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[期刊] 西南农业学报
[作者]
周力 李雪清 孙永刚 高占红 桂林生
【目的】本文旨在分析偶联蛋白3(uncoupling protein 3, UCP3)和叉头转录因子1(Forkhead box O 1, FOXO1)基因的多态性及其合并基因型与早胜牛生长发育的相关性。【方法】采用DNA测序技术,检测419头早胜牛UCP3和FOXO1基因的多态位点,同时分析了单个多态位点不同基因型及合并基因型与早胜牛生长发育性状的关联性。【结果】在UCP3上检测到3个多态位点,分别命名为g.4439G>A,g.4899G>A和g.5575G>A,在FOXO1的3’侧翼区检测到1个突变,命名为g.92209C>T。关联性分析表明,g.4899G>A和g.92209C>T能够显著影响早胜牛的体重和胸围(P<0.01或P<0.05),优势基因型分别为GG和CC。通过合并基因型发现,组合基因型GG-GG-GG-CT的体重和胸围表现最佳,显著高于组合基因型GG-GA-GA-CC(P<0.01或P<0.05)。【结论】UCP3和FOXO1可能直接或间接影响早胜牛的生长发育,可尝试作为早胜牛分子标记辅助选择的候选基因。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
谭义洲 丁考仁青 褚敏 郭宪 马晓明 包鹏甲 阎萍 梁春年
[目的]探索欧拉型藏羊解偶联蛋白2(UCP2)和解偶联蛋白3(UCP3)基因的多态性及其与生长性状的关联性,为运用分子标记辅助育种方法提高欧拉型藏羊的生长性状提供理论依据。[方法]以239头成年欧拉型藏羊为试验对象,采用PCR产物直接测序技术检测UCP2和UCP3基因的遗传多态性,并将其与体质量、体高、体斜长和胸围生长性状进行关联性分析。[结果]在欧拉型藏羊UCP2基因上筛选出2个SNPs位点,分别为g.52130414C>T和g.52130584 G>A,其中g.52130414 C>T位点产生TT、CT和CC 3种基因型,g.52130584 G> A位点产生AA、AG和GG 3种基因型;在UCP3基因上筛选出1个SNP位点g.52157335 C>T,产生CC、CT和TT 3种基因型。基因多态性分析表明,3个SNPs位点均为错义突变位点,属于中度多态,且均符合Hard-Weinberg平衡适应性检验(P>0.05)。关联分析结果显示,UCP2基因g.52130414 C>T位点TT基因型欧拉型藏羊体质量显著高于CT基因型(PA位点AA基因型欧拉型藏羊体质量和体斜长均极显著高于AG和GG基因型(P<0.01),AA和GG基因型欧拉型藏羊胸围均显著高于AG基因型(PT位点CC基因型欧拉型藏羊体质量显著高于CT基因型(P<0.05),TT基因型欧拉型藏羊胸围显著高于CT基因型(P<0.05)。3个多态位点基因型组合分析发现,5个发生频率较高的双倍型中,D5型欧拉型藏羊体质量极显著高于D1、D2、D3型(P<0.01),体高显著高于D3型(P<0.05),体斜长显著高于D1、D3、D4型(P<0.05)且极显著高于D2型(P<0.01)。[结论]UCP2和UCP3基因多态性与欧拉型藏羊的部分生长性状显著相关,UCP2和UCP3基因可作为欧拉型藏羊生长性状选育的候选基因。D5双倍型为优势基因型,可在选育工作中优先考虑。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
丁维芹 祁增源 刘亚倩 韩银仓 李文浩 孙永刚
【目的】探索青海高原型牦牛(Bos grunniens)生长激素受体(growth hormone receptor)基因GHR多态性及其与生长性状的关联性。【方法】以440头同等放牧条件下的30～36月龄健康牦牛为试验群体,PCR扩增其GHR基因,测序后用DNASTAR 7.1软件分析单核苷酸多态性(SNP)位点,研究不同基因型及其合并基因型与生长发育指标(体质量、体高、体斜长、胸围和管围)的关联性。【结果】青海高原型牦牛GHR基因上存在g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A 3个SNP位点,其中g.732195A>G上存在2种基因型(AA,AG),g.732091C>G和g.732373G>A上各存在3种基因型(分别为CC、CG、GG和GA、AA、GG);卡方检验表明,g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A均处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态,且g.732195A>G为低度多态(PICG和g.732373G> A为中度多态(0.25G和g.732373G>A能够显著或极显著影响高原型牦牛的体质量和胸围,优势基因型分别为g.732091C>G和g.732373G>A的GG以及g.732195A>G的AA。对合并基因型分析发现,合并基因型GGAA-GG个体的生长发育尤其是体斜长表现最佳。【结论】青海高原型牦牛GHR基因有3个SNP位点,因其与青海高原型牦牛的部分生长性状相关,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李秋玲 许尚忠 昝林森 高雪 张争锋 任红艳 陈金宝
