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[期刊] 华北农学报
[作者]
郭荣雨 路曼 宋晓飞 孙成振 李晓丽 闫立英
为了解旱黄瓜种质资源的遗传多样性及亲缘关系，利用黄瓜全基因组测序的４５０对ＳＳＲ引物对３８份旱黄瓜种质资源进行了多样性和聚类分析。结果表明：７２对引物共扩增出１３３个等位变异，平均每个ＳＳＲ位点的等位基因数为１．８５个，变幅为１～４个。３８份旱黄瓜种质资源的相异系数分布在０．２１５～０．７０４，其中６４５７与佳美旱黄瓜、选丰与佳美旱黄瓜、新宝与绿之秋亲缘关系较远，而ｇｆｃＳ与四季翠绿、玉翡翠与翠玉、真把握与唐山秋瓜、真把握与皇家绿秀亲缘关系较近。在阈值为０．５４处，可将这３８份黄瓜种质资源划分为Ⅰ、Ⅱ类。在阈值为０．４８处，可将Ⅰ类再分为Ⅰ＿Ａ、Ⅰ＿Ｂ、Ⅰ＿ｃ、Ⅰ＿Ｄ４个亚类，Ⅱ类可再分为Ⅱ＿．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
李艳梅 段会军 马峙英
利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析。结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0.24~0.99之间,平均相似系数为0.70,说明西瓜品种间遗传基础狭窄。用NTSYS软件进行聚类分析,57个西瓜品种被划分为2个类群。其中类群1包括1个野生西瓜,类群2均为栽培种。在类群2中引进的资源聚在一起,杂交种和双亲或其一聚在一起。此外,本研究表明,AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,能够揭示西瓜品种间的差异,是鉴定西瓜品种的有...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
苏小俊 徐海 陈龙正 宋波 袁希汉 陈劲枫
利用ISSR标记,对来源于不同地区的丝瓜种质资源的亲缘关系进行了分析。从80个ISSR引物中筛选出多态性强、重复性好的9个引物,对43份丝瓜种质基因组DNA进行扩增,共扩增出60条谱带,平均每个引物扩增出6.67条带,其中多态性带47个,多态性位点百分率为78.3%。丝瓜种质间遗传相似系数变化范围在0.37~0.98之间,暗示了丝瓜栽培种内的遗传基础相对狭窄。利用UPGMA聚类分析,43份丝瓜种质被划分为6个类群,类群的划分与形态学性状较吻合,而且与地理来源也有较高的相关性。
关键词：
丝瓜 种质资源 亲缘关系 ISSR
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张建农 赵建华 李计红 曹孜义
采用RAPD标记方法,对22份甜瓜材料进行了品种遗传多样性分析。结果显示,22个引物共扩增 出189条DNA条带,其中143条表现出多态性,占总带数的75．66％。聚类分析结果表明,22个甜瓜品种(系)中首 先可分为薄皮甜瓜与厚皮甜瓜两大类,彼此亲缘关系最远;厚皮甜瓜中网纹甜瓜与厚皮甜瓜的其他类型又被分开; 再次一级的分类为河套蜜、皇后和剩余的厚皮甜瓜。对照田间表型观察结果可见,聚类分析结果与传统分类结果相 近。
关键词：
甜瓜 亲缘关系 RAPD标记 聚类分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
向世鹏 胡日生 周向平 谢扬军 周冀衡 李辉
黑胫病是烟草大田生产的主要病害之一。烟草种质资源抗病性的筛选、鉴定和亲缘关系分析是抗病育种的基础。利用黑胫病１号生理小种对４９份种质资源进行了抗病性鉴定，并利用ＳＳＲ分子标记进行了遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明：２４份材料表现为抗黑胫病，其中大叶永烟、Ｇ８０、Ｅ９、ＭＳ２１２－８的抗性比较好；７份材料表现为中抗黑胫病；中感黑胫病和高感黑胫病材料共６份；１２份材料表现为感黑胫病。４９份烟草种质资源的平均有效等位基因数为３．０６（１．３１），平均Ｓｈａｎｎｏｎ’Ｓ信息指数为１．１８（０．３６）。２３对ＳＳＲ引物在遗传相似系数为０．６６时将４９份材料分为４个类群，第Ⅰ类群为抗病材料Ｋ３２６；第Ⅱ．．．
关键词：
烟草 黑胫病 SSR 亲缘关系
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘殿林 杨瑞环 哈玉洁 陈德富 陈喜文 夏立新
用RAPD技术对黄瓜基因组DNA进行多态性研究,分析了39份黄瓜材料的遗传差异。结果表明,所采用的172条随机引物中,有49条引物扩增谱带清晰且重复性较好,扩增总片段数达378个,单个引物的扩增片段数在4-12之间,片段大小在0.2-3.5 kb之间。不同材料间的遗传距离(D)在0.064-0.592之间,并根据遗传距离,按UWPGA法进行了聚类分析。
关键词：
黄瓜 RAPD 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
王惠哲 李淑菊 孙霞 管炜
用AFLP分子标记对4种不同类型黄瓜种质资源进行了多态性分析。利用NTSYS软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。从50对AFLP引物中筛选出24对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物。结果表明:24对引物组合共产生1 367条扩增带,平均每对引物组合产生56.96条;共产生多态性位点297个,多态性比率为21.7%。28份材料两两间的遗传相似系数在0.841 3~0.994 9之间,聚类分析结果显示,28份材料被聚成7小组,各组内生态类型基本一致。其中,华北有刺类型黄瓜在DNA水平上的同源性极高,遗传变异度较小,多样性水平较低,不如其他3个类型黄瓜多样性丰富。试验结果表...
