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[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
刘果
我国桉树(Eucalyptus)种质资源材料主要来源于桉树原产地澳大利亚,作为世界上生长最快和经济价值极高的树种,桉树已成为我国南方造林的战略性树种。SSR分子标记技术能为桉树种群遗传多样性调查和种质资源鉴定提供重要的技术手段,有效地促进桉树资源的良种选育与种质资源的开发和利用。本研究利用Genbank数据库中桉树基因组序列和EST序列进行桉树SSR标记的开发,以42种159份桉树DNA种质材料为主要研究对象,对桉树种质资源的遗传多样性进行分析,探讨桉树种间亲缘关系,并通过选用种内扩增序列完全保守的SSR
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
李永涛 董玉峰 王振猛 张鹏远 王卫东 荀守华 秦光华 姜岳忠
为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对Pst I/Mse I引物组合从44份楸树种质中共扩增出1 087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1 043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(I)分别为1.321 0、0.200 3和0.320 4,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.502 2～0.791 9间,平均为0.652 7。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
高燕会 樊民亮 骆文坚 黄华宏 童再康
通过优化随机扩增多态性DNA(RAPD)反应体系,对浙江省不同来源的金钱松Pseudolarix amabilis进行遗传多样性分析。结果表明:18条随机引物在62个样品中可检测到172个可重复位点,其中多态性位点有170个,多态性比率为99.2%。聚类分析的结果表明:同一来源金钱松材料聚为一类,说明金钱松天然群体的RAPD多态性分类和其地理分布有一定的关系,但也有特殊个体不一致,表明金钱松天然种群体存在较高的遗传多样性,并建议对金钱松进行就地保存和迁地保存。
[期刊] 林业科学
[作者]
贾会霞 吴立栓 胡建军 卢孟柱
利用毛细管电泳-AFLP技术,采用EcoRⅠ+3/MseⅠ+3和PstⅠ+2/MseⅠ+3引物组合,对从国内外搜集的37份柳树种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。11对引物共扩增出1580条条带,多态性条带数为1399条,多态率在80.65%～94.67%之间,表明柳树种质间的遗传多样性较高。采用NTSYS-pc2.10e软件对37份种质进行聚类分析和主成分分析,在相似系数0.63时,37份种质分为2大类,一类是乔木柳,一类除小乔木康定柳外,其余都为灌木柳。聚类分析和主成分分析结果与传统形态分类基本一致,但筐柳组中簸箕柳P295和沙柳基因组水平上差异较大,P295与银芽柳亲缘关系较近。研究结...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
何倚剑 刘卫东 柳李旺 王倩 崔群香
采用SRAP分子标记技术,对国内外70份茄子材料的遗传多样性和群体结构进行了分析。结果表明:21对引物共扩增出375条条带,平均每条引物扩增出17.8条条带,其中多态性条带共72个,多态性比例为19.2%,各种质间遗传相似系数变幅为0.388 9～0.958 3,平均值为0.705 3,表明参试材料间存在着一定的遗传差异,但遗传基础比较狭窄。群体结构分析则得出84.29%的材料遗传结构相对比较单一,仅15.71%拥有复杂的遗传背景。从材料划分类群来看,遗传多样性和群体结构分析结果基本一致,只有少数遗传背景复杂的材料类群划分有些差异。
关键词：
茄子 遗传多样性 群体结构 SRAP