以中国西门塔尔牛、安格斯牛和海福特牛为试验材料,设计特异性引物扩增解耦联蛋白3基因(UCP3)的第5内含子和第6外显子部分序列,利用PCR-SSCP技术对牛UCP3基因进行了SNPs检测和基因型分析。结果表明,3个牛品种中的优势等位基因均为B,中国西门塔尔牛和安格斯牛的优势基因型为BB型,海福特牛的优势基因型为AB型;中国西门塔尔牛和海福特牛在UCP3基因位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,而安格斯牛在UCP3基因位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态;中国西门塔尔牛和海福特牛在UCP3基因位点为中度多态,安格斯牛在UCP3基因位点为高度多态。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
管峰 刘守仁 程瑞禾 代蓉 石国庆 艾君涛 杨利国
以绵羊BMPRIB基因为候选基因,采用PCRRFLP方法分析湖羊、夏洛来、陶赛特、萨福克、罗米丽、中国美利奴羊以及中国美利奴肉用多胎品系共553只个体的基因单核苷酸多态性,以及BMPRIB基因多态性与产羔数和生长发育的关系。实验结果显示,BMPRIB基因在不同绵羊品种(系)中共有3种基因型(BB、B+和++),但基因型频率分布在各品种(系)间差异极显著(P<0.01)。在湖羊中仅有BB基因型;在中国美利奴肉用多胎品系中BB、B+和++基因型频率分别为51%、30%和19%;而其他品种(系)羊中则仅有++基因型。对中国美利奴羊肉用多胎品系的研究发现:BB、B+和++基因型群体第一胎产羔数分别为2...
[期刊] 林业科学
[作者]
沈文静 张莉 刘来盘 方志翔 刘标
【目的】调查转cry1Ac基因欧洲黑杨(世纪杨)对土壤指示生物蚯蚓生长、繁殖和体内生物酶活性的影响，为转基因杨树大规模应用提供生态安全方面的数据。【方法】以非转基因杨树为对照，将转基因欧洲黑杨(世纪杨)叶片添加到土壤中连续喂养赤子爱胜蚓140天，每隔14天调查蚯蚓存活情况，测定蚯蚓体质量变化，统计蚯蚓繁殖产生蚓茧数量及蚓茧孵化情况，在蚓茧孵化7天后和成蚓暴露140天后测定蚯蚓体内总蛋白、乙酰胆碱酯酶(AchE)、谷胱甘肽过氧化物酶(GST)和超氧化物歧化酶(SOD)活性的变化。【结果】与对照杨树相比，饲喂转基因杨树叶片的蚯蚓存活率未发生显著改变；各处理组蚯蚓的体质量随试验进行而增加，140天10次调查中转基因杨树和对照杨树处理组蚯蚓体质量均无显著性差异；转基因杨树和对照杨树处理组均于试验第2次调查(28天)时开始繁殖，整个试验期转基因杨树和对照杨树处理组单条蚯蚓产蚓茧数无显著性差异，42～140天8次调查中，仅在第70天时对照杨树处理组蚓茧数显著高于转基因杨树组，其余7次调查均无显著差异；转基因杨树和对照杨树处理组蚓茧孵化率和每茧平均新生蚓数量无显著性差异；暴露140天，蚯蚓体内乙酰胆碱酯酶(AchE)、谷胱甘肽过氧化物酶(GST)和超氧化物歧化酶(SOD)活性在转基因杨树和对照杨树处理组无显著性差异；通过ELISA法未在蚯蚓组织检测到外源Cry1A蛋白，说明长时间饲喂(140天)转基因杨树叶片，外源蛋白不会在蚯蚓体内蓄积。【结论】相对对照杨树，饲喂转基因杨树叶片对赤子爱胜蚓的生存、生长和繁殖无不利影响。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李国辉 魏岳 张学余 韩威 屠云洁 苏一军
以GH和POU1F1作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法,检测白耳鸡GH外显子4和POU1F1外显子3区域的单核苷酸多态性,并利用最小二乘法分析GH、POU1F1单基因型和两基因聚合基因型与72周龄产蛋数的关联.结果表明,GH基因exon4(C2338G\C2341T)的突变和POU1F1基因exon3的突变(A5331T)基因型CC与白耳鸡的72周龄产蛋数显著相关(P<0.05),基因型AA、CC对产蛋数的加性效应分别为3.80和3.57.聚合基因型AACC个体72周龄产蛋数(除基因型ABCC外)与对照组差异显著(P0.05).扩...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
高雪 徐秀容 许尚忠 张英汉
【目的】研究牛GH基因的遗传多态以及各多态位点对肉牛生长发育性状的影响,以期找到可用于标记辅助选择的分子标记,为下一步分子育种提供依据。【方法】利用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了牛GH基因第3内含子、第4内含子、第5外显子、3′非翻译区和5′侧翼区的位点遗传多态,并分析了5个多态位点不同基因型对肉牛体重、体高、体斜长、胸围和肉用指数的基因型效应,以及GH基因的第5外显子、3′非翻译区位点的不同基因型组合基因型效应。【结果】GH基因的第5外显子、3′非翻译区的基因型效应在肉牛体重、体高、体斜长、胸围和肉用指数性状上存在显著差异(P<0.05),且这2个位点等位基因B为优势等位基因;...