关键词：
黄瓜 AFLP 聚类分析 亲缘关系
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张春英 林同香 戴思兰 张秀英
利用３６ 个１０ 碱基随机引物首次对７ 个桃花（ Ｐｒｕｎｕｓ ｐｅｒｓｉｃａ） 近缘种和３０ 个品种进行ＲＡＰＤ 反应．对选出１０ 个引物扩增出的具有多态性、可重复的、清晰的５６ 条带进行数据统计分析．ＵＰＧＭＡ聚类结果表明：毛桃（ Ｐｒｕｎｕｓ ｐｅｒｓｉｃａ） 和新疆桃（ Ｐ． ｆｅｒｇａｎｅｎｓｉｓ） 之间具有很近的亲缘关系，并与桃花品种间亲缘关系最近；寿星桃、垂枝桃类品种在聚类图上分别较早地聚合在一起，表明其类内具有较近的亲缘关系；直枝桃类品种没有在树系图上聚合成一类，表明直枝桃花品种群演化关系较为复杂，多样性较丰富．该文还从分子生物学角度探讨了桃花品种的演化关系和‘白花山碧’桃的起...
[期刊] 华北农学报
[作者]
谭雪 郭爽 郑少薇 刘自珠 林锦英 林春华
利用RAPD标记对31份菜薹种质资源进行亲缘关系分析。15条引物共扩增出66条谱带,其中多态性谱带43条,多态性谱带比率为65.15%,平均多样性指数为0.302 2。菜薹种质间遗传距离为0.046 5～0.526 1,遗传相似系数为0.590 9～0.954 5。UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数为0.74处,将31份菜薹种质分为四大类,与传统分类结果相比,有一致性但也存在差异。
关键词：
菜薹 种质资源 亲缘关系 RAPD
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈勇 唐昌亮 李浩 钱磊 罗树凯 周修任
【目的】分析所收集洋紫荆(Bauhinia variegata)种质资源亲缘关系和遗传多样性。【方法】通过ISSR-PCR方法,对15个不同来源和特征的洋紫荆个体间亲缘关系和遗传多样性进行研究。【结果】ISSR实验共得到150个清晰位点,其中145位点具有多态性,总的多态性比率为96.67%,其中8条引物的扩增产物多态位点比率达到100%;洋紫荆材料的平均等位基因(Na)为1.9667±0.1801、平均有效等位基因数(Ne)为1.6847±0.2934、平均Shannon信息指数(I)为0.5611±0.1639;亲缘关系分析表明,相同花色、相似开花量或相同来源地的不同个体间亲缘关系有时不显著。【结论】所收集洋紫荆资源形态特征具有丰富的遗传来源,亲缘关系复杂;同时,由于异地洋紫荆商品种苗活跃的流通导致不同来源种质资源亲缘关系复杂,种质资源高度杂合,育种过程亲本性状的纯化需较长周期。
[期刊] 华北农学报
[作者]
林建丽 朱正歌 王建成 高建伟
利用200个随机引物对21份白菜类蔬菜种质资源材料的基因组DNA进行了扩增,研究了它们的亲缘关系。结果表明,有22个随机引物可得到稳定的RAPD谱带,扩增带总数为135条,其中多态性带为125条,多态性比例为92.6%。系统聚类分析结果显示,在遗传距离(D)=0.25处,可将供试材料分为2类10组,其中第1类包括5个甘蓝品种,另外还包括芜菁;而第2类包括白菜和芥菜2个亚类。这表明芜菁和白菜的亲缘关系较远。芜菁和散白菜的杂交后代与芜菁和其他白菜的杂交后代形态相似,不能从形态学上为李家文的"杂交起源"假说提供佐证。推测白菜可能起源于野生小白菜的原始类型,在向北方传播的过程中相互杂交,经过长期的自然...
