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[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
王春源 熊力 杨红文 郭小江 张依裕 谭元成 杨酸
【目的】基于串联体量标记(TMT)定量蛋白组学技术探讨柯乐猪母猪乳腺发育的调控机制，为选育工作提供依据。【方法】选取乳腺发育正常和异常的柯乐猪母猪各3头，采集乳腺组织，利用TMT定量蛋白组学技术探究正常和异常乳腺组织的差异表达蛋白，筛选与乳腺发育相关的差异关键蛋白，并对差异表达蛋白进行生物信息学分析。【结果】从柯乐猪乳腺组织中共筛选出474个差异表达蛋白，包括245个上调蛋白、229个下调蛋白；基因本体(GO)功能注释和富集分析显示，差异表达蛋白主要富集在上皮细胞分化、皮肤形成和肾小管上皮细胞分化等生物学过程中，主要分布在胞外区和细胞外空隙中，参与调节肽酶抑制剂活性和肽链内切酶活性；京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析显示，差异表达蛋白主要富集在补体系统、过氧化物酶体增殖物激活受体和金黄色葡萄球菌感染等信号通路上；结合差异表达蛋白互作网络分析，筛选出10个核心差异表达蛋白[上调蛋白有P14287(骨桥蛋白)、F1RXF9(角蛋白25)、I3LDS3(角蛋白10)、Q75QW1(上皮细胞黏附分子)、A0A5S8KLN1(丛生蛋白)、F1RW75(桥粒素),下调蛋白有A0A286ZT13(白蛋白)、P06867(血纤维蛋白溶酶原)、F1SCC9(含丝氨酸蛋白酶抑制剂结构域的蛋白)、P50447(α-1-抗胰蛋白酶)]。【结论】采用TMT定量蛋白组学技术能有效筛选出母猪正常和异常乳腺组织中的差异表达蛋白。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
李晨雷 齐昆龙 刘蓥珂 叶建伟 李新建 王克君 李秀领 乔瑞敏 韩雪蕾
为解决养猪生产中传统发情鉴定法工作量大、准确率低等问题,本研究以经产大白母猪为研究对象,将发情周期分为发情前3天(PE),发情期(E)和发情后3天(AE)3个阶段,分别收集口腔中唾液,提取唾液蛋白,使用Lable-free定量蛋白组学技术对3个阶段的唾液蛋白组进行质谱检测,并通过蛋白质组学定性定量软件Maxquant进行分析。结果显示:1)3个阶段共鉴定到405个蛋白质,包括149个共有蛋白和160个特异蛋白,其中有45个共有蛋白差异达到显著水平(P
关键词：
大白母猪 发情鉴定 唾液蛋白组 蛋白互作
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
杨铭宣 刘梦杰 王晋 虞德兵
[目的]本试验旨在研究日粮添加姜黄素对由热应激引起的蛋鸡肝脏抗氧化性能损伤的影响。[方法]以南京盘滁机械化养鸡场提供的180只280日龄海兰蛋鸡为研究对象，随机分成3组，对照组（Control）饲喂基础饲粮，环境温度为24±2℃；热应激组（HS）是基于对照组的基础上每天维持热应激6h以上，环境温度为34±2℃；姜黄素组（HS+CUR）是在热应激组的基础上，饲喂基础饲粮中添加150mg·kg~(-1)姜黄素的试验饲粮；每组4个重复，每个重复15只鸡。为了探究姜黄素对热应激蛋鸡肝脏的保护作用，采集蛋鸡肝脏组织样利用TMT蛋白质组学技术分析蛋鸡肝脏蛋白质差异表达。[结果]首先检测了蛋鸡肝脏的抗氧化功能，实时荧光定量PCR结果显示热应激组与对照组相比肝脏sod1和gpx1的表达极显著降低（P＜0.01)，cat表达显著降低（P＜0.05)；在添加姜黄素后可以极显著增加肝脏sod1和gpx1表达（P＜0.01)，显著增加cat表达（P＜0.05)。TMT (TandemMassTags)蛋白组学分析共检测到5039个蛋白，其中4235个具有定量信息，结果显示差异表达蛋白主要参与脂质和葡萄糖代谢，氧化应激，线粒体功能障碍和炎症反应等生物进程；主要参与的途径有PPAR信号通路，过氧化物酶体，脂质代谢，细胞色素P450，生物合成以及脂肪细胞因子信号通路等。进一步的，我们选取15个显著表达的差异蛋白进行在基因水平上的验证，结果表明基因水平和蛋白组学分析结果一致。[结论]本研究结果提示，补充姜黄素可以缓解蛋鸡由热应激引起的肝脏氧化应激以及与脂质代谢相关生物学过程。
关键词：
热应激 肝脏 氧化应激 脂质代谢
[期刊] 华北农学报
[作者]
赖多 曹永军 卢梦玲 徐汉虹
活性测定表明仙人掌苷对荔枝霜疫霉菌菌丝生长具有良好的抑菌活性,EC50达到173.52μg/mL。为了从蛋白质水平探讨仙人掌苷对荔枝霜疫霉菌的抑菌机制,利用蛋白质双向电泳方法分析仙人掌苷处理前后荔枝霜疫霉菌蛋白质组表达的差异,结合飞行质谱以及数据库检索鉴定差异蛋白。结果发现,仙人掌苷处理后荔枝霜疫霉菌有16个蛋白发生了显著变化,其中11个下调表达蛋白,4个上调表达蛋白,1个诱导表达蛋白。其中鉴定的5种差异蛋白质为:线粒体二羧酸载体蛋白(DIC 1)、半胱氨酸合成酶A、ABC转运蛋白(ABCF-EF-3)、Class III stress response-re-lated ATPase以及假定...
