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[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
张凯强 韩长志
【目的】植物病原真菌中的糖苷水解酶(GH)是参与破坏植物细胞壁的重要酶类，在真菌致病过程中发挥着重要作用。了解核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作蛋白及其遗传关系，可为深入研究该病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。【方法】基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白，通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽菌Nara gc5相关蛋白的互作关系；同时，利用生物信息学分析工具对这些蛋白进行了分子对接、亚细胞定位及遗传关系分析。【结果】两个炭疽菌菌株GH蛋白的互作情况极为相似。其中：GH5的互作蛋白数量最多，且GH5、GH6、GH7、GH11之间均存在明显互作关系；GH28亚家族中两个蛋白之间互作但不与其他GH亚家族蛋白互作；与单独GH蛋白存在互作关系的其他类蛋白多参与多糖催化、碳水化合物代谢等过程。不同蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸位点；仅GH72亚家族中的3个蛋白定位于质膜，其余蛋白均定位于细胞外；胶孢炭疽菌Cg1、Cg-14以及果生炭疽菌Nara gc5中GH蛋白明显分为四大类。其中：GH43亚家族中的3个蛋白分属于不同分支，亲缘关系较远；GH5中的3个蛋白有两个属于同一分支，另一个单独在一个分支；而GH7、GH11、GH28亚家族内部的蛋白均属于同一分支。【结论】核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作关系主要有3种，即不同GH蛋白之间的互作、同一GH亚家族中不同蛋白之间的互作以及单独的GH蛋白。其中，大部分GH蛋白定位于细胞外，且大多数GH亚家族中不同蛋白之间的亲缘关系较近，仅有小部分亲缘关系较远。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
张凯强 韩长志
植物病原真菌中的糖苷水解酶（GH）是参与破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白，通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽菌Nara gc5相关蛋白的互作关系。结果发现，两个炭疽菌菌株GH蛋白的互作情况极为相似。其中：GH5的互作蛋白数量最多，且GH5、GH6、GH7、GH11之间均存在明显互作关系；GH28亚家族中两个蛋白之间互作但不与其他GH亚家族蛋白互作；与单独GH蛋白存在互作关系的其他类蛋白多参与多糖催化、碳水化合物代谢等过程。此外，利用生物信息学分析工具对上述蛋白进行了分子对接、亚细胞定位及遗传关系分析。结果发现：不同蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸位点；仅归属于GH72亚家族的3个蛋白定位于质膜，其余蛋白均定位于细胞外；胶孢炭疽菌Cg1、Cg-14以及果生炭疽菌Nara gc5中GH蛋白明显分为四大类。其中：GH43亚家族中的3个蛋白分属于不同分支，亲缘关系较远；GH5中的3个蛋白有两个属于同一分支，另一个单独在一个分支；而GH7、GH11、GH28亚家族内部的蛋白均属于同一分支。本研究结果可为深入研究核桃炭疽病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
薄淑文 韩长志
