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[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘晨龙 杨慧 张慧 张志燕 段艳宇
【目的】利用全基因组关联分析定位影响杜长大猪（ＤＬＹ）、二花脸猪（ＥＨＬ）和莱芜猪（ＬＷ）３个群体２５种血液性状的染色体位点，为最后鉴定影响这些性状的因果基因提供前期基础，同时为猪抗病育种和生产提供参考。【方法】将６１０头杜长大三元杂猪在（１８０±５）日龄，３３６头二花脸猪和３３３头莱芜猪在（３００±５）日龄进行统一屠宰。收集２ ｍ Ｌ血液于抗凝管中，利用全自动生化分析仪进行２５种血液性状的血常规检测。采集猪耳组织提取ＤＮＡ并测浓度和质量。将质检合格的ＤＮＡ样品利用ＩＬＬｕｍＩＮＡ ６０Ｋ ＳＮＰ芯片进行基因型判定。运用ＰＬＩＮＫ软件对判型结果进行质量控制，将合格的ＳＮＰ标记用于后续的关联分析．．．
关键词：
猪 血液性状 全基因组关联分析 候选基因
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宿英 阮国荣 龙毅 杨斌 张志燕 邓玮芸 吴丽花 吕显山 艾华水 肖石军 任军 黄路生 丁能水
【目的】通过基于单倍型的病例-对照全基因组关联分析(GWAS)鉴别白色杜洛克×二花脸F2资源家系中影响猪阴囊疝的易感位点及位置功能候选基因,并在远缘纯种猪阴囊疝三联体核心家系(Trio)群体中进行重复验证。【方法】利用Illumina porcine 60K SNP芯片对1 020头白色杜洛克×二花脸F2资源家系阴囊疝群体(包含19个阴囊疝患病个体)进行扫描获取基因型。通过Plink v1.07软件对基因型数据进行质量控制;剔除个体基因型检出率<90%的个体,剔除SNP位点检出率<90%、哈迪温伯格平衡卡方检验P≤10-3和最小等位基因频率<0.05及性染色体上和无法定位的SNP位点。质控合格...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
徐盼 张震 章峰 杨斌 段艳宇
【目的】整合数字基因表达谱与全基因组关联分析鉴定白色杜洛克×二花脸Ｆ＿２资源群体的血液性状候选基因。【方法】白色杜洛克×二花脸Ｆ＿２资源群体在（２４０±３）ｄ屠宰，收集血液于抗凝管中进行血常规检测。利用ＩｌｌｕｍＩｎａ ６０Ｋ ＳｎＰ芯片对１ ０２０头Ｆ＿２资源群体进行基因分型。剔除基因型检出率５％的个体。检出率＜９５％、次等位基因频率＜５％、哈代－温伯格检验（ＨＷＥ）Ｐ
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
姜志华 牛树理 冯紫云 甘信德 刘焕芝
利用二花脸、大约克及其Ｆ１、Ｆ２和回交世代的最小二乘均数，采用多元回归分析程序，对猪的产仔数主要组分性状的基因效应进行了研究。组分性状包括卵巢体积、总卵泡数、未成熟卵泡数、排卵数、卵泡成熟率和妊娠胚胎数。结果表明：加性效应是世代间遗传变异的主导因素。在卵巢体积、总卵泡数和未成熟卵泡数方面，大约克对二花脸加性效应值依次为５．３４８０ｃｍ３，５．３４０２枚和８．０５３９枚；在排卵数、卵泡成熟率和妊娠胚胎数方面，二花脸对大约克加性效应值依次为１．９７４６枚，６．８４１１％和２．６１１４个。大约克在４个性状上呈显性，即卵巢体积、总卵泡数、未成熟卵泡数和妊娠胚胎数，而二花脸仅在排卵数和卵泡成熟率方面呈显...
