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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
康强 周鑫 罗燕 田青 程建国 赵位
【目的】探索从林麝粪便中提取基因组ＤＮＡ并进行物种鉴定的可行性，为林麝野外调查工作以及分子粪便学在林麝保护中的应用提供科学依据。【方法】采集林麝粪便，采用改良的ＣＴＡＢ抽提基因组ＤＮＡ；按常规ＰＣＲ法对ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因进行扩增测序后，用ＤＮＡｍＡＮ ６．０软件进行系统发育分析；在不同温度存放不同时间，研究林麝粪便基因组ＤＮＡ的提取与ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因ＰＣＲ扩增的时效性。【结果】以提取的基因组ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ扩增均能特异性地扩增出ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因。系统发育分析结果表明：所扩增产物为林麝的ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和．．．
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
张杰 张晓鹏 李鹏高 赵志强
分别将研磨、水煮两种预处理方法和改良CTAB法、试剂盒法两种提取方法进行组合,比较提取小鼠粪便细菌基因组DNA的效果。结果发现,研磨预处理过的样品提取到的细菌基因组DNA的浓度和纯度均高于水煮预处理过的样品,研磨结合改良CTAB法提取到的DNA完整性好于其他方法,研磨结合改良CTAB法是一种提取粪便细菌基因组DNA较为实用可靠的方法。
关键词：
粪便 细菌基因组DNA 提取方法
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
赵金艳 刘榜 王文君 张宇 张庆德
以大白猪背最长肌、脾脏、耳组织为材料,用碱裂解法和酚-氯仿法分别提取猪基因组DNA,用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增检测DNA的产量和质量,结果发现2种方法提取的DNA产量没有明显差异。通过猪MC4R、TEF-1基因特异引物进行PCR扩增均能得到目的条带。碱裂解法提取的DNA原液稀释5倍、10倍后作为模板均获得了较为稳定的扩增产物。该结果表明,简单、快速、无毒的碱裂解法适用于动物定性PCR检测时DNA的提取。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
马艳芝 张玉星
中国梨属植物资源丰富,RAPD技术已广泛用于梨资源遗传多样性研究。通过对不同部位提取的DNA纯度进行测定,并进行RAPD扩增分析,为RAPD技术在梨属种质资源中的应用提供参考。以鸭梨和杜梨为试验材料,利用CTAB法对其幼叶、老叶及韧皮部等不同组织或同一组织的不同时期进行了基因组DNA的提取,并对其进行了RAPD反应的比较。所提取的鸭梨的幼嫩叶片、成熟叶片、韧皮部DNAOD260/OD280的比值分别为2.0、1.8、1.7;杜梨幼嫩叶片、成熟叶片、韧皮部DNAOD260/OD280的比值分别为1.9、1.8、1.6。二者都能成功进行RAPD扩增,且扩增结果基本一致。利用CTAB法从鸭梨和杜梨的...
关键词：
梨属 不同部位 基因组DNA RAPD
[期刊] 华北农学报
[作者]
郭光艳 李瑞芬 张敬原 葛荣朝 赵茂林 黄占景 沈银柱
用227对小麦微卫星引物对多枝赖草基因组DNA进行PCR扩增,共有81对引物有扩增产物,占所用引物的35 7%。这81对小麦微卫星引物涉及101个微卫星位点,覆盖了小麦全部7个部分同源群。其中有76对引物可在多枝赖草和中国春及丰抗13间扩增出多态性标记。这说明多枝赖草虽然和普通小麦亲缘关系较远,但小麦SSR引物还是可以在多枝赖草上应用的,这不仅拓宽了小麦微卫星引物的使用范围,更重要的是为使用小麦微卫星引物对普通小麦与多枝赖草远缘杂交种质材料进行深入研究奠定了基础。
关键词：
小麦微卫星引物 多枝赖草
[期刊] 西南农业学报
[作者]
苟本富
采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测,比较了2种方法的多态性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,共获得108个AFLP标记,片段大小在100~2000 bp,得到33个多态位点,多态性位点百分率为30.56%;双酶切采用25对双酶切AFLP引物,在50~600 bp扩增出清晰条带658条,得到182个多态位点,占总扩增带的27.6%。对多态性片段进行统计,计算出不同品种间的相似系数和遗传距离。结果表明:硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远,且其它四种蔷薇的遗传距离均较近,这与蔷薇品种来源和培育史...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
周美丽 王立志 闫天海 杨营 徐琴 王继文 郭伟