关键词：
牛 GH基因 遗传多态 生长发育性状
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
赵毅昂 魏大为 张久盘 宋雅萍 姜超 王兴平 罗仍卓么 马云
为鉴定牛叉头框转录因子1(Forkhead box,FoxO1)的核心启动子区及其关键转录因子，利用PCR扩增牛FoxO1基因的启动子序列，同时设计7个逐段缺失片段引物扩增其启动子逐段缺失片段，进一步将其构建双荧光素酶报告载体并分别转染小鼠C2C12和3T3-L1细胞系，通过检测不同缺失片段荧光素酶报告载体的活性，以确定牛FoxO1启动子的核心区域；使用Genomatix和JASPAR在线软件预测牛FoxO1基因启动子核心区域的关键转录因子，采用定点突变试验在小鼠C2C12细胞系中初步鉴定预测的关键转录因子对FoxO1的转录调控作用。结果表明：1）成功扩增了牛FoxO1的启动子区1 920bp序列，获得了FoxO1基因启动子序列的7个逐段缺失片段序列；2）经双荧光素酶报告试验进一步证实，牛FoxO1基因核心启动子位于-285/-27区域；3）预测并通过定点突变试验鉴定出MEF2A、KLF4、HOXA5和KLF5转录因子对FoxO1基因的转录活性具有关键调控作用。综上，本研究初步鉴定出牛FoxO1基因启动子核心区（-285/-27）内转录因子MEF2A、KLF4、HOXA5和KLF5对FoxO1基因有重要的转录调控作用，为FoxO1基因对牛肌肉脂肪发育过程中的转录调控机制奠定了一定理论基础。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
蔡欣 陈宏 雷初朝 胡沈荣 苏利红
基于mtDNA cyt b基因全长序列,对中国黄牛、牦牛和水牛的遗传多态性和系统发育关系进行了分析。结果表明,中国黄牛、牦牛和水牛cyt b基因序列中碱基A和T的含量均比较高,A+T的平均含量分别为56.6%,58.2%和56.0%。黄牛在cyt b基因全长序列具有较丰富的核苷酸多样性(Pi=0.016 84),水牛的核苷酸多样性相对贫乏(Pi=0.003 51),牦牛的核苷酸多样性介于二者之间(Pi=0.012 28)。中国黄牛与牦牛和欧洲野牛之间的亲缘关系相对较近,而与水牛间的亲缘关系则相对较远,黄牛有普通牛和瘤牛2个母系起源;中国牦牛和斑腾牛以及羯牛的亲缘关系相对较近;中国水牛和沼泽型水...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
王强 王志跃 杨海明 陈五湖 杨建刚
以新扬州鸡胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因作为控制其生长、发育性状的候选基因,通过对IGF-Ⅰ基因主要部分序列进行PCR-SSCP检测,发现了2个多态位点.测序结果表明,IGF-Ⅰ基因存在2个突变位点:插入(G)和(G→C).分析多态位点与0-12周龄鸡生长发育性状的关联性,结果表明:插入(G)突变基因型中,2周龄鸡体重BB型与AB型差异显著(P<0.05),但AA型与AB型和BB型差异均不显著,而(G→C)突变各基因型间没有显著差异;插入(G)突变位点对0-12周龄鸡的龙骨长、胫骨长均没有显著影响,而(G→C)突变位点仅在鸡6周龄时表现出与龙骨长、胫骨长间的差异显著性.
