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[期刊] 林业科学
[作者]
王娇莉 南小宁 任争争 明洁 唐光辉
【目的】了解危害核桃果实青皮的核桃举肢蛾和桃蛀螟幼虫肠道细菌群落结构与多样性。【方法】采用基于１６ＳｒｒＮＡ基因的变性梯度凝胶电泳（ＰＣｒ－ＤＧＧＥ）和末端限制性片段长度多样性（Ｔ－ｒＦＬＰ）技术分析２种害虫幼虫肠道细菌群落特征。【结果】１）ＰＣｒ－ＤＧＧＥ分析显示核桃举肢蛾幼虫肠道细菌主要有沃尔巴克氏体属、肠球菌属、肠杆菌属、根瘤菌属和假单胞菌属，其中沃尔巴克氏体属是优势菌群，占测得序列的４０．０％；桃蛀螟幼虫肠道细菌主要有沃尔巴克氏体属、肠球菌属、根瘤菌属和假单胞菌属，其中肠球菌属是优势菌群，占测得序列的６２．９％。２）ＤＧＧＥ条带的系统发育分析显示，核桃举肢蛾幼虫肠道中，７２．５％的菌株．．．
[期刊] 淡水渔业
[作者]
吴康 胡俊 黄晓声 夏虎 陈亮 李男 张学振
为探讨饲喂蚕豆(Vicia faba)对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群的影响,采用PCR-DGGE技术比较了饲喂蚕豆的草鱼(脆肉鲩组)及饲喂配合饲料的草鱼(普通草鱼组)肠道微生物菌群的异同。结果显示,DGGE图谱上出现了20条明显条带,表明脆肉鲩组及普通草鱼组肠道中均存在大量细菌群落。对这20条条带测序后,获得了其中17条条带的序列,这17条条带中有9条是尚未被培养的细菌。经分析发现,这17条条带分属于变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)及未...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
倪学勤 Joshua Gong Hai Yu Shayan Sharif 曾东
【目的】研究蛋鸡MHC(Major Histocompatibility Complex,主要组织相容性复合物)基因对不同周龄和不同部位肠道细菌种群结构的影响。【方法】使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,对2,4,6和8周龄商品蛋鸡和15I5系蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内含物细菌群落的结构和多样性进行比较,鉴定8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员。【结果】商品蛋鸡和15I5系蛋鸡盲肠细菌的多样性最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的细菌多样性比较低,且随着蛋鸡周龄增加,各肠段细菌多样性呈上升趋势,MHC基因对细菌多样性无显...
关键词：
肠道菌群 MHC 变性梯度凝胶电泳 蛋鸡
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
曾燕 倪学勤 曾东 简平 王剑 唐雨蕊
为探讨蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性,采用变性梯度凝胶电泳技术结合聚合酶链式反应(PCRDGGE)及条带的克隆测序,比较瘤胃液相和固相细菌的差异,同时采用聚类分析和主成分分析(PCA)方法分析瘤胃液相和固相细菌的多样性。结果表明:1)瘤胃液相和固相样品均含有物种丰富的细菌菌群,但液相比固相具有更高的平均条带数,分别为30条和24条;2)瘤胃液相样品比固相样品具有更高的多样性指数、均匀度和丰富度,其数值分别为3.45、0.90和30.20及3.23、0.84和24.62;3)同一动物个体瘤胃液相样品和固相样品聚类在一起,相似性系数均高达0.81;4)共性条带测序结果表明瘤胃的优势细菌主要是Un...