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
宋丛文 许业洲 胡兴宜 管兰华
利用RAPD标记对垂枝杉种质资源进行了遗传多样性分析,并与杉木其它类型作对照,对其进行鉴定。结果表明:垂枝杉群体具有较高的遗传多样性,群体间变异占总变异的15.6％;3个垂枝杉群体遗传相似度高,与其它杉木类型的遗传相似度低;垂枝杉具有稳定的遗传性和一致的表现型。从分析结果可以得出垂枝杉是杉木的一个自然变异类型。
关键词：
垂枝杉 RAPD 种质资源
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
周远航 鲁伟丹 马小龙 高江龙 樊晓琴 郭建富 陈友强 林明 石书兵
为探究籽瓜种质资源的多样性，深度挖掘籽瓜优异种质应用潜力，采用相关性、主成分与聚类分析方法对100份籽瓜种质资源的21个农艺性状进行表型鉴定及遗传多样性分析。结果表明：籽瓜种质资源遗传多样性丰富，7个质量性状的多样性指数范围为0.53～1.65,14个数量性状变异系数为10.41%～35.56%,各表型性状间具有遗传相关性。以欧氏距离为遗传距离进行聚类分析，可将100份籽瓜种质资源聚为5大类群，其中第Ⅴ类群具有高产特性，可作为育种亲本材料。主成分分析提取前7个主成分，其成分累计贡献率达到了74.185%,可以作为籽瓜种质资源主要评价指标；籽瓜种质资源的综合得分范围为-2.78～2.86,依据综合得分排序，筛选出了3份优异籽瓜种质资源材料。本研究从多角度系统评价籽瓜种质资源遗传多样性，可为后续籽瓜种质资源高效利用及遗传育种提供科学依据。
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
刘跃钧 张媛 蒋燕锋 刘京晶
为揭示中药材黄精种质资源的遗传多样性及种源间亲缘关系，建立了目标起始密码子多态性分子标记（ＳＣｏＴ）方法 ，采用非加权平均距离法（ＵＰＧＭＡ）和主坐标分析（ＰＣｏ Ａ）等方法对１９份不同种源的黄精ＰｏｌｙＧｏｎＡＴＵＭ材料进行分析。从待选的２９个引物中筛选出１５个ＳＣｏＴ引物用于扩增基因组ＤｎＡ，总共得到５００个条带，平均每个引物产生３３．３个条带，其中多态性条带４９８个，多态性比率为９９．６％，１９个黄精种质间的遗传相似系数范围为０．５５４ ０～０．７３４ ０。结果表明：不同种源的黄精种质有较丰富的遗传多样性，ＳＣｏＴ分子标记可以为黄精的分类及鉴别提供一定的依据，为中药黄精优良品种的培育及资．．．
[期刊] 林业科学
[作者]
杨汉波 张蕊 王帮顺 徐肇友 陈焕伟 周志春
【目的】利用SSR标记深入研究木荷优树无性系种质的遗传多样性,揭示其遗传多样性地理分布特点及种质间遗传关系,为木荷种质资源的保护和育种亲本的选择提供理论依据。【方法】利用10对SSR引物,分析我国5个省份24个地区的734份木荷优树无性系种质的遗传多样性和遗传结构。利用CERVUS、Gen AIEx 6.5、NTSYS、Arlequin和STRUCTURE 2.3软件进行无效等位基因检测、遗传参数估算、主坐标分析、聚类图构建、遗传变异分析及遗传结构分析。【结果】10对引物共检测到105个等位基因(Na),
[期刊] 中国农业科学
[作者]
屈洋 周瑜 王钊 王鹏科 高金锋 高小丽 冯佰利
【目的】了解苦荞产区种质资源遗传多样性和遗传结构，为苦荞资源的有效利用提供参考。【方法】采用相关性分析、主成分分析方法对苦荞８个植株性状进行分析；温室内培养苦荞资源，于３叶期，每个资源选取１０株新鲜叶片，采用ＣＴＡＢ方法提取苦荞基因组ＤＮＡ，结合ＳＳＲ分子标记方法进行ＰＣＲ扩增，然后对扩增产物进行电泳检测并照相保存，根据ＳＳＲ检测位点构建［０，１］矩阵，最后利用ＰｏｗｅＲ ＭＡＲｋｅＲ３．２５和ＳＴＲｕＣＴｕＲｅ２．３．４软件对８３份苦荞种质资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析。【结果】８个植株性状分布较分散，大部分植株性状间呈现显著相关，植株性状的前４个主成分累计贡献率达到８５．２２％，基本．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
李立新 杨途熙 魏安智 冯世静 陈旅 侯娜
