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[期刊] 中国水产科学
[作者]
李盛文 贾智英 柏盈盈 李池陶 石连玉
应用35对多态性较高的微卫星标记对鲤新品种——松浦红镜鲤(Cyprinus carpio var.songpu red mirror carp)的保种群体进行了遗传结构研究。结果显示,在91尾松浦红镜鲤个体中,共检测到140个等位基因,每个位点等位基因数3~6个,平均有效等位基因数为3.042 6;期望杂合度范围为0.375 0~0.827 4,均值为0.649 3;多态信息含量范围为0.396~0.912,均值为0.586 9;哈迪-温伯格平衡检验结果表明群体处于不平衡状态;平均固定系数为-0.026,说明该群体存在杂合子过剩现象;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计...
关键词：
松浦红镜鲤 微卫星 群体遗传结构 保种
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾智英 李飞 李池陶 石连玉
松浦鲤作为鲤鱼的一个培育品种,在我国北方地区的鱼类养殖实践中占有重要地位,为了促进该品种优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用,本研究应用29对多态性较高的微卫星标记对松浦鲤保种群体进行了遗传结构研究。结果显示:在194尾松浦鲤个体中,共检测到166个等位基因,平均有效等位基因数为5.724 1,平均多态信息含量为0.584 9,平均期望杂合度为0.572 2;哈迪-温伯格平衡检验结果群体处于不平衡状态;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为69.8。该研究表明人工选择压力对松浦鲤保种群体造成了较大影响,虽然其仍具有较丰富的遗传多样性,但由于经历了瓶颈效...
关键词：
松浦鲤 保种 微卫星 遗传结构
[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘娟 袁林聪 李伟斌 白寿有 李进荣 蔡实旺 尹馨玉 孔令富 武祥伟
杞麓鲤(Cyprinus carpio chilia)是云南特有水产种质资源，为研究杞麓鲤保种群体的遗传结构，本研究开发了15个多态性高的杞麓鲤微卫星(SSR)分子标记，并对保种群体进行了SSR分析。结果显示：杞麓鲤保种群体40个个体的平均等位基因数为7.8个，有效等位基因数为3.2～8.9,期望杂合度为0.696 4～0.900 0,多态信息含量为0.647 6～0.877 0,保种群体遗传多样性水平较高。基于突变模型与等位基因分布均检测到了保种群体的瓶颈效应，近交系数F_(is)为0.249 7,保种群体存在近交现象，并且10个SSR位点偏离Hardy-Weinberg平衡。结果表明杞麓鲤保种群体的遗传多样性较高，但经历了瓶颈效应，不利于继续保种。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
赵新春 贾智英 李盛文 李池陶 石连玉
【目的】研究易捕鲤的群体遗传结构，为其优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用奠定基础。【方法】提取９６尾易捕鲤个体的鳍条基因组ＤＮＡ，以其为模板，利用３０对微卫星标记进行ＰＣＲ扩增，根据基因型，利用生物信息学软件对各种遗传参数进行分析。【结果】在９６尾易捕鲤个体中，共检测到１５４个等位基因，每个位点的等位基因数３～９个，平均有效等位基因数为４．０６０ ７；期望杂合度为０．５９６ ９～０．８７１ ０，平均为０．７４０ ０；多态信息含量为０．６２８ ０～０．８５５ ０，平均为０．７０２ ２，说明此品种具有较丰富的遗传多样性；哈迪－温伯格平衡检验结果表明，群体处于不平衡状态；群体平均固定系数为－０．．．
关键词：
易捕鲤 微卫星 遗传结构 保种
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
王成辉 李思发 赵金良
采用聚丙烯酰胺凝胶水平电泳,分析了兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤和瓯江彩鲤的8种同工酶和1种肌蛋白。结果发现,荷包红鲤的多态位点比例最高(21.05%),瓯江彩鲤和玻璃红鲤相等(15.79%),兴国红鲤最低(10.53%);群体平均杂合度期望值为0.0458～0.0742,平均杂合度观察值为0.0440～0.0748;聚类分析表明,兴国红鲤、玻璃红鲤和瓯江彩鲤为同一分支,荷包红鲤为另一分支。
关键词：
红鲤 群体 同工酶 遗传差异
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
贾智英 池喜峰 李池陶 张玉勇 石连玉
利用AFLP技术对2007年、2008年所采集的我国北方网箱养殖中出现爆发性死亡的德国镜鲤的死亡个体和存活个体分子样品进行遗传结构分析,以期对德国镜鲤群体内二者遗传变异进行快速而准确的评价。研究结果表明,(1)8对引物组合共扩增出289个条带,其中多态位点比例为47.40%,每对引物多态位点比例为18.8%~56.3%。(2)死亡和存活个体在两年采集样品中的遗传相似性系数分别为0.981 8和0.986 2,遗传分化系数分别为0.037 4和0.037 9,表明死亡个体和成活个体遗传分化程度较低。(3)在两年采集样品中死亡个体平均多态位点比例均低于存活个体,平均杂合度在2007年采集的样品中死...