[期刊] 林业科学
[作者]
贾若峰 谷奇 孙一鸣 陆鹏飞 俱世博 乔海莉
【目的】从肠道细菌多样性角度探究光肩星天牛幼虫对传统抗性树种洋白蜡的适应性原因。【方法】基于16S rDNA高通量测序技术，分别对用洋白蜡、旱柳饲喂的光肩星天牛幼虫肠道细菌进行了分子鉴定及多样性分析；然后通过富集培养，从未经饲喂的幼虫中筛选出了31株纤维素降解细菌，以透明水解圈直径（D）/菌落直径（d）为标准初步测定了各菌株纤维素降解能力；对降解能力最强的4个菌株进行了滤纸复筛试验。【结果】使用洋白蜡饲喂后，厚壁菌门、芽孢杆菌纲、乳杆菌目、链球菌科、乳球菌属为优势类群；使用旱柳饲喂后，厚壁菌门、芽孢杆菌纲、乳杆菌目、肠球菌科、肠球菌属为优势类群；变形菌门、γ-变形菌纲、肠杆菌目、肠杆菌科、拉乌尔菌属在两者中都为优势类群。两者肠道细菌群落最显著的差异在于，取食洋白蜡幼虫链球菌科、乳球菌属相对丰度显著高于取食旱柳的幼虫，而肠球菌科、肠球菌属相对丰度显著低于取食旱柳的幼虫。直接取食洋白蜡枝干的幼虫肠道纤维素降解细菌种类丰富，隶属于4门、5纲、5目、7科、7属，15种；优势属包括微杆菌属、纤维单胞菌属、假单胞菌属；其中纤维素降解能力最强的4个菌株分别为2株假单胞菌和2株产黄纤维单胞菌；二者在滤纸复筛试验中显著地分解了滤纸，进一步验证了其良好的纤维素降解能力。【结论】在取食洋白蜡光肩星天牛幼虫肠道中，链球菌科、乳球菌属为优势类群，可能发挥重要功能但不直接降解纤维素；放线菌门下的微杆菌属、纤维单胞菌属和变形菌门下的假单胞菌属非优势类群但纤维素降解能力强，可能发挥降解纤维素的功能；上述菌群共存于光肩星天牛肠道，参与其适应洋白蜡的过程。
[期刊] 林业科学
[作者]
田士波 靳杏蕊 赵淑娥
核桃是山区主要经济树种之一,由于核桃举肢蛾(Atrijuglous hetaonei yang)的为害,使核桃大幅度减产、变质,甚致绝收。过去的防治目标集中在果外的各个虫态的防治,防止幼虫蛀入果内,一旦蛀入,多采取摘掉或拾毁虫果,减少了当年的收入,或者是刨树盘树上、树下多次喷药防治成虫,有条件的地区可以收到较好的效果。但是核桃多分布在山区,刨树盘难;干高冠大的树不易喷药,加上山区缺水,连续喷药不易做到。为探讨解决这一问题,1988-1991年,我们作了用高压注射机将久效磷注射到树干内,防治果内低龄幼虫的研究。
关键词：
核桃举肢蛾 高压注射 低龄幼虫防治
[期刊] 西南农业学报
[作者]
易春燕 杜超 杨明 刘昌华 郝员敏 雷应华 刘旭
【目的】研究眼斑芫菁幼虫肠道共生菌的多样性，并鉴定其相关功能，以探寻眼斑芫菁肠道共生菌在其生长发育中的作用。【方法】分别以人工饲料、蝗卵为食物饲喂眼斑芫菁幼虫，饲养至不同龄期的眼斑芫菁为材料，按相应龄期收集试验所需幼虫，提取眼斑芫菁幼虫肠道细菌基因组DNA，通过16S rDNA全长扩增子测序，分析其肠道细菌的多样性和相对丰度，并探究其肠道共生菌发挥的潜在功能。【结果】获得最终有效序列81 759条，聚类共获得230个OTUs，注释到17个门，27个纲，41个目，71个科，109个属。变形菌门（Proteobacteria）为3个组中的最优势门，各分组样品的优势菌属不相同，劳尔氏菌属为3个组的共同优势菌属。α多样性分析发现，蝗卵饲养的眼斑芫菁二龄幼虫（L.H2）肠道菌群多样性和丰度较四龄幼虫（L.H4）高，且均高于转接入人工饲料饲养的四龄幼虫（L.S4）；α与β多样性分析结果均显示眼斑芫菁肠道内共生菌多样性各组内差异大，组间有一定差异，但不同组之间差异不显著（P＞0.05）。功能分析结果发现，L.S4在氨基酸代谢、核苷酸代谢、环境适应、免疫系统等方面明显高于L.H4和L.H2，且L.S4的氨基酸代谢比L.H4显著增强（P=0.035）。【结论】明确了眼斑芫菁幼虫肠道菌多样性和群落结构受食物影响，其肠道细菌在代谢功能上能协助宿主适应相应的食物。研究眼斑芫菁幼虫肠道细菌多样性与食物之间的关系，为研究眼斑芫菁肠道微生物变化奠定了基础。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李志鹏 姜娜 刘晗璐 崔学哲 荆祎 杨福合 李光玉
【目的】细菌区系在梅花鹿(Cervus nippon)瘤胃发酵中发挥着重要作用,然而有关梅花鹿瘤胃细菌区系的研究鲜有报道。研究梅花鹿瘤胃细菌区系,为梅花鹿瘤胃发酵调控提供分子生物学依据。【方法】选取4头2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象,分别饲喂以柞树叶(OL组,梅花鹿A和B)和玉米秸秆(CS组,梅花鹿C和D)为主要粗饲料的日粮,持续饲喂30 d。通过瘤胃瘘管取瘤胃内固液混合物,提取瘤胃微生物基因组DNA。扩增瘤胃细菌16S rRNA基因V3区以及16S rRNA基因,分别用于DGGE和T-RFLP分析。DGGE图谱进行聚类分析,并切取优势条带进行克隆测序,鉴定瘤胃内细菌组成...