关键词：
白菜类蔬菜 RAPD 种质资源 聚类分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵海艳 赵纯 杨爱珍 王秋锦 孙清鹏 赵福宽
参考马铃薯和烟草的反转录转座子LTRs保守区域设计引物,对34份茄子材料进行PCR扩增,得到了多态性丰富的指纹图谱。聚类分析将34份茄子材料分为三大类群,表明IRAP分子标记适合于茄子种质资源的亲缘关系分析。
关键词：
茄子 种质资源 分子标记 IRAP
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
燕丽萍 吴德军 王因花 刘翠兰 王开芳 吴红 任飞 李庆华
为了探讨白蜡属植物种间、品种间亲缘关系以及同品种不同区域间的基因型差异,利用荧光AFLP分子标记技术,采用8对Pst I/Mse I引物组合对90个白蜡种质进行了DNA遗传多样性分析。结果表明:8对引物组合扩增出1 630条带,其中多态性条带1 399条,平均多态位点百分率为85.8%,平均有效等位Ne基因数为1.258 8,Nei’s平均遗传多样性指数为0.171 7;Shannon平均信息指数为0.286 9,表明白蜡属种间具有丰富的遗传多样性。采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析,结果表明,白蜡属植物种的聚类结果与传统的分类结果基本一致,绒毛白蜡及新品种(鲁蜡1号-鲁蜡4号)、美国紅梣及新品种(鲁蜡5号、鲁蜡6号)、美国白蜡及新品种(红叶白蜡、秋紫白蜡、秋火白蜡和秋欢白蜡)聚为一类;秦岭梣、庐山白蜡、花曲柳、中国白蜡、和窄叶白蜡聚为一类;不同之处在于花具花萼的象蜡树和对节白蜡与花无花萼的欧洲白蜡、水曲柳、新疆小叶白蜡和狭叶白蜡聚类为一类,象蜡树和水曲柳的亲缘关系较近,对节白蜡和象蜡树的起源与分类学地位有待于进一步的研究。说明AFLP标记技术能较好地揭示白蜡属种质资源的亲缘关系及演化规律,为种的分类及亲缘关系分析提供有力参考依据。
关键词：
白蜡属 优良种质 亲缘关系 AFLP
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李冬梅 叶庆生 朱根发
【目的】从分子水平研究大花蕙兰品种资源之间的遗传亲缘关系,为大花蕙兰种质资源的保存和利用及其杂交亲本的选配提供依据。【方法】利用RAPD标记方法对来自日本、韩国、中国和美国的48个大花蕙兰品种和2个国产兰属原生种的种质资源亲缘关系进行了检测。【结果】从100个10碱基随机引物中筛选出20个多态性高的引物,共扩增出258条DNA带,其中253条为多态带(占98.1%),平均每个引物扩增多态性带12.6条。50份种质之间的相似系数变化范围为0.364～0.817,平均相似系数为0.581。基于RAPD的扩增结果建立的UPGMA亲缘关系聚类图,50份种质在相似系数0.592处被划分为5大类群。【结论...
关键词：
大花蕙兰 亲缘关系 RAPD 聚类分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘子记 朱婕 詹园凤 党选民
以８２份小型西瓜核心种质为研究材料，对６个果实性状进行遗传多样性分析，同时基于基因型效应值进行性状间的相关性和种质间的亲缘关系分析，６个果实性状的多样性指数分别为４．２９，４．３９，４．３９，４．２９，４．３７和４．３７。结果表明，小型西瓜核心种质存在丰富的遗传多样性。果实重量与果实长度、果实宽度和果皮厚度呈极显著相关，相关系数分别为０．６７４，０．８２６和０．５３３。果实长度与果实宽度和果皮厚度呈极显著相关，相关系数分别为０．４１６和０．４８９。果实宽度与果皮厚度呈极显著相关，相关系数为０．４８５。边糖含量与心糖含量成极显著相关，相关系数为０．９３２。不同种质间遗传距离变幅为０．４２９～８．．．．
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