖父母所培育的自交F2群体的68个个体为作图群体,首次以新型分子标记单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)为主要作图标记,以微卫星(Simple Sequence Repeats,SSR)和表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)为辅助标记,采用CP(CrossPollinators)模型构建鲤的遗传连锁图谱。构建的遗传连锁图谱含有560个标记(174个SSR标记、41个EST-SSR标记和345个SNP标记),分布在50个连锁群上,最大连锁群由60个标记组成,最小连...
[期刊] 华北农学报
[作者]
王淼 王剑 李宏博 林荣杓 朴钟云
以易感染根肿病的大白菜(Brassica campestrisssp. pekinensis)自交系94SK和抗根肿病的CR Shinki DH系为亲本,通过杂交获得F1,并选择一株F1植株进行自交,构建了F2作图群体。利用扩增出与根肿病抗性基因CRb连锁标记的17对AFLP引物组合Pst+GNN/Mse+CNN构建大白菜遗传连锁图谱。这些AFLP引物组合共扩增出322个亲本间表现出多态性的AFLP标记。应用其中6个与CRb基因紧密连锁的AFLP标记转化成的SCAR标记和清晰可见的大于100 bp的211个AFLP标记构建了一张包含179个标记位点1、0个连锁群、覆盖长度为576 cM,平均图...
关键词:
大白菜 AFLP 遗传连锁图谱 根肿病
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李媛媛 沈金雄 王同华 傅廷栋 马朝芝
【目的】建立甘蓝型油菜的高质量遗传图谱,为在分子水平上研究复杂性状打下基础并提供保证。【方法】以甘蓝型油菜自交不亲和系“SI-1300”及其恢复系“Eagle”组配得到的184个F2单株为群体,利用SRAP、SSR和AFLP标记技术构建甘蓝型油菜遗传图谱。【结果】该图谱共包含21个连锁群,涉及137个SRAP标记、143个SSR标记和118个AFLP标记。图谱总长1949.8cM,标记间平均图距为4.9cM。以SSR标记为锚定标记,该图谱与国际标准图谱进行了初步对应。研究共发现了8个偏分离区域。【结论】根据对标记分布的均匀程度,图谱覆盖程度以及标记密度等方面的分析,本研究构建的甘蓝型油菜分子遗...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘兰浩 裴玉贺 穆平 张恩盈 郭新梅 鄢洪海 宋希云
利用SSR分子标记技术以及软件Mapmaker3.0,Mapdraw2.0和QTLMaper1.6对齐319和掖478及其F2∶3家系进行了初步的遗传分析,构建了分子遗传连锁图谱。该连锁图总长度1 638.7 cM,包含114个标记,平均两个标记间的距离为14.37 cM。在所做标记的附近得到5个QTLs,分别位于第2,3,5,6,9条染色体上,能解释表型变异的36.21%,21.6%,39.41%,20.67%,30.54%,而且均检测出加性效应。另外,还发现QTLs之间表现出上位性互作。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
兰进好 张宝石
以黄早四×Mo17自交形成的191个F2单株为作图群体,利用240对SSR引物和280对AFLP选扩引物,在亲本黄早四和Mo17之间进行了多态性检测,筛选出91对SSR引物和20对AFLP选扩引物用于F2群体分析。利用上述引物组合共检测到248个多态性标记位点,其中的218个标记构建了玉米分子连锁图谱,该图谱覆盖基因组全长2015.5cM,标记间平均间距9.69cM。
关键词:
玉米 遗传图谱 SSR AFLP
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