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[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张俊娥 范鑫磊 梁英梅 田呈明
为探究杨树腐烂病菌的表观特征、遗传多样性以及它们与不同寄主杨树派别和病原菌地理来源的关系,本文收集来自我国14个省份的106份杨树腐烂病标本,纯培养观察记录菌落生长状况,分析菌株培养形态多样性,并从中选取背景信息差异较大的菌株34份,采用SRAP和ISSR两种标记方法分析其遗传多样性。结果显示:杨树腐烂病菌同一菌株在不同条件下的培养性状稳定;不同菌株的培养形态差异明显,且各类别间菌株的培养性状与寄主植物、地理来源没有明显相关性。利用获得多态性良好的12对SRAP引物和20条ISSR引物分析得出群体的Nei
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
黄宇飞 赵奎华 刘长远 梁春浩 王辉 刘丽 王雪洁
为了明确辽宁省不同地区葡萄白腐病菌遗传分化情况,对采自辽宁省沈阳、朝阳、锦州、营口、大连、辽阳等主要葡萄产区的病样进行分离鉴定,对病原菌形态学进行观察及r DNA-ITS序列分析,测得的序列与GenBank中已知序列进行比对,并利用MEGA5.05进行聚类分析。结果表明:分离得到的42株白腐病菌菌落形态基本一致,菌丝平伏,有隔膜,分生孢子器呈球形或扁球形,暗褐色,球内含有大量分生孢子,有孔口;分生孢子单孢,卵圆形,最初无色,后变为暗褐色。病菌rDNA-ITS序列与已知序列的相似度达99%以上,42个菌株的ITS序列同源性极高,不同地区葡萄白腐病菌区域性特征不明显。
关键词：
葡萄白腐病菌 ITS序列 同源性分析
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
杨艳 李永进 黎蕾 吴毅 杨柳 田野 唐洁 汤玉喜
【目的】综合表型性状及分子标记多样性分析探明供试的62个杨树无性系的遗传多样性，为杨树进一步遗传改良奠定基础。【方法】选取地径、苗高、叶面积、叶长、叶宽、叶柄长、叶绿素、侧枝数、叶厚、单株总叶片、叶片干质量、叶片含水率等12个表型性状和ISSR分子标记对杨树无性系个体间进行遗传多样性分析，利用PopGen 32、SPSS 16.0及NTsys 2.10e等软件分别计算多样性指数、进行表型性状间的方差分析以及对各无性系进行UPGMA法聚类分析。【结果】侧枝数、单株叶片数、叶片干质量、叶面积以及地径的变异系数均达到了10%以上，叶柄长、叶长、苗高的变异系数也达到了8%以上的水平。利用5条ISSR引物检测到62份杨树无性系多态性谱带百分率平均为89.04%，基因多样度平均为0.407 4,Shannon多样性指数（I）平均为0.530 4。采用UPGMA法构建的形态和分子标记聚类图将供试材料聚成的类群均有家系内聚为一类的趋势，但也存在较大的差异；表型性状聚类分析主要是根据叶片的相关性状相似度越高的被聚为一个类群；分子标记聚类主要呈现出亲缘关系越近的无性系越容易聚为一个类群的聚类规律。【结论】供试的杨树无性系间表型性状分化程度高，具有丰富的遗传多样性，研究结果为杨树种质资源的改良、种质创新及多元化开发利用提供科学依据。
[期刊] 林业科学
[作者]
宋红竹 张绮纹 周春江
利用10对AFLP引物对杨属5个派20个种及杂种的44份杨树材料进行分析。结果表明:在这些材料中,不同引物组合的多态性均为100%,表明杨属种间及无性系间在DNA水平上存在广泛变异。利用UPGMA法对AFLP数据进行聚类分析,相似系数在0.765~0.971之间,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同。构建了44份材料的指纹图谱,在该图谱中,每个材料都具有自身独特的条带。最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张海燕 樊军锋 郑涛
[目的]正确评价杨树资源的遗传多样性,为其新品种选育和资源利用提供理论依据。[方法]以来自黑杨派和白杨派的18个杨树无性系为试验材料,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳从84对SSR引物中初步筛选出多态性较好的12对,再利用12对SSR荧光引物构建18个杨树无性系的指纹图谱并进行遗传多样性分析,同时依据遗传相似系数构建聚类图并进行亲缘关系分析。[结果]筛选出的12对引物共检测到91个多态性位点,每对引物检测到的多态性位点为4～12个,平均为7.6个,观测杂合度平均为0.482 8,Shannon信息指数平均为1.801 5,Nei’s基因多样性指数平均为0.794 8;通过引物PMGC-2385和PMGC-2500构建了18个无性系的指纹图谱,该指纹图谱可将全部无性系区分开。UPGMA聚类分析表明,18个无性系的遗传相似系数在0.549～0.978,平均遗传相似系数为0.764,黑杨派与白杨派无性系遗传相似系数变幅分别在0.681～0.978和0.549～0.912,均具有较高的遗传变异性;18个无性系被分为黑杨与白杨2大类及6个亚群,与传统形态分类学结果基本一致。[结论] 18份杨树资源的遗传多样性较为丰富,SSR分子标记技术结合STR分型检测技术在杨树资源的鉴定与分类中具有一定的可靠性。
关键词：
杨树 简单重复序列 遗传多样性 指纹图谱