糖苷水解酶（GH）作为植物病原菌侵染、破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。为了解禾谷炭疽菌GH蛋白之间的互作机制，本研究基于前期所获的禾谷炭疽菌GH蛋白，通过STRING网络在线分析不同GH蛋白之间的互作关系，利用ProtComp v 9.0在线分析GH蛋白的亚细胞定位，通过ClustalX和MEGA 11软件对GH蛋白进行多重比对和构建系统进化树，，并选取互作关系多的蛋白通过GRAMM在线软件进行分子对接。结果显示，禾谷炭疽菌中89个GH蛋白之间的互作表现为三大类的聚集关系，其中，I类聚集了34个GH蛋白，II类聚集了33个GH蛋白，III类聚集了22个GH蛋白。这些GH蛋白之间有3种互作情况，即不同亚类GH蛋白之间的互作、同一亚类中不同GH蛋白之间的互作以及不存在互作关系；85个GH蛋白定位于细胞外（分泌），仅4个GH蛋白定位于细胞核、内质网、细胞质膜。系统发育树分为四大类，有一些GH亚家族蛋白只存在于一类中，也有一些GH亚家族蛋白同时存在于两类及两类以上中；分子对接发现，互作蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸残基位点，蛋白之间可通过氢键相互作用。
[期刊] 林业科学
[作者]
李思蒙 王永林 黄冬辉 田呈明
以杨树炭疽病菌菌株C1-5-2作为受体,通过PEG介导的原生质体转化法,将含有潮霉素B(hph)和GFP表达基因的质粒gGFP转入杨树炭疽病菌菌丝的原生质体中。幼嫩菌丝在0.7mol·L-1NaCl溶解的1% Lysing enzyme酶解液的作用下酶解210min可以得到108·mL-1的原生质体;在PEG介导下,通过含有潮霉素浓度为300μg·mL-1的PDA选择培养基筛选转化子,每微克DNA获得41个转化子的平均转化效率。对转化子进行PCR鉴定表明:hph基因和GFP基因已经整合到杨树炭疽病菌转化子基因组中,通过荧光显微镜观察到转化子可以发出清晰的绿色荧光,且转化子的潮霉素抗性和GFP表...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
齐尧尧 周洁 张冬梅 张宏鑫 李光普 鲁国东
利用酵母双杂交系统,以稻瘟病菌MoYpt7激活型为诱饵蛋白,从稻瘟病菌不同生长发育阶段的cDNA文库中筛选互作蛋白,经复筛得到10个候选互作蛋白基因,利用Bi FC或pull-down assay验证蛋白间的互作,为寻找MoYpt7下游调控侵染致病过程的效应因子提供依据.
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
凡婷婷 张佳琦 刘会君 王凤敏 马宇航 吴宇伟 胡恒康 黄有军 李岩 王克涛 黄坚钦 张启香
【目的】研究高效利用氮素基因铵态氮转运蛋白基因JrAMT2，对核桃Juglans regia的品种改良、快速生长及产量形成有重要意义。【方法】以核桃JrAMT2过表达幼苗为实验材料，对JrAMT2基因进行生物信息学分析。通过基因表达量和表型测定对核桃JrAMT2过表达植株生长发育、氮素吸收、叶绿素质量分数、叶绿素荧光进行理化分析。【结果】JrAMT2基因在核桃JrAMT2过表达植株中稳定表达。与野生型相比，核桃JrAMT2过表达株系的株高、节间长、生物量等生长参数显著提高(P<0.05)，核桃幼苗的株高、节间长增加，最高可增加68.2%和50.3%，植株地上部分、地下部分生物量显著增加，地上部分最高可增加56.26%(鲜质量)和56.26%(干质量)，地下部分最高可增加344.38%(鲜质量)和354.33%(干质量)；核桃JrAMT2过表达株系地下部分对铵态氮及硝态氮的吸收显著提高(P<0.05)，最高可提高114.1%和70.3%，其中JrAMT2基因介导了铵态氮从地下部分到地上部分的运输，地上部分铵态氮质量分数显著增加(P<0.05)，最高可增加59.1%；核桃JrAMT2过表达植株叶绿体表面积与单层细胞表面积比率、叶绿素质量分数显著增加(P<0.05)，最高可增加22.94%和74.3%；对叶绿素荧光参数分析，核桃JrAMT2过表达植株叶片放氧复活体活性、量子产额、电子传递效率均显著提高(P<0.05)。【结论】核桃JrAMT2基因在核桃幼苗生长发育、氮素吸收和光合作用中均有积极显著调控的作用，为进一步研究核桃快速繁育提供一定的理论依据，且为筛选优良品种奠定一定基础。图9表2参41