关键词：
猪 产仔数 组分 基因 效应
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
姜志华 刘红林 李齐贤 胡秀义
利用二花脸、大约克及其Ｆ１、Ｆ２和回交世代共８个猪群的最小二乘均数，采用多元回归分析程序，对猪的初生重、２０日龄重和６０日龄重的母体效应和基因效应进行了研究。结果表明，大约克猪初生重、２０日龄重及６０日龄重平均比二花脸猪依次高０４６１３，１３６４３和２０８９０ｋｇ。初生重受母体效应影响最大，而到６０日龄时加性基因效应则占主导地位。在总变异中，母体效应由初生时的８８８９％降至６０日龄时的４４９％；而加性效应则由初生时的５６１％升至６０日龄时的６５４７％。６０日龄时的个体重，大约克对二花脸猪的加性效应为２３１８４ｋｇ，显性效应为０１１２８ｋｇ。
关键词：
猪 早期生长性状 母体效应 基因效应
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
王海燕 贺佳玮 向安静 章程 朱猛进 赵书红 刘向东
为研究聚肌胞苷酸（ｐｏｌｙｉｎｏｓｉｎｉｃ：ｐｏｌｙｃｙｔｉｄｙｌｉｃ ａｃｉｄ，简称ｐｏｌｙ ｉ：ｃ）刺激对杜洛克×二花脸Ｆ２猪群血液参数的影响，选用杜洛克×二花脸Ｆ２猪３９３头，在３３ｄ时前腔静脉采血（对照组），在３５ｄ时用ｐｏｌｙ（ｉ：ｃ）刺激，４ｈ后采血（处理组），对刺激前后血液参数进行相关性和主成分等分析。研究结果表明，处理组与对照组相比，白细胞中的嗜中性粒细胞百分比（ｎＥ％）、淋巴细胞数（ｌｙ）和淋巴细胞百分比（ｌｙ％）这３项血液参数差异显著相关，红细胞中的红细胞压积（ｈｃｔ％）和红细胞数（ＲＢｃ）差异相关性显著，而血小板第一主成分中决定性指标血小板数（ｐｌｔ）和血小板压积（ｐｃｔ．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
杨彤彤 张婷婷 赵族 徐银学
采用PCR-RFLP方法分析大约克猪和二花脸猪SLA-DRB外显子2的多态性。结果显示:RsaⅠ酶切后得到3种等位基因条带,分别为A(141/93/11 bp)、B(111/69/54/11 bp)、D(93/48/39/54/11 bp)。χ2检测表明:二花脸猪SLA-DRB基因外显子2处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而大约克猪处于非平衡状态(P<0.01)。两品种A等位基因均为优势等位基因,AA型为主要基因型,其频率在品种间无显著差异。首次发现等位基因B、D分别出现在二花脸猪和大约克猪中,有望用于区分两品种。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
兰旅涛 郭源梅 陈从英 杨斌 毛辉荣 任军 周利华
【目的】通过测量猪体长、体高、管围、胸围、胸宽、胸深、腹围和腿臀围等8个体尺性状,应用全基因组扫描定位影响猪体尺性状的数量性状位点(QTL)。【方法】在210日龄,活体测量白色杜洛克×二花脸资源群体129头F2个体的上述8个体尺性状,利用分布于猪18条常染色体和X染色体上的183个微卫星标记,对这129头F2个体及其父母和祖代亲本进行基因型检测。应用基于最小二乘线性回归分析的复合区间作图法在QTL Express进行在线QTL定位分析,并通过1000次的Permutation来确定不同显著水平的临界值。【结果】在8条染色体上共检测到19个影响猪体尺性状的QTL,其中位于4和7号染色体上的5个Q...