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
王朔 黄海娇 杨光 姜静 刘桂丰
本文以３株野生型白桦为母本、３株３５Ｓ∷Ｂｐ Ａｐ１转基因白桦及１株野生型白桦为父本进行杂交，调查杂种子代的生长发育、开花结实特性，分析外源Ａｐ１基因在Ｔ１代白桦中的遗传稳定性及分离规律。结果表明：Ｂｐ Ａｐ１基因的插入对转基因植株的花粉活力略有影响，Ｂｐ Ａｐ１基因可遗传给Ｔ１代的部分个体，遗传比例在３６％～５８％之间，经χ２检验，Ｂｐ Ａｐ１基因的分离比符合孟德尔分离定律；遗传了Ｂｐ Ａｐ１基因的白桦子代与父本一样仍然呈现出提前开花结实、明显矮化的特点，其１年生和２年生的高生长仅为野生型白桦杂种子代的４４．１９％和１８．９２％；Ｔ１代白桦存在２种完全不同的表型，据此能够简便快捷地判断出杂种．．．
关键词：
BpAP1 生长发育 遗传规律 白桦
[期刊] 西南农业学报
[作者]
黄兴 柴志欣 王会 姬秋梅 信金伟 钟金城
【目的】本研究旨在对西藏牦牛MyoD1基因多态性与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状进行关联性分析,以期获得对牦牛重要经济性状具有显著效应的遗传标记。【方法】本研究利用DNA池直接测序、PCR-RFLP与生物信息学技术,对西藏帕里(PL)、斯布(SB)、申扎(SZ)和类乌齐(LWQ)4个牦牛类群(品种)共148头个体的MyoD1基因内含子2及外显子3部分序列进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状的关联性。【结果】①西藏牦牛MyoD1基因外显子3上存在(C1710T)XmaI酶切位点,多态性检测均存在CC、CT和TT 3种基因型,T/C频率分别为:0.308/0.692、0.400/0.600、0.605/0.395和0.527/0.473,处于中度多态。②适合性检验表明,西藏4个牦牛类群MyoD1基因多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。③利用最小二乘拟合线性模型,对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围和体重)进行差异显著性检验,申扎牦牛该位点TT和CT基因型在生长性状上差异显著(P<0.05),CT基因型胸围均高于CC和TT基因型。【结论】可以将MyoD1上的C1710T基因座作为牦牛经济性状选育的一个重要遗传标记,用于育种改良。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王斌 昝林森 杜宝民 余横伟 刘红 陈兴平
【目的】分析12个微卫星DNA与西镇牛长发育性状的关联性,为西镇牛品种资源保护和开发利用提供理论依据。【方法】测定西镇牛的体高、体长、胸围、管围、腰角宽和体质量。利用12对微卫星引物,采用PCR扩增和非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳技术,对48头西镇牛母牛进行了遗传多样性检测,并统计分析各位点各种基因型群体与体尺性状之间的效应关系。【结果】12个微卫星位点各基因型与西镇牛生长发育性状具有关联性。IDVGA2、BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、BM1824位点与体高,BM2113
关键词：
西镇牛 微卫星DNA 体尺性状
[期刊] 林业科学
[作者]
左雯腾 孟佳慧 卢孟柱 王留强
【目的】本研究分析了银腺杨生长素受体基因PagFBL3的序列结构、组织表达特异性和亚细胞定位，并创制了过表达PagFBL3转基因杨树，探讨其对茎次生生长的影响，为进一步阐明生长素受体在茎次生生长中的作用机制提供帮助。【方法】利用生物信息学方法及相关软件分析系统进化关系、序列相似性及生化特征；克隆并鉴定了银腺杨PagFBL3基因，利用实时荧光定量PCR技术，分析该基因在根、幼叶、成熟叶、幼茎、维管形成层、木质部和韧皮部中的表达；利用Gateway技术，构建融合表达载体35S::PagFBL3-GFP，通过瞬时转化烟草叶片表皮分析PagFBL3的亚细胞定位；同时，将PagFBL3编码区序列重组进入pMDC32载体，构建植物过表达载体35S::PagFBL3，利用农杆菌介导法创制转基因银腺杨，通过表型观察和组织切片分析过表达PagFBL3基因对转基因杨树茎部生长发育的影响。【结果】PagFBL3基因可编码571个氨基酸残基，其编码蛋白定位于细胞核。PagFBL3基因在根、茎和叶中均有表达，并在成熟叶和次生茎中表达量较高。基于抗性筛选和分子水平鉴定，创制了11个过表达PagFBL3转基因杨树株系，选择两个表达量较高的转基因株系进行功能分析。与非转基因植株相比，过量表达PagFBL3基因促进转基因杨树木质部发育，显著增加了转基因杨树的木质部宽度，提高了转基因杨树的径向生长，地径分别增加6.7%和8.5%，第15节间木质部宽度分别增加17.3%和19.9%。此外，过量表达PagFBL3基因也增强了植株的高生长，株高分别增加6.3%和6.9%。【结论】PagFBL3基因主要在成熟叶和次生茎中表达并发挥作用，通过影响木质部发育，提高木质部宽度，进而参与调控杨树的径向生长，该研究为进一步揭示PagFBL3基因参与杨树茎部生长发育的分子机制提供了参考。
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