关键词：
梅花鹿 细菌区系 普雷沃氏菌 单宁
[期刊] 中国水产科学
[作者]
孙豪 时云朵 倪学勤 刘倩 曾东
采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量-聚合酶链式反应(Q-PCR)技术分析高体重(high weight,HW)和低体重(low weight,LW)斑点叉尾鮰鮰(Ietalurus punetaus)皮肤、鳃和胃肠道菌群多样性,为斑点叉尾鮰微生态研究及筛选斑点叉尾鮰源益生菌提供理论依据。结果显示,斑点叉尾鮰菌群丰富度由低到高依次为鳃、皮肤、前肠、后肠和胃。肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和气单胞菌属(Aeromonas)是皮肤的优势菌群;肠杆菌科(Enter
[期刊] 华北农学报
[作者]
张永生 赖欣 张静妮 李刚 赵帅 杨殿林
用Bourrain法、LaMontagne法、Zhou法、BBI.公司的试剂盒4种方法,比较研究了不同方法对内蒙古贝加尔针茅草原土壤基因组DNA的提取效果以及对后续分析的影响。用PCR-DGGE技术对贝加尔针茅草原土壤细菌群落结构进行分析,并对主要条带进行测序。结果表明:试剂盒法提取的DNA效果最好;贝加尔针茅草原土壤细菌主要由6个分支组成:变形菌门(Proteobacteria)中的α、δ、γ三个类群,放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),酸杆菌门(Acidobacteria)和疣微菌门(Verruc...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
刘芳 王道营 徐为民 诸永志 曹建民
利用传统平板培养和变性梯度凝胶电泳(DGGE)指纹图谱相结合的方法,对盐水鸭在4℃贮藏期间的细菌多样性进行了分析。传统培养方法结果显示:盐水鸭在贮藏期间细菌数量增加迅速。PCR-DGGE对盐水鸭及平板培养物中的细菌组成分析结果显示:腐生葡萄球菌(Staphylococci saprophyticus)、溶酪大球菌(Macrococcus caseolyticus)、魏斯氏菌(Weissellasp.)、中度嗜盐菌(Halomonas sp.)和盐单胞菌(Cobetia sp.)是盐水鸭的主要细菌,而腐生葡萄球菌、溶酪大球菌和魏斯氏菌是平板培养物中的主要细菌。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
高菲 孙慧玲 许强 谭杰 燕敬平 王清印
利用PCR-DGGE技术研究刺参(Apostichopus japonicus)前肠、中肠和后肠内含物的细菌群落组成。通过软件Bio-rad Quantity one分析DGGE指纹图谱,发现刺参后肠内含物的条带数目显著高于前肠和中肠(P=0.003,P=0.016),表明刺参后肠内含物的细菌多样性最高,其次是中肠;前肠内含物的细菌多样性最低。UPGMA聚类分析发现,不同刺参个体其后肠的细菌群落组成差异最小,前肠的细菌群落差异最大。经DGGE分离、条带切割和序列测定,共获得了13条序列,系统发育分析表明,刺参消化道内含物的细菌群落可主要归属于5大类群,即α-变形菌纲(α-proteobacte...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
余宙 贺韶韶 庄浩楠 袁格格 陈功 于欢
‘BLTY’品系辣椒叶片对1～3龄斜纹夜蛾幼虫有较高的胃毒性。为进一步探明这种胃毒性与肠道细菌群落结构及多样性的相关性，利用illuminationHiSeq技术对斜纹夜蛾3龄幼虫取食胃毒性的‘BLTY’品系、无毒性的‘FXBX’辣椒及人工饲料后肠道细菌16S rRNA的特异性区域进行测序，应用Usearch和R语言软件分析其肠道细菌群落结构、物种丰度及多样性的差异。结果表明，厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）为斜纹夜蛾3龄幼虫肠道细菌的共有优势菌门。相较于取食无胃毒性的‘FXBX’辣椒叶片和人工饲料，取食‘BLTY’ 品系辣椒叶片的肠道菌群Alpha多样性指数显著上升，菌群组成和结构差异显著。在门水平上，变形菌门、放线菌门（Actinobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）相对丰度升高；在属水平上，有益菌肠球菌属（Enterococcus）相对丰度降低，而致病菌沙门氏菌属（Salmonella）、布鲁氏菌属（Brucella）、寡养单胞菌属（Stenotrophomonas）相对丰度显著升高。KEGG代谢差异分析发现，取食‘BLTY’品系辣椒会使肠道细菌外源化合物的生物降解和代谢通路的相对丰度显著上升。以上结果说明斜纹夜蛾在取食‘BLTY’ 品系辣椒后肠道细菌群落结构和多样性均发生变化，即有益菌的相对丰度下降，而致病菌的相对丰度上升。
关键词：
辣椒 斜纹夜蛾 抗性 肠道细菌 菌群结构
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