关键词：
德国镜鲤 抗病性能 遗传变异 抗病育种
[期刊] 水产学报
[作者]
孙效文 鲁翠云 匡友谊 金万昆 沈俊宝 朱晓东 李大宇 马海涛 于冬梅
利用扩增效果好、在群体中具有多态性的28个微卫星标记,检测国家换新良种场的镜鲤繁殖群体和黑龙江水产研究所松浦实验场的镜鲤繁殖群体的遗传组成,计算了两个群体的有效等位基因数,期望杂合度和多态信息含量等遗传参数,换新与松浦两个群体的有效等位基因数分别为2.874和3.102,期望杂合度分别是0.565和0.603,多态信息含量分别是0.534和0.568;遗传结构分析研究结果表明这两个群体的多样性较高,信息含量丰富,具有进一步筛选出优良品种的遗传基础。但连锁不平衡分析表明这两个群体在较大的选择压力下,已严重偏离Hardy-Weniberg平衡,要保持群体的优良性状相关的遗传基础,应该在进一步的选种...
关键词：
镜鲤 繁殖群体 遗传结构 基因型
[期刊] 中国农业科学
[作者]
鲁云风 王茜 黄文波 史利华 吴克亮
【目的】基于微卫星标记特点,采用计算机模拟技术,探讨畜禽保种群遗传多样性的变化过程。【方法】选择30个均匀分布于基因组、具有4—10个等位基因的标记位点,位点间无相互作用;模拟产生的畜禽保种群公母比例为1﹕5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定,世代间无重叠,群体有效大小分别为Ne=10、20、50、100和200,保种繁殖50个世代,1 000次重复。采用多态性位点数(num-p)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ae)、观测基因杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、稀有等位基因数(RA)、缺乏丰富位点数(NRP)作为遗传多样性度量指标。【结果】保种群体的遗传多样性总体...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
鲁翠云 杜雪松 郑先虎 李超 程磊 孙志鹏 孙效文 陈忠
为了评估金边鲤(Cyprinus carpio var.Jinbian)群体的遗传组成,制定合理的繁殖配组策略,本研究用24个QTL标记分析了金边鲤亲本群体的遗传结构及雌、雄个体间遗传距离。结果显示:在192尾样本中共检测到184个等位基因,群体平均等位基因数(N_o)、有效等位基因数(N_e)、观测杂合度(H_o)、期望杂合度(H_e)和多态信息含量(PIC)分别为7.667、3.941、0.590、0.707和0.670,表明群体处于高度多态水平(PIC≥0.5),具备进一步选育优良品种的遗传潜力。经Bonferroni校正的Hardy-Weinberg平衡检验显示,金边鲤群体有10个位点显著或极显著偏离平衡,多数位点表现为杂合子缺失。在此基础上统计了金边鲤雌、雄个体间的遗传距离在0.1231～1.8563之间,遗传距离呈正态分布,且中间值位于0.7～0.9,占38.36%,结合聚类图将192个个体划分为3个繁殖组,组间呈现出显著的遗传分化,交叉配组能够有效避免近亲繁殖。研究结果为金边鲤选育、繁殖配组及持续利用提供参考。
[期刊] 水产学报
[作者]
王成辉 李思发 邹曙明
用13种限制性内切酶对兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤及瓯江彩鲤4种红鲤的线粒体DNA(mtDNA)进行RFLP分析。共产生17种限制性态型,其中5种酶为限制性片段长度多态性(RFLPs),归结为5种单倍型;兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤和瓯江彩鲤的核苷酸多样性(π)分别为0.0087、0.0059、0.0094、0.0286,瓯江彩鲤的遗传多样性最为丰富;瓯江彩鲤起源于单倍型II为主的母系祖先,推算分化时间分别约在11.5万年、9.5万年前;玻璃红鲤和荷包红鲤起源于单倍型I为主的母系祖先,推算分化时间分别约为5～5.6万年、2万年前。