关键词：
仙人掌苷 荔枝霜疫霉菌 抑菌活性 蛋白组
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
舒建洪 潘智芳 郑月茂 石玉强 张涌
通过RT-PCR技术从人乳腺癌组织中扩增出长度为2259 bp的人乳铁蛋白cDNA,PCR产物经凝胶回收纯化后,克隆在pMD 18-T载体的T位点。测序结果和序列分析显示,与GenBank中收录的人、小鼠、奶牛和山羊的乳铁蛋白cDNA序列的同源性分别为99．73％,82．19％,81．79％和87．28％。其中与人乳铁蛋白cDNA 序列相比,发现有5个碱基因等位基因间的突变而发生变异,1个碱基发生了未知的突变,表明已成功的扩增、克隆了人乳铁蛋白基因cDNA序列,此基因序列的GenBank登录号为AY165046。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
孙瑞萍 陈婷 王峰 晁哲 刘海隆 刘圈炜 黄丽丽 邢漫萍 郑心力 魏立民
为比较五指山猪和长白猪生长后期肌肉生长发育的差异,以6、8月龄五指山猪和长白猪为试验对象,采用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)对其背最长肌总蛋白进行鉴定,结合生物信息学技术筛选品种间和品种内差异蛋白,并对其进行KEGG通路富集分析。结果表明:4组样品中共鉴定到1713个蛋白;五指山猪和长白猪品种间比较,6、8月龄猪中分别有460、337个差异的蛋白;品种内2个生长阶段比较,五指山猪和长白猪中分别有421、275个差异蛋白;2种比较均为上调的差异蛋白数多于下调差异蛋白数;KEGG通路分析发现,在五指山猪和长白猪品种间,6、8月龄在2个品种间的差异蛋白富集到差异显著(P<0.05)的条目分别为34、33个,在品种内,五指山猪和长白猪在2个生长阶段间的差异蛋白富集到差异显著(P
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
孙瑞萍 陈婷 王峰 晁哲 刘海隆 刘圈炜 黄丽丽 邢漫萍 郑心力 魏立民
为比较五指山猪和长白猪生长后期肌肉生长发育的差异,以6、8月龄五指山猪和长白猪为试验对象,采用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)对其背最长肌总蛋白进行鉴定,结合生物信息学技术筛选品种间和品种内差异蛋白,并对其进行KEGG通路富集分析。结果表明:4组样品中共鉴定到1713个蛋白;五指山猪和长白猪品种间比较,6、8月龄猪中分别有460、337个差异的蛋白;品种内2个生长阶段比较,五指山猪和长白猪中分别有421、275个差异蛋白;2种比较均为上调的差异蛋白数多于下调差异蛋白数;KEGG通路分析发现,在五指山猪和长白猪品种间,6、8月龄在2个品种间的差异蛋白富集到差异显著(P<0.05)的条目分别为34、33个,在品种内,五指山猪和长白猪在2个生长阶段间的差异蛋白富集到差异显著(P
[期刊] 水产学报
[作者]
陶丽寒 胡丹丹 张嘉俊 陶会竹 李槿年
为探讨鱼类感染拟态弧菌后脾脏和肠黏膜组织蛋白差异变化,本研究以拟态弧菌04-14分离株人工感染实验动物草金鱼,利用双向电泳(2-DE)结合质谱技术对感染前后脾脏和肠黏膜组织的差异蛋白组学进行研究。结果显示,感染后脾脏和肠黏膜组织中分别有11个和12个显著差异表达蛋白点,经MALDI-TOF-MS质谱鉴定出19种显著差异表达蛋白,其中上调表达蛋白10种,下调表达蛋白9种,α-淀粉酶、载脂蛋白A-I、β-肌动蛋白和过氧化物还原酶2为两种组织中共同存在的显著差异表达蛋白。GO注释分析表明,显著差异表达蛋白分别定
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杨永新 张勇 周雷 程广龙 陶金忠 赵兴绪
【目的】通过分析临床健康和乳房炎奶牛乳腺组织膜蛋白的差异表达,以期在蛋白质水平探索奶牛乳房炎的发生机理。【方法】采用二维凝胶电泳技术分离了临床健康和乳房炎奶牛的乳腺组织膜蛋白,经考马斯亮蓝染色后PDQuest 7.4软件匹配、检测凝胶中差异表达的蛋白点,对12个差异蛋白点采用高效液相色谱串联离子阱质谱分析,SEQUEST软件搜索NCBInr数据库。半定量RT-PCR分析差异表达蛋白的mRNA水平。【结果】12个差异蛋白点鉴定为11种蛋白质,其中9个蛋白点在临床型乳房炎奶牛乳腺组织膜蛋白中表达量上调而3个蛋白点表达量下调,主要涉及细胞膜骨架系统、信号转导、物质结合和传递等生物学功能。半定量RT-...