关键词：
猪 体尺 QTL定位
[期刊] 华北农学报
[作者]
呼红梅 王继英 郭建凤 张印 沈彦锋 武英
旨在研究莱芜猪和杜洛克猪间肌肉H-FABP基因mRNA表达差异,同时分析H-FABP基因mRNA表达量与肌内脂肪和脂肪酸含量的相关性,探索莱芜猪肌内脂肪沉积的分子机理。试验选择100kg体重莱芜猪10头、杜洛克7头,采用荧光定量RT-PCR法测定H-FABP基因mRNA表达丰度,并测定肌内脂肪和脂肪酸含量。结果表明,莱芜猪背最长肌H-FABP基因mRNA的表达量比杜洛克猪高36.16%。莱芜猪和杜洛克猪肌肉H-FABP基因mRNA的表达量与肌内脂肪含量相关显著,H-FABP基因mRNA的表达量和肌内脂肪含量与饱和脂肪酸、饱和+单不饱和脂肪酸含量相关显著,莱芜猪H-FABP基因mRNA的表达量和...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李发弟 夏东 陈杰 赵茹茜
随机选取0、3、20、30、90、120和180日龄二花脸公猪和大白公猪各4头,用相对定量RT-PCR法研究睾丸组织中生长激素受体(GHR)基因表达的发育性变化。结果表明,二花脸猪与大白猪睾丸GHR mRNA表达的发育模式不同,二花脸猪GHR mRNA相对表达量从0到30日龄逐渐上升,在90和120日龄呈阶段性降低(P
[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈从英 朱万成 李平华 魏娜 郭源梅 高军
【目的】研究PRL、PRLR基因在白色杜洛克×二花脸F2资源群体中的遗传变异及其与母猪杀婴行为和产仔数的关联性。【方法】PRL基因的g.1317T>A、g.8905C>T、g.9056C>T位点,PRLR基因的g.1217C>T、g.1283C>A、g.1439G>A、g.1528G>A和g.1600T>A位点采用SNaPshot法对资源群体所有F0、F1和288头F2母猪进行基因型判定,分别利用传递不平衡检测(TDT)和最小二乘法分析这些位点与母猪杀婴行为和产仔性状的关联性。【结果】TDT分析发现,PRL和PRLR基因所有检测SNP位点,无论基因型还是单倍型均与母猪杀婴行为无显著相关。与母猪...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
孙梅 陈杰 赵茹茜 韦习会 刘红林
利用Bi PASA技术检测了二花脸猪OB基因的多态性 ,并且分析了其与母猪产仔性能的相关性。结果显示 ,OB基因在第 371 4碱基处存在G/T替换 ,经Bi PASA检测后分别定义为等位基因G和T。在二花脸母猪群中 ,等位基因G和T的频率分别为 0 339和 0 6 6 1。方差分析发现 ,G/G基因型个体的头胎产仔数以及平均产仔数略低于G/T型和T/T型个体 ,但相互之间无显著差异 ;在最高产仔数性状上 ,G/G型个体显著低于G/T型和T/T型个体 (P
[期刊] 中国农业科学
[作者]
吴延博 陈从英 张志燕 郭源梅 高军
【目的】猪精子黏合分子1(SPAM1)基因在精卵结合过程中发挥重要作用,是影响产仔数的重要候选基因。本试验分析SPAM1基因的遗传变异及其与母猪产仔数的相关性。【方法】以305头白色杜洛克×二花脸资源群体F2母猪为材料,记录连续3胎的产仔性状,利用PCR-RFLP检测intron1 g298C>T、intron1 g357C>T和intron3 g380C>T共3个SNP位点在F2群体中的多态性,构建单倍型,分析各SNP基因型和单倍型与母猪产仔数、产活仔数、产死胎数的相关性。【结果】intron1 g298C>T位点CC型母猪的总产仔数显著低于CT、TT型母猪(P<0.05),CT基因型母猪产...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
周李生 杨杰 刘先先 张志燕 杨斌 麻骏武
【目的】利用全基因组关联分析(GWAS)方法搜寻与苏太猪肉质性状相关的候选基因及分子标记。【方法】屠宰测定了150头苏太猪的背最长肌和半膜肌72 h pH值(包括72 h pH、45 min至72 h pH下降值)及72 h肉色性状(包括红度a,黄度b,亮度L和主观评分)。利用Illumina猪60 K SNP芯片,对这些个体进行基因型判定,用PLINK v1.07对获得的基因型数据进行质量控制,剔除检出率
[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈从英 郭源梅 杨斌 任军 黄路生
【目的】通过全基因组扫描,鉴别影响猪四肢骨骨骼长度,股骨和肱骨的骨髓腔长度、骨髓腔直径以及股骨骨壁厚度的数量性状位点(QTL)。【方法】在白色杜洛克×二花脸资源群体中测定132头240日龄阉割公猪29类四肢骨骨骼的长度、6类四肢骨骨骼直径以及股骨和肱骨骨壁厚度、骨髓腔长度和骨髓腔直径等表型性状。选择多态信息含量丰富并覆盖猪全基因组19条染色体的183个微卫星标记,采用最小二乘区间定位法进行猪全基因组扫描,定位猪四肢骨骼各性状QTL。【结果】在39个表型性状中定位到14个基因组1%显著水平QTL,14个基因组5%显著水平QTL和47个染色体5%显著水平QTL。除SSC11没有检测到QTL外,其它...
关键词：
四肢骨骼 全基因组扫描 QTL定位 猪
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