[期刊] 西南农业学报
[作者]
周晓罡 侯思名 苏源 陶南 丁玉梅 姚春馨 孙茂林 张绍松
以CH-63和TH-16 2个致病性差异显著的稻瘟病菌株为材料,在氮胁迫培养条件下进行液体培养,经培养2 d后,采用铵盐沉淀及透析纯化提取稻瘟病菌培养滤液中的致病性分泌蛋白。以24个IRRI水稻抗稻瘟病单基因系和普感品种丽江新团黑谷(LTH)的成熟种胚为材料,诱导愈伤组织并构建水稻悬浮细胞系。以构建成功的感病品种LTH和抗病品种IRBL-9的水稻悬浮细胞系为材料,接种稻瘟病菌致病性分泌蛋白并对活性氧浓度变化进行检测。结果表明,感病与抗病品种在接种前12 h均出现活性氧迸发,且均出现2个峰值。比较稻瘟病菌株TH-16和CH-63分泌蛋白接种IRBL-9与LTH后H2O2浓度变化特征,发现分泌蛋白...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
代红梅 刘志朋 张霞 杨忠 曾日彬 王配 常勇诚 霍金龙
利用RT-PCR技术从版纳微型猪近交系睾丸组织中扩增出GSKIP全长编码序列并分析其分子特征，对GSKIP基因进行功能注释，分析其与非编码RNA(miRNA和lnRNA)间的调控关系，并构建ceRNA转录调控网络，进一步分析GSKIP蛋白的基本功能，构建多物种进化树和相互作用蛋白网络.通过RT-PCR获得了BMI GSKIP CDS区全长420 bp,该基因含4个外显子；基因功能分析表明，GSKIP主要参与Wnt信号通路；基因靶向作用分析表明，猪GSKIP受ssc-miR-181c、ssc-miR-181b、ssc-miR-181a、ssc-miR-335和miR-644-5p等5个miRNA的靶向调控；蛋白质结构分析表明，GSKIP包含1个DUF727结构域，α螺旋在二级结构中占比最高；多物种进化分析表明，BMI GSKIP氨基酸序列在哺乳动物中较为保守，与绵羊和牛的亲缘关系最为接近；蛋白互作网络分析表明，BMI GSKIP与10个蛋白存在相互作用.
[期刊] 中国农业科学
[作者]
安秀红 厉恩茂 李敏 李壮 张修德 程存刚
【目的】克隆苹果茉莉酸信号途径阻遏因子基因ＭｄＪＡＺ１，并对其表达及蛋白互作进行分析，为进一步研究ＭｄＪＡＺ１的功能奠定基础。【方法】以ＴＩＦＹ及ＪＡｓ功能域为探针，在苹果基因组中进行比对，获得多个同源基因，对其中的一个基因设计引物进行克隆；利用ｄＮＡＭＡＮ软件对该基因编码蛋白的分子量、等电点进行预测；利用ｓＭＡＲＴ在线分析软件对该蛋白的功能域进行分析；利用ＭＥＧＡ５．０对该蛋白与拟南芥ＪＡＺ家族蛋白构建系统发育树；利用荧光定量ＰＣＲ分析该基因在苹果不同组织器官、茉莉酸甲酯及创伤处理下的表达情况；利用ＰｌＡＮＴ ＣＡＲＥ在线软件分析该基因启动子区域的顺式作用元件；利用酵母双杂交系统检测ＭｄＪＡ．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
杨虹 孟克 王烨辉 芒来
采用垂直平板不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳技术分别对蒙古马、三河马及纯血马的8种血液蛋白进行多态性检测。计算了各位点的基因型频率、基因频率、遗传杂合度,并通过聚类分析探讨了群体间的亲缘关系和遗传距离。结果表明:种血液蛋白(酶)位点在不同程度上呈现出多态。平均杂合度分别为:蒙古马0.378 2,三河马0.395 6和纯血马0.257 1。聚类分析表明,蒙古马与三河马间的亲缘关系最近,与纯血马的亲缘关系相对较远。通过分析不同马品种的遗传关系,为中国马遗传资源的保护与育种提供依据。
关键词：
马 血液蛋白 遗传多态性 聚类分析
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
陈敏 白俊杰 何小平 简清 叶星 吴立新 姜鹏