关键词：
奶牛 乳房炎 乳腺膜蛋白 蛋白质组
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张勇 杨永新 赵兴绪
【目的】采用比较蛋白质组学技术分析、检测了临床健康与乳房炎奶牛乳腺组织中的差异表达蛋白,以寻找药物治疗目标,探讨奶牛乳房炎的发生机理。【方法】采用二维凝胶电泳分离临床健康与乳房炎奶牛的乳腺组织蛋白,考马斯亮蓝染色,PDQuest7.4软件自动匹配检测差异表达蛋白斑点,高效液相色谱串联离子阱质谱分析鉴定。【结果】凝胶图谱中检测出15个差异蛋白斑点,串联质谱分析后有12个蛋白斑点可搜索到相应的结果,对应于10种蛋白质,主要涉及结合、运输和催化活性等分子功能,参与细胞、代谢及生物调节等生理过程。【结论】临床健康与乳房炎奶牛的乳腺组织中蛋白的表达模式存在差异,表达差异蛋白与奶牛乳房炎的发生相关,对其分...
关键词：
奶牛 乳房炎 乳腺组织 蛋白质组
[期刊] 海洋渔业
[作者]
陈漪 胡瑞芹 冉皓宇 陈良标
斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用i TRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用i TRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用i TRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
于东立 宋晓欧 鲍亚林 林思远 王建升 王秀娟 卢唯 赵弘巍
[目的]水稻葡糖酸氧化酶1(OsGLO1)定位于水稻过氧化物酶体(peroxisome),参与过氧化氢的产生,但其是否参与水稻对稻瘟病抗性的调控还未见报道。本研究的目的是为了考察OsGLO1在水稻对稻瘟病抗性中的作用。[方法]以水稻‘日本晴’和稻瘟病病菌互作体系为研究对象,使用定量蛋白质组学技术,比较和分析了亲和型和非亲和型稻瘟病菌菌株侵染引起的水稻蛋白质表达变化。[结果]研究发现水稻OsGLO1蛋白的表达受到亲和型稻瘟病菌侵染的特异性抑制,但是在非亲和反应中的表达量变化则不明显。水稻原生质体过表达和沉默
[期刊] 西南农业学报
[作者]
马健 王振勇 王允田 杨笃宝 刘操 高媛媛 张西营 陈甜甜
本实验采用醋酸纤维素薄膜电泳法分离了低酸度酒精阳性乳患牛血清中各蛋白组成成分,并测定了血清蛋白组份的相对百分含量。结果表明:酒精阳性乳患牛血清总蛋白含量没有显著变化(P>0.05);各血清蛋白组分中,清蛋白、α-球蛋白没有显著的变化(P>0.05);但β-球蛋白极显著升高(P<0.01),γ-球蛋白显著升高(P<0.05)。由此可见,酒精阳性乳患牛体内血清蛋白组分发生了变化,这种变化可能是酒精阳性乳患牛体内氧化损伤及甲状腺机能降低所致。
关键词：
酒精阳性乳 醋酸纤维素薄膜电泳 血清蛋白
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
程金波 王加启 卜登攀 刘光磊 张春刚 董晓丽 魏宏阳 周凌云 刘开朗
研究小鼠不同生理阶段以及免疫条件下,乳腺内乳铁蛋白基因mRNA表达量的变化。选择120只健康昆明小白鼠,于分娩后4 d进行如下制剂处理:脂肪酶蛋白(Lipase)、空免疫刺激复合物(ISCOM)和Lipase。于分娩后8和12 d(即注射后4和8 d)用间接ELISA法测定乳中和血清中的特异性IgG含量,用Real Time PCR检测小鼠乳腺中乳铁蛋白基因的相对表达量。另外,正常生理状态乳腺内乳铁蛋白基因mRNA表达量的变化分别是在分娩后1、4、8和12 d进行检测。结果表明,正常状态下,小鼠分娩后1 d时,乳腺内乳铁蛋白基因mRNA表达量相对较高,而在分娩后4、8和12 d时较低;免疫条件...
关键词：
小鼠 免疫刺激 乳腺 乳铁蛋白 基因表达
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李午佼 颜瑾 王运生
通过SignalP 3.0、TargetP 1.1、KohGPI、TMHMM 2.0等系列软件对南方和北方根结线虫分泌蛋白组进行预测。结果表明,南方和北方根结线虫预测分泌蛋白数为2 622和1 696个,分别占总基因数的13.65%和12.95%。经BlastP(E
关键词：
根结线虫 分泌蛋白 模体
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