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宋培玲 李子钦 杨家荣
【目的】利用ISSR分子标记技术,对不同地理来源的棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,以了解其遗传关系。【方法】选用25条引物,对来自于我国11个省(市、自治区)的28个棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,研究各菌株间的遗传相似性。【结果】从25条ISSR随机引物中筛选出9条多态性好、条带稳定的引物,用其对28个棉花黄萎病菌株进行扩增,共获得1 989条谱带,其中1 908条为多态性条带,多态性比率为95.9%,表明ISSR标记对棉花黄萎病菌具有较高的多态性;通过对棉花黄萎病菌ISSR遗传相似系数的统计与分析,得到其相关系数r=0.88,该r值介于0.8和0.9之间,表明进化树符合较好,故将ISSR标...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
谭小平 宋建伟 刘二明 刘年喜 王金辉 肖启明
选用10个随机引物,利用RAPD技术,分析了来自湖南不同县(区)的53个稻曲病菌株的群体遗传结构.结果表明:以遗传相似系数0.78,将供试53个菌株划分为5个谱系,这5个谱系所含菌株数分别为42、7、2、1、1个,分别占总株数的79%、13%、4%、2%和2%,其谱系Ⅰ为优势谱系.由此说明湖南稻曲病菌遗传群体有分化,但分化不明显;来自同一地区和不同地区同一品种的菌株大多数聚集在同一类.
[期刊] 西南农业学报
[作者]
肖丹凤 王玲 刘连盟 侯恩庆 黄世文
从黑龙江、浙江、广西3个稻区内采集稻瘟病样品,分离得到144个菌株。对其中的89个菌株进行了生理小种鉴定,将它们分成7群35个生理小种。结果表明,ZB、ZA、ZC和ZE种群出现频率分别为50.56%、22.47%、12.36%和7.86%,ZD、ZF和ZG种群频率均为2.25%。优势生理小种为ZB15和ZB1,出现频率分别为12.36%和6.74%。黑龙江优势生理小种是ZB1和ZE1,出现频率均为12.5%;浙江优势生理小种是ZB15和ZB9,频率分别达到19.15%和10.64%;广西优势生理小种为ZA11、ZA7和ZA15,出现频率分别达到16.67%,11.11%和11.11%。使用UP...
关键词：
稻瘟病菌 生理小种 遗传宗谱 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
毛岚 宋培玲 杨家荣
【目的】优化棉花黄萎病菌ISSR反应体系,筛选特异性引物,对陕西关中棉花黄萎病菌的分子水平遗传变异及其与地理来源之间的关系进行研究。【方法】用优化好的反应体系和筛选出的引物,对采集自陕西关中6个地区的棉花黄萎病菌和3个参照菌系(新疆和田、陕西泾阳、河南安阳)的亲缘关系进行聚类分析。【结果】优化的反应体系(25μL)为:dNTP、引物的浓度和TaqDNA聚合酶用量分别为150μmol/L,0.5μmol/L,1.5U。筛选到多态性强的引物842和834。在遗传相似系数为0.36处,将16个菌株分为2个遗传类群。【结论】陕西关中棉花黄萎病菌13个菌株与新疆和田、河南安阳菌系的亲缘关系较远,与泾阳菌...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
胡中会 赵立华 孔宝华 陈海如 范静华 刘飞 李小鹏 蔡红 杨根华 秦西云 方敦煌
采用ISSR和RAPD 2种分子标记方法对来自不同地区的28份烟草赤星病菌进行遗传多样性分析,筛选后选用10个ISSR引物和10个RAPD引物,ISSR扩增出多态性条带112条,多态性条带百分率为86.82%,菌株间相似性系数为0.53～0.97;RAPD引物扩增出多态性条带70条,多态性条带百分率为81.39%,菌株间相似性系数为0.57～0.94;用SPSS17.0软件对2种标记遗传距离进行相关性分析,发现2种分子标记结果呈显著正相关,表明2种分子标记方法都适合于烟草赤星病菌遗传多样性研究,ISSR是一种多态性优于RAPD的标记技术。根据2种标记的结果,利用NTSYS软件按UPGMA方法进...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈小林 颜群 李瑞芳 李焜华 韦善富 黄凤宽 韦丽丽
【目的】明确广西稻瘟病菌生理小种组成及遗传结构,为今后水稻抗病品种的选育和布局提供依据。【方法】利用我国7个稻瘟病菌鉴别品种和SSR对广西20122014年分离获得的稻瘟病菌单孢菌株分别进行生理小种鉴定和遗传多样性分析。【结果】2012-2014年分离获得的142株稻瘟病菌菌株分成ZA、ZB、ZC、ZD、ZE、ZF、ZG 7群24个生理小种,其中优势种群为ZB,出现频率67.61%,优势生理小种为ZB_9和ZB_(13),出现频率均为19.01%。运用UPGMA法对其中107个菌株进行遗传多样性分析,在0
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘佳 张梦雅 任世龙 王永芳 马继芳 全建章 刘磊 董志平 白辉 李志勇