为探讨花椒种质资源的遗传多样性和群体结构特征，用ＳＲＡＰ分子标记技术对采自陕西、山西、云南、四川、甘肃５个种源地的２６９份花椒属样品的遗传多样性进行了研究。结果表明：从１２０对引物组合中筛选出了１６对图谱带型清晰、丰富、重复性好的引物组合；２６９份花椒属样品用这些引物组合共扩增出１６９条清晰可重复的条带，其中多态性条带１５１条，多态性比率为９３．８％；通过ＵＰＧＭＡ分子系统聚类法，将２６９份花椒属种质划分为２个类群，即竹叶椒类群和花椒类群；在所研究的５个种源中，陕西花椒的遗传多样性水平最高，陕西和甘肃花椒的遗传距离最小，陕西和云南花椒的遗传距离最大；ＡＭＯＶＡ分子变异分析显示，在花椒总的遗传变．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
周福平 孙黛珍 王曙光 李瑞 冀彩萍
利用RAPD标记对10份六倍体小黑麦、1份普通小麦和1份黑麦种质资源遗传多样性进行了分析,19个RAPD引物中,有10个引物(52.63%)可扩增出清晰且具多态性的条带。10个引物共产生385条DNA片段,其中384条具有多态性,多态性比率为99.74%,不同引物扩增带数变幅为8~71条,平均为38.5条,扩增产物的片段大小为298~3 054 bp,材料间的遗传距离变化范围在0.724~0.833之间。对12份供试材料的遗传关系进行聚类分析,在平均GD值0.77水平上可将12份供试材料分为3类。研究结果为将六倍体小黑麦的优良基因导入到普通小麦中提供了理论依据。
[期刊] 华北农学报
[作者]
毛培春 孟林 田小霞
应用ISSR分子标记技术,对收集自我国北方4省区的20份马蔺种质材料进行遗传多样性分析,结果显示,利用筛选出的多态性强、重复性好的14条ISSR引物,共扩增出303条带,其中241条带呈多态性,多态性位点百分率为77.29%。遗传相似系数(GS)为0.340 2～0.824 7,分布幅度较广,遗传多样性丰富。利用非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类,当GS为0.587 6时,可将20份马蔺种质材料划分为3个类群。主成分分析(PCA)的结果与UPGMA聚类分析结果一致,表明20份马蔺种质材料的遗传距离与其野生分布的地理距离存在较密切相关关系。
关键词：
马蔺 ISSR 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
耿攀 阮小凤 杨勇 赵红星
【目的】用SSR标记分析柿属植物种质资源的遗传多样性,为其有效利用提供依据。【方法】以7个柿种或变种的48份材料为研究对象,利用30对SSR标记对其进行遗传多样性分析。采用NTSYS-pc2.10e分析软件对SSR数据进行聚类分析。【结果】共检测到83个等位基因,每对SSR引物检测到3～6个等位基因变异,平均为4.9个。供试柿品种间的遗传相似系数介于0.397～1.000,平均为0.698,范围较大,说明柿资源种类较多、来源较广泛、遗传多样性较丰富。48份柿材料在相似系数为0.66水平上分为4大类,第Ⅰ类包括浙江柿和5个美洲柿及1个柿品种;第Ⅱ类只有2个资源,即油柿和野柿;第Ⅲ类为柿种下的大部...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李超 罗淑萍 曾斌 李疆 李刚
【目的】通过ISSR标记技术,对新疆核桃种质资源的遗传多样性及遗传结构进行分析,为该资源的保护与利用提供理论依据和技术支持。【方法】采用ISSR标记对5个居群和1个栽培类型共163份样品进行遗传多样性分析。【结果】用13条引物对163份样品进行扩增,共检测扩增位点117个,其中多态性位点98个。在物种水平上,多态性位点百分率(PPL)为83.76%,Nei’s基因多样性(H)为0.3010,Shannon信息指数(I)为0.4182;在居群水平上,多态性位点百分率平均为68.36%,Nei’s基因多样性(H)平均为0.1265,Shannon信息指数(I)平均为0.1651。基于Nei’s遗传...
关键词：
核桃 种质资源 遗传多样性 ISSR
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