转红色荧光蛋白基因唐鱼(Tanichthys albonubes)测交获得实验鱼,以表达红色荧光蛋白为表型性状,采用点杂交和遗传学分析相结合的方法,研究外源基因的遗传传递规律,并对转基因唐鱼和非转基因唐鱼的生长和繁殖等方面进行了比较。结果显示:测交后代表型的分离规律基本符合经典的孟德尔单显性基因遗传模式,外源基因属于单位点整合,测交后代中没有发现沉默整合个体;实验鱼的生长和可量性状对比实验表明,转基因唐鱼和非转基因唐鱼在仔鱼期到性成熟之间,生长速度无显著差异,性成熟个体的外部形态除体色外也无差别,繁殖力方面基本无显著差异。本研究结果表明了培育转红色荧光蛋白基因唐鱼纯系的可行性;同时在生长、繁殖...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
赵宗胜 贾斌 李大全 王根林
采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,对罗米丽羊 (RomillyHills)、哈萨克羊、中国美利奴羊、巴什拜羊等 4个群体 171只绵羊的白蛋白 (A1b)、转铁蛋白 (Tf)和脂酶 (Es)共 3个蛋白座位进行了检测 ,发现这 3个蛋白分别出现了3、 4、 3种表型 ,受到 2、 6、 2种基因支配。对这 4个绵羊群体的遗传分析表明 ,中国美利奴 (新疆军垦型 )羊、哈萨克羊、巴什拜羊和罗米丽羊的基因平均杂合度分别为 0 4 96 4、 0 5 0 39、 0 5 35 2和 0 5 2 90。本研究的结果与各品种羊的选育史是吻合的。由于选育目标、过程不同 ,哈萨克羊与巴什拜羊虽然有...
关键词：
血液蛋白 多态性 绵羊 遗传多样性
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
甘莉 王新
对55份油菜种子可溶性蛋白进行了SDS－PAGE分析，结果表明不同类型油菜种子的蛋白质具有组分差异。芥菜型油菜种子蛋白质资源比白菜型和甘蓝型油菜种子蛋白质资源丰富。本文用可溶性蛋白条带的信息，估计了所有参试品种（系）之间的遗传距离，聚类分析结果表明，在遗传距离为0．1207的水平上可将参试材料分为三类。Ⅰ类：为16个B.napus品种（系）。Ⅱ类：为所有参试的4个芥菜型油菜品种（系）、2个埃塞俄比亚芥油菜品系和15个甘蓝型油菜品种（系）。Ⅲ类：所有参试的5个白菜型油菜品种和11个甘蓝型油菜品种。另有2个甘蓝型油莱737（黄籽双低）和Tapiotor不属于任何一类。4个甘蓝型油菜品种（系）的谷蛋...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
韩长志 许僖
利用CAT(CAZymes analysis toolkit)在线分析程序对Trichoderma virens Gv29-8中碳水化合物活性酶类蛋白(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)不同亚家族的分布情况进行分析,结果表明:粘绿木霉Gv29-8中含有185个CAZymes蛋白,分为主要类别和复合类别两种类型;其中,主要类别含有71个GH蛋白、54个CBM蛋白及12个AA蛋白、25个CE蛋白、3个PL蛋白、3个GT蛋白;复合类型含有17个蛋白。遗传关系分析表明,CAZ
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
姜莉 陈金海 徐怀德 刘邻渭 李学俊
【目的】确定蛋白酶水解核桃蛋白的最佳工艺条件。【方法】在单因素分析的基础上,采用响应面分析方法对核桃蛋白的水解条件进行了优化。【结果】胰蛋白酶水解核桃蛋白的最佳反应条件为:反应时间4.0 h,底物质量浓度27 g/L,温度53.4℃,pH8.0,加酶量(E/S)8.3 g/kg,各因素对核桃蛋白水解的影响顺序为温度>加酶量>底物质量浓度。【结论】实际验证表明,利用优化的水解条件可取得较好的水解效果,水解度可达14.497%。
关键词：
核桃蛋白 胰蛋白酶 水解条件 工艺优化
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