了解谷瘟病菌的变异和群体结构，为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增，利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析，通过UPGMA方法进行聚类分析，使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明，筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析，这8对引物共扩增出条带1 728条，其中多态性条带1 492条，多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析，其相似性系数为0.77～0.85,遗传相似系数为0.802时，所有菌株被分为27个遗传宗谱(L1～L27),其中L1为绝对优势组群，共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌，占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析，9个地区谷瘟病菌的Nei′s遗传多样性指数(H)为0.141 4～0.288 1,Shannon′s信息指数(I)为0.196 0～0.441 6,河北夏谷区Nei′s遗传多样性指数和Shannon′s信息指数最高，遗传多样性最丰富，而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较，吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远，而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见，不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富，各菌株间存在遗传分化，但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。
[期刊] 华北农学报
[作者]
李婷 练森 李保华 梁文星 王彩霞
为探究苹果树腐烂病菌β-葡萄糖苷酶基因VmGluI的序列特征及其在病菌侵染致病过程中的表达,以强致病力菌株LXS080601为材料,利用RT-PCR技术克隆基因c DNA序列,通过生物信息学软件对VmGluI编码蛋白的系统进化关系、理化性质和二级结构进行分析,采用实时荧光定量PCR技术测定VmGluI的表达量。结果显示,苹果树腐烂病菌VmGluI的开放阅读框为1 689 bp(GenBank登录号KY646110),编码562个氨基酸,蛋白分子量62.7 k Da。VmGluI编码的蛋白具有糖基水解酶1家
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李文秀 贺军军 张华林 翁俊亮 李进良 罗萍
【目的】从表型性状和分子标记两个方面分析亲本和杂交子代群体的遗传特性和遗传分化，为亲本组合的甄选和杂交子代的差异分析等工作提供参考依据。【方法】以35份橡胶树杂交后代群体为供试材料，利用表型性状和SSR分子标记进行遗传特性及遗传多样性研究。【结果】32个表型性状的变异系数平均值为32.59%，其中叶枕沟的变异系数最大为60.90%，小叶柄沟的变异系数最小为0；多样性指数分布在3.22～3.53之间，平均为3.49。杂种优势分析表明，F_(1)杂种在树围、年平均增长量和产量上具有较强的杂种优势，分别为101.2%、117.2%和95.38%。在35个杂种F_(1)中，产量最高的是材料A38，最低的是材料A9。2017—2020年4年间，材料A22每年都是树围最大的杂交子代；35个F_(1)杂种的年增长量分布在5.6～10.4 cm之间，年平均周长增量居6.7～8.8 cm之间。根据分子标记分析结果，从104对引物中筛选出扩增效果较好的引物15对，利用15对SSR标记亲本和后代群体遗传多样性分析，共扩增出15个等位基因，多态信息含量值（PIC）在0.2710～0.6827之间，Shannon’s信息指数(I)，观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别处于0.5004～1.3459、0.1714～1和0.3246～0.74之间；采用UPGMA方法进行聚类分析，结果表明杂种可分为3个类群。【结论】亲本选配合理，杂交子代多样性丰富，解析了杂交子代遗传变异和遗传多样性，为杂交育种及亲本选配提供材料和理论支持。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
尹燕妮 张晓梅 葛芸英 郭坚华
采用ER IC-PCR、BOX-PCR和ITS技术,对江苏省6个市的24个小麦苗枯病菌(C lavibacter fangii)进行遗传多样性分析,并与其他10种病原细菌进行比较。结果表明,在相似率达60%时,ITS将24个小麦苗枯病菌分成了5簇。以相似性60%为界,ER IC-PCR将34个参试菌株分为14簇,而BOX-PCR只得到9簇,暗示这两种短重复序列在基因组中的分布不同;将两者电泳图谱结合,得到介于上述两者间的结果,所有菌株被分成12簇,24个小麦苗枯病菌分布在5簇中。3种分析方法相互验证,均说明江苏省小麦苗枯病菌基因组存在显著多样性。ER IC-PCR和BOX-PCR聚类证明了小麦...
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