为研究林麝粪便细菌的结构与组成，选取６只２～３岁的圈养条件相同且健康的公林麝，饲喂精粗比为２∶８的饲粮，收集其新鲜粪便，提取其总ＤＮＡ，然后用１６ＳｒｒＮＡ细菌通用引物进行ＰＣｒ扩增，并用ＩｌｌｕｍＩＮＡ ｍＩＳｅｑ２５０Ｐｅ测序平台，对扩增子进行ｍＩＳｅｑ双端测序。结果显示：１）借助ＩｌｌｕｍＩＮＡ ｍＩＳｅｑ２５０Ｐｅ测序平台对样品进行测序，共获得８５ ０９１条有效序列，５ １３３个有效ＯＴｕ。２）所得ＯＴｕ经物种注释被归类为２３个门，其中厚壁菌门（ＦＩｒｍＩＣｕＴｅＳ）（５１．１％±１９．９％）、拟杆菌门（ＢＡＣＴｅｒＯＩＤｅＴｅＳ）（３５．６％±１５．５％）、变形菌门（ＰｒＯＴｅＯＢＡ．．．
关键词：
林麝 菌群结构 OTU稀释曲线 共享菌群
[期刊] 林业科学研究
[作者]
孟现东 陈益泰
从SDS、CTAB、高盐低pH值3种方法中选择了CTAB法作为枫香适合的DNA提取方法,同时构建了枫香DNA的PCR扩增程序,并从Mg++浓度、Taq酶用量、dNTP浓度、引物浓度、DNA模板用量等方面优化了PCR扩增程序。
关键词：
枫香 DNA提取 PCR扩增程序
[期刊] 西南农业学报
[作者]
潘丽梅 朱建华 秦献泉 彭宏祥 卢美英
应用改良的CTAB法提取龙荔基因组DNA,探讨龙荔ISSR-PCR扩增反应体系的建立和优化。结果表明,经过改良的CTAB法提取龙荔基因组DNA效果良好,所提取的DNA纯度较高,符合ISSR-PCR反应的要求;龙荔ISSR-PCR最佳反应体系(反应总体积20μl):1×Buffer缓冲液(含适量Mg2+),1 UTaqDNA聚合酶,0.20 mmol/L dNTP,0.25μmol/L引物,DNA模板70~80 ng/μl,退火温度53~54℃。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
魏雨婷 周冉 刘宝庆 胡晓龙 刘树强 李林海 胡德夫
林麝饲养繁育承担着重建野生种群和保障麝香可持续利用的艰巨任务，然而其饲养种群长期受到健康状态不稳定和疾病高发的困扰，同时，受到濒危等级和试验样品的限制，迄今鲜有涉及林麝生理参数的文献。本研究于２０１４年７—８月分别采集陕西火烧店和四川米亚罗林麝饲养场的林麝粪样，采用酶联免疫法（ＥＬＩＳＡ）测定雌麝粪便中三碘甲腺原氨酸（Ｔ３）的含量，以探讨雌麝粪便Ｔ３值表达的生理状态及变化趋势。结果表明，陕西火烧店和四川米亚罗饲养场雌麝粪便Ｔ３在所研究的时段内不存在显著差异；两地雌麝粪便Ｔ３在３岁至５岁期间随着年龄的增长呈现逐渐上升的趋势，但在５岁之后随着年龄的增大而逐渐下降，这可能意味着雌麝在５岁左右达到生理．．．
关键词：
林麝 粪便甲状腺激素 生理状态 指示作用
[期刊] 水产学报
[作者]
史杰 白昌明 李晨 蔡生力 王崇明
为获取2001年低温冻存栉孔扇贝感染牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)变异株(ZK2001)基因组序列,并分析ZK2001与其他Os HV-1变异株的序列差异和系统发育关系,利用基于长片段PCR的基因组DNA的扩增和富集技术,获取2001年栉孔扇贝感染Os HV-1变异株的基因组DNA;再使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对其测序。最后分析ZK2001与Os HV-1其他变异株基因组的序列差异和系统发育关系。测序数据组装后获得8个Scaffold。基因组变异分析结果显示,ZK
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
黄建安 黄意欢 罗军武 王坤波 周李华
为了从富含多酚和多糖等多种次生代谢物质的茶树叶片中分离出高质量的基因组 DNA,对 4种植物 DNA提取方法进行改良后 ,以茶树春梢为材料 ,对提取效果进行了比较 ,并首次采用 CTAB区室法提取茶树基因组DNA.结果表明 ,用该 4种方法提取的 DNA,其 OD2 6 0 / OD2 80 都在 1.8以上 ,相对分子质量均大于 2 1kb,能完全被Eco R 酶切消化 ,也能获得清晰的 PCR扩增图谱 .因此 ,只要操作合理 ,4种方法均能提取出高质量的 DNA.
关键词：
脱氧核糖核酸 茶树 提取方法
[期刊] 中国水产科学
[作者]
刘必谦 周湘池 王亚军 俞小燕
利用两种市售的DNA提取试剂盒对几种紫菜进行基因组DNA提取。该方法需要的组织量少 ,需时短 ,获得的基因组DNA纯度高 ,可被AFLP内切酶 ,特别是EcoRⅠ完全酶切 ,完全满足AFLP研究的需要。不同的DNA提取方法及提取出的基因组DNA的质量对酶切效果及以后的实验结果有影响。
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
谢一青 李志真 黄儒珠 肖祥希 王志洁
为从富含次生代谢物的光皮桦Betula luminifera嫩叶中获得高质量DNA,设计了5种先提核再提DNA的CTAB法Ⅰ,CTAB法Ⅱ,CTAB法Ⅲ,CTAB法Ⅳ及改进的SDS法,并以常规CTAB法为对照。用不同的方法就光皮桦基因组DNA进行了提取,采用琼脂糖凝胶电泳检测、A260/A280值测定、限制性内切酶处理和PCR扩增等方法对所提的DNA进行了比较分析。结果表明:实验设计的5种改进方法提取的DNA质量要比常规法的好,但提取的效果差异较大。其中改进的CTAB法Ⅰ是提取光皮桦基因组DNA的最佳方法;PCR扩增结果表明,不同的DNA提取方法会影响PCR带型的变化。图3表1参13
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘遵春 包东娥 廖明安
通过添加Vc对传统的CTAB法进行改进,结果表明:在磨样时,1 g鲜样中添加0.10 g的Vc提取的DNA质量最高;最佳提取材料是嫩芽,其次是新梢和成熟叶片。
关键词：
金花梨 基因组DNA 提取
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