[期刊] 林业科学
[作者]
徐斌 张方秋 潘文 刘有成
红锥(Castanopsis hystrix)是壳斗科(Fagaceae)锥属(Castanopsis)的常绿乔木,天然分布于我国广东、广西、云南、海南以及福建南部(中国树木志编委,1981;《广东森林》编辑委员会,1990),是我国华南地区一个重要的生态公益林树种和珍贵用材树种。红锥为二倍体,2n=2x=24(Http://www.tropicos.org/Name/),单性花、雌雄同株,以风媒传
关键词：
红锥 ISSR 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 华北农学报
[作者]
张超 佟广香 匡友谊 尹家胜
利用29对多态性较好的微卫星引物对哲罗鱼保种群体332个个体(由4个子代群体组成)进行遗传多样性的分析。结果表明:29对引物扩增的等位基因数为2~13,平均有效等位基因数为3.961 3,平均观测杂合度Ho和平均期望杂合度He分别为0.642和0.675 1,平均多态信息含量PIC为0.633。4个子代群体的遗传多样性趋势为B7(F1♀×野生♂3×3)略高于B10(F1♀×F1♂3×3),B10(F1♀×F1♂3×3)略高于B6(野生♀×野生♂3×3),B9(F1♀×F1♂1×1)最低。4个群体间的遗传距离趋势为:除F1♀×F1♂1×1群体外,野生♀×野生♂3×3群体与F1♀×F1♂3×3群体...
关键词：
哲罗鱼 遗传多样性 微卫星 保种
[期刊] 中国水产科学
[作者]
鲁翠云 张晓丽 顾颖 李超 董在杰 冯建新 程磊 孙效文
用微卫星标记分析了鲤鱼（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ Ｌ．）的２个品种福瑞鲤和豫选黄河鲤选育群体的遗传结构，并揭示了雌雄个体间遗传距离的分布规律。结果表明，２３个微卫星标记在福瑞鲤（Ｆｒ，ｎ＝１９２）和豫选黄河鲤（ｙＸ，ｎ＝９６）中各检测到１６０个和１３１个等位基因。福瑞鲤的平均有效等位基因数（ｎ＿ｅ）、观测杂合度（Ｈ＿ｏ）、期望杂合度（Ｈ＿ｅ）和多态信息含量（ｐｉＣ）分别为４．５５９、０．６９５、０．７４１和０．７０２，群体处于高度多态水平（ｐｉＣ≥０．５）；豫选黄河鲤的４项遗传多样性参数分别为３．６２０、０．６６５、０．６４２和０．６００。虽然豫选黄河鲤同样处于高度多态水平（ｐｉＣ≥０．．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
刘军 陈益泰 姜景民 何贵平 余国民
利用SSR分子标记对分布在我国的7个毛红椿群体进行了遗传结构研究。结果表明:毛红椿群体具有较低水平的遗传变异;毛红椿群体的等位基因的平均数为6.1,有效等位基因数平均为2.7,平均期望杂合度为0.600 6;毛红椿群体遗传分化系数(FST)平均值为0.185 4,在FST值的基础上估算毛红椿群体间的基因流(Nm)为1.098 3。采用平均距离方法(UPGMA)对7个群体进行了聚类,对各群体遗传距离与地理距离的相关分析表明:群体间遗传距离与地理距离显著相关。分析了毛红椿濒危的原因,并提出了保护策略。
关键词：
毛红椿 SSR 分子标记 遗传结构
[期刊] 林业科学
[作者]
胡新生
一个植物种群体的空间分布大致可划分为两类 :离散分布与连续分布。然而隐藏在这种表观物理分布内部的遗传变异是十分复杂的。这种变异是如何分布的呢 ?这种分布又是如何维持的呢 ?因此 ,认识一个种的群体遗传结构有助于我们理解该种的进化过程 ,并提供为遗传资源保护做出决策的重要信息。本文对三大经典遗传结构模型 (岛屿模型、步石模型及距离隔离模型 )与渐变群理论及它们的异体和发展进行了详细的分析和评述。目前获得的许多不同类型的遗传标记使这些理论的应用得到不同程度的实现 ,但由于这些理论结论涉及到许多假设 ,在实际应用时应十分慎重。作者认为许多已建立的适合于动物群体遗传结构理论不能简单地直接应用于植物群体...
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